基因總覽
ZNF285 的正式名稱為 zinc finger protein 285,屬於蛋白質編碼基因。其產物歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,具有 KRAB 結構域及多個 C2H2-type zinc finger 區域。現有資料指出它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000614994 ★ | 44,382,298–44,401,608 | 4 |
| ENST00000544719 | 44,382,298–44,401,576 | 4 |
| ENST00000591679 | 44,382,298–44,401,624 | 5 |
| ENST00000911249 | 44,382,298–44,401,586 | 5 |
| ENST00000911250 | 44,382,298–44,401,586 | 4 |
| ENST00000911251 | 44,382,298–44,401,414 | 4 |
| ENST00000965651 | 44,382,298–44,401,624 | 5 |
| ENST00000977368 | 44,382,298–44,401,624 | 4 |
| ENST00001014583 | 44,382,298–44,401,624 | 4 |
| ENST00001014584 | 44,382,298–44,401,624 | 5 |
| ENST00001096433 | 44,382,298–44,401,624 | 4 |
| ENST00001096435 | 44,382,298–44,401,586 | 3 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料僅指出 ZNF285 可能參與轉錄調控,尚未說明它如何影響轉錄,也未指出受調控的基因、分子作用步驟或相關生物學過程。因此,這項功能描述應視為可能性,而非已確立的具體機制;目前也無從據此判定其作用方向或生物學後果。
Promoter 與基因調控
>ZNF285 ENST00000614994 GRCh38 chr19:44401508-44402608 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACAATTGCACTGTCCCTTTATGTGCCCTAAGCTGCGATGTCAAGCTATAGTTGGATATTATTCAACCAT TTCCTGCCCATTGCGTAGAGGTGGGGGTCTTCACTTCTCTATCTAGTCTAGGACTGGAACCGCCTCACCA CCCCTACAGCTTGAGGGTGCGTGGAAAAGGGAATGCCAGCCAGATATTCCAAACAGAGACTCTGCCAGCA GGACCAGGTGACCTTTCCTAGGAGACAGATTGTTCTCACACGTTATCAGGGCTTTCCTCCAGGCTAAAAC TGTGGGCCTCTAATGGAATTCCTATTCAATTTTCTTACCCCATTTAGGGTACCCAAATTTTTCTTTAATA GAAATCTTAAATCTTAAATGCAATAACATGAAGTAAAATAAAGCCTAAGTCTCAACAAGGGCAAATTTTC AAAAAGAATCTGAAAACTTCCCGCGTTTTCTTGTTATGTTGTAATGTGTCTCTTTTAGGACACTCTCAGT ACTCCTGCAATTCCCCTGTTAAGGATTCAGACAATAGTTGTTAATTCCTTCTGCTTCTTCTGAGACTAGG AAATAAATTACAGGGCTATGTTATATCGCAAGTGTAGATTATCCAGAGTTTTCATCAACAGAAATAAAAC ATGGTGGGGGGCGGGGAGGGAATTATTTAAGTGAGTGTTAATTGAAAAGTTTCGTGGTTTTAACGTTAAA AGACATGCCTATAAAATAAGAACTTATAAAAGTCTTCACTAAAACGGTAAAGTGCCCATTTCCAAGTAGT AAAATATTGAAACTTCTTTTCATCGTTGATAGTGATTTATTTAACATTTCATTATTTTATCGTTATTATG ATTGTCGTTATTTTAGACGAATGCACGGAAGTCAAAGGACTTCCAAATGCACGGAAGTCAAAGGCCACCT TCACCAGGGTAGCCTTGCGAATGGCCACTGCTGCGCGCGGGGCTTTCTGGGGATTGTAGGCCATAGGCCT CCTTGCGCATGCGCCATGGTACTGGACGCACGCTGCGGGCGACATTGTTTGGGACGCTGGGGTGAGTCCC GTCTGTACCGCGCCCCTCTTGGAGGCGTAGCCAGGAGTAGGAGTGTAGGAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF285_2 ↗ | 19:44,401,608 | 負股 | 44,401,598–44,401,657 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BBRWR · enhancer · 44400908–44401564 · regulatory
ENSR19_9MLSP · promoter · 44401565–44401934 · regulatory
· motif · 44397111–44397122 · motif
· motif · 44401614–44401625 · motif
· motif · 44401614–44401625 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:590 aa
ZNF285 蛋白質長 590 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端含 KRAB 結構域(第 8–86 位),另有 11 個 C2H2-type zinc finger 區域;其中第 2 個被註記為退化型,其餘 10 個列為 C2H2-type。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF285 的定位資料將其列於細胞核;目前來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTGGACGCACGCTGCGGGCGACATTGTTTGGGACGCTGG40GTTCTGCTTTTCCAGAATCCTGCCCTTTCCAAAAGGAAGA80CGGTATGATTAAGTTCCAGGAAAGGGTGACATTCAAGGAT120GTGGCTGTTGTCTTCACCAAGGAAGAGCTGGCACTATTGG160ATAAAGCCCAGATAAACCTGTACCAAGATGTGATGCTGGA200AAACTTCAGGAACCTCATGTTAGTGAGAGACGGGATTAAA240AACAACATTTTGAATCTTCAGGCAAAGGGGTTAAGTTACC280TTTCGCAAGAAGTGCTTCATTGCTGGCAGATTTGGAAACA320AAGGATCCGGGATTTAACTGTGAGTCAGGATTATATCGTG360AACCTTCAAGAAGAGTGTTCCCCACATTTAGAAGATGTTT400CCCTCAGTGAAGAGTGGGCAGGCATTTCTCTTCAGATTTC440TGAAAATGAAAACTATGTAGTAAATGCCATTATCAAAAAT480CAAGATATCACAGCATGGCAAAGCCTGACACAGGTTCTTA520CCCCAGAATCGTGGAGGAAAGCCAACATAATGACCGAGCC560CCAGAACTCTCAGGGAAGATATAAGGGAATTTACATGGAA600GAGAAATTGTACAGACGTGCTCAGCATGATGACAGCCTCA640GTTGGACCTCATGTGATCATCATGAGTCCCAAGAATGTAA680AGGAGAGGACCCTGGTAGACATCCCAGCTGTGGGAAAAAC720TTGGGTATGAAATCAACGGTTGAAAAACGTAATGCGGCCC760ATGTATTACCACAGCCTTTCCCATGTAATAACTGTGGGGT800GGCCTTTGCAGATGATACAGATCCTCATGTCCATCACAGC840ACTCACCTAGGAGAAAAATCTTATAAATGTGACCAGTATG880GAAAGAACTTTAGTCAGAGCCAAGATCTTATCGTTCATTG920TAAAACTCACTCTGGCAAGACTCCCTATGAATTCCACGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。