演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF30KOX28

zinc finger protein 30

ZNF30(zinc finger protein 30)是人類蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.13UniProt P17039
OFFICIAL SYMBOL
ZNF30
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17039
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF30(zinc finger protein 30)是人類的蛋白質編碼基因,其蛋白質屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質全長為 623 個胺基酸,結構包含 N 端 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指區域;其中部分鋅指區域被標註為退化型。這些家族與結構特徵界定了 ZNF30 蛋白質的基本分子類別。

Official symbol
ZNF30
Gene name
zinc finger protein 30
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13090
UniProt
P17039
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX28DKFZp686N19164FLJ20562

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.13
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF30pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:34,926,887–34,945,172
Gene span
18,286 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000601142 ★34,926,903–34,945,1685
ENST0000095711034,926,887–34,945,1724
ENST0000030358634,926,903–34,945,1725
ENST0000043978534,926,903–34,945,1725
ENST0000060195734,926,903–34,945,1686
ENST0000089191334,926,903–34,945,1725
ENST0000089191434,926,903–34,945,1725
ENST0000093230734,926,903–34,945,1725
ENST0000114178534,926,903–34,945,1725
ENST0000060154034,926,910–34,933,7234
ENST0000093230634,926,966–34,945,1725
ENST0000095711134,927,137–34,945,1725

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF30 蛋白質可能參與轉錄調控。現有資料僅支持這項概括性功能描述,未進一步指出其調控方向、作用標的或具體分子機制,因此不宜推定它會促進或抑制特定基因的轉錄。

轉錄調控涉及基因表現的控制,但目前提供的 ZNF30 資料沒有說明它在何種細胞或生物學條件下發揮作用,也沒有描述其所影響的基因或轉錄程序。KRAB 區域與 C2H2 型鋅指區域是其蛋白質結構特徵,但來源未交代這些區域在 ZNF30 中的實際功能,故不能據此補述其 DNA 辨識、調控複合體或其他作用方式。

因此,現階段可將 ZNF30 的功能理解為可能與轉錄調控相關;其具體調控對象、分子過程及生物學結果仍未由所提供的資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 34926903 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF30 ENST00000601142 GRCh38 chr19:34925903-34927003 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCTCACCCTGTCATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGTGGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCGAG
ACTAGCCTGGGCAAGATGGCAAAACCCCATTTCTACAAAAAATATACAAAAATTAGCCAGGTGTAGTGGC
GCGCCCCTGTAGTCTCAGCTACTCTGGAGGCCGAGGTGGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTT
ACAGTAAGCCGAGATAGCGCCACTGCATTCCAGTCTGAGCGACAGAGGGAGACCCTGTCTCAAAACAAAA
CAAAAACAAAACAAACAAAAAGCGGAGCTGACAGTCAAGGTGAATTTCACGTTTGCCTGTATTCAGTTTT
AGCATTACATAAACCAAAAGAAGAATGCCATAAAGGCTACAGGCAGCTAATACAGAGAGGTGTTACTGGA
AAAGGAACCAGAAAGAGTAAATATCTCCTAAACGTATGATGGGACAGAAAGATAAATGCCTATTACATAT
AGTTAATATCTGTTTGATTAGCCTTATTTACATTCTCCTTTTAAAAGGTCTTACATTTAGCATCTTAGAT
AGAACCCACAAAATTTAAATATTTAATAGAAACTTAAAATTCCTGTATCAGAGGACAGAAATATATTTTT
CTCACACGTGATTAGTCTAATTGCCACTATTAATCCTATTAATATTCTGTTAAATAATAGCATTTCTGTA
GCGAAAAGCAAACAGTACGGAAAGATAATTTCAAACACCTAGTTTTCATATTTTTGTGTTAAAGTAATAA
CATATTTTGGTATAGATTATCATTTTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGCTTTTTCTGACCTGGTGTGTTAATG
CCCTGGGTTGGCCCTCTAAGAAGCTGGCCACCTACTTCGGGCCTCAGGTGTCAGACGCCCCAGCTTCGAG
GTCTATGGCTCCCAGCAACTCGAGCGCCTGCGCCTGCGCATTCTCAGCCGGACGGGAGCGCCCAGAAGTC
TCCGGGCGCCGGTGGGCGGCCTTGTGGACTGCGCCGGGCATGCTCGGCGGTGTGACGGCTCAGGACTGCA
TTTCCCAGAGGCTGCAGCTATCCGGCCAATGTAGCCTGAAACTACATTTCT
ZNF30 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF30_1 ↗19:34,926,906正股34,926,857–34,926,916

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_832PL7 · enhancer · 34926612–34926815 · regulatory

ENSR19_832PLB · promoter · 34926816–34926990 · regulatory

ENSR19_9HTB9 · enhancer · 34926991–34927494 · regulatory

· motif · 34926835–34926846 · motif

· motif · 34926835–34926846 · motif

· motif · 34926841–34926852 · motif

· motif · 34926841–34926852 · motif

· motif · 34926917–34926928 · motif

· motif · 34927051–34927066 · motif

· motif · 34927070–34927084 · motif

· motif · 34927320–34927333 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:623 aa

1 aa623 aa結構域鋅指
依 P17039 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF30 蛋白質長 623 個胺基酸,含有位於第 14–85 位的 KRAB 區域,以及 18 個依序排列的 C2H2 型鋅指區域。第 1 與第 3 個鋅指被標註為退化型,其餘為 C2H2 型;這些區域的註解依序延伸至第 618 位。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate120–142 aa
鋅指C2H2-type 2148–170 aa
鋅指C2H2-type 3; degenerate176–198 aa
鋅指C2H2-type 4204–226 aa
鋅指C2H2-type 5232–254 aa
鋅指C2H2-type 6260–282 aa
鋅指C2H2-type 7288–310 aa
鋅指C2H2-type 8316–338 aa
鋅指C2H2-type 9344–366 aa
鋅指C2H2-type 10372–394 aa
鋅指C2H2-type 11400–422 aa
鋅指C2H2-type 12428–450 aa
鋅指C2H2-type 13456–478 aa
鋅指C2H2-type 14484–506 aa
鋅指C2H2-type 15512–534 aa
鋅指C2H2-type 16540–562 aa
鋅指C2H2-type 17568–590 aa
鋅指C2H2-type 18596–618 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17039…

AlphaFold · P17039

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

現有資料未提供定位隨條件變化或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX28ZNF30
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF30 蛋白質可能參與轉錄調控;此描述保留可能性的限定,未進一步指出調控的方向、作用標的或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF30 蛋白質位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000601142 · 2,580 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTGTGGACTGCGCCGGGCATGCTCGGCGGTGTGACGGCT40
41CAGGACTGCATTTCCCAGAGGCTGCAGCTATCCGGCCAAT80
81GTAGCCTGAAACTACATTTCTCAGCGGCCACTGGAACGAC120
121CTCAATCTCTGCCTCCTCGCCAGTTCATTGTGGTCGTTGA160
161CCCGGCAGCGAGCTTTGGAGTTCATCGAGGGAGAAGTCAG200
201CGCCCAGCTCCGAGGTTGGAGCAGCCCCGCCGGGCAACTT240
241GAATTTCTGCAAACGAACACAGCACCGGGAGCTCTGCAGA280
281CCTGTGTCGGCGCGGAACCCGGACTGAGACATGCCTTTTG320
321AACTTCTCAGATAGAGGAACCCCAGTGAAGACTGATCAGT360
361TCTTACAATTCTCAAAGCATGGCCCATAAATATGTGGGTT400
401TGCAGTATCACGGATCAGTGACATTTGAGGATGTGGCCAT440
441AGCCTTCTCCCAGCAGGAGTGGGAGAGTCTGGACTCTTCC480
481CAGAGGGGCTTGTACAGAGATGTGATGTTGGAGAACTACA520
521GGAACTTGGTGTCAATGGGACATTCCCGTTCTAAACCACA560
561TGTGATCGCCTTATTGGAACAATGGAAAGAGCCTGAAGTG600
601ACAGTGAGGAAAGATGGAAGAAGATGGTGCACAGATTTGC640
641AGTTGGAAGATGATACAATCGGCTGTAAAGAAATGCCCAC680
681CTCTGAAAACTGTCCATCTTTTGCTCTACATCAGAAAATA720
721AGTAGACAGAAACCACGTGAATGTCAGGAATATGGAAAGA760
761CCCTTTGTCAAGACTCAAAGCCTGTTCAACATGAAAGAAT800
801ACATAGTAGTGAAAAACCCAACAGATGTAAAGAATGTGGG840
841AAGAACTTTAGTAATGGACATCAACTCACCATACATCAGA880
881GATTGCATGTTGGTGAGAAACCCTATAAATATGAAAAATG920
921TGGGAAGGCCTTTATCAGTGGCTCAGCCTTTGTTAAGCAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。