演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF300

zinc finger protein 300

ZNF300(zinc finger protein 300)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 成員,具有轉錄抑制活性,並定位於細胞核。

Homo sapiens5q33.1UniProt Q96RE9
OFFICIAL SYMBOL
ZNF300
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q96RE9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF300(zinc finger protein 300)是蛋白質編碼基因,產生屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質。其蛋白質具有 KRAB domain,並含有多個 C2H2-type zinc finger;另有一段被註記為無序區域。這些結構特徵構成其基本分子特性。已知的功能描述指出,ZNF300 具有轉錄抑制活性;蛋白質定位於細胞核。

Official symbol
ZNF300
Gene name
zinc finger protein 300
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13091
UniProt
Q96RE9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q33.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegZNF300pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:150,893,804–150,904,987
Gene span
11,184 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000274599 ★150,894,399–150,904,9806
ENST00000446148150,893,804–150,904,9837
ENST00001132855150,893,804–150,904,9876
ENST00000427179150,894,399–150,904,9875
ENST00000981280150,894,399–150,904,9875
ENST00001096827150,894,399–150,904,9875

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF300 的功能註解指出其具有轉錄抑制活性,亦即能抑制轉錄。現有資料僅提供這項功能描述,未進一步說明其作用的特定基因、轉錄調控步驟或抑制效應如何形成,因此不宜據此推定更細的分子機制或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 150904980 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF300 ENST00000274599 GRCh38 chr5:150904880-150905980 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTTCTGAATACATTGTCTTCTTATCTAAGTGCATTTGTTTTGACATGAGAAATAAATTGCTAAATGTAA
AATTGCTGCCTATTTCATAACATATCAAAAAGCATGACTCGTGTGAAAATTATGATTCAAAATTGTATTC
ATTTATACAAATGAAACATTGGTCTGTGAACATGCATTTTGCTTTTTTAAAGCTTGATGTAAGGTCTAAG
GGTTAAGATAACAATTTTAGTATTCTCTTTGGCTGGTTCATTTTTAAAAAATCATGTTGTTGTTGTTGTT
TCTGAAATCTAACCTTCTCAGTCTCTCCCTTATGTCTGTTCCAATTTTCAAGTCTCTTTTCTGTCTCAAT
CTGTCTGTCTACCACGCTCTACCCCTTAGATCCCCACTTCTATTCCTATGTCTATTTTTTTCTCTTCAGT
CTCCCGTCTCTCCTCCTTTCTAGGCTGGCTCCTTTGTCCCCATTTCCCCCATTTTCTCTCTGATTCTCTG
CTTCTCACTTCCCTCTCTTTGTGCCTCAGTCTCCTCTTCCCTGCTCTTAATTTCCCTTTTTCCTTCAGTC
GACCTCTTATTACTTATTACTGCAATATCAAATTCCCTTATAAGGATTCCTTACCGTTGTTATTGGCATA
ATTACAGTACACAATGATTGTTCAGCCCCCAGATTTTGTCCCTCTCTCCCACAGTGAAATCTCCCTGGAG
AGGACCGCACCATTCCACGCTTCCCCTCTGAGCAGTCGAATCTCCCGGCATGGGGCTGTACCATTCACAA
ACACGTCCATGGTACCATCTAAAATTCCTCCCCTTTCGTCAGAAGCATGCTTCCAATAGAGGAAGGTTCA
CTCCAACTTCCTCTTCAATCCCCCTTGTAAAATCTTTCTGCAAAAGTGTGCTCCTTAATGCTCCTTTCGC
AGGCCTCCTTTCCGTCGCCTTCCCCTCCCTTCGCTGCCGCTGTGGTACAGCCCATTCTCGGGCTCAGCAC
TGGGCGAATCCTCCGCTAGTACGAAGACGACCGGGCTCTCAAGATGGCGGCCCCATGCGGAAACAGCTCC
AGGGAGCAGCCATGTTGCTTCCTGAACAAAGCCTCTGAAGATGCGGAACGG
ZNF300 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF300_2 ↗5:150,904,867負股150,904,857–150,904,916
ZNF300_1 ↗5:150,904,978負股150,904,968–150,905,027

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_947W7H · enhancer · 150904269–150904778 · regulatory

ENSR5_947W7M · promoter · 150904779–150905275 · regulatory

ENSR5_947W7Q · enhancer · 150905276–150905563 · regulatory

· motif · 150904813–150904822 · motif

· motif · 150904936–150904947 · motif

· motif · 150904949–150904959 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:604 aa

1 aa604 aa結構域功能區域鋅指
依 Q96RE9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 300 長 604 個胺基酸。其 N 端含 KRAB domain(第 8–79 位),第 203–234 位為註記的無序區域;第 269–599 位分布著 12 個 C2H2-type zinc finger。這些結構區域的註記提供蛋白質組成資訊,但來源未描述各區段的個別作用。

結構域KRAB8–79 aa
鋅指C2H2-type 1269–291 aa
鋅指C2H2-type 2297–319 aa
鋅指C2H2-type 3325–347 aa
鋅指C2H2-type 4353–375 aa
鋅指C2H2-type 5381–403 aa
鋅指C2H2-type 6409–431 aa
鋅指C2H2-type 7437–459 aa
鋅指C2H2-type 8465–487 aa
鋅指C2H2-type 9493–515 aa
鋅指C2H2-type 10521–543 aa
鋅指C2H2-type 11549–571 aa
鋅指C2H2-type 12577–599 aa
功能區域Disordered203–234 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96RE9…

AlphaFold · Q96RE9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 300 定位於細胞核。 資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF300ZNF300ALX1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF300 透過 KRAB domain 與 TRIM28 互作;相對地,TRIM28 的 RBCC domain 參與此互作。此註記支持兩者存在結構域介導的互作,但未說明是否屬於特定複合體,也未提供其他功能關係細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF300 具有轉錄抑制活性;此註記指出其能抑制轉錄,但未交代受影響的特定基因、作用步驟或抑制所造成的下游結果。含實驗來源
證據與來源

Has a transcriptional repressor activity

PMID 14746915 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF300 透過 KRAB domain 與 TRIM28 互作,TRIM28 則透過 RBCC domain 參與此互作。此資料描述的是結構域介導的互作,未進一步說明互作形成的複合體或功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via the KRAB domain) with TRIM28 (via the RBCC domain)

PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF300 的細胞內定位為細胞核;此項註記未提供定位變化條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 14746915 ↗ · PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000274599 · 3,258 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACGAAGACGACCGGGCTCTCAAGATGGCGGCCCCATGCGG40
41AAACAGCTCCAGGGAGCAGCCATGTTGCTTCCTGAACAAA80
81GCCTCTGAAGATGCGGAACGGGCAAAACCGCCCAGTACGG120
121AACGGCGCAGCCTCGGGAGCCCGGTGTGGTGCTCGCGGAC160
161AGGAAGCAGGAGAGTTTGCCAATAGGGATGTGACAGCGGT200
201TCCCATTAAGCGGTGATGGTGGTTTTGGGACCTGATAATC240
241GAGCTGGGAGTCAGAGGCGGGATGTGTGCGGTGAAGGATG280
281TTTTGATACCCCCATATAAAATAATCTGTCTGTCATGGGA320
321GCCCCCACGTCCTCTGAAATAGTTCAGCTCTGTCTGCATG360
361ACTTGTCCTGGGACTGAGGAAAATTTACCAGTCATCTGGC400
401CTTTTGGAAGAGCAAAAAATGATGAAGTCCCAGGGGTTAG440
441TATCATTCAAGGATGTGGCTGTGGATTTCACCCAGGAGGA480
481GTGGCAGCAACTTGACCCTTCTCAGAGGACCCTGTACAGG520
521GATGTGATGCTGGAGAACTACAGCCACCTGGTCTCAATGG560
561GGTATCCAGTTTCCAAACCAGATGTCATCTCCAAGTTGGA600
601ACAAGGAGAAGAGCCATGGATCATAAAGGGAGACATATCA640
641AATTGGATCTATCCAGATGAATATCAGGCAGATGGGAGAC680
681AAGACAGGAAGAGTAACCTTCACAACTCCCAGTCATGTAT720
721TTTGGGGACAGTTTCCTTCCATCATAAGATACTGAAAGGA760
761GTCACAAGGGATGGTTCATTGTGCTCCATTTTAAAAGTCT800
801GTCAAGGTGATGGTCAGCTGCAGAGATTTCTAGAGAATCA840
841AGACAAACTCTTCAGGCAGGTCACATTTGTTAACAGCAAA880
881ACAGTGACTGAGGCATCAGGGCATAAATATAATCCACTGG920
921GGAAAATATTTCAAGAGTGCATAGAAACAGATATATCAAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。