基因總覽
ZNF260 是一種蛋白質編碼基因，其產物正式名稱為 zinc finger protein 260，屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質序列長 412 個胺基酸，含有 13 個 C2H2 型鋅指區域，分布於序列中段至末端。這些結構特徵構成其家族辨識基礎；來源另將 ZNF260 描述為轉錄因子，並指出其與心臟調控有關。其具體的 DNA 調控作用及相關訊號脈絡見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000523638 ★ | 36,510,687–36,528,271 | 3 |
| ENST00000592282 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
| ENST00000588993 | 36,510,687–36,525,387 | 3 |
| ENST00000593142 | 36,510,687–36,525,299 | 2 |
| ENST00000855526 | 36,510,687–36,528,696 | 2 |
| ENST00000855527 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
| ENST00000855528 | 36,510,687–36,528,696 | 3 |
| ENST00000927402 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
| ENST00000927403 | 36,510,687–36,528,696 | 3 |
| ENST00000927405 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
| ENST00000927407 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
| ENST00000927408 | 36,510,687–36,528,696 | 4 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF260 被註記為轉錄因子，與心臟調控及 alpha1-腎上腺素訊號相關。現有功能說明指出，ZNF260 可辨識位於基因啟動子中的 PE response elements（PERE）；所舉例子包括 ANF/NPPA 啟動子。這種與特定調控序列的結合，將其 DNA 結合能力連結到基因轉錄調控。
在 NPPA 的例子中，ZNF260 被描述為直接轉錄活化因子，亦即來源將其作用指向 NPPA 的轉錄促進，而非僅籠統地指出與該基因有關。這項註記呈現了 ZNF260 作為轉錄因子的具體目標與作用方向，但來源沒有進一步列出其他受調控基因，或說明這種活化在不同細胞或生理條件下的差異。
ZNF260 也被描述為 GATA4 的輔因子；GATA4 在來源中被稱為重要的心臟調控因子。此處的輔因子關係提示 ZNF260 可與另一個心臟調控因子共同參與相關轉錄調控，但來源未詳述兩者如何協作，也未交代其對特定基因表現的共同影響。因此，不宜將此描述延伸為未提供的分子機制或下游效應。
上述心臟調控、PERE 辨識、NPPA 直接活化及 GATA4 輔因子功能均以「By similarity」標示，表示這些功能註記具有相似性推定性質。來源將 ZNF260 放在 alpha1-腎上腺素訊號的效應因子脈絡中，但未進一步交代訊號如何傳遞至其轉錄作用；因此可確定的是資料庫所述的功能關聯與調控方向，不能據此補出未提供的細胞機制或生理結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF260 ENST00000523638 GRCh38 chr19:36528171-36529271 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGCACACCCAATGCTTCACAGTCACACACCCACCACTGTACACAAAGTCACAAGCACCCACCCTCCATAC TCCCACACAAGGACACAGAGTCACAACTACATAAGTACAAAGCTCCCTATATCTGCACACAAACGAACAT ATGGTCACAGAGTTACAATCACACACCCACCGCGGGCACACAGTCACAGCTAACCCACACCCTCACACAG CGTTACACAGTCACACAATAACAGTCCTAACACAGGGACTCACGGGACACCCGCAGAGTCCTCCCCACAT CCGTACACAAGGTGTCACACACAATCACAATCACACACACACTGTGCTAGGACATACATTCACAAAAACA CAATTTCACAACCGCCCTTCTCGGCGCGTTCCGCCTGAACAGACTTAATACTCAGTCTCAACCTCCGCAC CGGATTCCAGACGCTTCACCTCCAACCTCCTCCTGATCCTGTAGTCTCCGAGCCGACCCGCTCAGAGGCC AGCACCTGGGTCGCGTGCAGCTCTCCCCCGAGCCGCGGGAGTCGCGAGGGGAGGGGCCGAGGGCGCGGCG CCTTCTGGGAAATGTAGTTCAGCGCCACGCCCGCGATGAGCAAGATGGCGCCCGGCTTGAGCCCAGCCAA AGGGATTACCCTCATTCCCGAACCGTGTCTGAGAGTCTCCTGGGGTTCCTGGCTTAGTATCGCACCGTGG CTGTTACATAAAGTCAGCACAGCGTGTTTAAGCTGATGTTACACCACTACCCAATCCCAGGGATAGAGTA AACTAAGACTAAGGCCTTACACCCCTGCCCCGGCCAGGGAGACAGTCCCACAAGCTCTGGCGGAGGAAAA GTTCGCGCGAAAAGCTGACTCAAACCGCTGAACCTTCTGGGAAATGTAGTCTACCCTCAAAAGAGTGGCA CGGAGGACGGGCCAAGATCTCTCGATTCCGTCCGGTTCTGAGTCGGGGCCTGGCCCAGCCCAGGAGACCT CTGGGAGCGCTGCCCGCGGAAGGAGTGCGCAGGCGCGGAATCTCCGACTTGCCATGGTCGTCTTTGTCTG CCGGTGAGTTGGGTTTCGGCCCTGTGGGACTTGGGTTTCTGGACACTGAAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF260_3 ↗ | 19:36,525,319 | 負股 | 36,525,309–36,525,368 |
| ZNF260_1 ↗ | 19:36,528,246 | 負股 | 36,528,236–36,528,295 |
| ZNF260_2 ↗ | 19:36,528,767 | 負股 | 36,528,757–36,528,816 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_B98PN · enhancer · 36527471–36528257 · regulatory
ENSR19_745ZT5 · promoter · 36528258–36528328 · regulatory
ENSR19_C5LTF · enhancer · 36528329–36529567 · regulatory
ENSR19_5BKZH7 · CTCF_binding_site · 36528658–36528679 · regulatory
ENSR19_5BKZJM · CTCF_binding_site · 36528971–36528992 · regulatory
· motif · 36528255–36528266 · motif
· motif · 36528255–36528266 · motif
· motif · 36528271–36528282 · motif
· motif · 36528595–36528608 · motif
· motif · 36528595–36528608 · motif
· motif · 36528660–36528676 · motif
· motif · 36528772–36528781 · motif
· motif · 36528823–36528836 · motif
· motif · 36528879–36528895 · motif
· motif · 36528941–36528963 · motif
· motif · 36528941–36528963 · motif
· motif · 36528973–36528989 · motif
· motif · 36529306–36529318 · motif
· motif · 36530469–36530480 · motif
alpha1-腎上腺素受體活化會上調 ZNF260。來源未提供此調控的其他條件或分子機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：412 aa
zinc finger protein 260 長 412 個胺基酸，屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質特徵註解列出 13 個 C2H2 型鋅指區域，依序位於胺基酸 27–49、55–77、83–105、136–158、164–186、192–214、220–242、248–270、276–298、304–326、332–354、360–382 及 388–412；這些區域的分類來自序列特徵註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間有所差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDEL1Q9GZM8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF648Q5T619 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF260 可結合 DNA，並與 GATA4 有互作註記；後者帶有相似性推定標示。來源沒有說明兩者是否構成特定複合體，因此不將此互作描述進一步解讀為已確立的複合體關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF260 被描述為轉錄因子，與心臟調控及 alpha1-腎上腺素訊號相關。它可結合基因啟動子中的 PE response elements（PERE），包括 ANF/NPPA 啟動子，並直接活化 NPPA 的轉錄；另被註記為心臟調控因子 GATA4 的輔因子。這些功能描述帶有相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Transcription factor that acts as a cardiac regulator and an effector of alpha1-adrenergic signaling. Binds to PE response elements (PERE) present in the promoter of genes such as ANF/NPPA and acts as a direct transcriptional activator of NPPA. Also acts as a cofactor with GATA4, a key cardiac regulator (By similarity) |
| 交互作用 | ZNF260 可結合 DNA，並與 GATA4 互作。此互作註記帶有相似性推定，來源沒有進一步指出兩者是否形成特定複合體。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | ZNF260 的細胞內定位註記為細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | alpha1-腎上腺素受體活化會使 ZNF260 的表現上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGGAGTGCGCAGGCGCGGAATCTCCGACTTGCCATGGTCG40TCTTTGTCTGCCGGCCTGCTTCCTTGTATATCCACAGGAG80CTGCAAAACCTCTTAGAGTTCTAAGGGCGCTCCCTGAATT120TTGGGATGCTGCTTTGTTCCCCAACCATAACATCCAAGTC160CAGTGTCATTTTTCTGCTCACAAGTTTAAAGTCAGCACTT200AAAAGAACAGCAACAGATGATTGAGAAAGAAATGTAAAGA240AGGTTCTCTTTGTGTGAGTAAGCAAGAACCTGAAGAAGCC280TGGGAAGTTTATAAACAGATAAAGACGCAACATGAAAGAC320TTGTAAGTTAAGTCTCATCTTTCTCTGTGAAAAGACAGAC360TGAGGGAAAATTTAGGAAACAAAGTATTTCCTCTGAACAG400TCATTGATTCTTCAAGACTACCCTTCTGTGTATGGAACTC440AGTTTAAAAGAATTTGAAACCTAATTTATATACAATCTAT480ACCTAAATATGGGAGAAGCTATATAAGAACCATTAAGAAT520ATAAAGAGAATGTTACATTTTATCCCTTTTTGTAATCATC560TCATCTCAGGGTAATCAATGTGAGAAAAGTCTTCCATCAT600AAATTTAACTTCATTAGATACCTGAGAATTAATATTGAAA640ATACACCATATGAATTTAGTGAATGTGGGAAAGCTTTCAT680CCTTATTACATCTTATTTGATACTAGGGAAATCTCCTGAT720TAAATTCACATGCATGATAGGCATGTTGGAAAGTCTTCAG760CATGAATCAGATCTCCTTCAGCATGATCAAATTCATACTG800GAGAGAAACCTTATGAATGTAATGAATGTAGAAAAACTTT840TAGCCTGAAGCAAAACCTTGTAGAGCATAAGAAAATGCAT880ACTGGAGAGAAATCTCATGAATGCACTGAATGTGGTAAAG920TGTGCTCTCGAGTCTCATCTCTTACTCTACACCTTAGAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。