基因總覽
ZNF252P 是人類假基因(pseudogene),正式名稱為 zinc finger protein 252, pseudogene。登錄類型為 pseudogene。此基因座位於 8q24.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000592792 ★ | 144,976,190–144,999,723 | 2 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
Promoter 與基因調控
>ZNF252P ENST00000592792 GRCh38 chr8:144999623-145000723 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTCACTTTATCGGAGGTGTCTTCCCTGGCCATCCTGTGTAAAATATCTCTTACCACCAGTCGCTGCCCT CGTGCTGCGTCATTAATTTTTTGTATCCTTTGTCATTACCTGACACCACCTGGGCGTTGTGTCTGTGTGT CATGCATATGTGTTAACTTCTCCATTTGCTCATTCGCTGCCTTAGCACCAGAGCCTGGTCCGCTGTTCTC AGCTGTTTGCCGTCTGCGCAGGACCTCATAGGTGGGCCTGGGAAACGCAGTCCATTGTCTCTCCTGGCCA AGTGCACTGCCACAGTCCTGGCTTTCACATGGTGGCCTCAGGATGCTGTCATCCCAGGGGCCTCAGGAAG GCCTCTCTTGAGACATGGAGAGGTATGGCAGAAAATTAGGGAGGGGATATGGTCTCAGAGACCACTGGCT ACTTAGTTCATCCACCTTTCCTGGGGTGTTCAGGCAGCTCATAATTGGGTCTCTGCTACCACAAAATGTC TAGGCTTAGAAGTCTCAGAGCACCTATGGGGAGCAGAAGGTTGGTCAGGCTCCATCACCCTCCTCTCCCT ACAGCTCTGCCCACACCTCAGGACAAGCTCAGAGACCTAGTGATGGCTGTCATGCAGCTCCTTCTTGGTG GGCTCCAAGTGAGTGGTCCTCATGGAGTCTCTTCCATGTGACCTCAGCCTTTTCTCAGCAGGAGTCTGTC TATAAGGAGCTGGTCCCAGAGGGTGGACAGCTCCCTGTCTCCACCGATGTCCTCAGTTCCTGAGTTCAAG TCCCTGAAATGTACTTCTCACTGTTTTACTGTCCCTGGACCAGGTACAGTAGAGGTCAGAGTTGGGGCAC ACCAAGATGAGCCAATATAGTGTCTGCCTCAAAGAGTTCACATTAGTGGGGAAGACAGGTACATGTTCCC AGAGGGATTTTACCAGTCCTGAGCCTAATATCTTCTCCCTCCAGGTCCTGACCTGAGGGCTGCATCAAGA TCTTGTCATTCCACATCGTGGTTTCCTTTGAGGATGTGGCTGTACCCCTCTCCCAGGAGGAGTGGGACTG TCTGATCCCTGCTCAGAGGGGCCTCTACAAGGATGTGATGATGGGGACCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_B33QXN · enhancer · 144997500–144998081 · regulatory
ENSR8_5394SG5 · CTCF_binding_site · 144997796–144997817 · regulatory
ENSR8_945JXQ · promoter · 145002321–145002821 · regulatory
ENSR8_8694WP · promoter · 145002836–145003007 · regulatory
ENSR8_B33QZH · enhancer · 145003008–145003830 · regulatory
ENSR8_5394TCP · CTCF_binding_site · 145003105–145003126 · regulatory
· motif · 144997798–144997814 · motif
· motif · 145001464–145001472 · motif
· motif · 145001492–145001505 · motif
· motif · 145001632–145001640 · motif
· motif · 145001632–145001647 · motif
· motif · 145001632–145001649 · motif
· motif · 145001715–145001723 · motif
· motif · 145002328–145002343 · motif
· motif · 145002328–145002343 · motif
· motif · 145002330–145002345 · motif
· motif · 145002387–145002400 · motif
· motif · 145002883–145002894 · motif
· motif · 145002887–145002896 · motif
· motif · 145002906–145002915 · motif
· motif · 145002906–145002917 · motif
· motif · 145003056–145003067 · motif
· motif · 145003056–145003067 · motif
· motif · 145003058–145003067 · motif
· motif · 145003078–145003093 · motif
· motif · 145003107–145003123 · motif
· motif · 145003300–145003315 · motif
· motif · 145003305–145003317 · motif
· motif · 145003308–145003315 · motif
· motif · 145003308–145003323 · motif
· motif · 145003348–145003361 · motif
· motif · 145003500–145003516 · motif
· motif · 145003500–145003516 · motif
基因座與轉錄註解
ZNF252P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000592792 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 2,485 nt | 2 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
DNA 與 RNA 序列
GTTTCCTTTGAGGATGTGGCTGTACCCCTCTCCCAGGAGG40AGTGGGACTGTCTGATCCCTGCTCAGAGGGGCCTCTACAA80GGATGTGATGATGGGGACCTATGGGAACCTACTCTCATTA120GGCTGTGATTCTAGGATTGAAAAAGAGGAAATGATTCCAA160AGCAGGACATTTCTGAAGAATTGGAATCCCAGAGAGCAAA200ATCAGAAGATCATGTAAGGAATATTTTTAAGGAAACTGAA240GAGATGAGTAAAACTGAGGGAAAGTTAGAGAATTGCTGGA280GAAAATATGCAGTAGAAGGAGTTAAGAACTCATTCTCCCA320GAAGAGCAATTTCAGAGAAATTACCATGAGGTATGTGAAA360ACCCTCTCTAGAGAGAATGGCCAGAAGTTCAATGCTGTTG400GAGAAAACTGCATTACAGACTCAAATCCTGCCAAACATCT440TAGAGGGTCTAGAGAGGAGAGTCTCCATCCAAGTGTGTCA480AGTGTAGAAAACTTGCAACAACATGAGGACCTCATTAACC520TCCAGAGTTTCCAATTAGGAGAAAGAGCCTATCAGACAGA560TGTGTTAGTGAAAGTGCCCAGACAGAGCTCAGTTCTTAGT600GAGAATCAGAGGATGAATAATCCAGAGAGATGGTTTGAGA640GTACTGGGTGTGGAAAAACTTACAATCAGAACAGAGCTTT680TAACCAGCACCAGAGATTTCATAGTGGAGAGAAGACCTAT720GAGCACAATGAATGTGGAAAAGCTTTCAGTTGGCCCTCTA760TCCTCAGTAAACATCAGAGAATCCACACTGGTAAGAAACT800CTACACATGTGAGGATTGTGGCAAATCTTTCAGTGTTCAC840TCATACTTTATTCAGCATTGTAAAATTCACACTAGAGAAA880AACCCTATGAGTGTATTAAATGTGGGAAAGCTTTTAGTAC920ACATTCATCTTATGTTCAACATCTAAAAATTCATACAGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。