演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF287ZKSCAN13

zinc finger protein 287

ZNF287 是人類的蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控,並具有多種鋅指結構。

Homo sapiens17p11.2UniProt Q9HBT7
OFFICIAL SYMBOL
ZNF287
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9HBT7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF287(zinc finger protein 287)是位於人類第 17 號染色體 17p11.2 的蛋白質編碼基因,產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 761 個胺基酸,具有 SCAN box、KRAB 結構域及一串 C2H2-type zinc finger 結構,另有一段被註記為無序區域。這些結構特徵界定了它的蛋白質類型;目前提供的功能資料僅指出其可能參與轉錄調控,未詳述具體作用方式。

Official symbol
ZNF287
Gene name
zinc finger protein 287
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13502
UniProt
Q9HBT7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZKSCAN13ZSCAN45

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p11.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegZNF287pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:16,546,954–16,569,218
Gene span
22,265 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000395825 ★16,546,954–16,569,2046
ENST0000039582416,546,954–16,569,1696
ENST0000090789016,546,954–16,569,2185
ENST0000090789116,546,954–16,569,2186
ENST0000090789216,546,954–16,569,2046
ENST0000090789316,546,954–16,569,2185
ENST0000044834916,567,560–16,569,1983

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有功能註解指出,ZNF287 可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,表示其參與轉錄調控的角色尚不能寫成已確立的功能;來源也未說明它在何種細胞或生物條件下發揮作用。

轉錄調控涉及基因轉錄活動的調整,但目前資料未指出 ZNF287 是促進或抑制轉錄,也沒有提供它作用於特定基因、DNA 序列或轉錄機制的證據。因此,不能據此推定其調控方向、目標或分子步驟。

來源亦未提供實驗系統、基因或蛋白質擾動方式及相應讀出,故無法進一步判定其功能在不同生物過程中的意義。就目前可支持的範圍而言,ZNF287 僅可描述為可能參與轉錄調控的蛋白質;更具體的調控作用仍未由所提供資料界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 16569204 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF287 ENST00000395825 GRCh38 chr17:16569104-16570204 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCCTTTATGCTGGAGAGACCACATTGAGGCACTCTGGTCAAACACAAGCCGAGTTCATCTTTTAGCCCAT
CTCCTCCCAAGCAGTAGACATGTGAGTGGAAAAGCCATCTTGGAAGCGGGCCCTCCCAGCCATCAAATCA
TCCCAACAGAGGCTACAGACATAATGAGGCAAAGGCCCACCCACTCAGTTCCCCTTTCAAATTCCTCACC
ATGAAATTTATGAGCATAATACGGTGATTGTCCTTCAAAACCACTAAGTTTTGGGGTGGTTTGTTAATAG
AACAGTAGATAACGGGAACACCTTGAATATGTTTTTCTATGCTTTTATTTTTCCAGTGTTTTATGTATTT
TTGTTTTGTGTCTCTTAGAAATAACAGCTACTCGGGAGGCTGAACCCAGGAAGTTCAAGTGAGAATCACT
TGAACACAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGCTCGCACCATTGCACTC
CAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAGAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAGAACATGGGTTTTT
TTCCCCCAATCTGAGAGTCTCAGAATCAAATTCCTGAGGAGGAAGTGAAAACCTTTCACAGTTAGTATGT
ATGCACAGTAAAGCCCGAAACCGCACATTAAGTCTTTCTGCCTTTAGACCCACATCTTCCCTGCCCATTC
TTCCTCTAGGAAATCTGGCGCCCAGTTTTCTCTGCGTAGTTGGCGCGGGGCTTCAACTCCCGGCGCTCCT
CCAGCTACTGGCACCTCCCTGGCCTCCAAGACGTCTACCAGACCTGCGTCTGCCCGGGGAAACTTTGAAG
TTCCCTTCGGAACCTCGCAGGCTGACAAGCAAGTCAGAGCGATGGGTGGAGGAGGTTGCCATGGAGACAG
GTCCAGGGCCAGAGGCGCGGGAGGGGGAGGCGGCAGCTTGGGCTCCGATTGGCTCTGCGGGCGCGCAGCG
TTCCTCTGGCGCACATGCGCAGTGACGCCGAGGCGAGGTCGCGGCTAAGCAGAGGCGCCGGGGTTTCTGG
GCCGGGCTTCTCAGGACCGGGCTGGAACGTGCAGCTCCTGGCCGGGACACT
ZNF287 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF287_1 ↗17:16,569,204負股16,569,194–16,569,253

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B59R4 · enhancer · 16568454–16569158 · regulatory

ENSR17_98KKD · promoter · 16569159–16569639 · regulatory

· motif · 16568856–16568871 · motif

· motif · 16569007–16569017 · motif

· motif · 16569026–16569037 · motif

· motif · 16569026–16569037 · motif

· motif · 16569088–16569103 · motif

· motif · 16569204–16569215 · motif

· motif · 16569204–16569215 · motif

· motif · 16569549–16569557 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:761 aa

1 aa761 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9HBT7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF287 蛋白質長 761 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解包括位於第 49–131 個胺基酸的 SCAN box、第 170–238 個胺基酸的 KRAB,以及第 368–754 個胺基酸間連續排列的 14 個 C2H2-type zinc finger。第 134–154 個胺基酸另標示為無序區域。

結構域SCAN box49–131 aa
結構域KRAB170–238 aa
鋅指C2H2-type 1368–390 aa
鋅指C2H2-type 2396–418 aa
鋅指C2H2-type 3424–446 aa
鋅指C2H2-type 4452–474 aa
鋅指C2H2-type 5480–502 aa
鋅指C2H2-type 6508–530 aa
鋅指C2H2-type 7536–558 aa
鋅指C2H2-type 8564–586 aa
鋅指C2H2-type 9592–614 aa
鋅指C2H2-type 10620–642 aa
鋅指C2H2-type 11648–670 aa
鋅指C2H2-type 12676–698 aa
鋅指C2H2-type 13704–726 aa
鋅指C2H2-type 14732–754 aa
功能區域Disordered134–154 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9HBT7…

AlphaFold · Q9HBT7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF287 的定位註記為細胞核。 資料未說明定位是否會隨細胞狀態改變,也未提供異構型之間的定位差異或動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZKSCAN13ZNF287
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF287 可能參與轉錄調控;此註記保留可能性,未指出其調控方向、作用標的或具體分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF287 的定位註記為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000395825 · 7,639 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGACGCCGAGGCGAGGTCGCGGCTAAGCAGAGGCGCCG40
41GGGTTTCTGGGCCGGGCTTCTCAGGACCGGGCTGGAACGT80
81GCAGCTCCTGGCCGGGACACTCTGTGCTTTGCGGGGAAGG120
121GAAGTGGCGGAGCCCGAGGATCCGCTGCCGCTCGGGACTG160
161AGCCCGCCACGCAGGCGCCTGTGCCAGCGTCGCCATTGTT200
201GCCTGTGGCCTTAGGGCCGCTCCGGCTGCCCGTCGGCCGG240
241GTCCCAGCGACAGGGTCTCTTATCCATCCCTGCAAGTTCT280
281GGGCTCAGAATTTGTCACTAAGGCTGCTAACTCTACCTTG320
321ATTCTGTTCTGCCCTCGGCTGCAGCAGCCTTTGATATAGT360
361GTCCTTGTGACTCTAGCATGAGACTTCAAGCAGTTGGCTC400
401ACTACTGGAGAAATAAAGGATATTGCCAGATTGACTCTCC440
441TGTCTGTAGCAATGTTAGCCTCAAGCAAGAGGATGAACAG480
481TTCTTCACGTTCTCAAATCCTTCTAAGGTGGAAGTCAGAC520
521AAGGCTCAGAGTGGACCCTACAATGTTGAGAAGGAAATCC560
561TTACTTCAAGATTCTTGCGTGACACTGAGACCTGTCGACA600
601GAATTTTAGGAATTTTCCATACCCAGACCTGGCTGGTCCT640
641CGAAAGGCATTGAGTCAACTCCGAGAGCTCTGCCTTAAGT680
681GGCTGAGACCTGAGATTCACTCAAAGGAACAAATTTTGGA720
721GCTGCTGGTGCTGGAGCAATTCCTGACCATCCTGCCTGGT760
761GAGGTTAGGACTTGGGTAAAGTCCCAGTATCCAGAGAGCA800
801GCGAGGAAGCAGTGACTCTGGTGGAGGATTTGACTCAGAT840
841TCTAGAAGAGGAAGCTCCTCAAAACTCTACCCTTTCCCAA880
881GATACCCCAGAGGAAGACCCCAGAGGAAAACATGCTTTCC920
921AGACAGGATGGCTAAATGACTTGGTGACCAAAGAATCGAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。