演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF277NRIF4

zinc finger protein 277

ZNF277(zinc finger protein 277)是可能參與細胞衰老調節的轉錄因子,並可能抑制腫瘤抑制基因 INK4A/ARF 的轉錄。

Homo sapiens7q31.1UniProt Q9NRM2
OFFICIAL SYMBOL
ZNF277
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q9NRM2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF277 是一種蛋白質編碼基因,其正式名稱為 zinc finger protein 277。其蛋白產物被認為可能是轉錄因子,與調節細胞衰老及控制 INK4A/ARF 轉錄有關。現有資料以可能的功能描述為主,並指出其抑制 INK4A/ARF 的作用或許透過 Polycomb group(PcG)複合體 PRC1 進行;這些描述不應視為已確立的作用機制。

Official symbol
ZNF277
Gene name
zinc finger protein 277
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13070
UniProt
Q9NRM2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NRIF4ZNF277P

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q31.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegZNF277pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr7:112,206,619–112,356,519
Gene span
149,901 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000361822 ★112,206,695–112,343,93412
ENST00000421864112,206,695–112,356,51912
ENST00000421043112,206,695–112,288,9792
ENST00000450657112,206,695–112,330,4747
ENST00000869148112,206,695–112,356,51912
ENST00000869149112,206,695–112,356,51910
ENST00000913151112,206,695–112,343,02412
ENST00000965706112,206,695–112,356,51910
ENST00001143278112,206,695–112,356,51912
ENST00000425229112,206,698–112,336,1645

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF277 被認為可能具有轉錄因子功能,並參與細胞衰老的調節。現有資料指出,它可能透過抑制腫瘤抑制基因 INK4A/ARF 的轉錄,影響與細胞衰老相關的調控;此處描述的是轉錄層級的抑制,而非對 INK4A/ARF 蛋白活性的直接作用。

ZNF277 對 INK4A/ARF 的轉錄抑制可能涉及 Polycomb group(PcG)複合體 PRC1。資料以「或許」描述這項關聯,因此不能據此認定 PRC1 是唯一途徑,也不能將 ZNF277 與 PRC1 的關係表述為已確證的直接作用機制。

目前來源將 ZNF277 的作用概括為可能調節細胞衰老,並連結至 INK4A/ARF 的轉錄抑制;未提供更多實驗情境或細節,故其具體作用條件與完整分子過程仍無法由這些資料確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 112206695 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF277 ENST00000361822 GRCh38 chr7:112205695-112206795 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCGTTGCAGCTCCCTGTCGCTTTGGGGAAGAAGGGTAAGGAAGGAGAGAAACCCCATTCGCCTCCTCTT
CCAACTTGACACACACACACACACACACACACACGCCCAGTCGCCACTCCAAACTCCGCAGGCAGAGCCC
GAAGCTAGCGGGCCGGCCGCGCGCTCCCCCAAGCTGTCCCGGCGCTTCGGGAACCAGTGCGGGGCGCGCC
GAGCAGGCGGTGCGGGGCGAGAGCCTGGTGCGCAGCCCTCTGCCTGGAGCTGGCTCGGCAAAGCCCCGTA
CCAGCTGCGCGATGCCAGGATTAGGCATTTTCAACCGGGCGGAGCGAGAGGGGCGCGGGGGCAAGGACGA
GAAATGCGCACTCGCTCGGGCCAGAGCAGAATAAAAGTTCGCCCCGCGGAGACTCACCCACGCCGTATTT
CTCGTGCTCCGTAGGTATCCACATGGCTAAAGGGGCTCCGGGGTCTTCAGGCTTTGTAATCCCCGCGCCC
CTTCTCCGGCTCACAACAATGCACAGTCCCCGAGCAGCGCTGCAGTGCCGGAGCCCAGCGGCTTCGCGCG
GGCTGCGGGCGCTGGGCAGGATCTGCGCTGGAGGCTCCCGAGCCCAGCGTTGACACTGCGCCGCCCGCAG
CTCTCCCGGCGGCGGCTGCTCACAGTCCTCCGACGCGCTCCCGGGTACCCGGCGGCGCAGTCATTGTTCT
GATTCACTGAACTAAGCGAACACGCCGGGGCACTCTCCGGCGCACCCCCGCCCGCCAGCGCCTAGTCCAG
CCCTCCCGTCCCAGGGCCCCGCAGCACGCTGGGAATTGTAGTTCTTGGCCTCCCCATCCCGGAAGTGGGC
GCGGCAAATGTGGTTCGGGGCGGGGATTCAGTTTTACTGATTGCGTCCTATTGGTCCAGAGCGCGGCGTA
GGTGTGGAGAAAACATTACGTCGACGGGGAGTTCGCCTCCAGTAGCGTTTCTACTGGTGCCACCCCGCCT
CCGACCCGCCCTGCGGCCCTCCCTTTTCTTTTCTGCCGGGTAATGGCTGCTTCCAAGACCCAGGGGGCTG
TCGCCCGAATGCAGGAAGACCGTGATGGGAGCTGCAGCACAGTCGGGGGTG
ZNF277 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF277_2 ↗7:112,205,529正股112,205,480–112,205,539
ZNF277_1 ↗7:112,206,702正股112,206,653–112,206,712

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_93MJFQ · enhancer · 112201402–112201854 · regulatory

ENSR7_93MJG6 · enhancer · 112202824–112203208 · regulatory

ENSR7_D7KBC · enhancer · 112204011–112206388 · regulatory

ENSR7_93MJH6 · promoter · 112206389–112206711 · regulatory

ENSR7_5ZDKRN · CTCF_binding_site · 112206519–112206540 · regulatory

ENSR7_CF5LS · enhancer · 112206712–112207796 · regulatory

ENSR7_93MJJM · enhancer · 112211409–112211813 · regulatory

· motif · 112205108–112205121 · motif

· motif · 112205578–112205587 · motif

· motif · 112206250–112206265 · motif

· motif · 112206439–112206449 · motif

· motif · 112206520–112206531 · motif

· motif · 112206520–112206531 · motif

· motif · 112206521–112206537 · motif

· motif · 112206522–112206531 · motif

· motif · 112206529–112206539 · motif

· motif · 112206533–112206550 · motif

· motif · 112206602–112206612 · motif

· motif · 112206666–112206676 · motif

· motif · 112206789–112206799 · motif

· motif · 112206824–112206834 · motif

· motif · 112206936–112206949 · motif

· motif · 112207221–112207228 · motif

· motif · 112207320–112207332 · motif

· motif · 112207672–112207687 · motif

· motif · 112207672–112207687 · motif

氧化壓力會下調 ZNF277。來源未提供此調控發生的條件或所涉及的分子機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:450 aa

1 aa450 aa鋅指
依 Q9NRM2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF277 蛋白長 450 個胺基酸,具有兩個 C2H2 型鋅指結構域:第一個位於第 224–248 個胺基酸,第二個位於第 355–381 個胺基酸。ZNF277 屬於 ZNF277 家族。

鋅指C2H2-type 1224–248 aa
鋅指C2H2-type 2355–381 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NRM2…

AlphaFold · Q9NRM2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

來源未描述其定位隨條件改變的情形或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
NRIF4ZNF277
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF277 透過鋅指結構域與 RPS2(40S ribosomal protein S2)直接作用;這種作用位於核糖體之外,且可能發生於 RPS2 在轉譯過程中合成時。ZNF277 與 RPS2 的作用會與 RPS2 結合 PRMT3 相競爭。另有相似性推論指出,ZNF277 與 PcG 複合體蛋白 BMI1 作用,並可能與 BMI1、RNF2/RING2 組成複合體;後兩項關係屬推論,並非直接結合證據。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF277 可能是轉錄因子,參與細胞衰老的調節,並抑制腫瘤抑制基因 INK4A/ARF 的轉錄;此抑制作用或許透過 Polycomb group(PcG)複合體 PRC1 進行,機制仍帶有不確定性。推論支持
證據與來源

Probable transcription factor. Involved in modulation of cellular senescence; represses transcription of the tumor suppressor gene INK4A/ARF, perhaps acting via the Polycomb group (PcG) complex PRC1

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF277 透過鋅指結構域直接與 RPS2 作用,可能發生於 RPS2 在轉譯時新生的過程,且作用位於核糖體之外;此作用會與 PRMT3 結合 RPS2 相競爭。ZNF277 也與 BMI1 作用,並可能與 BMI1、RNF2/RING2 同處一個複合體,後兩項關係依相似性推論。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via zinc-finger domains) with RPS2/40S ribosomal protein S2, perhaps as nascent RPS2 is synthesized during translation; the interaction is direct; the interaction is extra-ribosomal. Interaction with RPS2 competes with the binding of RPS2 to protein arginine methyltransferase PRMT3. Interacts with Polycomb group (PcG) complex protein BMI1 (By similarity). May be part of a complex including at least ZNF277, BMI1 and RNF2/RING2 (By similarity)

PMID 30530495 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF277 的細胞內定位為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

調控氧化壓力會使 ZNF277 的表現下調。推論支持
證據與來源

Down-regulated by oxidative stress

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000361822 · 2,580 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCTTTTCTTTTCTGCCGGGTAATGGCTGCTTCCAAGACC40
41CAGGGGGCTGTCGCCCGAATGCAGGAAGACCGTGATGGGA80
81GCTGCAGCACAGTCGGGGGTGTAGGTTATGGGGACAGTAA120
121GGATTGTATCCTGGAGCCGCTTTCCCTGCCAGAAAGTCCA160
161GGTGGCACCACCACTTTAGAAGGTTCTCCATCTGTGCCTT200
201GTATTTTCTGTGAAGAACATTTTCCTGTGGCTGAACAAGA240
241CAAACTTCTGAAGCACATGATTATTGAGCATAAGATTGTC280
281ATAGCTGATGTCAAGTTGGTTGCTGATTTCCAAAGGTACA320
321TTTTATATTGGAGGAAAAGGTTCACTGAACAGCCCATCAC360
361AGATTTTTGTAGTGTAATAAGAATTAATTCCACTGCTCCA400
401TTTGAAGAACAAGAGAATTATTTTTTGTTATGTGACGTTT440
441TACCAGAAGATAGAATTCTTAGAGAAGAGCTTCAGAAACA480
481GAGACTGAGAGAAATTCTGGAACAACAGCAGCAAGAACGA520
521AATGATACCAATTTTCATGGCGTTTGTATGTTTTGCAATG560
561AAGAATTCCTTGGAAACAGATCTGTTATTTTGAACCACAT600
601GGCCAGAGAACATGCTTTCAACATTGGATTGCCAGACAAC640
641ATTGTAAACTGCAATGAATTTTTGTGTACATTACAGAAAA680
681AGCTTGACAATTTGCAGTGCTTGTACTGTGAGAAGACCTT720
721CAGGGACAAAAATACACTTAAAGATCACATGAGGAAAAAA760
761CAGCATCGTAAGATTAATCCTAAGAACAGAGAATATGACA800
801GATTTTATGTCATCAATTATTTGGAACTTGGAAAATCGTG840
841GGAAGAAGTTCAGTTGGAAGATGATCGGGAGTTGCTGGAC880
881CATCAGGAAGATGACTGGTCTGATTGGGAAGAACACCCTG920
921CCTCTGCAGTCTGCTTATTTTGTGAAAAGCAAGCAGAAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。