演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF268HZF3

zinc finger protein 268

ZNF268(zinc finger protein 268)是轉錄抑制因子,與紅系分化、腫瘤細胞增殖及抗病毒干擾素訊號調節有關。

Homo sapiens12q24.33UniProt Q14587
OFFICIAL SYMBOL
ZNF268
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q14587
PDB / ALPHAFOLD
2EL4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF268 是一個蛋白質編碼基因,其產物為 zinc finger protein 268,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出它參與多種生物學情境,包括紅系分化、腫瘤細胞增殖,以及抗病毒干擾素訊號的調節。這些資料呈現 ZNF268 在轉錄調控與訊號相關過程中的不同角色;各作用的具體機制與條件則分別見功能說明。

Official symbol
ZNF268
Gene name
zinc finger protein 268
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13061
UniProt
Q14587
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HZF3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212q24.33
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegZNF268pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:133,181,409–133,214,832
Gene span
33,424 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000536435 ★133,181,495–133,214,8326
ENST00000416488133,181,409–133,193,5376
ENST00000228289133,181,474–133,214,8326
ENST00000885506133,181,474–133,214,8325
ENST00000937514133,181,474–133,214,8326
ENST00000995336133,181,474–133,214,8327
ENST00000541211133,181,495–133,214,8325
ENST00000539248133,181,495–133,214,8324
ENST00000542711133,181,495–133,214,8324
ENST00000536899133,181,495–133,214,8323
ENST00000542986133,181,495–133,214,8327
ENST00000541009133,181,495–133,214,8327

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF268 被描述為轉錄抑制因子,並與紅系分化及腫瘤細胞增殖的抑制相關。來源也指出,它在卵巢癌的發展與進程中具有作用,但未進一步說明其具體機制或作用方向,因此不宜據此推論更詳細的腫瘤調控途徑。

在子宮頸癌發生方面,ZNF268 被認為部分透過 TNF 誘導的 NF-kappa-B 訊號途徑產生影響。此關聯涉及與 I-kappa-B-kinase(IKK)核心複合體的互作;資料指出這是其促成子宮頸癌發生的部分途徑,並未將此作用描述為唯一機制。

ZNF268 也參與抗病毒干擾素訊號調節。在病毒感染期間,它會招募 SETD4 至 TBK1,促使 TBK1 發生單甲基化。來源指出,此修飾對 TBK1 複合體組裝及 IRF3 訊號傳遞至關重要,將 ZNF268 的作用連結至感染情境下的訊號調節。這項機制的描述限定於病毒感染期間,不能概括為所有條件下的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 133181495 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF268 ENST00000536435 GRCh38 chr12:133180495-133181595 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACTCAAAAGGTGTGGGGGGGTTTCAGGGATAATCATAAATTACCTGACTGGTACAATGCATATAACGTA
CTATAGGGCGTGGATACCTTAAAAGCCTTGACATCACCACTACACAACTGATGCATGTAACAAAATTACA
CTTGTACCTCATAAATTTATAAAAGTTTTTAAAAGCCAAAAACAAAAGAATTCTAGAAAACTTGTATCTG
CCTCTGTGAATGTCACCTCTTCCCAATACTTAAGATCAATAATGATTAGTGGATATTTTCCGTTGGTGCA
AAAGTAAGTAATTGCGGCTTTTGCCATTAAAGTAAACCAATATTTTCCAACTGGCCAATACATGATGTTA
CGAAATCATGCGTGATAAAAGAATCCATTCAAAGTGCAGTGTAGACCAACGGATTTTATGTAATAGAGTA
GAAAAAGTTCATCTACGTGGTTTCAGATTGTACACTAACAAAACTATCCCTTGTTCGACTTGTATCTTTA
TATACTTTAACAAAAACAACATACGCAACAGATTAAACATAGAAGCAGATATGAGAATCCAGCTTTCTAG
TAAGTCAGAAAAGACTTAAAAAGCGAAGCCACTCCTTACTAAATTTTTTCTTTTGTAAAATATATGTAAT
TTTCATTAAAATATTATTTATGTTAACATGTAATGGGAATTTTACGAATCTGTTATTAAAGTGTAAAGCA
AAATAAGACTTTTACCATTTCAGTAAAGCAGGGACTAGAACACTTGTAACCTAATTTACATCCCTCCAAC
CGTTGAGCCATTGGTGTCAAGTATTTTAATTCTCTTTAAAATTTAAAACCTGCAAGCGCGGGAGCTCAGG
GACCTGGCCAGGAAGGCCTGAGCTTCCGGGTCATCTTAGCACGCCCCCTCCCGGTGGCCCTTGGCCGGAG
CCCTCCGGCGCGGGAGTAACTCCTCGCAGAGGCCTCTGGGAGTTGTAGTTTTTTTGCCTTTGCCTCTCCA
TGACGCAATTCCTGTGCGACATACGTAGCGGCCGCCATTGTTCCGCGCCGATGGCGAGATCCTTGTTCCT
CAGATAGCGTTCATCGCCCGTCGTGGTCAACGGGCCAGCCGAGTCTGGAGT
ZNF268 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF268_1 ↗12:133,181,495正股133,181,446–133,181,505

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_BZFM5 · promoter · 133180966–133181630 · regulatory

ENSR12_536BRBG · CTCF_binding_site · 133181372–133181393 · regulatory

ENSR12_536BRCH · CTCF_binding_site · 133181597–133181618 · regulatory

· motif · 133180841–133180850 · motif

· motif · 133181355–133181364 · motif

· motif · 133181355–133181366 · motif

· motif · 133181355–133181366 · motif

· motif · 133181374–133181390 · motif

· motif · 133181474–133181483 · motif

· motif · 133181504–133181514 · motif

· motif · 133181567–133181582 · motif

· motif · 133181599–133181615 · motif

· motif · 133181680–133181689 · motif

ZNF268 在紅系分化期間受 GATA1 下調;HTLV-1 Tax 亦可透過 CREB/ATF pathway 下調其表現。相對地,UPF1 與 cyclic AMP-dependent transcription factor ATF4 可上調 ZNF268。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:947 aa

1 aa947 aa結構域鋅指
依 Q14587 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 268 長 947 個胺基酸,具有位於第 81–152 位的 KRAB domain,並包含 24 個連續排列的 C2H2-type zinc finger,範圍由第 276–298 位延伸至第 920–942 位。此蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB81–152 aa
鋅指C2H2-type 1276–298 aa
鋅指C2H2-type 2304–326 aa
鋅指C2H2-type 3332–354 aa
鋅指C2H2-type 4360–382 aa
鋅指C2H2-type 5388–410 aa
鋅指C2H2-type 6416–438 aa
鋅指C2H2-type 7444–466 aa
鋅指C2H2-type 8472–494 aa
鋅指C2H2-type 9500–522 aa
鋅指C2H2-type 10528–550 aa
鋅指C2H2-type 11556–578 aa
鋅指C2H2-type 12584–606 aa
鋅指C2H2-type 13612–634 aa
鋅指C2H2-type 14640–662 aa
鋅指C2H2-type 15668–690 aa
鋅指C2H2-type 16696–718 aa
鋅指C2H2-type 17724–746 aa
鋅指C2H2-type 18752–774 aa
鋅指C2H2-type 19780–802 aa
鋅指C2H2-type 20808–830 aa
鋅指C2H2-type 21836–858 aa
鋅指C2H2-type 22864–886 aa
鋅指C2H2-type 23892–914 aa
鋅指C2H2-type 24920–942 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2EL4…

PDB · 2EL4

NMR · - · A=663-695

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Cytoplasm

Isoform 1 位於細胞核;Isoform 2 則可見於細胞核與細胞質。 靜息條件下,細胞質中的 ZNF268 會被自噬體降解,因此蛋白質表現量偏低;病毒感染期間則會在細胞質累積。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HZF3ZNF268
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF268 透過 KRAB domain 與 TRIM28 的 RBCC domain 互作,此互作會提高 ZNF268 的核定位活性。Isoform 2 可與 CHUK 和 IKBKB 互作,且此互作在 TNF 依賴性條件下增強。ZNF268 也與 TOLLIP 互作;ZNF268 在 Ser-178 的磷酸化會削弱此互作。此外,ZNF268、TBK1 與 SETD4 形成三元複合體,且 SETD4 與 TBK1 的互作依賴 ZNF268。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF268 具有轉錄抑制作用,並抑制紅系分化與腫瘤細胞增殖;此外,它也參與卵巢癌的發展與進程,但來源未提供此部分的具體作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

Acts as a transcriptional repressor. Inhibits erythroid differentiation and tumor cell proliferation. Plays a role during ovarian cancer development and progression

開啟資料庫紀錄 ↗

功能ZNF268 部分透過 TNF 誘導的 NF-kappa-B 訊號途徑促成子宮頸癌發生;此作用涉及它與 I-kappa-B-kinase(IKK)核心複合體互作,來源未指出這是唯一途徑。資料庫紀錄
證據與來源

Contributes to cervical carcinogenesis in part through the TNF-induced NF-kappa-B signaling pathway by interacting with the I-kappa-B-kinase (IKK) core complex

開啟資料庫紀錄 ↗

功能ZNF268 參與抗病毒干擾素訊號調節;病毒感染期間,它招募 SETD4 至 TBK1,促使 TBK1 單甲基化。此修飾對 TBK1 複合體組裝及 IRF3 訊號傳遞至關重要。含實驗來源
證據與來源

Involved in the regulation of antiviral interferon signaling. During viral infection, recruits SETD4 to TBK1, leading to TBK1 monomethylation, which is critical for the assembly of TBK1 complex and IRF3 signaling

PMID 37926288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF268 透過 KRAB domain 與 TRIM28 的 RBCC domain 互作,並提高其核定位活性。Isoform 2 與 CHUK、IKBKB 的互作會受 TNF 增強;Ser-178 磷酸化會削弱與 TOLLIP 的互作。ZNF268 亦與 TBK1、SETD4 形成三元複合體,SETD4 和 TBK1 的互作依賴 ZNF268。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via the KRAB domain) with TRIM28 (via the RBCC domain); the interaction increases ZNF268 nuclear localization activity. Isoform 2 interacts with CHUK and IKBKB; the interaction is further increased in a TNF-dependent manner. Interacts with TOLLIP; this interaction is impaired by ZNF268 phosphorylation at Ser-178. Forms a ternary complex with TBK1 and SETD4; the interaction between SETD4 and TBK1 is ZNF268-dependent and leads to TBK1 monomethylation

PMID 23091055 ↗ · PMID 23665872 ↗ · PMID 37926288 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF268 的 Isoform 1 位於細胞核。含實驗來源
證據與來源

Isoform 1; Nucleus

PMID 23665872 ↗

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細胞定位ZNF268 的 Isoform 2 可定位於細胞核與細胞質。含實驗來源
證據與來源

Isoform 2; Nucleus; Cytoplasm

PMID 23665872 ↗

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細胞定位ZNF268 位於細胞質;靜息條件下會被細胞質中的自噬體降解,造成蛋白質表現量偏低。病毒感染期間,ZNF268 則會在細胞質累積。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Under resting conditions, degraded by autophagosomes in the cytosol, resulting in low expression at the protein level. Accumulates in the cytoplasm during viral infection

PMID 37926288 ↗

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調控紅系分化期間,GATA1 會下調 ZNF268;HTLV-1 Tax 也會透過 CREB/ATF pathway 下調其表現。UPF1 與 cyclic AMP-dependent transcription factor ATF4 則會上調 ZNF268。含實驗來源
證據與來源

Down-regulated during erythroid differentiation by GATA1. Down-regulated by HTLV-1 Tax through the CREB/ATF pathway. Up-regulated by the regulator of nonsense transcript UPF1. Up-regulated by the cyclic AMP-dependent transcription factor ATF4

PMID 16787922 ↗ · PMID 18375384 ↗ · PMID 18774934 ↗ · PMID 22235304 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000536435 · 13,390 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATACGTAGCGGCCGCCATTGTTCCGCGCCGATGGCGAGAT40
41CCTTGTTCCTCAGATAGCGTTCATCGCCCGTCGTGGTCAA80
81CGGGCCAGCCGAGTCTGGAGTGGTTGCGAACCCTTCTGGC120
121TGCAGATCTGGAGGTGGAGGCAGTACCCTGGACTCTATTC160
161TGCTGCCCCTTCAGGGTTTGGAGGAGCCGGAGCATCCCTC200
201GCGTCCTGTCACTTCCAGCGAGGCACACAAAACTGACCGT240
241AGGGATGGCCACCAGGGTCCGGACAGCTTCTATTTGGGTC280
281CCACCTCTCCAAGAACGAAACAGTTCATGGGATAGGATCA320
321GAAAGCTCCAAGGTCAGGAATCCATCTTGGGCCAAGGGAC360
361TCCTGGTCTGCAACCTCTCCCTGGAACACCCAGGCAGAAG400
401CAGAAGAGTCGCAGAATAGAGAAAGTCCTAGAGTGGCTGT440
441TTATTTCCCAAGAGCAGCCAAAAATCACCAAGTCCTGGGG480
481ACCTTTGTCATTCATGGATGTGTTTGTGGATTTTACCTGG520
521GAGGAGTGGCAGCTGCTAGACCCAGCACAGAAGTGCCTGT560
561ACAGGAGTGTGATGTTGGAGAACTATAGCAACCTGGTGTC600
601CCTAGGGTACCAACACACCAAACCTGATATCATCTTCAAG640
641TTGGAACAAGGAGAAGAGCTGTGTATGGTGCAGGCCCAAG680
681TTCCAAATCAGACCTGTCCAAACACAGTCTGGAAAATTGA720
721TGATCTTATGGATTGGCATCAGGAAAATAAAGACAAGCTG760
761GGAAGTACGGCAAAAAGCTTTGAATGCACTACATTTGGAA800
801AACTATGTCTTCTTAGTACAAAGTATCTTTCAAGACAAAA840
841ACCTCATAAATGTGGCACGCATGGAAAGAGTTTGAAATAT880
881ATAGATTTCACTAGTGATTATGCTAGAAATAATCCTAATG920
921GGTTTCAGGTACATGGAAAATCATTCTTCCATTCTAAACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。