基因總覽
ZNF25（zinc finger protein 25）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質全長 456 個胺基酸，具有位於 N 端的 KRAB 結構域，以及排列於後段的 12 個 C2H2 型鋅指。這些結構特徵是此蛋白質的主要序列註解；現有資料將其描述為轉錄抑制因子，並指出它與骨骼幹細胞分化為成骨細胞的適當進程有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302609 ★ | 37,949,573–37,976,647 | 6 |
| ENST00001116230 | 37,916,979–37,976,647 | 6 |
| ENST00001116231 | 37,916,979–37,976,647 | 6 |
| ENST00000963597 | 37,949,861–37,976,647 | 6 |
| ENST00000897640 | 37,949,862–37,976,647 | 6 |
| ENST00000897641 | 37,949,865–37,976,647 | 7 |
| ENST00000897642 | 37,949,865–37,976,647 | 7 |
| ENST00000897643 | 37,949,865–37,976,647 | 6 |
| ENST00000963596 | 37,949,869–37,976,647 | 6 |
| ENST00001019744 | 37,949,869–37,976,647 | 7 |
| ENST00000963595 | 37,949,873–37,976,611 | 5 |
| ENST00000963598 | 37,950,271–37,976,647 | 6 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF25 被描述為轉錄抑制因子，並參與骨骼幹細胞分化為成骨細胞的適當進程。這項資料將其分子角色概括為抑制轉錄，同時指出其與特定細胞分化過程的關聯；但未交代受到抑制的基因或轉錄事件，也沒有說明 ZNF25 如何辨識調控目標，因此不宜據此推定其直接調控哪些成骨相關基因。
其生物學脈絡限於骨骼幹細胞朝成骨細胞分化的過程。來源指出 ZNF25 在此分化過程中具有角色，但未詳述該角色涉及分化的哪一階段、對分化速度或細胞命運的具體影響，也未提供實驗中的細胞或其他條件。因而，較穩妥的理解是：ZNF25 的轉錄抑制功能與骨骼幹細胞適當分化為成骨細胞有關，而其間的具體分子連結尚無資料可述。
Promoter 與基因調控
>ZNF25 ENST00000302609 GRCh38 chr10:37976547-37977647 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TATGTGCGCATATTTTTATATGTATATATATGTGTGTTTATACACATGACAATATATACGTTTTTTTCTA GATGATTCTACATGTTTTAATGTAATAAAGTTATTGACCAGGAAATATATAATTTGTTTTACATATACAG CCAAGTCCTCTCTCTGTATCCGCGGGGGATTAGTACCAGGACCTCCCTGGATTACTCAAATCCAGGGATG TTCAAGTCTCTGGTAGAAAATAACCTGATATTTGCATAACCTACACACCTCCTCCTGTATATTTTAAATT ATGTCTAGATTAATTGTACACCTAACACAATGTAAATACTATGTAAATAGTTTTATTGTATTGTTTAGGG TATAATGACAAGGGGGAAACTTTGTACATGTTCAGTAAGATAGAATTTTTAAGTATTTTCATTCTGAGCT TAGTTGAATCCATAGATATGCACCCCCAGGATAAGGAGGGATGACTATATATATTCCTTAGTGAAATGAT AGTCATGATACTCTATACCATTAGGTTAAAATTTGTGTAAATTCATGAGAAGGATGTTCACCTAACATTA AGCGCTTTTGCTTTTGGGAAGTGGTATACTCGTTTTCTGTTTTAGCTTATACATATTTTGTAGTTTATTA CGTTTCGCGTACCGTTTGCACAATTGTGAAAGCTAGCATTCCTAAGAGGAAGCGGTTACAGGGCATTATC CTTCATTACTCCACGTACTCCTGTACCCACGGAGTTCAATCACTTTAACAAAACTGCCCATCAGTGTTCC TTGGAGCACCTCACGGTGGATTTCTGTCTTCAAGCCCAGACGTGCAGGGTGCAGCTCTCCGGCCATCACT GAGCAAGGACAGCGCCCTCTCCCGGAAACCCGACAGCAATCACTCAGGCCGCTGGAGGCGGCCGCGCCTC ACGACGTCATCCAAGATGGAGTCGCAGCCGGGCCTTCTGGGAAGCGTAGTTCTGGAGTAGGGCTAGGGAA ACGTTCTGCGCATGTGCAGTGTCTTCTTTCTGGCATTGGCGTTTTTTTGGTCTTACGCCCTAGGGTGGGG AGAGGACTCCGGTGCCTCCGGGTCTGGGCTGGGCCGCAAAGGGCGGGGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF25_2 ↗ | 10:37,976,613 | 負股 | 37,976,603–37,976,662 |
| ZNF25_1 ↗ | 10:37,976,647 | 負股 | 37,976,637–37,976,696 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_C5QQ4 · enhancer · 37975373–37976636 · regulatory
ENSR10_7489XH · promoter · 37976637–37976740 · regulatory
ENSR10_B9JHC · enhancer · 37976741–37977374 · regulatory
ENSR10_5BX6RG · CTCF_binding_site · 37976779–37976800 · regulatory
· motif · 37972581–37972592 · motif
· motif · 37975635–37975643 · motif
· motif · 37975905–37975920 · motif
· motif · 37976244–37976254 · motif
· motif · 37976256–37976269 · motif
· motif · 37976322–37976338 · motif
· motif · 37976501–37976510 · motif
· motif · 37976552–37976567 · motif
· motif · 37976650–37976661 · motif
· motif · 37976650–37976661 · motif
· motif · 37976652–37976668 · motif
· motif · 37976652–37976668 · motif
· motif · 37976726–37976739 · motif
· motif · 37976726–37976739 · motif
· motif · 37976781–37976797 · motif
在成骨細胞分化期間，ZNF25 蛋白質表現量上升；這項調控描述限定於蛋白質層級。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：456 aa
ZNF25 蛋白質長 456 個胺基酸，屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其 N 端第 8–79 位胺基酸為 KRAB 結構域；第 118–448 位區域則包含 12 個 C2H2 型鋅指，分布於第 118–140、146–168、174–196、202–224、230–252、258–280、286–308、314–336、342–364、370–392、398–420 與 426–448 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SCRN1Q12765-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF25 是轉錄抑制因子，並參與骨骼幹細胞適當分化為成骨細胞的過程；來源未說明其直接調控的目標或具體分子機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional repressor that plays a role in the proper differentiation of skeletal stem cells into osteoblasts PMID 27814695 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF25 定位於細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 調控 | 在成骨細胞分化期間，ZNF25 蛋白質層級的表現量上升；此描述指向蛋白質表現變化。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCTTCTTTCTGGCATTGGCGTTTTTTTGGTCTTACGCCC40TAGGGTGGGGAGAGGACTCCGGTGCCTCCGGGTCTGGGCT80GGGCCGCAAAGGGCGGGGCCTGGGCCCGGCGCGGGCCGGG120AGCAGAGGCCGAGACCCTGCAGGTGATTCCTGGGGCTGCC160AGCTAAGGTCCCTTATGATTTCTGCTCTGGCTTTGCAGTT200TTCAGCCTTTCCCAAGAGCAGCAGAAAATGAACAAGTTCC240AGGGACCCGTGACATTAAAGGATGTTATTGTGGAATTCAC280CAAGGAAGAATGGAAGTTACTGACCCCTGCTCAGAGGACT320CTGTATAAGGATGTGATGCTGGAAAACTATAGTCACCTTG360TCTCAGTGGGTTACCATGTGAATAAGCCAAATGCAGTCTT400CAAGTTGAAGCAAGGAAAAGAGCCATGGATATTAGAAGTA440GAATTTCCACATCGGGGCTTCCCTGAAGACCTATGGAGCA480TTCATGATCTAGAAGCAAGATACCAGGAAAGCCAAGCTGG520AAATTCAAGGAATGGAGAACTCACAAAACATCAGAAAACT560CATACCACAGAGAAAGCCTGTGAATGTAAGGAATGTGGGA600AGTTCTTCTGCCAGAAGTCTGCCCTCATAGTACATCAGCA640TACTCACTCAAAGGGCAAATCCTATGACTGTGATAAATGT680GGGAAATCTTTCTCTAAAAATGAAGACCTCATAAGACATC720AGAAAATTCACACGAGAGATAAAACCTATGAGTGTAAAGA760ATGTAAGAAAATATTTTACCACCTATCATCTCTCAGTAGA800CATCTGAGAACCCATGCAGGAGAGAAACCCTATGAATGTA840ATCAGTGTGAAAAATCCTTCTACCAGAAACCACATCTCAC880AGAACATCAGAAAACACACACAGGGGAGAAACCTTTTGAA920TGTACTGAATGTGGGAAGTTCTTCTATGTGAAGGCATACC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。