演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF28KOX24

zinc finger protein 28

ZNF28(zinc finger protein 28)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 KRüppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.41UniProt P17035
OFFICIAL SYMBOL
ZNF28
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P17035
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF28 是位於人類第 19 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 28。其產物屬於 KRüppel C2H2 型鋅指蛋白家族,蛋白質全長 718 個胺基酸。序列具有 N 端 KRAB 結構域,並含有多個 C2H2 型鋅指區域;其中部分鋅指被註記為退化型。來源將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用機制。

Official symbol
ZNF28
Gene name
zinc finger protein 28
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13073
UniProt
P17035
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX24DKFZp781D0275

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.41
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF28pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:52,796,894–52,857,649
Gene span
60,756 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000457749 ★52,797,408–52,821,6334
ENST0000043815052,796,894–52,806,0212
ENST0000059460252,796,894–52,857,6495
ENST0000086840452,796,894–52,821,6654
ENST0000097426952,796,894–52,821,6655
ENST0000104539352,796,894–52,857,6494
ENST0000108310952,796,894–52,821,6654
ENST0000112503052,796,894–52,821,6656
ENST0000112503152,796,894–52,821,6656
ENST0000112503252,796,894–52,821,0415
ENST0000113510252,796,894–52,821,6654
ENST0000097427052,797,408–52,821,6653

顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有功能註解指出,ZNF28 可能參與轉錄調控。這項描述表示其產物可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源未界定它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞情境或所涉生物學過程。因此,對其功能方向與影響範圍應維持審慎,不宜進一步推定具體機制。

目前資料也沒有提供 ZNF28 如何辨識調控目標、是否直接作用於 DNA,或是否透過其他分子間接影響轉錄的證據。雖然其蛋白質序列具有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指區域,但僅憑這些結構註記,不能確定它們在 ZNF28 中的實際作用,也不能據此補述結合對象或調控結果。整體而言,來源支持的功能結論限於「可能參與轉錄調控」,其分子作用方式與生物學意義仍未由所提供資料進一步說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52821633 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF28 ENST00000457749 GRCh38 chr19:52821533-52822633 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTGAGGACTGATTAGTGTTTATCTTGAAAACATGTACTTAACGGGTTGCATAGAACAATGAAGTTTCTT
TCTCTCTTTTCAACCTCTTAGCTGTTTGCCTCTATTTCCCAACACATTCTGGTCTAAGGCTTATTCATTA
ATAGAATAGTTCTTATTTCTTCCTGTTTTGTCATGAAGATGATTTCTCATTTCGGGGAAGATTTTTTAGT
TTTCAGTTGTATTTTCTCAACATTTAAAAAGCAAAGTAAAGAGTATTTCCTGGGCCAGGCACAGTGGCTC
AGGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGGAGGCCAAGGCAGTCGGATCACTTGAAGTCAGGAGTTCGAGACCAG
CCTGTCCAACATGGCGAAATCCTGTCTCTACACAAAATACAAAAATTAACCGGGCATGGTGGGTGTGCCT
GTAGTGCCAGCTACTCCGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTCAACCCAGGAGGCAGAGGCTGCAGTGAG
TCAAGATCTCGCCACTGCACTCCAGCCAGGGCGACAGAGAAATAGCCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAG
GGAAAAAGAAAAGAAAAAAATGTAAATAAAAAGGAGAAAGTAATAGATCTCTTTTACAAATGTGCTGGGA
CAACTAACTGGATATCCACACGGAAAAGAGTAATGTTGTATCCCTGTCTCGCACAAGCAAATTTTTTTTT
TATTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTAGAGACGGAGTCTGGCTCTGTTGCCCAGGCTGGTGTGCAG
TGGCTCGATCTCGGCCCAATGCAAGCTGTATCTCCCGGGTTCAAAAGCCTGAGAACATGGCCTGGGAGGA
GGCTGAGACTCACAGGTCCCGCTCCGGCCCCGCCCTCTGCGGGTTCTAAAGGGCAAGGTCTCGCCGCTTC
GCGCCCCGCCCACACCTCACCCGGGCCCCGCTCGCCTCCTCGTTGGCTCCACCCAGGCCTGGTTTCTGTC
CTGCGCGCGCAGATTCGCGCAGACCAGGAAGCGGATCCCGTGGAATGACGGTGACGCCGCGGCGGGCGGT
GAGTTTTGCTCTGTGTGGTGTTAAGTCTGAGCTTCCCAGGTCCCCGGCACT
ZNF28 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF28_1 ↗19:52,821,633負股52,821,623–52,821,682

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_C78HZ · enhancer · 52820592–52821622 · regulatory

ENSR19_9QZ44 · promoter · 52821623–52821972 · regulatory

· motif · 52819851–52819866 · motif

· motif · 52819952–52819964 · motif

· motif · 52820439–52820450 · motif

· motif · 52821003–52821014 · motif

· motif · 52821621–52821632 · motif

· motif · 52821738–52821752 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:718 aa

1 aa718 aa結構域鋅指
依 P17035 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger protein 28 長 718 個胺基酸,N 端第 8–81 位為 KRAB 結構域。其後有 18 個 C2H2 型鋅指區域,分布於第 215–713 位;其中第 1、2、4 個被標註為退化型,其餘所列區域未標註退化。蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB8–81 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate215–237 aa
鋅指C2H2-type 2; degenerate243–265 aa
鋅指C2H2-type 3271–293 aa
鋅指C2H2-type 4; degenerate299–321 aa
鋅指C2H2-type 5327–349 aa
鋅指C2H2-type 6355–377 aa
鋅指C2H2-type 7383–405 aa
鋅指C2H2-type 8411–433 aa
鋅指C2H2-type 9439–461 aa
鋅指C2H2-type 10467–489 aa
鋅指C2H2-type 11495–517 aa
鋅指C2H2-type 12523–545 aa
鋅指C2H2-type 13551–573 aa
鋅指C2H2-type 14579–601 aa
鋅指C2H2-type 15607–629 aa
鋅指C2H2-type 16635–657 aa
鋅指C2H2-type 17663–685 aa
鋅指C2H2-type 18691–713 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17035…

AlphaFold · P17035

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF28 的細胞內定位註記為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述不同異構型之間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX24ZNF28
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF28 可能參與轉錄調控;此註解僅指出可能的功能關聯,未說明其調控方向、作用對象、分子機制或發生情境。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF28 的細胞內定位註記為細胞核;此資料未提供定位條件、動態變化或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000457749 · 4,558 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACCAGGAAGCGGATCCCGTGGAATGACGGTGACGCCGC40
41GGCGGGCGGATTGACTTCTAAAGAATCTTGGTACGTGAGG80
81AAGAAACCCAGAAGAGGAAGAGGAAAGCAAAGGAGTCAGG120
121GATGGCTCTTCCTCAGGGTCTATTGACATTCAGGGACGTG160
161GCCATAGAATTCTCTCAGGAGGAGTGGAAATGCCTGGACC200
201CTGCTCAGAGGACTCTTTACAGGGATGTGATGCTGGAGAA240
241TTATAGGAACCTGGTCTCCCTGGATATCTCTTCCAAATGC280
281ATGATGAAGACATTCTTCTCAACAGGGCAAGGCAATACAG320
321AAGCGTTCCACACAGGGACATTGCAAAGACAAGCAAGTCA360
361TCACATTGGAGATTTTTGCTTCCAGAAAATTGAGAAAGAC400
401ATTCATGGCTTCCAGTTTCAGTGGAAAGAAGATGAAACAA440
441ATGACCATGCAGCACCCATGACAGAAATCAAAGAGTTGAC480
481TGGTAGTACAGGCCAACATGATCAAAGGCATGCTGGAAAC520
521AAGCATATTAAAGATCAGCTTGGATTAAGCTTTCATTCGC560
561ATCTGCCTGAACTGCACATATTTCAGCCTGAAGGGAAAAT600
601TGGTAATCAAGTTGAGAAGTCTATCAACAATGCTTCCTCA640
641GTTTCAACATCCCAAAGAATTTGTTGTAGGCCCAAAACCC680
681ATATTTCTAATAAGTATGGAAATAATTCCCTCCATTCTTC720
721ATTACTCACACAAAAACGGAATGTACACATGAGAGAAAAA760
761TCTTTCCAATGTATTGAGAGTGGCAAATCCTTTAATTGTA800
801GCTCACTTTTAAAAAAACATCAGATAACCCACTTAGAAGA840
841GAAACAATGTAAATGTGATGTATATGGCAAGGTATTTAAT880
881CAGAAGCGATACCTTGCATGCCATCGTAGATCTCACATTG920
921ATGAGAAACCTTACAAGTGTAATGAGTGTGGCAAGATCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。