演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF284DKFZp781F1775

zinc finger protein 284

ZNF284 編碼 zinc finger protein 284,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family;其可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q2VY69
OFFICIAL SYMBOL
ZNF284
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q2VY69
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF284 是蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 284 屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 593 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指區域;部分鋅指區域被註記為退化型。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或作用機制。

Official symbol
ZNF284
Gene name
zinc finger protein 284
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13078
UniProt
Q2VY69
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DKFZp781F1775

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF284pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:44,072,138–44,089,613
Gene span
17,476 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000421176 ★44,072,159–44,089,6135
ENST0000092928144,072,138–44,089,6135
ENST0000092928244,072,144–44,089,6136
ENST0000114004444,072,144–44,089,6135
ENST0000092928344,072,151–44,089,6135
ENST0000092928444,072,161–44,089,6135
ENST0000085166244,072,435–44,089,6135
ENST0000085166344,074,020–44,089,6134

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,zinc finger protein 284 可能參與轉錄調控。這項描述保留「可能」的限定,來源並未說明其調控的是哪些基因,也未提供其促進或抑制轉錄的方向,因此不能據此推定特定標的或調控結果。

資料亦未交代其如何辨識或作用於轉錄相關分子,也沒有說明其參與哪些細胞過程,或轉錄調控可能帶來的生物學影響。因而目前能支持的功能描述僅限於可能涉及轉錄調控;更細緻的機制與功能意義尚無法由這些資料判定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44072159 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF284 ENST00000421176 GRCh38 chr19:44071159-44072259 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACCACAAATGACATCTCCAATCAGAAACATTCCAACCATAAGATAAACCCCTCCCTGACCAGAGACATG
CCAGCACCGAGATAACCTCCCTTCCATTGGAGAGATGTCAGTCCCAAGATAACTTCCCCTCCAACCAGAG
ATATTCCAACCCCACAACAGACTTCTCCCCAATACAGAAACATTCTAAGCCTGTGGTAAGCTCTCTCTCC
CTAAAGCCAATACATACTCTTAGTCCGTAAGAGAGAGCGCTCCTGACTGCAATCGGCCAGAAGGCCCTCT
CGGTTTATTCTCCAAAACGAACCTGTCTTTGACTGTTGAGCCGCTTTTCGTGTTTTTTTTTTTTTTCTCT
TTAACTCTTACAGCCCTCTTAAACACTTAAACTGTGGTTGTTTTTCTTGCCAAACCAGTGGTACAACAGT
GTCTGGTTGTACCAGGGGCTGGTGCCCCACTCAATGCCTCTCCCAAACCATTTTTCCTGGCCCATTATTT
AAGCTCTTAGATTTAGCCTCATACTATTAGCGTCTAGTATATTAGCCTTTCAGCCATCTCCTGACCGCTC
CACAGTCACTCCCCGCTAACTCCTTGAAGATTGTATCTCCTTGCTTTGTTCTCTTTCAGTAACACTCCTG
TCATCATGGGAGGCGTGTAGACTTCAGGAATTCCTGTCTATTCAATATTTTCTCTCGAGGACGCAGGGAG
AGGGAAGGACCACTCTCAGGGCCACAGTCCATATTCCAAACCAGGCGCTTGGGTCTATGGGATTCATTCC
TCGTGGGCATTGCAGGAAGTGTAGTCAAAGAGCACCGCGGAGTCCCACGCTTCCCGCCGGAAGGTGATAC
TATAGAACGTCTCCTTTGAGATTCAAGGAAGTGTAGCGCAGGAGATCTGTTGAATGACGAGCAAGTAGGC
TCAGGACGGCGTATCCGGGGAATTCTGGGAAATGTAGTTCACACGCTGCGCGGGGTAGGGGCACTTCCGC
TCCCGGGGGGCGAGGTTGCTGCAGTGCATTCGGTGGTAGTTTGGTGTCAGTCCTGTGTCTTGTCGGTCCT
TCTAAACGTGTCCCCTTACGATGCTGGCTCGCAACCACCTGGAAGTTGACT
ZNF284 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF284_1 ↗19:44,072,161正股44,072,112–44,072,171

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9MHB9 · promoter · 44071669–44072169 · regulatory

ENSR19_BBQ68 · enhancer · 44072170–44073188 · regulatory

· motif · 44071551–44071562 · motif

· motif · 44071938–44071949 · motif

· motif · 44071940–44071949 · motif

· motif · 44072103–44072115 · motif

· motif · 44072130–44072139 · motif

· motif · 44072130–44072141 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:593 aa

1 aa593 aa結構域鋅指
依 Q2VY69 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 284 長 593 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端第 8–78 位具有 KRAB 結構域;另註記 15 個 C2H2 型鋅指區域,分布於第 145–561 位,其中第 1、2、10 與 15 個區域標示為退化型。

結構域KRAB8–78 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate145–169 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate175–197 aa
鋅指C2H2-type 3203–225 aa
鋅指C2H2-type 4231–253 aa
鋅指C2H2-type 5259–281 aa
鋅指C2H2-type 6287–309 aa
鋅指C2H2-type 7315–337 aa
鋅指C2H2-type 8343–365 aa
鋅指C2H2-type 9371–393 aa
鋅指C2H2-type 10; degenerate399–421 aa
鋅指C2H2-type 11427–449 aa
鋅指C2H2-type 12455–477 aa
鋅指C2H2-type 13483–505 aa
鋅指C2H2-type 14511–533 aa
鋅指C2H2-type 15; degenerate539–561 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q2VY69…

AlphaFold · Q2VY69

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 zinc finger protein 284 的定位記為細胞核;未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DKFZp781F177ZNF284
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 284 可能參與轉錄調控;此描述具有不確定性,資料未指出其調控標的、作用方向或具體機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 284 的定位記為細胞核;資料未提供定位條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000421176 · 4,336 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGTGCATTCGGTGGTAGTTTGGTGTCAGTCCTGTGTCT40
41TGTCGGTCCTTCTAAACGTGTCCCCTTACGATGCTGGCTC80
81GCAACCACCTGGAAGTTGACTAAGGGGAGAAGGAGTCTCG120
121TTGGAAAACGGAGGCACAATTCTGTCTTCTCTTGAACTGC160
161ATAACTGAGAACTCTGCAAATTCCCCAAAGAAGGAGGAAA200
201AATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTG240
241GCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACG280
281TTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAA320
321CTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATCAACTTTCCCAC360
361CGAGATACTTTTCACTTCCAAAGAGAAGAAAAGTTTTGGA400
401TCATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGG440
441CAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGA480
481CCACATGAAGAGTGGTCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAA520
521CTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTCCATAAGTAG560
561CTCTCAGTTCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTT600
601GACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACCTT640
641CTGAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTC680
681CATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAGGAAAGATA720
721TCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATA760
761GCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAAGTTCACATGGGAGA800
801GAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGT840
841CAGAACTCACAACTGCAAACTCATCAGAGAATCCACACTG880
881GAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTT920
921CAGCCGTAGATCAGGAATGTATGTTCATTGCAAATTACAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。