基因總覽
ZNF267(zinc finger protein 267)是位於人類第 16 號染色體 16p11.2 區域的蛋白質編碼基因,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 743 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger 結構域;其中第二個 zinc finger 被註記為非典型。這些序列特徵界定了它的蛋白質家族與基本分子架構。現有資料指出其可能參與轉錄調控,但尚未提供更具體的調控標的或作用條件。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300870 ★ | 31,873,807–31,917,357 | 4 |
| ENST00000394846 | 31,873,788–31,914,725 | 5 |
| ENST00000854651 | 31,873,788–31,918,055 | 3 |
| ENST00001119649 | 31,873,788–31,897,134 | 5 |
| ENST00001132469 | 31,873,788–31,918,055 | 4 |
| ENST00000562971 | 31,874,066–31,914,620 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF267 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源沒有進一步界定調控方向、作用標的或發生條件,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
目前提供的資料也未說明 ZNF267 如何影響轉錄、是否直接接觸 DNA,或其 KRAB 與 zinc finger 區域在功能上的分工;亦沒有列出受調控基因、生物學過程或實驗系統。因此,對其功能的理解應限於「可能參與轉錄調控」這一層級,不能延伸為已確認的分子機制或特定生理作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF267 ENST00000300870 GRCh38 chr16:31872807-31873907 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTCAGGAGATGGAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAAACCTCATCTCTACAAAAAATACAAAAATCAGC CGGGCATGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAAGATTGCTTGAGCCCC GGAGGCTGCAGTGAGCCATGACTGCACCACTGCACCAGCCTGGGCAATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAA CAAAAGCAAAAACCAGAGGTAGGGCTGAGGAGTCCGTGGCCACAGAGCCTGAGCCAGCACGGCCCAGAGG AACTGAGCTCCCAGCCCTGTCGCTGCCAAGGACCCTTCTTCCCTGAGCTTGAAGGGATTGAGAAGGAGAG ACAGACGGACAGTCAGCGGCCCCGTTACCAGTGATGCAGACTCCAGGAGATGCGGGCAGAGTTGTAGATT AGAAGAATAGGCCAGCCCCTCTTCCACGTTCCACCACGGCCCGCAACATCCTCCTGGGACCCCAGCCTGC ATGCCCCTATAAGATGCTTTTGCACTGGTTCAGTCTATGTATCATGCGAGGGCCTAATTGAAAACACGTG AATGAAGTGTACGGCCTTCTGTTCCCAGCTGAGGGGCCCCCTCCCACGGTGGCGTTAGCAGTGGGGTACA GTGCGGTAAGAGAGGTGCTAAGGGACGGGATGAGGGTCTTTCTTGCTTTAAAGGTGTCTAAATATACTTC TTCTTAAACTTAATTAGCTAATAAGATGTCTTATACAAGCAGAACCAGGTAAGGGAAAGAGCAAGTGTAT TTCAAGTCGCAGCTCACCCCTTAATTAGCTGTAATACCCGCAGCAGGCGGCCCCACCTCAATGAGCCAGT CTCCCTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCACTAATAATGAGGGGGCGGGGCATGGAGCTTTATCCAATC AGGGGCGCTGGAGTGGAAACCGTCCAATCAGGAGTGAAGCCGGAGAGCAGGGGCGGCTTCCGGGATTTGG CGGGGGCCTTCGTCGGCTCCAGTTAGAGCTCGGGTCTCCTCGCCACAGCTCCGAGTCTTTCGTTCTGGGA GGCCCAGGCGGCTTCGCGTTCTGAGAATAAACAGAACCTCTGTTGCTCTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF267_1 ↗ | 16:31,873,811 | 正股 | 31,873,762–31,873,821 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_B8BQN · enhancer · 31868621–31869262 · regulatory
ENSR16_9GMJJ · promoter · 31869357–31869810 · regulatory
ENSR16_9GMJM · enhancer · 31869811–31870298 · regulatory
ENSR16_9GMKN · promoter · 31873317–31873817 · regulatory
ENSR16_C56DQ · enhancer · 31873818–31875493 · regulatory
ENSR16_C56DX · enhancer · 31876751–31877935 · regulatory
· motif · 31868913–31868928 · motif
· motif · 31869007–31869027 · motif
· motif · 31869298–31869313 · motif
· motif · 31869298–31869313 · motif
· motif · 31869766–31869777 · motif
· motif · 31870140–31870153 · motif
· motif · 31870190–31870203 · motif
· motif · 31871718–31871729 · motif
· motif · 31873475–31873497 · motif
· motif · 31873475–31873497 · motif
· motif · 31873553–31873573 · motif
· motif · 31873688–31873698 · motif
· motif · 31873771–31873782 · motif
· motif · 31873950–31873961 · motif
· motif · 31873950–31873961 · motif
· motif · 31873952–31873961 · motif
· motif · 31874130–31874140 · motif
· motif · 31874429–31874444 · motif
· motif · 31874532–31874547 · motif
· motif · 31874566–31874581 · motif
· motif · 31874682–31874693 · motif
· motif · 31874682–31874693 · motif
· motif · 31875214–31875222 · motif
· motif · 31875356–31875369 · motif
· motif · 31875356–31875369 · motif
· motif · 31875388–31875401 · motif
· motif · 31875388–31875401 · motif
· motif · 31875476–31875487 · motif
· motif · 31875543–31875556 · motif
· motif · 31875543–31875556 · motif
· motif · 31876276–31876288 · motif
· motif · 31877454–31877466 · motif
· motif · 31877637–31877651 · motif
· motif · 31878482–31878493 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:743 aa
ZNF267 蛋白質全長 743 個胺基酸,N 端第 4–75 位為 KRAB 結構域。蛋白質另含 15 個 C2H2-type zinc finger,其中第 2 個註記為非典型,其餘為 C2H2-type。此家族分類與結構域註解描述其序列架構,不單獨證明特定功能。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF267 的細胞內定位註記為細胞核;資料未提供定位變化條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGTTAGAGCTCGGGTCTCCTCGCCACAGCTCCGAGTCTTT40CGTTCTGGGAGGCCCAGGCGGCTTCGCGTTCTGAGAATAA80ACAGAACCTCTGTTGCTCTGCGACTTGCAGGCACTGGGAG120ATTCGTAGCTAAGACGCCAGGGCATCCCGGAAGCTGGGAA160ATGGGACTGTTGACATTCAGGGATGTGGCCGTAGAATTCT200CTTTGGAGGAGTGGGAACACCTGGAACCAGCTCAGAAGAA240TTTGTATCAGGATGTGATGTTAGAAAACTACAGAAACCTG280GTCTCTCTGGGTCTTGTTGTCTCTAAGCCGGACCTGATCA320CCTTTTTGGAACAAAGGAAAGAGCCTTGGAATGTGAAGAG360TGAGGAGACAGTAGCCATCCAGCCAGATGTGTTTTCGCAT400TATAACAAGGACCTGTTGACAGAGCACTGCACAGAAGCTT440CATTCCAAAAAGTGATATCGAGGAGACATGGGAGCTGTGA480TCTTGAGAATTTACATTTAAGAAAAAGGTGGAAAAGGGAG520GAGTGTGAAGGGCACAATGGATGTTATGATGAAAAGACTT560TTAAATATGATCAATTTGATGAATCCTCTGTTGAAAGTTT600GTTTCACCAGCAAATACTTTCTTCTTGTGCCAAAAGCTAT640AACTTTGATCAATATAGGAAGGTCTTTACTCATTCATCAT680TGCTTAATCAACAAGAGGAAATAGATATTTGGGGAAAACA720TCACATATATGATAAAACTTCAGTGTTATTTAGGCAGGTC760TCTACTCTAAATAGTTACCGAAATGTTTTTATTGGAGAGA800AAAATTATCATTGCAATAATTCTGAAAAAACCTTGAACCA840AAGCTCAAGCCCTAAAAATCATCAGGAAAATTATTTTCTA880GAAAAACAATACAAATGTAAAGAATTTGAGGAAGTCTTTC920TTCAGAGTATGCATGGGCAAGAGAAACAAGAACAGTCTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。