演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF257BMZF-4

zinc finger protein 257

ZNF257(zinc finger protein 257)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控,並定位於細胞核。

Homo sapiens19p12UniProt Q9Y2Q1
OFFICIAL SYMBOL
ZNF257
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9Y2Q1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF257(zinc finger protein 257)是位於人類第19號染色體的蛋白質編碼基因,所屬蛋白家族為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein。其蛋白質全長563個胺基酸,結構包含N端KRAB區域,以及多個C2H2-type zinc finger區域;其中兩個鋅指區域被註記為退化型。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制。

Official symbol
ZNF257
Gene name
zinc finger protein 257
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13498
UniProt
Q9Y2Q1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BMZF-4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919p12
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF257pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:22,052,430–22,123,402
Gene span
70,973 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000594947 ★22,052,484–22,091,4804
ENST0000065133222,052,430–22,091,0185
ENST0000060016222,052,430–22,088,4055
ENST0000109599522,052,430–22,060,9652
ENST0000114038322,052,430–22,091,4804
ENST0000059436322,052,484–22,074,5534
ENST0000059792722,052,484–22,088,3762

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF257可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性描述,未指出它調控哪些基因或轉錄事件,也未說明作用方向、分子機制或發生條件,因此目前無法據此進一步界定其在特定生物學過程中的功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22052484 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF257 ENST00000594947 GRCh38 chr19:22051484-22052584 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATATTGGGTTACTGAAATTGTTACAATCAGTTTGACCTATTTCTTCTTTCTTTTTAAAGTTTGGCTACTA
GAAAATTTAAAATTCACATTTGGCTCACATTCTATTTCAGAAGATTGCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TGACGGAGCTTAGTTTCGCTTTTGGTGCCCAGGCTGGAGTTCAAAGCGATCTCGGCTCACTGCAACTCCT
GCCTCCCGGGTTCACCTGTCTCGGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCATGCCCCGCT
AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCATCGTATTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCA
GGTGATCCGCCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCATGAT
TGCCTCCTTCTTAAAATCTCAGGCTGCCTGATCAAAAAACCAGAAGCCAGGAAGGTCAGGAAAGCTGAAA
TTTTAAAATAGTTGTTATTAGATTATTTTTGTTTGTGAATAACAATATAGTGTATTTTTTTCTTTTCTTT
TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTTACTGCA
ATCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGAG
CCACCGCGCCCGGCCATATTATGTATTATGTATAAACGCATATGACCTTACACACAAGGTTAAATGCAAA
TACCTTTGGGTTGGGCCTGGCTCAGCTCAGGGAGGAAAACCTGCCTGAAAAGGCTGGAGCTTAGGCTTTC
ACTCTTTCTTCATTCAGCCGAGCATCTGATCACGTCTCCTGTCACTCAGGGCCTAAAGGGGCGAGGCCTT
AAACGTTATCCAGTCAGGGACGCTGGGCTGGAAACCGTCCAATCAGACACGAAGCTGGAGCGGACAGGGT
GGCTTCCGGGTTTGGCGGGTACTTTGTCTCTCGCTCTAGCCCGAGCTGCAGGTCTCGTCTTCCCTGGTCT
GTGTCCTCTTCTCCTAGGGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGACCTGCAGGT
ZNF257 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF257_1 ↗19:22,052,484正股22,052,435–22,052,494

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9BQBW · promoter · 22052167–22052546 · regulatory

ENSR19_B6D6H · enhancer · 22052547–22053079 · regulatory

· motif · 22052793–22052803 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:563 aa

1 aa563 aa結構域鋅指
依 Q9Y2Q1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF257蛋白長563個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含位於第4至75位的KRAB區域,並有13個C2H2-type zinc finger區域;其中第5與第9個鋅指區域註記為退化型。

結構域KRAB4–75 aa
鋅指C2H2-type 1173–195 aa
鋅指C2H2-type 2201–223 aa
鋅指C2H2-type 3229–251 aa
鋅指C2H2-type 4257–279 aa
鋅指C2H2-type 5; degenerate285–310 aa
鋅指C2H2-type 6316–338 aa
鋅指C2H2-type 7344–366 aa
鋅指C2H2-type 8372–394 aa
鋅指C2H2-type 9; degenerate400–425 aa
鋅指C2H2-type 10431–453 aa
鋅指C2H2-type 11459–481 aa
鋅指C2H2-type 12487–509 aa
鋅指C2H2-type 13515–537 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y2Q1…

AlphaFold · Q9Y2Q1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF257的定位資料標示其位於細胞核;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BMZF-4ZNF257
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF257可能參與轉錄調控。這項描述保留了可能性的限定;來源未說明調控對象、作用方向、分子方式或發生條件,因此無法據此推定更具體的轉錄調控功能。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF257的定位註記為細胞核。來源只提供此定位資訊,未描述特定細胞狀態、實驗條件或異構型之間的定位差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000594947 · 3,879 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTTTGTCTCTCGCTCTAGCCCGAGCTGCAGGTCTCGTCT40
41TCCCTGGTCTGTGTCCTCTTCTCCTAGGGGCCCAGCCTCT80
81GTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAGATCCCCAGCTA120
121AGACGCCAGGTCCTCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACCACT160
161GACAATTAGGGATGTGACTGTAGAATTCTCTCTGGAGGAG200
201TGGCATTGCCTGGACACTGCACAGCAGAATTTATATAGGG240
241ATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGG280
281TATTGCTGTCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAG320
321CAAGGAAAAGAGCCCTGTAATATGAAGAGACATGAGATGG360
361TAGCCAAACCCCCAGTTATGTGTTCTCATATTGCTGAAGA400
401CCTTTGCCCAGAGCGAGACATAAAATATTTTTTCCAAAAA440
441GTCATACTGAGGAGATATGATAAATGTGAACATGAGAATT480
481TACAATTAAGAAAGGGCTGTAAAAGTGTGGATGAGTGTAA520
521GGTGTGCAAAGGAGGTTATAATGGACTTAACCAATGTCTG560
561ATAACTACCCAGAGCAAAATGTATCAATGTGATAAATATG600
601TAAAAGTCTTCTATAAGTTTTCAAATTCAGATAGACATAA640
641GATAAGACATACTGAAAAGAAAACTTGCAAATGTAAAGAA680
681TGTGGCAAATCATTTTGCATGCTTTCACAACTAACTCGAC720
721ATAAGAGAATTCATATTAGAGAGAATTCCCACAAATGTGA760
761AGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAGCTCTTACT800
801CGACATAAGATGACTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAAT840
841GTGAAGAGTGTGGAAAAGCTTTTAACCGGTCTTCACACCT880
881TACTCAACATAAGGTAATTCATACTAGAGAGAAACCCTAC920
921AAATGTGAAGAGTGTGGCAAAGCCTTTAACCGGTCTTCAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。