基因總覽
ZNF273 的正式名稱為 zinc finger protein 273,屬於蛋白質編碼基因。其產物 Zinc finger protein 273 歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,蛋白質全長 569 個胺基酸。序列包含一個 KRAB 結構域,以及多個 C2H2 型鋅指區域,其中部分鋅指被註記為退化型;兩端另有無序區域。這些家族與結構特徵構成認識此蛋白質的基本資訊;目前提供的功能描述僅指出它可能參與轉錄調控,並未進一步界定其作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000476120 ★ | 64,903,273–64,930,981 | 4 |
| ENST00000936012 | 64,903,242–64,929,257 | 3 |
| ENST00001104077 | 64,903,242–64,929,257 | 2 |
| ENST00001110420 | 64,903,242–64,924,433 | 4 |
| ENST00001122102 | 64,903,242–64,944,241 | 4 |
| ENST00001126681 | 64,903,242–64,924,433 | 4 |
| ENST00001126682 | 64,903,242–64,923,437 | 3 |
| ENST00001142741 | 64,903,242–64,930,981 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料將 ZNF273 的功能描述為「可能參與轉錄調控」,因此其轉錄調控角色仍屬可能性,而非已確立的作用。來源未提供其調控方向、作用標的或具體分子機制,也未說明它在何種細胞或生物學條件下參與此過程。
Promoter 與基因調控
>ZNF273 ENST00000476120 GRCh38 chr7:64902273-64903373 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATTAACTCCGTTTTAAAATCTCAGGCTGCCTGCTTAAAGGACCAGAAGCTAGGAAGGTCGTAAAATCGG ATATTAAATAATGTTATTATATTTTTTCCATTTGTTAATAGCCATATAATTGTGAACCTCAAATATCTGA GACAGATCTCAGTTAATTTAGAAAGTTTATTCTGAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGC ACTTTGGGAAGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGACAAAGTGGTGA AACCCCGTCTTTACTAAAAATAGAAAAATTAGCCAGCTACTCTGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGA ACCCCGGAGGGAGGTGGAAGTTGCAGTAGCAGAGATCGGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGAAGACA GAGCGAGACTCCGAAAGAGACAGAGAGAGAGAAAGAAAAAGAAAGAAAGAAAACTGGAAGTGGGGAGGCG GCTTCCAGGTCCTAGGTAGATAAAAGACAAATGGTTGCATTCTTTTGAGTTCCTGATTAGCCTGGGAAAA GGAGGCAATCAGATATGCAATCATCTCAGTGAGCAGAGGGGTGACTTTGAATAGAATGGAAGGCAGGTTT GCCCTAAGCAGTTCCCAGCTTGACTTTTCCCTATAGCTTAGTGATTTTGGGGCCGCAAAATTTATTTTCC TTTCACACACTATACTATTTATTAATATAAATGCATATGACCTTATACACAAGGTTAAATGCAAATACCC CGTGGGTGGGCCGGGCTCAGTTCAGGGAGGAAGCCCTGACTGAAAAGCCTGCAGTTTAGGTTTCATTCTA TCTTCTTTCAGCCCAGCAACTGAGCACACCTTCTGTCATTCAGGGCCTGAGGGGGCGGGTCCTTAAACAT CCTCCAATCAGGGACGCTGGGCTGGGACCCGTCCAATCAGGCACGCAGCTGGAGCGGACAGGACGGCTTC CGGGATTTGGCGGGGCCTTTGTCTCTCGCTGCAGTCGCAGCTCCAGGTCTCGTCTTCACTGCTCTATGTC CTCTGCTCCTAGAGGTCCACCTTCTGTGGCCCCGTTACCTGCAGGTATTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF273_1 ↗ | 7:64,903,273 | 正股 | 64,903,224–64,903,283 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9XQJR · promoter · 64902783–64903283 · regulatory
ENSR7_9XQL8 · enhancer · 64907693–64908149 · regulatory
· motif · 64903006–64903018 · motif
· motif · 64903094–64903114 · motif
· motif · 64903163–64903173 · motif
· motif · 64903247–64903256 · motif
· motif · 64903247–64903258 · motif
· motif · 64903475–64903489 · motif
· motif · 64903991–64904004 · motif
· motif · 64903991–64904004 · motif
· motif · 64906042–64906057 · motif
· motif · 64907845–64907860 · motif
· motif · 64907874–64907889 · motif
· motif · 64907874–64907889 · motif
· motif · 64907917–64907928 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:569 aa
Zinc finger protein 273 長 569 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列在第 66–108 個胺基酸處含 KRAB 結構域,並具有 13 個 C2H2 型鋅指註解,其中第 1、8 與 13 個標示為退化型。第 1–31 與 536–569 個胺基酸區段另註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF273 的定位資料指向細胞核;來源未提供定位隨條件或異構型而改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- KRTAP10-5P60370 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTCTCGCTGCAGTCGCAGCTCCAGGTCTCGTCTTCACT40GCTCTATGTCCTCTGCTCCTAGAGGTCCACCTTCTGTGGC80CCCGTTACCTGCAGGTATTGGGAGATCCACAGCTAAGACG120CCAGGACTCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACCACTGACAT160TTAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAGTGGCA200ATGCCTGGACACTTCACAGCAGAATTTGTATAGGAATGTG240ATGTTAGATAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGGTATTG280CTGTCTCTAAGCCAGACCTGATCACTTGTCTGGAGCAAGG320AAAAGAGCCCTGCAATATGAAGAGACATGCGATGGTAGCC360AAACCCCCAGTTGTGTGTTCTCATTTTGCCCAAGACCTTT400GGCCAAAGCAGGGCTTAAAAGATTCTTTTCAAAAAGTGAT440ACTGAGAAGATATGGAAAATATGGACATGAGAATTTACAA480TTAAGAAAAGGCTGTAAAAGTGCGGATGAGCATAAGGTGC520ACAAAAGAGGTTATAATGGACTTAACCAATGTTTGACAAC560TACCCAGAGCAAAATATTTCAATGTGATAAATATGTTAAA600GTCCTTCATAAATTCTCAAATTCAAATATACATAAGAAAA640GACAAACTGGAAAGAAACCTTTCAAATGTAAAGAATGTGG680CAAATCATGTTGCATACTTTCACAACTAACTCAGCATAAG720AAAACTGCTACTAGAGTGAATTTCTACAAATGTAAGACAT760GTGGAAAAGCCTTTAACCAGTTCTCAAATCTTACTAAACA800TAAGATAATTCATCCTGAAGTGAATCCCTACAAATGTGAA840GAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTTAACTCTTACTA880AACATAAAAAAATTCATACTGAAGAGAAACCTTACAAATG920TGAAGATTGTGGCAAAGTCTTTAGTGTATTTTCAGTCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。