基因總覽
ZNF251 是蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 251。此蛋白質屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,序列包含 KRAB 區域及多個 C2H2-type zinc finger。其家族分類與結構特徵提供了辨識此蛋白質的基本資訊;目前可用資料僅指出它可能參與轉錄調控,尚未說明具體作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000292562 ★ | 144,720,909–144,755,531 | 5 |
| ENST00000861866 | 144,720,515–144,755,606 | 4 |
| ENST00000861867 | 144,720,515–144,755,467 | 5 |
| ENST00000861868 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00000861869 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00000861870 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00000861871 | 144,720,515–144,755,410 | 5 |
| ENST00000861872 | 144,720,515–144,755,467 | 5 |
| ENST00000917067 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00000965159 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00000965160 | 144,720,515–144,755,603 | 5 |
| ENST00001028020 | 144,720,515–144,755,603 | 6 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
zinc finger protein 251 可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性的功能描述,未指出它調控哪些基因或轉錄程序,也未說明其作用方向、所需條件或分子機制。因此,不能據此判定它會促進或抑制特定轉錄活動。
目前資料亦未提供支持更細緻功能推論的實驗情境或生物學過程資訊。其參與轉錄調控的可能性,應維持為來源所述的有限結論,不延伸解讀為已確立的調控機制或特定生理效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF251 ENST00000292562 GRCh38 chr8:144755431-144756531 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGATTCTAACACAGTGTACAGGGCCTACACTATATTCTGGGTGACAAGATGGCTTGGCTTTCCTTTCCT TCTCCCCCTGCTCCTAAGCTGGTCTCCTCACCTTTATCAAGTGCTATTTTTTCAACCATGCTTTATTGTG TAGGGGCCAAAGGGAAAGTTCCTCTTTGCCCTCTGAAGGTTCACTGAAAGCCAACTCATAAAAGGCAGAT TTTTGGAGAAAAGGCAAATAAATGGATTATTTATTTATTTATTATTTATTTTTGAGATGGAGTCTCGCTC TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGA TTCTCCCGCCTCAGCCTCCGGAGTAGCTGGGACTACAGACGCCCGCCACCACGCCCGGCCTTTACCGCCA GTTTTCACACAGAAAAGCGGGGGGAACATCAGAGTCGTGTTTTTAGGTTTTGTGGCTGGCTTTGGGGGTC TGGCCTCTGGGACTCGCCTTGGGTAAAAGGGATTCACTCTGTGAGGAGCCTCGCGGGAGAAAAGAACTGA GACTGGAGGCCTGGGAAGGTCAGAGGGAAACTGCCTCCCAGGCCTTCATTTTGGGGCGTTGTGTTCTGAG CCCCGATAATTGTAACATCTTCATAAGCGACTTTCTGGTGGTTATGGTGAATCGGGACACACGATGTATG GTGACCGACGGGGGAGCCGGGAGCCCAGCGGGGTTAGGGTTCAGGTGAGGGTTTAGGGTCGGGGCGAGCG CGGCGCGGCCCGGATGCGCAGCGTCACCGCGCCAGACCCTCCGCTCAGCTGCCGTGGGCTCTCCCCCTCC CCGACCATAGACGGCGCAGGCCTCCAGTCATCCCAGAGCGGCCCCGGAAGAATCCGGGCGGAACCGCGGC TGGCTTCCGGTTCCCGGCGTTCTCGGAGGCGTACTGAGGCCCCGCAGGGGGCGGGGAAGCCTGCGTGTGC GCAGCTCGGCCCGGCCCGCCCTCTTCATCCTAGCCCGCCCCCTCCCCGGCTCTGGACCCGGTTCTGTGGG AGGGTCCGTTCCGGGCTCGGTGCGACTGCGCAGCTCCTCGGCGCTTCCTCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_53939T8 · CTCF_binding_site · 144755249–144755270 · regulatory
ENSR8_945GBC · promoter · 144755521–144756021 · regulatory
ENSR8_945GBS · enhancer · 144757178–144757617 · regulatory
ENSR8_5393B7P · CTCF_binding_site · 144757295–144757316 · regulatory
· motif · 144755201–144755210 · motif
· motif · 144755251–144755267 · motif
· motif · 144755379–144755390 · motif
· motif · 144755400–144755409 · motif
· motif · 144755450–144755461 · motif
· motif · 144755476–144755486 · motif
· motif · 144755505–144755518 · motif
· motif · 144755510–144755520 · motif
· motif · 144755549–144755560 · motif
· motif · 144755555–144755566 · motif
· motif · 144755565–144755575 · motif
· motif · 144755589–144755602 · motif
· motif · 144755611–144755620 · motif
· motif · 144755744–144755753 · motif
· motif · 144757297–144757313 · motif
· motif · 144758872–144758886 · motif
· motif · 144758879–144758890 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:671 aa
zinc finger protein 251 長 671 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列在第 15–86 位具有 KRAB 區域,並註記多個 C2H2-type zinc finger;其中第 566–588 位的第 12 個及第 622–644 位的第 14 個被標為退化型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 251 定位於細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件、動態或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCTTCATCCTAGCCCGCCCCCTCCCCGGCTCTGGACCCG40GTTCTGTGGGAGGGTCCGTTCCGGGCTCGGTGCGACTGCG80CAGCTCCTCGGCGCTTCCTCGGTGGCTTCCCCGGGTCGAG120CAAACAGGTAAGTTCGGGGAGACTTCAGGCCAGGGCAGTC160TCCTGTCTTCTCTTGGAAACCACAGCAGCCCATGCACACA200GAATGGCAGCCACATTCCAGCTTCCAGGGCACCAGGAGAT240GCCGCTGACCTTCCAGGATGTGGCCGTGTACTTCTCTCAG280GCGGAGGGGCGGCAGCTGGGCCCCCAGCAGCGGGCGCTCT320ACCGGGATGTGATGCTGGAGAACTATGGGAACGTGGCCTC360TCTGGGATTCCCTGTCCCTAAGCCGGAGTTGATCTCCCAG400CTGGAGCAGGGGAAGGAACTTTGGGTCCTGAATCTTCTGG440GAGCTGAGGAACCAGATATCTTGAAAAGCTGCCAGAAAGA480TTCTGAGGTTGGGACCAAGAAGGAACTATCTATTTTAAAC520CAAAAATTTTCCGAAGAAGTAAAAACCCCAGAATTTGTAT560CAAGAAGACTCTTAAGGGATAATGCACAGGCCGCTGAGTT600TCGGGAAGCATGGGGCCGTGAGGGCAAACTCAAAGAGCGC640GTGGGAAATTCTGCCGGGCAGAGTTTGAACAAACCCAATA680TTCACAAGAGAGTTTTAACAGAAGCTACCGTGGGCAGGGA720AAGATCTTTGGGAGAAAGAACCCAAGAGTGTAGTGCATTT760GATAGAAACTTGAATCTGGACCAAAATGTTGTTAGACTTC800AAAGAAATAAAACAGGAGAGAGGGTCTTTAAATGTGATAT840ATGCAGCAAAACCTTCAAATATAATTCAGACCTAAGTAGA880CACCAGAGAAGTCACACTGGGGAGAAGCCGTACGAATGTG920GCCGGTGTGGGCGAGCCTTTACTCACAGCTCAAATCTTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。