基因總覽
ZNF284 是蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 284 屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 593 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指區域;部分鋅指區域被註記為退化型。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控標的或作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000421176 ★ | 44,072,159–44,089,613 | 5 |
| ENST00000929281 | 44,072,138–44,089,613 | 5 |
| ENST00000929282 | 44,072,144–44,089,613 | 6 |
| ENST00001140044 | 44,072,144–44,089,613 | 5 |
| ENST00000929283 | 44,072,151–44,089,613 | 5 |
| ENST00000929284 | 44,072,161–44,089,613 | 5 |
| ENST00000851662 | 44,072,435–44,089,613 | 5 |
| ENST00000851663 | 44,074,020–44,089,613 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,zinc finger protein 284 可能參與轉錄調控。這項描述保留「可能」的限定,來源並未說明其調控的是哪些基因,也未提供其促進或抑制轉錄的方向,因此不能據此推定特定標的或調控結果。
資料亦未交代其如何辨識或作用於轉錄相關分子,也沒有說明其參與哪些細胞過程,或轉錄調控可能帶來的生物學影響。因而目前能支持的功能描述僅限於可能涉及轉錄調控;更細緻的機制與功能意義尚無法由這些資料判定。
Promoter 與基因調控
>ZNF284 ENST00000421176 GRCh38 chr19:44071159-44072259 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AACCACAAATGACATCTCCAATCAGAAACATTCCAACCATAAGATAAACCCCTCCCTGACCAGAGACATG CCAGCACCGAGATAACCTCCCTTCCATTGGAGAGATGTCAGTCCCAAGATAACTTCCCCTCCAACCAGAG ATATTCCAACCCCACAACAGACTTCTCCCCAATACAGAAACATTCTAAGCCTGTGGTAAGCTCTCTCTCC CTAAAGCCAATACATACTCTTAGTCCGTAAGAGAGAGCGCTCCTGACTGCAATCGGCCAGAAGGCCCTCT CGGTTTATTCTCCAAAACGAACCTGTCTTTGACTGTTGAGCCGCTTTTCGTGTTTTTTTTTTTTTTCTCT TTAACTCTTACAGCCCTCTTAAACACTTAAACTGTGGTTGTTTTTCTTGCCAAACCAGTGGTACAACAGT GTCTGGTTGTACCAGGGGCTGGTGCCCCACTCAATGCCTCTCCCAAACCATTTTTCCTGGCCCATTATTT AAGCTCTTAGATTTAGCCTCATACTATTAGCGTCTAGTATATTAGCCTTTCAGCCATCTCCTGACCGCTC CACAGTCACTCCCCGCTAACTCCTTGAAGATTGTATCTCCTTGCTTTGTTCTCTTTCAGTAACACTCCTG TCATCATGGGAGGCGTGTAGACTTCAGGAATTCCTGTCTATTCAATATTTTCTCTCGAGGACGCAGGGAG AGGGAAGGACCACTCTCAGGGCCACAGTCCATATTCCAAACCAGGCGCTTGGGTCTATGGGATTCATTCC TCGTGGGCATTGCAGGAAGTGTAGTCAAAGAGCACCGCGGAGTCCCACGCTTCCCGCCGGAAGGTGATAC TATAGAACGTCTCCTTTGAGATTCAAGGAAGTGTAGCGCAGGAGATCTGTTGAATGACGAGCAAGTAGGC TCAGGACGGCGTATCCGGGGAATTCTGGGAAATGTAGTTCACACGCTGCGCGGGGTAGGGGCACTTCCGC TCCCGGGGGGCGAGGTTGCTGCAGTGCATTCGGTGGTAGTTTGGTGTCAGTCCTGTGTCTTGTCGGTCCT TCTAAACGTGTCCCCTTACGATGCTGGCTCGCAACCACCTGGAAGTTGACT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF284_1 ↗ | 19:44,072,161 | 正股 | 44,072,112–44,072,171 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9MHB9 · promoter · 44071669–44072169 · regulatory
ENSR19_BBQ68 · enhancer · 44072170–44073188 · regulatory
· motif · 44071551–44071562 · motif
· motif · 44071938–44071949 · motif
· motif · 44071940–44071949 · motif
· motif · 44072103–44072115 · motif
· motif · 44072130–44072139 · motif
· motif · 44072130–44072141 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:593 aa
zinc finger protein 284 長 593 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 N 端第 8–78 位具有 KRAB 結構域;另註記 15 個 C2H2 型鋅指區域,分布於第 145–561 位,其中第 1、2、10 與 15 個區域標示為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 zinc finger protein 284 的定位記為細胞核;未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAGTGCATTCGGTGGTAGTTTGGTGTCAGTCCTGTGTCT40TGTCGGTCCTTCTAAACGTGTCCCCTTACGATGCTGGCTC80GCAACCACCTGGAAGTTGACTAAGGGGAGAAGGAGTCTCG120TTGGAAAACGGAGGCACAATTCTGTCTTCTCTTGAACTGC160ATAACTGAGAACTCTGCAAATTCCCCAAAGAAGGAGGAAA200AATGACCATGTTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTG240GCTGTGGTCTTCACCGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACG280TTTCCCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTCATGCTGGAGAA320CTTCAGAAACCTGCTATCAGTGGGGCATCAACTTTCCCAC360CGAGATACTTTTCACTTCCAAAGAGAAGAAAAGTTTTGGA400TCATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGG440CAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAACAGGA480CCACATGAAGAGTGGTCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAA520CTGCAAGTGAGTTAACTAGACCTCAAGACTCCATAAGTAG560CTCTCAGTTCTCCACACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTT600GACGCAGGACTATCTATAATTCACATAGGAGAGACACCTT640CTGAGCATGGGAAGTGTAAAAAATTCTTCAGTGATGTCTC680CATCCTTGATCTTCATCAACAATTACACTCAGGAAAGATA720TCCCATACATGTAATGAGTACAGGAAGAGATTCTGTTATA760GCTCAGCTCTTTGTCTTCATCAGAAAGTTCACATGGGAGA800GAAACGCTATAAGTGTGATGTGTGTAGTAAGGCATTTAGT840CAGAACTCACAACTGCAAACTCATCAGAGAATCCACACTG880GAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTGGGAAAAGTTT920CAGCCGTAGATCAGGAATGTATGTTCATTGCAAATTACAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。