基因總覽
ZNF266 是一個蛋白質編碼基因,產物名稱為 zinc finger protein 266,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長 549 個胺基酸,具有 KRAB 區域與多個 C2H2 型鋅指,構成其主要結構特色。現有功能描述指出,它可能參與轉錄調控;這項功能定位仍以「可能」表述,來源未提供更具體的分子作用或生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000592904 ★ | 9,412,429–9,435,573 | 11 |
| ENST00000588933 | 9,412,210–9,435,304 | 11 |
| ENST00000588221 | 9,412,210–9,435,526 | 9 |
| ENST00000590306 | 9,412,210–9,435,193 | 10 |
| ENST00000651268 | 9,412,210–9,435,571 | 12 |
| ENST00000592292 | 9,412,210–9,435,504 | 8 |
| ENST00000859744 | 9,412,210–9,435,601 | 9 |
| ENST00000859745 | 9,412,210–9,435,601 | 8 |
| ENST00000859746 | 9,412,210–9,435,601 | 11 |
| ENST00000859747 | 9,412,210–9,435,601 | 11 |
| ENST00000859748 | 9,412,210–9,435,601 | 11 |
| ENST00000859749 | 9,412,210–9,435,601 | 11 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前對 ZNF266 的功能描述指出,它可能參與轉錄調控。這表示其可能與調節基因轉錄的過程有關,但現有資料沒有說明調控的方向、作用標的或發生條件,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
來源也未提供可進一步界定其作用方式的實驗細節,例如特定 DNA 序列辨識、分子互作、調控複合體或下游生物過程。因此,ZNF266 的功能目前只能概括為可能涉及轉錄調控,不宜延伸推論其調控路徑、細胞效應或生理意義。
Promoter 與基因調控
>ZNF266 ENST00000592904 GRCh38 chr19:9435473-9436573 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATAACTTTATTAACTCCATAAAGGCCACCCACTACAAAGCACAGCAAAAACGATTTCTGGAGAAACTAGA ATCACTCCTGCAGAAGTGAATGCCTGATATCAGTGCTATTTTACAACGCGGTATTTTACAACGAGGCCCT GGAACTCACTGTAAGATCTCAGAAAACAATATATTAGTCAAAGAAAAAAAAATCAACATTTACAAAAAGT ATCAGCATATTGAATACACAAAGGAATCAACTATTAGAATTTAGCATGGCGTCCAGATAAATGAAATAAG GGGAAATATTGGCCTCAAGTTGAATTGGGCCCGGCGCCGTGGTGCACGCCTGTAATCCCAGCCTTTTGGG AGGCTGAGGCGGGATGATTGTTGGAGCCCAGGAGTTTGAGATCAGCCTGGGTAACATACCTCAACTCTGG GGGAAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCCTGCGCCTGTAGACCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCGGGA TGATGGCGTGAGCCCATGAGTTTCGCCCCACAGCACGCCAGCCTGGACTACACAGTGAGACCCTGTCTCA AACAAAAACAAAATAAAAAACTAAAACTAGATTGAATGAATGGAGGAGATAGGCCATATCATGGACTGGC AGGATTATCAAAGGAAGCATCATTTTGAGGGTGCTAGGAACGTGGGAGGAGGTGAGAATAAAAGCTTTTT GTGAGCATTGTGCACATCCTGTGGGGGAGCCCCCACCTCTAACTTTGCCAACACCACCGACCCCACCCTA GGTTAGCCCCGTCCGCAGGGCTGGTTCTAACCTCAGCCTTGTGCTCTGGGCCCCTTTTGGCCTCCATCCC TCAAGGTGAGCAGACTCCAAGGCCTCCAAGGCGTCTCCGTAGCCACTGGGGAGTAAACCAGAATCTCTCT GCCTGAGGTTGTTCAGCTCGGCTGAGGTTGCAGTTCCCGAGCGCTCCTCCAGGTTTGAGGCTGGAGGCGG AAGTGACGTCACGGAGCGCTGCTGTGTTTTCCGGCGCTTTCTCCGCGCCGCCAAACCCGTTTTCTTCCTG GTGGCGTTTGGGCTTAATACAGCTTTGGCGAGGTCGGATGACGGGTGGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF266_2 ↗ | 19:9,418,580 | 負股 | 9,418,570–9,418,629 |
| ZNF266_1 ↗ | 19:9,435,541 | 負股 | 9,435,531–9,435,590 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_95Q44 · enhancer · 9431519–9431856 · regulatory
ENSR19_547W83 · CTCF_binding_site · 9431645–9431666 · regulatory
ENSR19_95Q53 · enhancer · 9434881–9435182 · regulatory
ENSR19_95Q55 · promoter · 9435183–9435592 · regulatory
ENSR19_B3TK6 · enhancer · 9435593–9436220 · regulatory
· motif · 9431647–9431663 · motif
· motif · 9431724–9431732 · motif
· motif · 9435521–9435532 · motif
· motif · 9435571–9435587 · motif
· motif · 9435580–9435593 · motif
· motif · 9435580–9435593 · motif
· motif · 9435589–9435598 · motif
· motif · 9435589–9435600 · motif
· motif · 9435589–9435600 · motif
· motif · 9435883–9435895 · motif
· motif · 9435983–9435994 · motif
· motif · 9436148–9436159 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:549 aa
Zinc finger protein 266 長 549 個胺基酸,N 端第 1–42 位為 KRAB 區域。其後具有 14 個 C2H2 型鋅指,其中前兩個被註記為退化型;C 端第 530–549 位另標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-9P26371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- RANGRFQ9HD47 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCTGTGTTTTCCGGCGCTTTCTCCGCGCCGCCAAACCCGT40TTTCTTCCTGGTGGCGTTTGGGCTTAATACAGCTTTGGCG80AGGTCGGATGACGGGTGGGAGCCAGCGGTGGAAGGGGTGG120CGAAAGTACCGGTTTGCCCCAGGCCGCCGAGGGGCCTCCT160TAGAGAGACCTTGCCTGCTCCGCTCGCGTCCGCCGGGGCC200GCGCGGGTCCTCCTGGCGCCGCCAGGTTCAAAAAGCCACT240CGAGTTGTCACTGCGACGGCCCTGGGCCAGGAGCCGTTTC280GGGATCTGTCAAACAACGAGTTTTCGTCGTTCGAATCAGG320TTGACTGGTCCTTCATCCCCCCAATCTCCCGTACCTGGCG360AGTCCAGCTCGTCGCGGCCTGTACCTCCCCACAGAGCTTC400AAAACGGGCTTTTAGGAAGAAGGAATGGAGGCTTTGAAGC440AATGCTAAGAAAAGAGTGATATGCAAGCTGAGACCAAAAA480TATGGTATGATTTAGCCATACTGAAGGGGAAGGAAATAAG520AGCTGGGCAAAGCATTCTGTGAATTGGCTGACTCCACTTC560TATGGTGAGAGAGAGGAGTGCATCAAAGATTACTCCCAGT600AGAGATGGTTTCAGCATGTTGGCCAGTCTGGTCTCAGACT640CCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAAT680GCTGGGATTACAGGTATAAGCCACTGTGCCTGGCCAAAGA720TACCGTTAACCCTGGATAAAGAGAATGGAGGTTACCTCTG760TCCGTGTAGATTCCTAAGCTGTCCTGGAGTGATCCTTGGA800GTAAAGGAAAGGTGCTTTGAAGCACATTCAGCCATCAGCC840CTGTGGGATGGCAGCCACTGATTTGTCCTATGGTCTTTAC880AGGGACCCAGTCTGCCTTCAAGAAAAGACAGAAGTAGAAA920GGGTGGTGGCTGACTGTCTGACAAATTGTTATCAGGATTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。