演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF311

zinc finger protein 311

ZNF311(zinc finger protein 311)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控,並含有 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指結構。

Homo sapiens6p22.1UniProt Q5JNZ3
OFFICIAL SYMBOL
ZNF311
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q5JNZ3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF311 是位於人類第 6 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 311。其產物 Zinc finger protein 311 歸屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 KRAB 區域與多個 C2H2 型鋅指結構,呈現此類蛋白質的家族特徵。

Official symbol
ZNF311
Gene name
zinc finger protein 311
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13847
UniProt
Q5JNZ3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p22.1
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegZNF311pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:28,994,040–29,005,651
Gene span
11,612 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000377179 ★28,994,788–29,005,3157
ENST0000091090728,994,040–29,005,6487
ENST0000091090828,994,040–29,005,6487
ENST0000091090928,994,040–29,005,6517
ENST0000091091028,994,040–29,005,6518
ENST0000091091128,994,040–29,005,6518
ENST0000091091228,994,040–29,004,2146
ENST0000091644128,994,040–29,005,6518
ENST0000091644228,994,040–29,005,6487
ENST0000091644328,994,040–29,005,6517
ENST0000091644428,994,040–29,005,6517
ENST0000091644528,994,040–29,005,6487

顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF311 的產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能角色,未進一步說明它如何影響轉錄,也未提供具體調控標的或分子作用方式,因此其功能解讀應限於可能參與轉錄調節。

這項註記將 ZNF311 與基因表現調控相連結,但未指出其作用方向、調控條件或所涉生物學過程。資料亦未說明它是否直接作用於 DNA,或是否透過其他分子發揮作用;因此不能據此推定特定機制或更廣泛的生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 29005315 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF311 ENST00000377179 GRCh38 chr6:29005215-29006315 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTAGTTCAGATGTGAATTTTAAAAGAATTAAGACACATGCCCAAATTAAATACTGGAACTTTAGATCTTG
AATGAAATAGAAAACAAATGTAAGAAGCATATGTATATATTTAGGGAAATATAATATGGACTTGGTATTA
GATGATAACCAGGAATTATTTTGTTAAATGGGATAATGGTATTGTGATTCTGTAGGAAAATATCCTTTTT
AAAATAAATGCATAATGAAGTTGAAAGTAAGATATTTGGGGTTTGCTTTAAAACGTTTCAGCAAGAAAAA
ATGGAGATGGATGAAACAAGTGTGGCAGAATTTTATGTATTTTTAAATGTAAATGATGGGTATATATGGG
TTAATTATACTCTTCTTTCGACTTCTGCATAGGCTTAAAATAGTCTTTACTTTTGAAAAAGACATTCAAT
TATTTGTGTTCTTAGTTAATATTTAAAAGTAACTTTTTCATATATTTGTCACAAAACTTCTGTCCATTCC
TATCTAGAGGTTCCTCTACATGGGAAAAAAGGAGCAAAAGGGTAATATTTCTGCAACCCCTTTGCACAGG
CCATAAACGCACGCAAACTCCTAGAAGGCTGAGCCGCGAGGAGGAGGGCGGAGAGTTTAAGGGAACGCCT
AGACCAGAGAGTTGACGCCTTTCCTAGAAAATCACCGGAAATGATAATTGGCGGACTAGGAAGTGGAGCT
TCTGTATATTTCTGTTTCTCATTTCTTGGGGAGAGTACCGGCGGGAAGGTCTGTGCCTTGGGCCGTCGTG
GGTCGGAATTTGCAGCTGAGAGGAGAGGAGTCCGGTGCCGCCGTCGCCCCCCTCACCTAAATACCCGGGC
CCCTGGGGTTGCAGGCAGGGGCGGGTCTTTGGGGCCAGATTTGAGGAGGGAGTCGGCTGCGGTTTCCTCC
CTCGAAGCCATTCCCCAAAATGAGCATTTCCCGCCCATTTGCCCTACCTCCTCCCAGGGGCTCGTGACCC
ATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACCGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCTCCTGACCCATTCTTTTTATTCTTC
TCTACAGCATCCATTCATATATTCATTCAGTCAGCTAATTTTTAATCCAGC
ZNF311 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_73P3CW · enhancer · 29005195–29005304 · regulatory

ENSR6_9FHSR · promoter · 29005305–29005805 · regulatory

· motif · 29005643–29005652 · motif

· motif · 29006206–29006216 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:666 aa

1 aa666 aa結構域鋅指
依 Q5JNZ3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger protein 311 長 666 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB 區域位於第 64 至 135 位;另有 14 個 C2H2 型鋅指,分布於第 247 至 634 位。

結構域KRAB64–135 aa
鋅指C2H2-type 1247–269 aa
鋅指C2H2-type 2275–297 aa
鋅指C2H2-type 3303–325 aa
鋅指C2H2-type 4331–353 aa
鋅指C2H2-type 5359–381 aa
鋅指C2H2-type 6387–409 aa
鋅指C2H2-type 7415–437 aa
鋅指C2H2-type 8443–465 aa
鋅指C2H2-type 9471–493 aa
鋅指C2H2-type 10499–521 aa
鋅指C2H2-type 11527–549 aa
鋅指C2H2-type 12555–577 aa
鋅指C2H2-type 13583–605 aa
鋅指C2H2-type 14611–634 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5JNZ3…

AlphaFold · Q5JNZ3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

Zinc finger protein 311 定位於細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF311ZNF311
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF311 可能參與轉錄調控;資料僅以可能性描述其角色,未提供更具體的調控機制、作用方向或目標。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Zinc finger protein 311 位於細胞核;此定位資訊未附帶其他條件或異構型差異說明。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000377179 · 2,782 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACCGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCTCCTGACCCATTCTT40
41TTTATTCTTCTCTACAGCATCCATTCATATATTCATTCAG80
81TCAGCTAATTTTTAATCCAGCACATACTATTGCAAGCGCT120
121GTTTTAGGCGTTGAGAATACAACTGTGAACAAGACGACAA160
161AAATTCCTGCCCTCATGGAGCCTAAGAGCCTAGATTTTAG200
201CGAAGGTAGAACCACCGTAAACAATGTATATATTAATAAG240
241TAACTTATGCACCATACTGGAAAATTATAAAGTGCTATAG280
281AGGAAAAGAAGAATTCATGTAAAGCAAGGGAAACAAGATG320
321TGAGATCACAGCGGTTTAGTGTTGCTAATGAACCCCAAAT360
361CCAGGGCAGTGTTTGACACATTAAGCCAAACAGTAGCGGC400
401ACTGTGGGTCAAGAAGGGCCCTTTGGCTGGCACCACCAAA440
441ACATGTGTTCTCCAAAGGAGGCTGGCATCAACTGGAGCCA480
481CTTCACAGCTTGTTTGAGAACTGGATCTGACCAGTAGGAA520
521GAAACCAGGACAGCAGTGGAAGACTGTTAAAGAAACCTGA560
561GTAAAAAGATGCAGGAGGTTGTGCTGTTGGATGAGAGTTC600
601AGGACCACCAAGCCAGCTGCTTTGGACCCGCCAGGATACC640
641CAGCTCCCTCAGGAAAGCGCTCTATTACCTGCTCCATATC680
681CTGCCTTCACTAAAGATGGAAGCCAAGGAAACCTGCCGCA720
721AGCAGATATCACACTAATGAGCCAGGCCCAAGAGTCAGTG760
761ACATTTGAGGATGTAGCTGTGAACTTCACTAACAGGGAGT800
801GGCAGTGTCTGACCTACGCTCAAAGGCATCTCTATAAGGA840
841TGTGATGTTGGAAAATTATGGGAACATGGTATCACTTGGA880
881TTTCCATTTCCTAAACCTCCTTTAATCTCTCATCTGGAGC920
921GAGAAGTAGACCCCTGTGTGCAGGATCCACAGGACAGGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。