基因總覽
ZNF250 是由 protein-coding gene 編碼的蛋白質,正式名稱為 zinc finger protein 250,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列長 560 個胺基酸,包含位於序列前段的 KRAB 結構域,以及一組延伸至蛋白質末端附近的 13 個 C2H2 型鋅指。這些結構特徵界定了它的家族歸屬;目前可用的功能描述則指出,它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000417550 ★ | 144,876,955–144,901,453 | 6 |
| ENST00000292579 | 144,876,951–144,901,475 | 6 |
| ENST00001136696 | 144,876,955–144,901,475 | 6 |
| ENST00001090792 | 144,880,104–144,901,475 | 5 |
| ENST00001090793 | 144,880,104–144,901,475 | 5 |
| ENST00000956453 | 144,880,876–144,900,320 | 5 |
| ENST00000862360 | 144,880,878–144,901,475 | 4 |
| ENST00000940317 | 144,880,879–144,901,453 | 5 |
| ENST00000862363 | 144,880,885–144,901,453 | 6 |
| ENST00000862373 | 144,880,885–144,900,342 | 7 |
| ENST00000940316 | 144,880,885–144,901,475 | 8 |
| ENST00000956450 | 144,880,891–144,901,475 | 7 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出,ZNF250 可能參與轉錄調控。這項描述保留了不確定性,表示其參與調控的角色尚不能寫成已確立的功能,也未說明它影響哪些基因或轉錄程序。
可用來源沒有提供 ZNF250 如何執行轉錄調控的分子細節,也未指出特定的 DNA 標的、調控方向、作用夥伴或受影響的生物學過程。因此,現有資訊僅支持將它描述為可能參與轉錄調控的蛋白質,不能據此進一步推定其調控機制或生物學後果。
Promoter 與基因調控
>ZNF250 ENST00000417550 GRCh38 chr8:144901353-144902453 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCCAGCCCCGCCCTGTGGGGAAGCCTCTTGAGAGTCTGGGCCCGCCCACGCGCCCAATGGACGACGCGG ACCTGACCTTCGGGAGTGGGGCCAGCAGAAGGTGGACTAGGCGTCAGCCTTCCCGTCCCCTGACACCGCT CCAAACCAGCCCCACCCTCCCTGCCGCGGCTGTCAGGTCCTGGGCTGTGCCCGAAGCCTCCACACGGGTG TGGCCCGCGCCCTCGTGAAGGCCCGCCCCTCTCCCCCAGGTGCGCGGTGTAAACACACCAAAAAGCAAAC ACCAGGGCCGAGTGGGCGACGGAGACGGTCGCTGTTCAGTGACGCCCCCTGTCGGGAGCACGCCGGGCCG GACACAGCGAAGAGCGGCTGCGCCTCGGACCTCGCAGCACTCAGCCTCCTAAGTGGGAGGAATAACCTCA CGCAAGTCATCAAACAAGAGGACTTCAGTGTTGCAACGAAGGAAGAGAAAGGGCCCCTGAGAAGGCGACA TTCGCACTGCAGCGGCGCAGGGACCAGCCAGGCGGCTGAGGGCAAGGTCGTTCCCAGCAGCGGGAACCGC AAGGGCAAAAGGCTCGGAGGGGGGAACGAGCTCGAGTTCCAGGACGGCCGAAGCCAGCGCAAGTCGAGGA GGGACTGCGGGGCCGGCAGGGGTGTCCTCCACAGGGCGACGGCGGCAGGAGCTCGGGAACCGGGACTGCG AGCGGGTAAGGCTCGGCGATGGGCTGTAACCTCCGCGCCCGGAAGTGCGGCCGGGGAGCCGGCCGGGCCC ATTGCCCAGAGGTGTTCGGCCCCTCTAGGGATCGCGGAGGTCTGGCTCTCGGTGGCTCCTGAGAGCTCCC TGCAGTCGGTCACCGAGAAAGGCTTCGGGCGGGCAGGCGGGCCAAATGACGTAAACATGCTTGCCCTCCA GGATTGGCGAACTCGGCTGTGGGGGCGGGAACTGAGGGGCAGGAGCCCCCAGGGATTGGCGGCTGCGCAG ACGGGGCGGGGCAGCCCTTTGTCTGAAGGTGCTGCGGGATGCCGTTCCTTCGCGCGTGAGGCTGCGGCTC TGACGGTGAGTGGGGGGCGCGTGTCGTCGCCGGCCAGGACCCTCTCCCATC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF250_1 ↗ | 8:144,901,453 | 負股 | 144,901,443–144,901,502 |
| ZNF250_2 ↗ | 8:144,902,095 | 負股 | 144,902,085–144,902,144 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_CJD7S · enhancer · 144900044–144901442 · regulatory
ENSR8_53947PZ · CTCF_binding_site · 144900343–144900364 · regulatory
ENSR8_945HTK · promoter · 144901443–144901951 · regulatory
ENSR8_5394836 · CTCF_binding_site · 144902115–144902136 · regulatory
ENSR8_5394848 · CTCF_binding_site · 144902346–144902367 · regulatory
ENSR8_945HTZ · enhancer · 144902952–144903307 · regulatory
· motif · 144900345–144900361 · motif
· motif · 144901379–144901389 · motif
· motif · 144901381–144901391 · motif
· motif · 144901395–144901412 · motif
· motif · 144901427–144901442 · motif
· motif · 144901462–144901472 · motif
· motif · 144901487–144901500 · motif
· motif · 144901487–144901500 · motif
· motif · 144901513–144901523 · motif
· motif · 144901557–144901570 · motif
· motif · 144901557–144901570 · motif
· motif · 144901668–144901677 · motif
· motif · 144901707–144901716 · motif
· motif · 144901707–144901718 · motif
· motif · 144901707–144901718 · motif
· motif · 144901892–144901900 · motif
· motif · 144902117–144902133 · motif
· motif · 144902154–144902167 · motif
· motif · 144902200–144902209 · motif
· motif · 144902348–144902364 · motif
· motif · 144902399–144902412 · motif
· motif · 144902454–144902467 · motif
· motif · 144902456–144902469 · motif
· motif · 144902595–144902611 · motif
· motif · 144902793–144902809 · motif
· motif · 144902793–144902809 · motif
· motif · 144902816–144902829 · motif
· motif · 144902816–144902831 · motif
· motif · 144902913–144902925 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:560 aa
zinc finger protein 250 長 560 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列第 22–93 位為 KRAB 結構域;第 199–557 位分布著 13 個 C2H2 型鋅指,依序排列,構成蛋白質的鋅指區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF250 的定位資料標示其位於細胞核;來源未提供定位變動條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 94 個夥伴
- ANKRD50Q9ULJ7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APOBEC3CQ9NRW3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD9Q9H257 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- CBY2Q8NA61-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC102BQ68D86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC125Q86Z20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC136Q96JN2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC6Q16204 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDCA7LQ96GN5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2Q01850 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP63Q96MT8-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DRC3Q9H069 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM124AQ86V42 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM161AQ3B820 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FDXACB1Q9BRP7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FLJ13057Q53SE7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAS8O95995 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GMNNO75496 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GNPTABQ3T906 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOLGA2Q08379 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRAP2O75791 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTCTGAAGGTGCTGCGGGATGCCGTTCCTTCGCGCGTGAG40GCTGCGGCTCTGACGCCCCATAGGCTCCTTCAATTTCCGT80GATCCTCGGAGTCCCCAGGAGACCAGGTGATGGCAGCAGC120CAGACTCCTGCCAGTGCCGGCAGGACCCCAGGCCAAGCTG160ACCTTCGAGGATGTGGCTGTGCTCCTCTCCCAGGATGAAT200GGGACCGCCTGTGCCCTGCTCAGAGGGGTCTCTACAGAAA240TGTGATGATGGAAACCTATGGGAATGTAGTCTCATTGGGA280CTTCCAGGATCCAAGCCTGACATAATCTCCCAGCTGGAGC320GAGGGGAAGATCCCTGGGTCCTGGACAGGAAGGGGGCTAA360GAAGAGCCAGGGCCTGTGGAGTGACTACTCAGACAACCTC400AAATATGACCACACTACAGCCTGTACACAACAAGACAGTT440TATCTTGTCCATGGGAATGTGAAACCAAGGGAGAGAGTCA480AAATACAGACTTGAGTCCGAAGCCATTAATTTCAGAGCAA520ACAGTGATTCTGGGGAAAACACCCTTGGGGAGGATTGATC560AAGAAAATAATGAAACAAAGCAAAGCTTCTGTCTGAGTCC600AAACTCTGTTGACCACCGTGAAGTTCAGGTCTTAAGCCAA640AGCATGCCACTCACTCCGCACCAGGCAGTGCCTAGTGGAG680AGAGGCCCTACATGTGTGTTGAGTGTGGGAAGTGCTTTGG720CCGGAGTTCCCACCTCCTTCAGCATCAGCGTATCCACACT760GGAGAGAAGCCCTATGTGTGCAGTGTATGTGGGAAGGCCT800TCAGCCAGAGCTCAGTCCTTAGTAAACACAGGAGAATTCA840CACAGGTGAGAAGCCCTATGAGTGTAATGAGTGTGGAAAA880GCCTTTAGAGTGAGCTCAGATCTTGCTCAGCATCACAAGA920TACATACAGGAGAGAAGCCTCACGAATGTCTTGAGTGTCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。