基因總覽
ZNF281 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 zinc finger protein 281，其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。這類蛋白質具有鋅指結構；ZNF281 的蛋白質序列註解列出四個 C2H2-type zinc finger，其中第四個標示為非典型。其主要角色與轉錄調控相關，來源描述其為轉錄抑制因子，並指出它參與胚胎幹細胞分化的調節。這些資訊概括了其家族歸屬、結構特徵與基本功能定位；其在特定基因調控及細胞分化中的作用，見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367353 ★ | 200,404,951–200,410,036 | 2 |
| ENST00000367352 | 200,400,937–200,410,063 | 3 |
| ENST00000294740 | 200,403,898–200,410,063 | 2 |
| ENST00000890708 | 200,403,898–200,410,063 | 2 |
| ENST00000890709 | 200,403,898–200,410,063 | 2 |
| ENST00001145507 | 200,403,898–200,410,063 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF281 是轉錄抑制因子，參與胚胎幹細胞（ESCs）分化的調控。來源指出，它是 ESCs 分化所必需的，但依相似性推定，並非 ESCs 建立與維持所必需；因此，其功能與分化過程相關，不能據此延伸為對幹細胞初始建立或持續維持的必要因子。
在 ESCs 中，ZNF281 可調節 NANOG 的自我抑制：它結合 NANOG 啟動子，促進 NANOG 蛋白與其自身啟動子的關聯，並招募 NuRD complex。該複合體會去乙醯化組蛋白；來源將這一連串作用與 NANOG 的轉錄抑制相連。此機制提供了 ZNF281 參與 ESCs 分化調控的具體途徑，但來源未進一步說明分化的方向或不同細胞狀態下的效應差異。
除 NANOG 外，ZNF281 也抑制包括 GAST、ODC1 與 VIM 在內的多個基因轉錄。它會結合這些基因增強子區域中的 G-rich box，顯示其抑制作用可透過辨識特定調控區域發生。來源未提供這些基因在此情境中的下游功能或其抑制對細胞表型的個別影響，因此可支持的結論限於 ZNF281 對這些基因轉錄的抑制及其與 ESCs 分化調控的關聯。
Promoter 與基因調控
>ZNF281 ENST00000367353 GRCh38 chr1:200409936-200411036 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGATTTTGTTGATATAACTTTGATTTTAAGATTTTACTTCATAATTTTCCCTTACAAGAAAAATTTCTA AATTTGCAATGAGTTTCTCGGTATTCTGTACTGGCGAGGAAAGAGTTGATCCTAGCAGAGCTCTTAGAAT GGCCTGGTGGTTAATTTTTCATAAACAATATAAAGGGCCAGGCATTCATAACGTGGCAAACAGACTGATT AGCCAGGCTAAGGTACGGGGGCATTTAAATAAGATGTAATGATAATGAAGTATGTGTGTGGGCGTGTTTT ACAGGACTGCTGCACCTGGATTACGCTCGGTTTCCTCTTCCAGTAGCCTTCAGGAAGGTTGGCAGTAAGA CAAGTTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGTTGCAACGGTACCACTAATTGCGGTTTCAAAGCAGGC TCCTCCCATAAATGCAAAGGATATGCGCCCATTATTAGTGCTTCCAAATTCAAAGGGATAACATAAGCAC CTGTTTTAATAAATGTTGAGCATTTGGAGTTGAATGCTTCTTGATAGAATCAAAAGTGCCCTCAATGATC CACTTCTAGGTTTGAATTTTATTTCAAGACCTGGATTGCAAAACCTAGAGTGAAGAAAGCCCTAACATTG AATCCTCAGTTTCCCTCACCTTCTCTTCCAGCCCCTTTCTCTGCATCTCCCACGCCACGCTGTAGTACAG TCCCCCGTAACTTCCCGCCCCTTGGGTTCCACCTCCTGAGCGTCTTTCCCCCAGAAACCCTCAACCACTT TCATCTCCTTCAGTGCAGCCCACCAATCACGCCTGTTCGCCTCGAAAGCCCCTTTTTAGCAGGGCTCCAA ATCCCCGCCTCCCCTGCCCTTGCTCCCCCGCCTCCGCCCAACGGCCCCAGTGATTGACAGGCAGGCCGGG CGGAAGCTGCGGCGCAGGCGCCCTGGCTCCTTAGCCCTCCCCTCTGGCCGGGTCGAGGAGTTCCCAGCAG ACACTGCGCCGCGGCTGCGCAGTACACGGGAGGCTTTTAATTCCATTGTGGAGAGGACGGCGTTATTTTT ATTAACTGGAGGCGACGGCGGCTGCGGCGGCGGCGGGACCCGTAAGTATTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF281_1 ↗ | 1:200,410,026 | 負股 | 200,410,016–200,410,075 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_87W4DD · enhancer · 200405361–200405535 · regulatory
ENSR1_B3GQTJ · promoter · 200409982–200410546 · regulatory
ENSR1_94XJQG · promoter · 200411421–200411824 · regulatory
ENSR1_94XJQK · enhancer · 200411825–200412167 · regulatory
· motif · 200405377–200405386 · motif
· motif · 200405427–200405436 · motif
· motif · 200405463–200405476 · motif
· motif · 200405463–200405476 · motif
· motif · 200405530–200405545 · motif
· motif · 200407153–200407166 · motif
· motif · 200407207–200407222 · motif
· motif · 200409266–200409283 · motif
· motif · 200409330–200409345 · motif
· motif · 200409641–200409658 · motif
· motif · 200409817–200409834 · motif
· motif · 200409826–200409834 · motif
· motif · 200409826–200409841 · motif
· motif · 200410105–200410116 · motif
· motif · 200410105–200410116 · motif
· motif · 200410157–200410170 · motif
· motif · 200410163–200410176 · motif
· motif · 200410349–200410362 · motif
· motif · 200410627–200410635 · motif
· motif · 200411492–200411507 · motif
· motif · 200411492–200411507 · motif
· motif · 200411493–200411507 · motif
· motif · 200411494–200411507 · motif
· motif · 200411621–200411631 · motif
· motif · 200411672–200411682 · motif
· motif · 200411847–200411858 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：895 aa
ZNF281 蛋白質長 895 個胺基酸，屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列出四個鋅指：前三個為 C2H2-type，第四個為非典型 C2H2-type。另有多段區域被註記為無序區，包括胺基端及序列中段、後段的數個區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF281 的定位註記為細胞核。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF281 是轉錄抑制因子，參與胚胎幹細胞（ESCs）分化調控且為該分化所必需；依相似性推定，它並非 ESCs 建立與維持所必需。它透過結合 NANOG 啟動子、促進 NANOG 蛋白與自身啟動子關聯並招募可去乙醯化組蛋白的 NuRD complex，介導 NANOG 自我抑制；也會結合 GAST、ODC1 與 VIM 增強子區的 G-rich box，抑制這些基因轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription repressor that plays a role in regulation of embryonic stem cells (ESCs) differentiation. Required for ESCs differentiation and acts by mediating autorepression of NANOG in ESCs: binds to the NANOG promoter and promotes association of NANOG protein to its own promoter and recruits the NuRD complex, which deacetylates histones. Not required for establishement and maintenance of ESCs (By similarity). Represses the transcription of a number of genes including GAST, ODC1 and VIM. Binds to the G-rich box in the enhancer region of these genes PMID 10448078 ↗ · PMID 12771217 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF281 的細胞內定位註記為細胞核；此資料未描述定位變化的條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTACACGGGAGGCTTTTAATTCCATTGTGGAGAGGACGG40CGTTATTTTTATTAACTGGAGGCGACGGCGGCTGCGGCGG80CGGCGGGACCCCCAGGCCTCCTCCGGGGTATGAAAATCGG120CAGTGGGTTCCTGAGTGGCGGCGGAGGTACCGGCAGTAGC160GGTGGTAGCGGCTCCGGCGGCGGTGGTAGTGGCGGCGGCG200GCGGCGGCGGCAGCAGCGGCAGGAGGGCAGAGATGGAACC240CACCTTTCCCCAGGGTATGGTTATGTTCAACCACCGTCTT280CCCCCGGTCACCAGCTTCACCCGGCCGGCGGGGTCGGCCG320CCCCTCCCCCGCAATGCGTGTTATCCTCCTCTACCTCCGC360AGCCCCGGCCGCTGAGCCCCCCCCTCCGCCAGCCCCGGAC400ATGACTTTCAAGAAGGAGCCGGCGGCGTCAGCCGCGGCCT440TCCCCTCGCAGAGGACCTCCTGGGGGTTCTTGCAGTCTTT480GGTTAGCATCAAACAGGAGAAACCCGCGGATCCTGAGGAG520CAGCAGTCCCACCACCACCATCACCACCACCACTATGGGG560GGCTGTTCGCTGGAGCTGAAGAGAGGTCTCCAGGCCTAGG600AGGCGGTGAAGGGGGGAGTCACGGCGTCATCCAGGACCTC640AGTATTCTCCACCAGCATGTCCAGCAGCAACCAGCCCAGC680ACCACCGTGACGTATTACTCAGCAGCAGTAGCAGGACTGA720TGACCACCATGGCACTGAGGAGCCAAAGCAGGACACTAAT760GTCAAAAAGGCAAAAAGGCCAAAGCCAGAATCTCAGGGAA800TCAAAGCCAAGAGGAAGCCAAGTGCATCTTCCAAACCTTC840TTTGGTTGGAGATGGAGAAGGTGCCATCCTCTCCCCAAGT880CAGAAACCTCATATCTGTGATCACTGTAGTGCTGCTTTCC920GAAGCTCCTATCACCTGCGGAGACATGTCCTCATTCATAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。