基因總覽
ZNF264 是一種由 ZNF264 基因編碼的蛋白質,正式名稱為 zinc finger protein 264,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 N 端 KRAB 結構域,以及多個 C2H2-type zinc finger;蛋白質全長 627 個胺基酸。另有數段區域被註解為無序區。現有資料將其主要角色概述為可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263095 ★ | 57,191,500–57,222,846 | 4 |
| ENST00000600531 | 57,191,465–57,194,969 | 3 |
| ENST00000599653 | 57,191,465–57,194,169 | 2 |
| ENST00001117111 | 57,191,465–57,212,253 | 5 |
| ENST00001142242 | 57,191,465–57,222,846 | 4 |
| ENST00000594126 | 57,191,501–57,193,958 | 3 |
| ENST00000597447 | 57,191,523–57,211,483 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,ZNF264 可能參與轉錄調控。這項描述是對其可能功能的概括,並未進一步界定它調控哪些基因、作用於何種轉錄步驟,或在特定細胞與生理條件下如何發揮作用。因此,不能據此確定其調控方向或具體生物學結果。
ZNF264 的蛋白質註解包含 KRAB 結構域與多個 C2H2-type zinc finger,並歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。這些特徵提供了其蛋白質家族與結構組成的基本資訊;然而,現有功能來源沒有說明這些區域各自如何參與轉錄調控,也沒有提供 DNA 標的、作用夥伴或分子機制的證據。因此,較合適的解讀是保留「可能參與」的限定,而不將家族或結構註解延伸為已證實的作用機制。
目前提供的資料也未描述 ZNF264 對特定生物學過程或細胞表型的影響。其功能意義可概括為可能與轉錄調控相關,但細節仍未由這些來源界定。
Promoter 與基因調控
>ZNF264 ENST00000263095 GRCh38 chr19:57190500-57191600 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGCTGCAGCACCGAATAAAGCCTTCATCCCTGACAATACTCATTGTCTTGCTGACTGGCCTTCTGTGCA GCAAGCAGCAGGATCTAGATGCAAGGACCTGGCCTTTCTGGTAATATTGTCATCAACCATTTAATGATGT AGACTTGGTCCCCGGCTCATGCTCTGTGTATTTTCTTCTCCATCTACATGCATTGCCTTGATGGTCTCAC TCAATATCATGACTTGAAATAACAGTGTAAGGTAACTCCTAAATTCATATATTCATGCTCAAACCTTCTT CCAACATTCAGTCGTAAGTCGAATTGCCTGTGACAGAGATACTTTGTGGTTCTGTAGACATTTCAAACTA ACCATCCTGAGCCTCCGAACCTCCTCCACTTGCAGCCTCCCCACCTCAGAAGTGGGCAAATCCACTTTTT GTGTGGTCTGGGCCAAATACATGACTCCCTGCATCACGTAGAGGCTGTGCTGGTCCAAAGAAGGCTCAAA AGAGGGCAGTTTGCGCACACAACGTGTCGGGGCAGGGCTTCCAGATGATCATTCGGCTTTTTTGTGTCTT CCAAGATGATGATCCGGGGAGGAGGGATGTGAAAGGGGGTCAGTCGCCAGGCGAGCTGAGGACCCAGTTC TGCGCCTTTGCCTGTGCCCTGACCTGAAGGAAAGTCCCTGTCTCCCGAGCTCCGATTTTCCCGAGAGAAG AATGCAATGTAACCCTTGCCCCTCGGTTCCCTCCCTCCATCCTTCCCCTCGAGTTGTGCCCACCGTAAAG AGGTGGGTCTGGAGCGTCTCCTCGGGTCCTGGAGTGCCTTTCCCTGGGAGGAAAACTTGCGCCGTGAAGC GTTCCTCCCGTTGTTGAACACATGAGGAAAACTACACTACTTAGAAGGCTGTGCATTATGCGTACGGCGG GAGCTGGGCCAACGACGGCCTAGGACGGGGACGTTTCCGACGGCTCACGCCGGTGGGGGCGGGACTTCCG GGTTGCTCGCTGCGGACGCCATTTTCTTCTGCACTTCTGTCTGGAGAGGTCTGTAGCCACTGAGGGCCCC GGTCGGGGCCGCTTTGCAGGTCCCTAGTCAGGACCGAGCAGGGGAGTAGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF264_1 ↗ | 19:57,191,508 | 正股 | 57,191,459–57,191,518 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BFCG7 · promoter · 57191010–57191547 · regulatory
ENSR19_BFCGB · enhancer · 57191548–57192566 · regulatory
· motif · 57191095–57191102 · motif
· motif · 57191209–57191222 · motif
· motif · 57191472–57191481 · motif
· motif · 57191472–57191483 · motif
· motif · 57191472–57191483 · motif
· motif · 57191493–57191503 · motif
· motif · 57191631–57191638 · motif
· motif · 57191912–57191922 · motif
· motif · 57191967–57191987 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:627 aa
ZNF264 蛋白質長 627 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端含 KRAB 結構域(第 14–85 位),並有 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 203–561 位。另有三段區域被註解為無序區:第 74–155 位、第 174–194 位及第 605–627 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF264 的定位註解為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變的資訊,也未描述不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DVL3Q92997 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IPO8O15397 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP2-4Q9BYR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCCP23508 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZNF175Q9Y473 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZNF526Q8TF50 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ATTTTCTTCTGCACTTCTGTCTGGAGAGGTCTGTAGCCAC40TGAGGGCCCCGGTCGGGGCCGCTTTGCAGGTCCCTAGTCA80GGACCGAGCAGGGGAGTAGGATAGGAATCCCCGCCGCACC120TTTGTACGAGCCTGACCCCTTCCGTGGGTTTGTTCCTGGG160TCGCCGTCAAGCTGCGGTCTCTCCTCCCCCGCCCTTCAGC200CCCGCGGTCTCCAGGGGCGGCGCCCTGGGTCTGGAACGCG240GTTGCCACCGAGGAGGCGGCGGCCCTGCGTCTGGAACGCC280GTTGCCACCGAGGAGGCGGCGGCCCCGAGCGCGCCTGGAA320GCCCCGGGCAACCGGCCAGGGTCGGGCACAGGTGGGGTCC360GTCAGGCCGCCCGGGGCTCCTCTGTCCCAGCTCTGCGGCC400CAGGGGGTGACGTGATGGCGGCAGCGGTGCTGACGGACCG440GGCCCAGGTGTCTGTGACCTTTGATGATGTGGCTGTGACT480TTCACCAAGGAGGAGTGGGGGCAGCTGGACCTAGCTCAGC520GGACCCTGTACCAGGAGGTGATGCTGGAAAACTGTGGGCT560CCTGGTGTCTCTGGGGTGTCCTGTTCCCAAAGCTGAGCTG600ATCTGCCACCTAGAGCATGGGCAGGAGCCATGGACCAGGA640AGGAAGACCTCTCCCAAGACACCTGTCCAGGCGACAAAGG680AAAACCTAAGACCACAGAACCTACCACTTGTGAGCCAGCC720TTGTCAGAGGGAATCTCACTTCAGGGACAAGTGACACAAG760GAAACTCAGTGGACTCACAGTTGGGGCAAGCCGAGGATCA800GGATGGGCTATCAGAAATGCAGGAAGGACACTTCAGACCA840GGAATAGATCCCCAGGAGAAGTCTCCTGGGAAGATGAGCC880CTGAATGTGATGGTTTAGGGACAGCTGATGGTGTGTGTTC920AAGGATTGGACAGGAGCAAGTCTCTCCAGGAGATAGAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。