演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF282HUB1

zinc finger protein 282

ZNF282(zinc finger protein 282)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質;資料指出它可辨識 HTLV-I 長末端重複序列中的抑制元件。

Homo sapiens7q36.1UniProt Q9UDV7
OFFICIAL SYMBOL
ZNF282
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9UDV7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF282(zinc finger protein 282)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 671 個胺基酸,含有 KRAB domain,以及多個 C2H2 型 zinc finger。這些結構特徵構成此蛋白質的基本辨識特色;來源另記載它能辨識特定病毒長末端重複序列中的抑制元件,相關分子作用方式見功能說明。

Official symbol
ZNF282
Gene name
zinc finger protein 282
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13076
UniProt
Q9UDV7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HUB1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q36.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZNF282pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:149,195,502–149,226,243
Gene span
30,742 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000610704 ★149,195,546–149,226,2388
ENST00000850624149,195,546–149,226,2438
ENST00000479907149,195,546–149,224,6639

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF282 可結合人類 T 細胞白血病病毒第一型(HTLV-I)長末端重複序列(LTR)中的 U5 repressive element(U5RE)。這項結合具有序列辨識特異性:來源指出,ZNF282 將 5'-TCCACCCC-3' 辨識為核心基序。也就是說,它對該病毒調控區的作用與辨識特定 DNA 序列相關,而非僅是一般性的核酸結合描述。

在功能結果上,ZNF282 對 HTLV-I LTR 所媒介的表現具有強烈抑制作用。來源將這種抑制效果連結至其對 U5RE 的結合,說明特定序列辨識與病毒 LTR 表現調節之間的關係。不過,現有資料未進一步說明抑制過程涉及的其他分子、作用步驟或細胞條件,因此不能據此推定更完整的調控機制。

因此,來源支持的主要功能是:ZNF282 辨識 HTLV-I LTR 中 U5RE 的核心序列,並強烈抑制該 LTR 所媒介的表現。這項描述限定於人類 HTLV-I 的 LTR 調控情境;資料未提供其在其他病毒序列或其他生物學過程中的作用資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 149195546 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF282 ENST00000610704 GRCh38 chr7:149194546-149195646 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCTGGAGCGCACTGGCGCGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCTTCGGAGGTTGAAGCGATTCTCCTG
CCTCAGCCTCCCGAGTAGCTAGGATTATAGGCCCACGCCACCACGCCCGGCTAATCTTTTTGTATTTTTA
GTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCCTGCCT
CAGCCTCCCAATGTGCTGGGATTACAGATGTGAGCCACCGCGCTCGGCTAATTTTTATTTTTTATAGGGA
TGGGGTGTCAATATGTTGCTCAGTCTGGTCTCGAACTCCTGGGCTCAAGTCGTTCTCCTGCTTCAGCCTC
TCAGAGTGCTGAGATTACAGGTGTGAGGCACCACGCCCAACCCAATTTCAAGGTGTTTGAAGAGGCCACT
GTTAAAATGCACTGCACCTTACCTGGGAGAAAGAGCTCAGCCCTCTTTTGACACCTTAACATGAATCACT
TCTCTATCATCCATAACAGTGCAAAAGCTCTGGGATGGGTCCAGGTAAATCTGGATTGGGAAGAAGGGGA
GTGGGAGGTAAAGTCTGCAAAGGAGTGAGGGAAGGCAGAAGGCCAGAAGAAAGTGTCTGAAGACAGAATT
ACTCCTGCAAAATTTTCACAAGGGTCAGGCACTATTTTCTCCCGGGATGCCCAATACATTTGCAGAATTA
ACAGTAATCAAGCCCACAGTCCAGGTCCTCGCATAGTTTGGGCCTTTAAAGTCGGCCATCCCAGATTGAG
GGGGCCTGACCCCTGGGCGAGGCCGCCGCCTCTCAGTTTTGGGGCGGTGGCGACCCCAGTCCGGGAGTGG
CCCCGGTAGGTCCCCGCAGGCGGGCAGGAGCTCCGAGGCCATTGGCTGGCGCGCGGGCTGCCAAGGGGCG
GGGAGCGCCGCCGAAGGGGACTGTTTGCTCCTACGGGCTGTAGATGGAGCTGTCCGGCCCCGGAGAGGGG
GAAGGCGCCTGGAAAACGTTCTTCTTCTCCCTGGCCGACCCGAGCGGGGAACAGCACTCCCAGGATGCAG
TTTGTGTCAACACGGCCGCAGCCTCAGCAGCTGGGCATCCAGGGCCTGGGG
ZNF282 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF282_1 ↗7:149,195,546正股149,195,497–149,195,556

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_86DFNH · enhancer · 149191115–149191293 · regulatory

ENSR7_9477TX · promoter · 149195056–149195560 · regulatory

ENSR7_53B4H7W · CTCF_binding_site · 149195488–149195509 · regulatory

ENSR7_CJRPK · enhancer · 149195561–149197253 · regulatory

ENSR7_53B4H9G · CTCF_binding_site · 149195826–149195847 · regulatory

ENSR7_86DFSC · enhancer · 149197756–149197901 · regulatory

· motif · 149195010–149195022 · motif

· motif · 149195194–149195206 · motif

· motif · 149195318–149195330 · motif

· motif · 149195321–149195328 · motif

· motif · 149195490–149195506 · motif

· motif · 149195750–149195759 · motif

· motif · 149195788–149195801 · motif

· motif · 149195828–149195844 · motif

· motif · 149195947–149195956 · motif

· motif · 149196310–149196318 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:671 aa

1 aa671 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9UDV7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF282 蛋白質長 671 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解標示一個位於 198–271 的 KRAB domain,以及五個 C2H2 型 zinc finger,位置依序為 518–540、546–568、574–596、602–624 與 630–652。另有數段區域被註解為無序區。

結構域KRAB198–271 aa
鋅指C2H2-type 1518–540 aa
鋅指C2H2-type 2546–568 aa
鋅指C2H2-type 3574–596 aa
鋅指C2H2-type 4602–624 aa
鋅指C2H2-type 5630–652 aa
功能區域Disordered239–258 aa
功能區域Disordered373–486 aa
功能區域Disordered649–671 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UDV7…

AlphaFold · Q9UDV7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF282 定位於細胞核;未提供定位隨條件改變、異構型差異或動態變化的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HUB1ZNF282ZNF398
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF282 可結合人類 T 細胞白血病病毒第一型(HTLV-I)長末端重複序列中的 U5 repressive element(U5RE),辨識 5'-TCCACCCC-3' 作為核心基序,並強烈抑制由 HTLV-I LTR 媒介的表現。資料庫紀錄
證據與來源

Binds to the U5 repressive element (U5RE) of the human T cell leukemia virus type I long terminal repeat. It recognizes the 5'-TCCACCCC-3' sequence as a core motif and exerts a strong repressive effect on HTLV-I LTR-mediated expression

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF282 的細胞內定位為細胞核;此項資料未描述定位改變的條件、異構型差異或動態。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000610704 · 3,651 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTTCTTCTCCCTGGCCGACCCGAGCGGGGAACAGCACTCC40
41CAGGATGCAGTTTGTGTCAACACGGCCGCAGCCTCAGCAG80
81CTGGGCATCCAGGGCCTGGGGCTGGACAGCGGGAGCTGGA120
121GCTGGGCCCAGGCTCTGCCCCCGGAGGAGGTCTGCCACCA160
161GGAGCCGGCGCTGCGCGGGGAAATGGCCGAGGGAATGCCG200
201CCCATGCAGGCTCAAGAATGGGACATGGACGCCCGGCGGC240
241CAATGCCTTTTCAGTTCCCACCCTTTCCAGATAGGGCACC280
281TGTCTTCCCCGACCGCATGATGCGAGAGCCCCAGTTGCCC320
321ACAGCAGAGATCTCACTCTGGACTGTGGTGGCTGCCATTC360
361AGGCTGTGGAGAGGAAGGTGGATGCCCAGGCCAGCCAGCT400
401GCTGAACCTGGAGGGGCGCACGGGGACAGCCGAGAAGAAG440
441CTGGCCGACTGTGAAAAGACGGCCGTGGAATTTGGGAACC480
481ACATGGAGAGCAAGTGGGCCGTGCTGGGGACCCTGCTGCA520
521GGAGTACGGGCTGCTGCAGAGGCGGCTGGAGAACTTGGAG560
561AACTTGCTGCGCAACAGGAACTTCTGGGTCCTGCGGCTGC600
601CCCCGGGCAGCAAGGGGGAGGCCCCCAAGGTTCCAGTGAC640
641TTTTGTCGACATTGCTGTGTACTTCTCCGAAGACGAGTGG680
681AAGAACTTGGACGAATGGCAGAAGGAGCTTTATAACAACC720
721TTGTTAAGGAGAACTACAAAACCCTCATGTCCCTGGACGC760
761GGAGGGCTCAGTCCCCAAGCCAGATGCTCCAGTCCAGGCT800
801GAGCCCAGGGAAGAACCTTGTGTGTGGGAGCAGCGCCACC840
841CCGAAGAGAGAGAAATCCCAATGGATCCCGAAGCAGGAGC880
881AGAGCCCCTGGTGCCTGCGCAGGATGCGTCCTCCCAGGTG920
921AAGCGTGAGGACACCCTGTGTGTCCGGGGTCAGCGGGGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。