基因總覽
ZNF283(zinc finger protein 283)是人類蛋白質編碼基因,所屬產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質長679個胺基酸,具有一個 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger 結構。來源指出它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000618787 ★ | 43,827,321–43,852,017 | 7 |
| ENST00000588797 | 43,827,297–43,852,017 | 6 |
| ENST00000988353 | 43,827,297–43,838,462 | 7 |
| ENST00000988354 | 43,827,354–43,838,468 | 7 |
| ENST00001105709 | 43,827,368–43,838,660 | 6 |
| ENST00001039038 | 43,827,374–43,852,017 | 6 |
| ENST00000650832 | 43,827,378–43,852,017 | 7 |
| ENST00001105708 | 43,827,424–43,842,314 | 8 |
| ENST00000588967 | 43,828,199–43,837,179 | 3 |
| ENST00000593164 | 43,828,202–43,838,080 | 4 |
| ENST00000324461 | 43,833,505–43,848,898 | 4 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF283 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能角色,未說明其調控的是哪些基因,也未提供作用方向或分子機制,因此無法據此判定它會促進或抑制特定轉錄活動。
Promoter 與基因調控
>ZNF283 ENST00000618787 GRCh38 chr19:43826321-43827421 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTTTTCTTTCTGTTAGTTTTAATATAAAATTTCGCTTTAATATTTTTAGACAATTCTTTTTTAAAAAAGT ATTTATATCCAAAGGTTCTTACCACACCAACCACAGCCCCAATCTTTTTGCCCTAACCTCAGAATCAGTT AGTTGTCTCCTTTAAAACCTTTCTCTCTCTCACACACCCACACACACACACACGCAAACACACAGGAGAG AGAGAGAGGGAATATATAGTATTGTTTTTGGAGTATGAGTGTGTGCTTCAGAATAAATGGTTTCATACTC TATAAAAAATGAGATTCAAATTTTATAATCCATCAAGTTTTATTGGAACACAGCCATGCTGGATTGCTTG TGCATTGTTTATGGCCGCCTTTGCACTGCCATAAGTCTCCACGGTCACAATATCCACTCACTACCACTTA TTGTTGTCTTTCAACAGCGGCATATAAAATCTGTAACACAGTTCATCTCACACCTAATAAAACAGACTCA CACAGGCATAAATTTAGAAAACATCCCATGAACATAAACAGGTCCACGCAGGGTCCCAGACACCGAATCG AACTAAGAAACTCCCTCACAGCAAGACACACCCATCTGTTCAATTGCCAGACACTGTTCCAGGCGCTCAT ACCCAGGTAAACTGGTAGTGTCGCGCAGGTCATTTCCAGCGAACTTACCCCGGATTCCCTTGCTCGCTCA CGTCTAAGTCCCCAGACACCCCAGTCCCATCTTCGCCTGTTCTAGACTCCAGAATGCGTTCCTTAGCGAA AGCTGAGAACCTTTTAATTCGCTCTCAGTCAACACCAAAGACCCTCAAGCAAAAGCAAGAGCTCCCGGGC GTCTTCGAAAAAAGCGCCTTTGACAGGTGAAGCCAAGTTGCATGCTGGGAGCATCCCTGCTGTCCAGGTT TCAACTTCCGGAGACTCTGCCGCTGTGGACTACATTTCCCAGAAGTCTCCGGGGCACAGGCCTTTTAGGG GCGGGGCGAGCTTGCCTGCCAGAAGCTCCTCTCCCAGCCTGCGAGCATTTCCAGGCTCTTGTTTCCCATC AGCCTCTGGGTCCAAACTAACCACAGGTCTCTGGGTCCTTTTCCGGTGTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BBNSP · promoter · 43826831–43827388 · regulatory
ENSR19_BBNSS · enhancer · 43827389–43828087 · regulatory
· motif · 43827233–43827242 · motif
· motif · 43827233–43827244 · motif
· motif · 43827233–43827244 · motif
· motif · 43827388–43827396 · motif
· motif · 43827814–43827822 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:679 aa
ZNF283 蛋白質長679個胺基酸,包含位於第73至152位的 KRAB 區域,以及15個 C2H2-type zinc finger,分布於第205至619位的多個區段。來源將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族;這些結構註解未提供各區域的具體作用說明。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或其他細胞位置的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAAGCTCCTCTCCCAGCCTGCGAGCATTTCCAGGCTCTT40GTTTCCCATCAGCCTCTGGGTCCAAACTAACCACAGGTCT80CTGGGTCCTTTTCCGGTGTCCTTAAGGTTCTTGGACTCTG120CATGTGCTGCCAGGTTGCCAGATTTCTAAGAAGGAGTTTG160AAGAGGAGAAAAGGATTTTTGCATGTTTAGAAATCAAGGT200TCAGGAGAATCTTGACAGTGAATGTGTCTCATTACATTGA240ATAACAGCTACAGGATGTTCGAGAGCTGATGGAGTCTCGC280TCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCT320CACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCTATTCTCCTG360CCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACAGTTCTGGCTTT400TCTGGATTCTGTGCTTCACCAATAGAGGAATCCCATGGAG440CATTAATTAGTTCTTGCAATTCCAGAACCATGACTGATGG480GTTGGTGACATTCAGGGATGTGGCCATCGACTTCTCTCAG520GAGGAGTGGGAATGCCTGGACCCTGCTCAGAGGGACTTGT560ACGTGGATGTAATGTTGGAGAACTATAGTAACTTGGTGTC600ACTGGATTTGGAGTCAAAAACGTATGAGACCAAAAAAATA640TTTTCAGAAAATGATATTTTTGAAATAAATTTTTCCCAGT680GGGAGATGAAGGACAAAAGTAAAACCCTTGGCCTTGAGGC720ATCCATCTTCAGAAATAATTGGAAGTGCAAAAGCATATTC760GAGGGACTAAAAGGACATCAAGAGGGATACTTCAGTCAAA800TGATAATCAGCTATGAAAAAATACCTTCTTACAGAAAAAG840TAAATCTCTTACTCCACATCAAAGAATTCATAATACAGAG880AAATCCTATGTTTGTAAGGAATGTGGGAAGGCTTGCAGTC920ATGGCTCAAAACTTGTTCAACATGAGAGAACTCATACAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。