基因總覽
ZNF26 是由蛋白質編碼基因產生的 zinc finger protein 26,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其蛋白質序列長 533 個胺基酸,具有一個 KRAB 區域及 13 個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵界定了它的蛋白質家族身分;來源對其主要角色的描述則較為審慎,指出它可能參與轉錄調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000328654 ★ | 132,986,367–133,027,102 | 4 |
| ENST00000943709 | 132,986,367–133,027,102 | 5 |
| ENST00001117629 | 132,986,367–133,027,102 | 4 |
| ENST00001117630 | 132,986,367–133,027,102 | 2 |
| ENST00000540238 | 132,986,443–133,010,216 | 3 |
| ENST00000544181 | 132,986,468–133,010,241 | 5 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註解指出,ZNF26 可能參與轉錄調控。這項描述使用「可能」限定其功能判斷,表示目前提供的資料支持其與轉錄調控相關,但未進一步說明它在調控過程中的具體作用,也沒有提供可據以判定調控方向或目標的資訊。
因此,依據現有資料,能確定的功能範圍僅限於轉錄調控相關的可能參與;來源未交代 ZNF26 是否直接作用於 DNA、如何影響轉錄,或此作用發生於哪些生物學情境。也沒有資料說明它對特定基因表現的影響、參與的細胞過程或相關功能後果。這些細節不宜由家族名稱或蛋白質結構特徵推定。
Promoter 與基因調控
>ZNF26 ENST00000328654 GRCh38 chr12:132985367-132986467 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGGCTTACTTTTGATATGTTTTGTAGAGACGAGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTAGTCTCCAACTCCTG GGCTCATGCGATCCACCCACCTCAGCCCTCCAAAATGCTGGGATTACAGACGTGAGCCATCGTGCCTGGC CATTTTGCACATTTTTAAATCTCAAAAGGCCAATCTACAATAGTGGTGTTATCTGTAGGAGTAACTGGGG AAGTTGCGTGTCTTGTGACCAATCCACATCTTAGCAGAATTCAGGCTCCTCTCCTCCCGCTAGCTTGGTG GTCTCTCATAGGTTTTACAAAGGCAGTTGGGTTTTGGAAAAGGGCTATCATTTGAACTATAACCTAAATG TCTTCCAAAGTTAGCTTGGCCTAAGCCCAGGAATAATGAAGGCATCTTGACAGCCAAAGGCGCGCAGAGT TGGGGGTTTGGTTAGATTAGACCTCCCCCACTGCTATAATTTTCTCACTGATATAATTTTTGCAAAGGCA GTTTCATTACTGGTGTGGTTCTATTTATTTGTTTTTCACATCTACTATAGTTTCTCCTTTATGAAGTTGG TTACTGTATTATTTGGTGCACTGATATTCAAAACTGTTATTTAACCCTATGAACTGCAGCTTTTAGCTTT ACAAAGCGTCCTTTTTTGCTGTGCCTTCTGGTCTGAACCCTATCTTGTTTGATATCAAAACCTCAGCACG CCTGCGTCTCTGCTGGGGTCGGACTCTGAGTCAGTTCTACAGGCCCTGGGAAACTGGGCGTCCAGGCTCC GAGGATGGTACTGAACCTGGCGCAGCCGTGGGAGGGTGAACCAGGTGCCGCTGGCGGAGCCCCCTCCCAG CCTTCCTTTCCCGTCAGGCTGTGCCCCTCTCTAGATCCGCGGCAGCTGGAAGCCAGGCCTGTAACGAGGG AGCCTTCTCCGAGGATTGTGGGAGATGTAGTTTTTCCGGCGCCTTCGCGTCCTGGCGCATCGACGCAGGA CGCACTTCCGCATGCGCCGCACTCCCGGCCTTAGTCGGGTGCGCGCGTGCAGGGCTGTTTCCGGCTTAGA CTCAGTGGACCGGAATCTGGCCAGCGGGTGTACCTGGCTGAGTCTCTGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF26_1 ↗ | 12:132,986,420 | 正股 | 132,986,371–132,986,430 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_93XR6R · promoter · 132985877–132986377 · regulatory
ENSR12_BZDKZ · enhancer · 132986378–132987203 · regulatory
· motif · 132986332–132986348 · motif
· motif · 132986349–132986360 · motif
· motif · 132986349–132986360 · motif
· motif · 132986349–132986362 · motif
· motif · 132986353–132986364 · motif
· motif · 132986353–132986364 · motif
· motif · 132986386–132986397 · motif
· motif · 132986386–132986397 · motif
· motif · 132986402–132986411 · motif
· motif · 132986402–132986413 · motif
· motif · 132986402–132986413 · motif
· motif · 132986533–132986542 · motif
· motif · 132986785–132986800 · motif
· motif · 132986803–132986816 · motif
· motif · 132986824–132986837 · motif
· motif · 132987204–132987217 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:533 aa
zinc finger protein 26 長 533 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質包含位於第 14–85 個胺基酸的 KRAB 區域,以及 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 174–532 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF26 的定位註解為細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、時間動態或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- KRT40Q6A162 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53BP2Q13625-3 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TRIM39Q9HCM9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTCCCGGCCTTAGTCGGGTGCGCGCGTGCAGGGCTGTTT40CCGGCTTAGACTCAGTGGACCGGAATCTGGCCAGCGGGTG80TACCTGGCTGAGTCTCTGTGGCCGCGGAGGCGCGGAGCTA120AGCGGCTCGGATTATCCTGGGCAGACCAGAGACTTGACCA160GCTAAACACTTCCGTCGGTCCGGGGCGTGGACGGGGCCAG200ATCAGCCTCCTGCTCTCCCGAGTCAGGGCCACGGAAAGGC240ACAAATCCATCCGTGCGACTCCTGGTACCCAGACCGGGAG280GTTGTCTAGTCACGCGCGGTCTGTGTTGGGCGAGAGCTGA320GGAGCCGGCGTCCCTGCCAACGACTCGGCCCCGGGACGGT360CAGGAGCCTGGGGCCCTGGTCCCGCACCTGTCTTCGGGCG400GACGCATCCCTCACGGTCTCTCCGCAGCCCGCGGGTCCTG440CCCCCGCAGGCAGCGCGCGAACGTGGGCGTGGGGATGGCC480ACCAGTTTCCGGACAGCTTCGTGCTGGGGATTATTGTCAT520TCAAGGATATATCTATGGAGTTCACCTGGGATGAATGGCA560GCTACTGGATTCTACACAGAAGTACCTGTACAGAGATGTG600ATATTGGAAAACTATCATAACCTGATATCAGTGGGGTATC640ATGGTACCAAGCCTGACTTAATCTTCAAGTTGGAACAAGG680AGAAGATCCATGGATAATAAATGCCAAAATTTCCAGGCAG720AGCTGTCCAGATGGCTGGGAAGAATGGTACCAGAACAATC760AAGATGAGCTTGAGAGTATTGAAAGAAGCTATGCTTGTAG800TGTGTTGGGAAGACTTAATCTGAGCAAAACCCATGATTCT840TCAAGACAGAGACTCTATAACACACGTGGAAAAAGTTTGA880CACAAAACTCAGCTCCAAGCAGAAGTTATTTAAGAAAGAA920TCCTGATAAGTTTCATGGTTATGAAGAACCATATTTTCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。