基因總覽
ZNF263（zinc finger protein 263）是蛋白質編碼基因，其產物為轉錄因子。來源指出，ZNF263可辨識特定 DNA 共識序列，並具有轉錄抑制作用；其基因啟動子結合與招募其他蛋白質的功能，見於 SIX3、HS3ST1 與 HS3ST3A1 等基因的調控描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000219069 ★ | 3,283,491–3,291,460 | 6 |
| ENST00000703449 | 3,263,800–3,291,029 | 2 |
| ENST00000574253 | 3,283,283–3,293,389 | 2 |
| ENST00000575823 | 3,283,283–3,293,368 | 3 |
| ENST00000572748 | 3,283,283–3,293,403 | 4 |
| ENST00000575332 | 3,283,283–3,301,382 | 7 |
| ENST00000573578 | 3,283,283–3,286,884 | 3 |
| ENST00000574674 | 3,283,283–3,301,401 | 8 |
| ENST00000999135 | 3,283,283–3,301,377 | 6 |
| ENST00000999137 | 3,283,283–3,301,396 | 5 |
| ENST00000999138 | 3,283,283–3,301,405 | 5 |
| ENST00000999139 | 3,283,283–3,301,405 | 3 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF263是轉錄抑制因子，可結合共識序列5'-TCCTCCC-3'。在SIX3的調控中，ZNF263結合其啟動子區域，並招募參與染色質修飾與轉錄共抑制的其他蛋白質。這個過程伴隨SIX3啟動子甲基化，並導致SIX3轉錄受到抑制。
ZNF263也可透過結合基因啟動子區域，抑制HS3ST1與HS3ST3A1的轉錄。現有資料支持其在這些基因上的啟動子結合及轉錄抑制作用，但未提供這些調控過程的更多細節。
Promoter 與基因調控
>ZNF263 ENST00000219069 GRCh38 chr16:3282491-3283591 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCATGGCCCGGAGGACCTGGGCCGCCTCACAACTGGGCAGCCCCGCTCACCGACACAAAGCCCACAACCG CGCCCAATAGGGAATCGGCCCTGCGGCCCTCCTGCCACTCGCCCCCAACTATCACAGTCCACGGCGGAGC TGGAGGCAGATCCCGCCCTTGCAGGGCTGGGTAAGAGACTGAAACTTGGAGAATGAACTGCAGGCGCTGC ACATCTCGGGCAGATTTAAAATTCGGTCTAAAATCGGAAGCAGGTGCCGCGAACCCAGACCCGAGCGCTC CTCTGGGACGTCCAGCCGCAGAAGCGAGCCCAAAGCCCAGCAGGGTTCTCCGCGGGACTCGGGGTTTCAG AACCGCCGGGCTCTTGGGCGCTCGCCCAGGGCGCACGCGCAGTCGCGAGGCCGCGCCGCGGACTGCATCT CCCAGCAGGCCCCGCGCAGCAGGCCACGCGGCGCCACTGACTGGGCGGGCGGCTAGCTCCCTGGCCTCCC CGACATGCCGAGGAGCCCCTGGCTTCCGGAGCCGACGAGGCCGCAGGGGCCAATGGGACCATCTTCAGCC AGCCCAGAGTAGCCGAAGCGGGTGGGGCCTGGCTTGGGAAAGGATTCATCCGGGGAAGCTGATTAACAAT TCAGATTTCCGGGTCTCACCCCGACACTGACGCACTGGAGAGCGCGTGGCCCTGGGATCTGCGTTTTCCC AAGCGCTCCGGAGTAATTCTAACCCAGGTTGCCCGCCAGTCACAACGACCTCAGGCTTGTTTTCTTCGCT TGGATCCAGCTGCCCTGCCCCCAGTCACTCCCAGAATTTCAGGGCGCGCCCCGTGGCCCCGCCTCTCGTC TCCAATTGGTCCCTCGCTCATCCAGTCCCCGTAGGCCAATCTTCCCTTCTCATTGGTAGGCGGTGAGTGT GTGGAGAAACCTGACCTAATGGGCGCTGGAGTTCGCAAAACGTGACCCGGAAATTGGTCACGAGCAGGCG CCGTGGGCTTGTGGACGCCTAACTTGCGCGCTGAGATTTCCGGCGTGGGAGCAGAGGTCTGAGTCTTGCG TGGGTCCTCTATATAGGGTGAGAAGCGTGGCGCTCGGTTCCTGCCTCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF263_2 ↗ | 16:3,282,928 | 正股 | 3,282,879–3,282,938 |
| ZNF263_1 ↗ | 16:3,283,523 | 正股 | 3,283,474–3,283,533 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_BMKZ · promoter · 3282793–3283556 · regulatory
· motif · 3282870–3282881 · motif
· motif · 3282870–3282881 · motif
· motif · 3283068–3283078 · motif
· motif · 3283124–3283133 · motif
· motif · 3283124–3283135 · motif
· motif · 3283124–3283135 · motif
· motif · 3283272–3283282 · motif
· motif · 3283316–3283326 · motif
· motif · 3283444–3283455 · motif
· motif · 3283444–3283455 · motif
· motif · 3283446–3283455 · motif
· motif · 3283461–3283472 · motif
· motif · 3283473–3283483 · motif
· motif · 3283505–3283514 · motif
· motif · 3283742–3283757 · motif
· motif · 3283840–3283854 · motif
· motif · 3283939–3283953 · motif
· motif · 3283954–3283968 · motif
· motif · 3284358–3284369 · motif
· motif · 3284359–3284370 · motif
· motif · 3287385–3287400 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：683 aa
ZNF263蛋白質長683個胺基酸，屬於Krueppel C2H2型鋅指蛋白家族。序列註解包含SCAN box、KRAB結構域及9個C2H2型鋅指；另有3段區域被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- CLK2P49760 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLK3P49761 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GPATCH2LQ9NWQ4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- JAKMIP2Q96AA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPLO60437 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- TCAF1Q9Y4C2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ZNF165P49910 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZSCAN22P10073 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF263與DNMT1、DNMT3A、HDAC2、PHF8、TRIM28/KAP1、SETDB1、EZH2、UHRF1、CBX3/HP1-gamma及CBX5/HP1-alpha等參與染色質修飾或轉錄共抑制的蛋白質互作，並可將這些蛋白質招募至SIX3啟動子區域，導致SIX3轉錄受到抑制。另有資料記載ZNF263與MAPK3/ERK1及MAPK1/ERK2互作；未提供這兩組互作的功能結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF263是轉錄因子，可辨識5'-TCCTCCC-3'共識序列並抑制轉錄。在SIX3調控中，它結合啟動子區域並招募參與染色質修飾與轉錄共抑制的蛋白質，使啟動子甲基化並抑制轉錄；它也藉由結合基因啟動子抑制HS3ST1與HS3ST3A1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that binds to the consensus sequence 5'-TCCTCCC-3' and acts as a transcriptional repressor. Binds to the promoter region of SIX3 and recruits other proteins involved in chromatin modification and transcriptional corepression, resulting in methylation of the promoter and transcriptional repression. Acts as a transcriptional repressor of HS3ST1 and HS3ST3A1 via binding to gene promoter regions PMID 32051553 ↗ · PMID 32277030 ↗ |
| 交互作用 | ZNF263與多種參與染色質修飾及轉錄共抑制的蛋白質互作，包括DNMT1、DNMT3A、HDAC2、PHF8、TRIM28/KAP1、SETDB1、EZH2、UHRF1、CBX3/HP1-gamma及CBX5/HP1-alpha；它將這些蛋白質招募至SIX3啟動子並導致轉錄抑制。另與MAPK3/ERK1及MAPK1/ERK2互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with a number of proteins involved in chromatin modification and transcriptional corepression including DNMT1, DNMT3A, HDAC2, PHF8, TRIM28/KAP1, SETDB1, EZH2, UHRF1, CBX3/HP1-gamma, and CBX5/HP1-alpha; recruits these proteins to the SIX3 promoter region, leading to SIX3 transcriptional repression. Interacts with MAPK3/ERK1 and MAPK1/ERK2 PMID 32051553 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF263定位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AACTTGCGCGCTGAGATTTCCGGCGTGGGAGCAGAGGTCT40GAGTCTTGCGTGGGTCCTCTATATAGGGTGAGAAGCGTGG80CGCTCGGTTCCTGCCTCGGGGAAGTCCTGGCGCAGATGGG120CCACGGGGCCGGCGTGGCGGCGCCTGGGACCGACTGAGGC160CTAGGCGCCGGAGCCGGCCGCGCCTGGGCTGGAGCGGGGC200TCCTCGGCCTGGACTGGGAGCCCCCGGCCCCGGGCTCCTG240CTGGCGCCGTCCAACCTTACATGGGTTCAGGGCGCCTTCG280TAGGCGGGCACGGCTGGTTTCGGGCTAAGGCGCTCTGGAG320ACCTGACGATGGCGTCGGGCCCGGGCTCCCAGGAACGGGA360AGGGCTCCTGATAGTGAAGCTGGAGGAGGACTGCGCCTGG400AGCCAGGAGCTGCCCCCACCTGACCCAGGACCGAGCCCCG440AGGCCTCCCACTTGCGCTTCAGACGGTTCCGCTTCCAAGA480GGCAGCTGGTCCCCGGGAAGCCCTCAGCCGGCTCCAAGAG520CTTTGCCATGGGTGGCTTCGGCCTGAGATGCGCACGAAGG560AGCAGATCTTGGAGCTGCTGGTGTTAGAGCAGTTCCTGAC600CATCCTGCCCCAGGAGATCCAGAGCAGGGTGCAGGAGCTG640CATCCGGAGAGCGGCGAAGAAGCGGTGACCCTTGTGGAGG680ATATGCAGAGAGAGCTTGGGAGACTGAGACAACAGGTCAC720AAACCATGGGCGGGGAACAGAAGTGCTTTTGGAGGAGCCT760TTGCCTCTGGAAACAGCACGAGAGTCACCGAGCTTCAAGC800TGGAGCCAATGGAGACTGAGCGAAGCCCTGGCCCCAGGCT840GCAGGAGCTGCTAGGCCCCAGCCCCCAAAGGGACCCCCAG880GCTGTAAAGGAGAGGGCATTATCTGCTCCCTGGCTTTCTC920TTTTTCCTCCTGAAGGGAACATGGAAGACAAGGAGATGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。