基因總覽
ZNF311 是位於人類第 6 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 311。其產物 Zinc finger protein 311 歸屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 KRAB 區域與多個 C2H2 型鋅指結構,呈現此類蛋白質的家族特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377179 ★ | 28,994,788–29,005,315 | 7 |
| ENST00000910907 | 28,994,040–29,005,648 | 7 |
| ENST00000910908 | 28,994,040–29,005,648 | 7 |
| ENST00000910909 | 28,994,040–29,005,651 | 7 |
| ENST00000910910 | 28,994,040–29,005,651 | 8 |
| ENST00000910911 | 28,994,040–29,005,651 | 8 |
| ENST00000910912 | 28,994,040–29,004,214 | 6 |
| ENST00000916441 | 28,994,040–29,005,651 | 8 |
| ENST00000916442 | 28,994,040–29,005,648 | 7 |
| ENST00000916443 | 28,994,040–29,005,651 | 7 |
| ENST00000916444 | 28,994,040–29,005,651 | 7 |
| ENST00000916445 | 28,994,040–29,005,648 | 7 |
顯示 12/25 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF311 的產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能角色,未進一步說明它如何影響轉錄,也未提供具體調控標的或分子作用方式,因此其功能解讀應限於可能參與轉錄調節。
這項註記將 ZNF311 與基因表現調控相連結,但未指出其作用方向、調控條件或所涉生物學過程。資料亦未說明它是否直接作用於 DNA,或是否透過其他分子發揮作用;因此不能據此推定特定機制或更廣泛的生物學效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF311 ENST00000377179 GRCh38 chr6:29005215-29006315 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTAGTTCAGATGTGAATTTTAAAAGAATTAAGACACATGCCCAAATTAAATACTGGAACTTTAGATCTTG AATGAAATAGAAAACAAATGTAAGAAGCATATGTATATATTTAGGGAAATATAATATGGACTTGGTATTA GATGATAACCAGGAATTATTTTGTTAAATGGGATAATGGTATTGTGATTCTGTAGGAAAATATCCTTTTT AAAATAAATGCATAATGAAGTTGAAAGTAAGATATTTGGGGTTTGCTTTAAAACGTTTCAGCAAGAAAAA ATGGAGATGGATGAAACAAGTGTGGCAGAATTTTATGTATTTTTAAATGTAAATGATGGGTATATATGGG TTAATTATACTCTTCTTTCGACTTCTGCATAGGCTTAAAATAGTCTTTACTTTTGAAAAAGACATTCAAT TATTTGTGTTCTTAGTTAATATTTAAAAGTAACTTTTTCATATATTTGTCACAAAACTTCTGTCCATTCC TATCTAGAGGTTCCTCTACATGGGAAAAAAGGAGCAAAAGGGTAATATTTCTGCAACCCCTTTGCACAGG CCATAAACGCACGCAAACTCCTAGAAGGCTGAGCCGCGAGGAGGAGGGCGGAGAGTTTAAGGGAACGCCT AGACCAGAGAGTTGACGCCTTTCCTAGAAAATCACCGGAAATGATAATTGGCGGACTAGGAAGTGGAGCT TCTGTATATTTCTGTTTCTCATTTCTTGGGGAGAGTACCGGCGGGAAGGTCTGTGCCTTGGGCCGTCGTG GGTCGGAATTTGCAGCTGAGAGGAGAGGAGTCCGGTGCCGCCGTCGCCCCCCTCACCTAAATACCCGGGC CCCTGGGGTTGCAGGCAGGGGCGGGTCTTTGGGGCCAGATTTGAGGAGGGAGTCGGCTGCGGTTTCCTCC CTCGAAGCCATTCCCCAAAATGAGCATTTCCCGCCCATTTGCCCTACCTCCTCCCAGGGGCTCGTGACCC ATTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACCGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCTCCTGACCCATTCTTTTTATTCTTC TCTACAGCATCCATTCATATATTCATTCAGTCAGCTAATTTTTAATCCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_73P3CW · enhancer · 29005195–29005304 · regulatory
ENSR6_9FHSR · promoter · 29005305–29005805 · regulatory
· motif · 29005643–29005652 · motif
· motif · 29006206–29006216 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:666 aa
Zinc finger protein 311 長 666 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB 區域位於第 64 至 135 位;另有 14 個 C2H2 型鋅指,分布於第 247 至 634 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Zinc finger protein 311 定位於細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGACCGGAGTCTTGCTCTTGTCGCCTCCTGACCCATTCTT40TTTATTCTTCTCTACAGCATCCATTCATATATTCATTCAG80TCAGCTAATTTTTAATCCAGCACATACTATTGCAAGCGCT120GTTTTAGGCGTTGAGAATACAACTGTGAACAAGACGACAA160AAATTCCTGCCCTCATGGAGCCTAAGAGCCTAGATTTTAG200CGAAGGTAGAACCACCGTAAACAATGTATATATTAATAAG240TAACTTATGCACCATACTGGAAAATTATAAAGTGCTATAG280AGGAAAAGAAGAATTCATGTAAAGCAAGGGAAACAAGATG320TGAGATCACAGCGGTTTAGTGTTGCTAATGAACCCCAAAT360CCAGGGCAGTGTTTGACACATTAAGCCAAACAGTAGCGGC400ACTGTGGGTCAAGAAGGGCCCTTTGGCTGGCACCACCAAA440ACATGTGTTCTCCAAAGGAGGCTGGCATCAACTGGAGCCA480CTTCACAGCTTGTTTGAGAACTGGATCTGACCAGTAGGAA520GAAACCAGGACAGCAGTGGAAGACTGTTAAAGAAACCTGA560GTAAAAAGATGCAGGAGGTTGTGCTGTTGGATGAGAGTTC600AGGACCACCAAGCCAGCTGCTTTGGACCCGCCAGGATACC640CAGCTCCCTCAGGAAAGCGCTCTATTACCTGCTCCATATC680CTGCCTTCACTAAAGATGGAAGCCAAGGAAACCTGCCGCA720AGCAGATATCACACTAATGAGCCAGGCCCAAGAGTCAGTG760ACATTTGAGGATGTAGCTGTGAACTTCACTAACAGGGAGT800GGCAGTGTCTGACCTACGCTCAAAGGCATCTCTATAAGGA840TGTGATGTTGGAAAATTATGGGAACATGGTATCACTTGGA880TTTCCATTTCCTAAACCTCCTTTAATCTCTCATCTGGAGC920GAGAAGTAGACCCCTGTGTGCAGGATCCACAGGACAGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。