基因總覽
ZNF257(zinc finger protein 257)是位於人類第19號染色體的蛋白質編碼基因,所屬蛋白家族為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein。其蛋白質全長563個胺基酸,結構包含N端KRAB區域,以及多個C2H2-type zinc finger區域;其中兩個鋅指區域被註記為退化型。現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000594947 ★ | 22,052,484–22,091,480 | 4 |
| ENST00000651332 | 22,052,430–22,091,018 | 5 |
| ENST00000600162 | 22,052,430–22,088,405 | 5 |
| ENST00001095995 | 22,052,430–22,060,965 | 2 |
| ENST00001140383 | 22,052,430–22,091,480 | 4 |
| ENST00000594363 | 22,052,484–22,074,553 | 4 |
| ENST00000597927 | 22,052,484–22,088,376 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF257可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性描述,未指出它調控哪些基因或轉錄事件,也未說明作用方向、分子機制或發生條件,因此目前無法據此進一步界定其在特定生物學過程中的功能。
Promoter 與基因調控
>ZNF257 ENST00000594947 GRCh38 chr19:22051484-22052584 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ATATTGGGTTACTGAAATTGTTACAATCAGTTTGACCTATTTCTTCTTTCTTTTTAAAGTTTGGCTACTA GAAAATTTAAAATTCACATTTGGCTCACATTCTATTTCAGAAGATTGCCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT TGACGGAGCTTAGTTTCGCTTTTGGTGCCCAGGCTGGAGTTCAAAGCGATCTCGGCTCACTGCAACTCCT GCCTCCCGGGTTCACCTGTCTCGGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCGCCACCATGCCCCGCT AATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGAGTTTCATCGTATTGGTCAGGCTGGTCTCCAACTCCTGACCTCA GGTGATCCGCCGGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCACCCGGCCATGAT TGCCTCCTTCTTAAAATCTCAGGCTGCCTGATCAAAAAACCAGAAGCCAGGAAGGTCAGGAAAGCTGAAA TTTTAAAATAGTTGTTATTAGATTATTTTTGTTTGTGAATAACAATATAGTGTATTTTTTTCTTTTCTTT TTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTGGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTTACTGCA ATCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGAG CCACCGCGCCCGGCCATATTATGTATTATGTATAAACGCATATGACCTTACACACAAGGTTAAATGCAAA TACCTTTGGGTTGGGCCTGGCTCAGCTCAGGGAGGAAAACCTGCCTGAAAAGGCTGGAGCTTAGGCTTTC ACTCTTTCTTCATTCAGCCGAGCATCTGATCACGTCTCCTGTCACTCAGGGCCTAAAGGGGCGAGGCCTT AAACGTTATCCAGTCAGGGACGCTGGGCTGGAAACCGTCCAATCAGACACGAAGCTGGAGCGGACAGGGT GGCTTCCGGGTTTGGCGGGTACTTTGTCTCTCGCTCTAGCCCGAGCTGCAGGTCTCGTCTTCCCTGGTCT GTGTCCTCTTCTCCTAGGGGCCCAGCCTCTGTGGCCCTGTGACCTGCAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF257_1 ↗ | 19:22,052,484 | 正股 | 22,052,435–22,052,494 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9BQBW · promoter · 22052167–22052546 · regulatory
ENSR19_B6D6H · enhancer · 22052547–22053079 · regulatory
· motif · 22052793–22052803 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:563 aa
ZNF257蛋白長563個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含位於第4至75位的KRAB區域,並有13個C2H2-type zinc finger區域;其中第5與第9個鋅指區域註記為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF257的定位資料標示其位於細胞核;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTTTGTCTCTCGCTCTAGCCCGAGCTGCAGGTCTCGTCT40TCCCTGGTCTGTGTCCTCTTCTCCTAGGGGCCCAGCCTCT80GTGGCCCTGTGACCTGCAGGTATTGGGAGATCCCCAGCTA120AGACGCCAGGTCCTCCTGGAAGCCTAGAAATGGGACCACT160GACAATTAGGGATGTGACTGTAGAATTCTCTCTGGAGGAG200TGGCATTGCCTGGACACTGCACAGCAGAATTTATATAGGG240ATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGG280TATTGCTGTCTCTAAGCCAGACCTGATCACCTGTCTGGAG320CAAGGAAAAGAGCCCTGTAATATGAAGAGACATGAGATGG360TAGCCAAACCCCCAGTTATGTGTTCTCATATTGCTGAAGA400CCTTTGCCCAGAGCGAGACATAAAATATTTTTTCCAAAAA440GTCATACTGAGGAGATATGATAAATGTGAACATGAGAATT480TACAATTAAGAAAGGGCTGTAAAAGTGTGGATGAGTGTAA520GGTGTGCAAAGGAGGTTATAATGGACTTAACCAATGTCTG560ATAACTACCCAGAGCAAAATGTATCAATGTGATAAATATG600TAAAAGTCTTCTATAAGTTTTCAAATTCAGATAGACATAA640GATAAGACATACTGAAAAGAAAACTTGCAAATGTAAAGAA680TGTGGCAAATCATTTTGCATGCTTTCACAACTAACTCGAC720ATAAGAGAATTCATATTAGAGAGAATTCCCACAAATGTGA760AGAATGTGGCAAAGCCTTTAACCAGTCCTCAGCTCTTACT800CGACATAAGATGACTCATACTGGAGAGAAACCCTACAAAT840GTGAAGAGTGTGGAAAAGCTTTTAACCGGTCTTCACACCT880TACTCAACATAAGGTAATTCATACTAGAGAGAAACCCTAC920AAATGTGAAGAGTGTGGCAAAGCCTTTAACCGGTCTTCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。