基因總覽
ZNF302 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列長 478 個胺基酸,具有位於蛋白質前段的 KRAB 區域,以及集中於後段的七個 C2H2 型鋅指區域。這些結構註解呈現其家族特徵;可確認的基本功能描述為可能參與轉錄調控,尚無來源提供更具體的作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000505242 ★ | 34,677,678–34,686,396 | 5 |
| ENST00000929232 | 34,677,084–34,687,065 | 5 |
| ENST00000929233 | 34,677,084–34,687,065 | 6 |
| ENST00000929234 | 34,677,084–34,687,065 | 5 |
| ENST00000958498 | 34,677,084–34,687,065 | 6 |
| ENST00000929235 | 34,677,282–34,687,065 | 5 |
| ENST00000869116 | 34,677,343–34,687,065 | 5 |
| ENST00000869118 | 34,677,343–34,687,065 | 5 |
| ENST00000958495 | 34,677,343–34,687,065 | 6 |
| ENST00000988893 | 34,677,343–34,687,062 | 5 |
| ENST00000869120 | 34,677,572–34,687,065 | 5 |
| ENST00000929236 | 34,677,572–34,687,065 | 5 |
顯示 12/69 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF302 可能參與轉錄調控。這項描述指出其與基因轉錄調節有關,但來源未說明它促進或抑制轉錄,也未界定受調控的基因、細胞過程或作用條件,因此不宜將其功能進一步解讀為特定方向或機制。
雖然 ZNF302 帶有 KRAB 與多個 C2H2 型鋅指區域,現有功能資料並未交代這些區域如何參與轉錄調控,也未提供其是否直接接觸 DNA、是否透過其他分子影響轉錄,或是否形成特定複合體的證據。其生物學作用目前只能概括為可能涉及轉錄調節;具體靶標、調控結果及生理意義均未由來源說明。
Promoter 與基因調控
>ZNF302 ENST00000505242 GRCh38 chr19:34676678-34677778 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGGTAACAGAAGCACTGCTTCACGAAGATCATGCAGGTCAGTACTTAATAAGTACAAAAAAGTCTATAGC GACACTATTTATAATTTTAAAAATGATTGAAGTCAATTAACATTTAAGTGTTAAAAAGAAAGTAAACAAC CCAAATATACACAAACAGTAGACTGCTCTGGCTTGCATACAGAGAGGTCCATTGCCCTTTTGGGTGGGCC TAAGAAGCACTTCTGGGGAGAGGGGGCGTCAGGCTGTGATGGCTGCGGGAGGAGTGACTCCTCCCAGGAT GAGGGTCTCCATCCTCCCAGTGCTCACTCAAGTTCAGTATTTCCAAGTCCTTCCAGGGGCGTAACGCACG TCAGAACGGCCATTAGTGTCACAGATACGTGTCCCCTTGCATTTCCAGGAAATGCCCTTGGTTGGCGAAC TACAGTCGTGACAGTCGGGCCACAGGGCGTTTTGTGAGTTATCGTCTTGGGCAAATGAGTGCCAAAAAAA AAAAAAAAAAAAGACCTGAAGGTGAACAGCATAGCGGCAGGGTTTGGGATGAGAGGAGCCCCTTTGCTAG CAACGGCGAGCACTTGCGCGGTACCAGCAAGGGCTGCCCATGTCTCGGAGGGAAACGTTTGTGTGAGCGC AGGAATGACCCGGAAGACCTTGGCACGGCTGCAGTTTTCTGGGAAATGTAATTTCTTGGTCCGGGCGCCA TGGCCCTTATAAGTAGAGGGTGTCCCTTGGTTTCGAGTTGTATCGTTCACCAGAGGACGACTGTGTGCCC CAGGACAATTTGCGCATGGTCCTAGCTGGCCGGCTCTAGGTCGACGGCCCCAGGCGGTTAAGCTACTTAC AAAGCCGTGACCGGTTTGCCCGCGGCGCACCAGGTCCGCGCAGCCGCAGAGACCCTTGGGAAGTGTGGTC TTCGGGTGCCGGCGGTTCGCGGCTTCCGGGACATTTGTACCGCAGGGGGAGGATTCTGGGAAATGTGGTT CGCCGTGGGCGGTGCACTGGGTCAGTCCCGCGATAGCTTCAGGCCTGGCGGCGGCTTCCAAGCTAAGGAA CGGTTTGGGGCAGTGTCGTTCCCGGAGGTCGGCCGCCGTTACCCGCTCACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF302_1 ↗ | 19:34,677,678 | 正股 | 34,677,629–34,677,688 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9HQLS · enhancer · 34676678–34677148 · regulatory
ENSR19_B8TRZ · promoter · 34677149–34677846 · regulatory
ENSR19_9HQM6 · enhancer · 34677847–34678299 · regulatory
· motif · 34676066–34676081 · motif
· motif · 34676066–34676081 · motif
· motif · 34676161–34676172 · motif
· motif · 34677032–34677042 · motif
· motif · 34677070–34677081 · motif
· motif · 34677246–34677257 · motif
· motif · 34677314–34677325 · motif
· motif · 34677379–34677394 · motif
· motif · 34677567–34677580 · motif
· motif · 34677567–34677580 · motif
· motif · 34677597–34677612 · motif
· motif · 34677641–34677658 · motif
· motif · 34677662–34677672 · motif
· motif · 34677983–34677998 · motif
· motif · 34678053–34678066 · motif
· motif · 34678053–34678066 · motif
· motif · 34678081–34678090 · motif
· motif · 34678081–34678090 · motif
· motif · 34678243–34678253 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:478 aa
ZNF302 蛋白質全長 478 個胺基酸。其 N 端第 4–75 位為 KRAB 區域;C 端附近則有七個 C2H2 型鋅指區域,依序位於第 280–302、308–330、336–358、364–386、392–414、420–442 及 448–470 位。蛋白質家族歸屬為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF302 的細胞內定位註解為細胞核。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEFLP07196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF11Q9Y3C5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCAGTCCCGCGATAGCTTCAGGCCTGGCGGCGGCTTCCA40AGCTAAGGAACGGTTTGGGGCAGTGTCGTTCCCGGAGGTC80GGCCGCCGTTACCCGCTCACCAGCTACGCGGCGCGTCAGG120TCCGCGGAGGCGCGGGCTCGGGGCGCCTGCGGGACGGTGA160GGCCCTGCTGAGGACTCCGGCAAGTGTGGGTCGCGGCGAC200GGCGGGGCTAAGGCCCTGGGTCCGCGCGCGGTTTGACCAC240GGCCGGGGCCTTGGGCATTTCCTGGCCTTCCTGTTGAGCC280GTGTAAACGCGGGGTGATGACGGCGCCGACCTCTTGGCAC320TGTTGTGAGAGCGAAGTGGGCGCGAGAGCAGACGCCAGCT360ACAGTTTTTTTTGGGTTATGTCGTCATGAAGCCGGCGCTT400TCAGTTGTGCAACCTTGAACAAATGGGACACTGCCCATCT440CTAAGATAAGAACCTGGAAAGGGGACTCTGTTGGCCATTG480GAAATTGCAGAATAATGTCTCAGGTGACATTTAGTGATGT520GGCTATAGACTTCTCTCATGAAGAGTGGGCATGCCTAGAT560TCTGCTCAGAGGGACTTATACAAGGATGTGATGGTCCAGA600ATTATGAGAACCTGGTCTCTGTAGGTCTTTCCGTAACTAA640GCCATATGTGATCATGTTATTGGAGGATGGAAAAGAGCCC680TGGATGATGGAGAAAAAACTGTCAAAAGATTGGGAATCAA720GATGGGAAAACAAGGAATTATCAACAAAGAAGGATATTTA760TGATGAAGATTCACCCCAACCAGTAACAATGGAAAAAGTT800GTAAAACAAAGTTATGAATTTTCAAATTCTAATAAGAATT840TGGAATATACAGAATGCGACACATTTAGAAGCACCTTTCA880TTCAAAGTCTACTCTTTCTGAACCACAAAACAATTCTGCT920GAAGGGAATTCACACAAATATGATATATTAAAGAAGAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。