基因總覽
ZNF275 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 275 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。現有資料將它與轉錄調控連結,但僅指出可能參與,未提供其調控對象或作用方式的細節。蛋白質含有多個 C2H2-type zinc finger,並具有註解為無序的區域,呈現鋅指結構域與無序區段並存的特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000650114 ★ | 153,334,153–153,352,926 | 4 |
| ENST00000370251 | 153,334,122–153,352,926 | 5 |
| ENST00001119143 | 153,334,122–153,352,925 | 3 |
| ENST00001136543 | 153,334,122–153,352,926 | 4 |
| ENST00000370249 | 153,334,147–153,352,882 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出,zinc finger protein 275 可能參與轉錄調控。這項描述屬於可能性,並未確立其在特定細胞或生物過程中的作用,也沒有說明它調控哪些基因或轉錄事件。因此,較適合將轉錄調控視為其可能涉及的功能方向,而非已明確界定的作用機制。
現有資料未提供 ZNF275 如何影響轉錄的細節,例如是否直接作用於 DNA、如何辨識調控序列,或是否透過其他分子改變轉錄活性;也未指出相關作用的條件或下游結果。因而目前能支持的功能說明僅限於它可能參與轉錄調控,不能據此推定具體的調控方向、分子途徑或生理意義。
Promoter 與基因調控
>ZNF275 ENST00000650114 GRCh38 chrX:153333153-153334253 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCTCTCTCTATATATACACACACACATATATATACATATATATATACTGCACATAACATTGGGCAAACT ACTTGAACAGACACTTTACAAAGAAAGATATAGAAATGGCCAGTGAGCACATAAAAGCATACTCAACATA ATTAGTCATCAGGGAGATGATAATTGAAATAACAATGAGATGCCACTTCCCACCCTTTCAAATGGCTAAA AATAAAGGCTGACAACCTCAAATGTTGATGAGGATGGGAAAGAAAAGGAGCTCGCATACATTTCTGGTGG GAATGTAAATTGCACAACCACTTTGGAATACATTCTGGCAGTTTCTTATAAAACATAAAACTATCCTGTG ATGTGGCAATTCATCTCTTAGGTATTTGCCCAAGAAAAATGAAAGCATATGTCCACACAAAGATGTGTAC ATGAATATTCATAGTAGCTTTATTTATAATCGCCCAAACTGGAAACAGCCCAGATCATAACCTGGTGAAT GAACAAACCAACTCTGATATATCCAAACAATAGCATACTACTCAGCGATAGCACATTCAACAACATAGAT AAATCTTGAAAACATCACGTTGAATGAAAGAATCCAGACACACAATAGTACATACGATCTGATTCCATTC ATACAGAATACTGGCTTTCCAGTCTTCGCCCTCAGTTCCCGACCCTTCACTCCCCCCACCACCATCTTGA AGATGCCCAAGGGGGAGAGGTCCCTTCCATTCCTTCGTTCCTTCCTTCGTCTGCTGGTCGATTTGTTCGC TCGTTCATTCATTCATTCGCACGCTCATTCCACTCCTCCCCACCTCCACCCAAGCGTCCAGCCCGCGCGC GCCGCTCCCCCGCAGGCTGATCAGACTTGCCTGCCCAGTCCGCCCCCGCCCAAACCCCGCCCCCTTCCCG CCACGCCCCCTTCCCGGGCCAATCGGGGACGAGACTGGGGCCGGGGCGGGGCCTCGCTCCCTCAGAACCC CCGGCGGCGCTCACGGCTCCGGAAACGCGCCGCGGGGCTGTTAGCTCGGCTGGGCACGGGCGGCTCCGTG GCGCTTCCTGCCACGCCAGGCCTGCCTGGGCCGCGCCAGCGCCGCTCCACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_948T8G · promoter · 153333657–153334165 · regulatory
ENSRX_B35FLS · enhancer · 153334166–153335037 · regulatory
ENSRX_948T95 · enhancer · 153336085–153336478 · regulatory
· motif · 153333441–153333450 · motif
· motif · 153333441–153333450 · motif
· motif · 153333967–153333980 · motif
· motif · 153333995–153334008 · motif
· motif · 153334031–153334044 · motif
· motif · 153334348–153334361 · motif
· motif · 153334428–153334441 · motif
· motif · 153334476–153334489 · motif
· motif · 153334541–153334557 · motif
· motif · 153335139–153335154 · motif
· motif · 153335146–153335161 · motif
· motif · 153336227–153336240 · motif
· motif · 153336393–153336402 · motif
· motif · 153336393–153336404 · motif
· motif · 153336393–153336404 · motif
· motif · 153336683–153336691 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:429 aa
zinc finger protein 275 長 429 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列出 11 個 C2H2-type zinc finger,另有兩段被註解為無序區域,分別位於胺基酸 31–95 與 149–176。這些資訊描述其結構特徵,未提供各區段的實驗功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 275 的定位資料標示為細胞核;來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- BAHD1Q8TBE0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIN28AQ9H9Z2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBM10P98175 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RNF4P78317 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRAF4Q9BUZ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ZNF329Q86UD4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF648Q5T619 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF792Q3KQV3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF837Q96EG3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGAAACGCGCCGCGGGGCTGTTAGCTCGGCTGGGCACGGG40CGGCTCCGTGGCGCTTCCTGCCACGCCAGGCCTGCCTGGG80CCGCGCCAGCGCCGCTCCACCGAGGGCCGCGCGTCGGCCG120CCGCCGGGCCTGGATGGGGCCTTACCTGCCAGGCTGATCC160CTTGGAGTAGTTCTGAGGCATGATGAGTCATCCGTGTGTG200TCTCTTTTGGGCGTTCCTGTTTTAAATCCTGCCTTGGTCC240CTCACCTGGCACAAGGACAAGTGCTACTGGTGTCAGACCC280ATCGCCCAACACTGATCCTGCTAAGTACTCTGAAAGCACC320TCCGCGACCCGACACCAGATGAAGGGGGAAGATGCCCAGC360CACAGGAGATGGCGTCCACAAGCTTCCCAAGGGCCAGTGG400TCCCAGTCCTGAATTCAGACAGCACGGGGACTCTGACGGG440AAGAGAGGGAGCCCACAGAATCTGCCCATAGAACATCATT480TTGCTTGTAAAGAGTGTGGGGACACCTTTCGGCTTAAAGT520CCTGCTTGTCCAGCACCAGAGAGTCCACAGTGAGGAGAAG560GGCTGGGAATGTGGCGACTGCGGGAAGGTCTTTAGGGGGG600TGGCGGAGTTTAATGAGCACAGGAAAAGCCACGTAGCTGC640GGAGCCCCAGCCCGGCCCCAGTAGGGCCCTGGAGAATGCC680GCGGAGAAGAGGGAGCAGATGGAGAGGGAGGCAAAGCCCT720TCGAGTGCGAGGAGTGCGGAAAACGGTTTAAGAAGAATGC760AGGCCTGAGTCAGCATCTGAGGGTCCACAGCAGAGAGAAG800CCCTTTGATTGCGAGGAATGCGGGCGGTCGTTCAAAGTCA840ACACCCACCTCTTCCGACATCAGAAACTTCACACTTCGGA880AAAGCCTTTCGCCTGCAAGGCGTGCAGCAGGGATTTCCTG920GATCGCCAGGAGCTTCTCAAGCACCAGCGCATGCACACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。