基因總覽
ZNF286A 的正式名稱為 zinc finger protein 286A,屬於蛋白質編碼基因。其產物歸入 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,蛋白質全長為 521 個胺基酸。序列中包含一個 KRAB 結構域及十個 C2H2 型鋅指,並有兩段被註記為無序區域。這些資訊勾勒出其家族歸屬與主要序列特徵;現有功能註記則指出,該蛋白可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000583566 ★ | 15,699,752–15,720,787 | 6 |
| ENST00000421016 | 15,699,577–15,720,787 | 6 |
| ENST00000593105 | 15,699,577–15,720,787 | 5 |
| ENST00000472486 | 15,699,577–15,716,490 | 5 |
| ENST00000581529 | 15,699,577–15,716,398 | 4 |
| ENST00001124121 | 15,699,707–15,709,812 | 6 |
| ENST00001124122 | 15,699,717–15,709,816 | 6 |
| ENST00000580259 | 15,699,719–15,716,112 | 5 |
| ENST00001062701 | 15,699,730–15,710,287 | 6 |
| ENST00000395894 | 15,699,739–15,720,787 | 6 |
| ENST00000579694 | 15,699,740–15,716,417 | 4 |
| ENST00001130941 | 15,699,740–15,706,791 | 4 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註記指出,ZNF286A 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與調節轉錄的過程有關,但來源沒有說明它如何影響轉錄,也沒有指出受調控的基因、分子作用步驟或作用方向,因此不宜進一步推定其會促進或抑制特定轉錄活動。
來源亦未提供實驗系統、特定細胞或生物學條件,也沒有描述可用來判定其轉錄調控作用的讀出結果。因而目前能支持的功能性結論限於「可能參與轉錄調控」;更細緻的分子機制與生物學意義尚無法由這項資料判定。
Promoter 與基因調控
>ZNF286A ENST00000583566 GRCh38 chr17:15698752-15699852 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGTTTTAGAAAGAGCACTAGCCAGAAAGTGTGGAGAACAGATTGGTGGTAGAGAAAACCTTAGTTAGGG AATCCAGTTACCAGGCTGCAACGGCAATCCTAGTGAAATGGTGGTGGCCCCAACTAAGGTAATGCTACTG AGAATAGAGAAAGATGGAAACAATTGAGTTATTTAAGATACAATGAATAGGACTTGGTGATAAATAGATG GTGAGATCAAAGAGTTAAGAATATTCAGGCTCTGGTTTGTGCAAATGAGTGAGTGGGCAGTAATGTCATT CACTGAGAAAAGGAGGGCAGTCTAGACACGAAGCTGGAGGTGGATGGGTTAGTCCTCTAACAGAATTGGA GAGACTGAATAACTCTCCCTTGAAAGAACCACCTTTTATGATATGTTTAAACTAATGCTTATGTCTGCAA AGAACCTATTGCTTAAATTTGTTACAACAGGTTCAATCTTTTCAACTCATTTTAAATACATGAATTTTAG GATTACAAGTAGTCTGTGGATACAGGAACATCTGACTGAGTGTACAAAGAGGGACCTGCTCTTCCTAAAA ACATCCTTCGTATGTTTTGAAAGCAAAAGGATGAGTTCTGGGCGCACAAAATATGGATAAAAGCTATGTA TTTTAACGTATCTTACACCGGAGTAATTTGGGTTGAACTCAGCAGCCCTAAGCACTGTGCCGCAGGAACT TGTGCAGACAAAGCGCGGGGACGGACCCTGACTCCGGTCCGCGTCTCCGCTGCTCCCTCCCTCCCTTGCT CTGAGGATTAGACACAGGAGATGCTGCCTCATACTCTCGCGAGACGGACGGAGCTCTTCGATCGTCCGAT TCTCCCAGCCGCACCACGGGTGCTCCCACCTGCGGAGAACCGGAGTCTGGCGATGCCAAGGCGCTTCTGG GAATTGTAGTTCCGGGCGGGATGAGGGCAGCACGCCTGGCTCCGCTCCTTCTTACGCATGCGCGACTCCG AGCTGGCCAAAGAAGTTCGTCCCCTTTGTGAGGCCCGGGATGGGAGGTGAGTTGCTTGTGGTGATGTCGC TCGTCTCGGCTCGGCCTCGGCGGTGGTTCCCCGGGTCGTTCTGTGCCGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF286A_1 ↗ | 17:15,699,752 | 正股 | 15,699,703–15,699,762 |
| ZNF286A_2 ↗ | 17:15,707,848 | 正股 | 15,707,799–15,707,858 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_C3K3N · promoter · 15699087–15700143 · regulatory
ENSR17_B555G · enhancer · 15700144–15700761 · regulatory
· motif · 15699616–15699625 · motif
· motif · 15699668–15699677 · motif
· motif · 15699714–15699725 · motif
· motif · 15699714–15699725 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:521 aa
ZNF286A 蛋白長 521 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列含有位於第 45–111 位的 KRAB 結構域,以及第 243–516 位間排列的十個 C2H2 型鋅指。另有兩段序列被註記為無序區域,分別位於第 1–31 位與第 91–126 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF286A 的定位註記為細胞核。 資料未提供不同條件下的定位變化或異構型差異,也沒有描述定位動態。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXB5P09067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNPS1Q15287 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRRM4A7MD48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSPYL2Q9H2G4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF587Q96SQ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF792Q3KQV3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCCCTTTGTGAGGCCCGGGATGGGAGGCTCCAGCGCCGTA40GGACTGAGGCAGACTCCACGGTGAGAAAGAGACCCGATCT80AACCCAGGCCTTTCATCAGAGCCCAGGAGGGAAGGCAGGA120AGTGGGACCACGAGGCCCGGGGGGCTTCTAACTCGTCTGG160CCAGGGAGATCTGAATTGGGGTGAAGAGCAGAATCTCCAG200AACAAGGAGGAGGTGGTGATCATGGAGACAGATTTGGCTG240AAATGCCTGAGAAAGGAGCTCTGTCTTCCCAGGATTCTCC280CCATTTCCAAGAGAAGAGCACAGAAGAGGGAGAAGTGGCT320GCTCTGCGCCTCACGGCCAGATCCCAGGAAACAGTGACAT360TCAAGGATGTGGCCATGGACTTTACACCAGAGGAGTGGGG400GAAGCTGGATCCTGCACAAAGGGATGTGATGCTGGAGAAC440TATAGGAACCTAGTCTCACTTTGGCTTCCAGTTTCCAAAC480CTGAGAGCTACAACTTGGAGAATGGAAAAGAACCATTGAA520GCTTGAGAGAAAAGCCCCCAAAAGCAGCTATTCAGACATG560GAGACTAGACCACAGAGCAAGGATTCAACTTCAGTGCAAG600ATTTTTCCAAAGCAGAATCATGCAAAGTTGCAATAATAGA640CAGACTGACACGGAATAGTGTCTATGACTCTAACTTGGAA680GCAGCCCTTGAATGTGAAAATTGGTTAGAGAATCAGCAAG720GAAATCAGGAGAGACATTTGAGAGAAATGTTCACTCACAT760GAATTCACTCTCTGAGGAAACAGACCATAAGCATGATGTA800TACTGGAAAAGCTTCAATCAGAAATCTGTCCTTATCACTG840AAGACAGAGTTCCCAAAGGATCTTATGCCTTCCATACACT880TGAAAAAAGCTTGAAACAAAAATCAAACTTAATGAAAAAG920CAGAGAACTTATAAAGAGAAAAAACCTCATAAATGTAATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。