基因總覽
ZNF24 的正式名稱為 zinc finger protein 24,屬於蛋白質編碼基因。其產物是一種轉錄因子,來源資料指出它與少突膠質細胞的髓鞘形成,以及發育中的中樞神經系統維持前驅細胞階段有關。資料亦記載其具有體外轉錄抑制活性;這些資訊概述了此蛋白質的基本角色,具體作用情境與分子層級描述見功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261332 ★ | 35,332,227–35,344,420 | 4 |
| ENST00000589881 | 35,332,227–35,344,466 | 3 |
| ENST00000399061 | 35,332,227–35,344,476 | 4 |
| ENST00000876552 | 35,332,227–35,345,502 | 4 |
| ENST00000876553 | 35,332,227–35,344,476 | 4 |
| ENST00000876554 | 35,332,227–35,344,476 | 4 |
| ENST00000876555 | 35,332,227–35,344,466 | 3 |
| ENST00000876556 | 35,332,227–35,343,993 | 4 |
| ENST00000876557 | 35,332,227–35,343,985 | 4 |
| ENST00000876558 | 35,332,227–35,343,966 | 4 |
| ENST00000931765 | 35,332,227–35,344,464 | 4 |
| ENST00000931766 | 35,332,227–35,344,476 | 4 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF24 是參與少突膠質細胞髓鞘形成所需的轉錄因子。它與已分化的少突膠質細胞形成髓鞘的過程有關,並且是少突膠質細胞由髓鞘形成前狀態轉變為髓鞘形成狀態所必需的因子。來源未提供此轉變所涉及的下游分子或具體調控步驟,因此其功能可依據資料概述為參與細胞狀態轉換及髓鞘形成,而不延伸推論未載明的機制。
在發育中的中樞神經系統,ZNF24 也參與維持細胞處於前驅細胞階段;來源描述此作用與促進細胞週期有關。這項資訊指出其在發育過程中的角色不同於少突膠質細胞轉為髓鞘形成狀態的功能,但未詳述所涉細胞類型、調控對象或作用時序。
分子作用方面,ZNF24 可特異性結合 5'-TCAT-3' DNA 序列;此結合資訊標示為相似性推定,應視為推論性描述。另有體外研究顯示,ZNF24 具有轉錄抑制活性。現有資料未進一步說明該序列結合與轉錄抑制活性之間的直接關係,也未指出特定靶基因,故不宜據此補述其調控網絡。
Promoter 與基因調控
>ZNF24 ENST00000261332 GRCh38 chr18:35344320-35345420 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAAAGACAAAACAAAACAAAAAATAAAACAAGTAAATAAATGAGATCACTTCCATTAATAACAGTGCCAT GAAGGGTCATGCGCCATGAAAGGCAGGTGGTGAGGCTGAGGATCTTGGGCCACAATGAGCCGAGGAGCTG AGGTGACTGGGGGCGCCAGGGTCTGGGGGTGCGGGCAGGCAACAGACCACAGGGGACTTACAGGCCATTA TAAGGAGTTTTTATGTCATAAATTATTATGACATAAATTGGAGGGCTTTAAATAGGGGAGTGAAGTGGTC TGATTTGTAATTTTAAATGATCGCGTCAGCAGTTGTTTTATGGTATAAAATGCCCAGCTTTAAGATGACC ATGCATTCTACAAATTCACCGTGACATCACTGCCAAAACTCTTAACCTGTCTTATCTAGTTTTCCTGACA GATAAATAGGTCGGAATAAAGCTCCATGACATAACTAGTGGGAGCCAAAGATTTGAATCACGTCTTGGTT TCAAATCTTGCTACCCACAAATGAGTTGTGAGCTCTTGTCAGGTTATTTACTGTATTTGTGCCTCAACTA TCTCAGCTGTGAAATGGGGATAATGAAAGTTCCTACATCATTTATTTGTGGAAAAAAAAATGACATGTAA AGCACGACGAGAGCGCCTGGCACAATGTAGTAAGCTTTCACAAACACTCACTTTCATTCCTTCTTGCAGG GGATTACTGAGAGGATCCACAAGATAATGCACGTGAAAGGGCTTGCGAAATTGTAAGGACTATCTTAATG GTAGAGTCCTCTTTATGTTTTCTTTTAAACGGTCCAGAGGACGCTGGGCTGTTCGAGGAGAGGCGCGAGG CCAAGCGCAGCCTCAATGCGGTCATTGTCGTGGGGCCGCCCCTCCCCCGCCCGGGGCGCTTCTCCATGGC AACGTGGGCTTTACCTCTCCCCGCCTCCTCAGGCCCGCAGACCGGAAGCAGCCCGCGCCGGGGGCTTCTG GGAAAAGGCTTGTGAACGGCGTTTCTGCGTCTGCCGTGGACAGCGAAGCTGCTGCGGTTCCTGAGCCGGA GGTTTGCGCCGGTGTGCGGGGAACGTTATGAGAGGGAGGGGGGACACCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF24_1 ↗ | 18:35,344,420 | 負股 | 35,344,410–35,344,469 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR18_9J2QR · promoter · 35343571–35344071 · regulatory
ENSR18_9J2QW · enhancer · 35344072–35344409 · regulatory
ENSR18_B92DJ · promoter · 35344410–35344946 · regulatory
· motif · 35343966–35343975 · motif
· motif · 35343966–35343977 · motif
· motif · 35343966–35343977 · motif
· motif · 35344216–35344233 · motif
· motif · 35344461–35344470 · motif
· motif · 35344464–35344479 · motif
· motif · 35344548–35344565 · motif
· motif · 35344806–35344817 · motif
· motif · 35345039–35345052 · motif
· motif · 35345105–35345116 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:368 aa
ZNF24 蛋白質長 368 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含一個 SCAN box,以及四個 C2H2-type zinc finger。另有一段涵蓋前兩個鋅指區域的序列註記為核定位所需且足以支持核定位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
序列註解指出,胺基酸 251–301 的區域被標示為核定位所需且足以支持核定位;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 40 個夥伴
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APLP1P51693 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APOEP02649 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDX6P26196 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DZIP3Q86Y13 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- FAM161AQ3B820 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- LMO2P25791 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- MAP1LC3CQ9BXW4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MID2Q9UJV3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEK6Q9HC98-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PGBD1Q96JS3 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PRPF31Q8WWY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- S100BP04271 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SQSTM1Q13501 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SYKP43405-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCAF1Q9Y4C2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBE2IQ7KZS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YJU2BP13994 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ZGPATQ8N5A5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZKSCAN4Q969J2 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF24 是少突膠質細胞髓鞘形成所需的轉錄因子,參與細胞由髓鞘形成前狀態轉為髓鞘形成狀態;在發育中的中樞神經系統,亦與促進細胞週期、維持前驅細胞階段有關。它可結合 5'-TCAT-3' DNA 序列,此結合為相似性推定,並在體外具有轉錄抑制活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor required for myelination of differentiated oligodendrocytes. Required for the conversion of oligodendrocytes from the premyelinating to the myelinating state. In the developing central nervous system (CNS), involved in the maintenance in the progenitor stage by promoting the cell cycle. Specifically binds to the 5'-TCAT-3' DNA sequence (By similarity). Has transcription repressor activity in vitro PMID 10585455 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF24 的細胞內定位為細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTTTCTGCGTCTGCCGTGGACAGCGAAGCTGCTGCGGTTC40CTGAGCCGGAGGTTTGCGCCGGAGTGCCTGTGAAGAAAAC80GGGGTATTGCCCTGAGGCTTATATTCTGCCTCAGTTGTCT120TTTCTTGAAATATTATAAATCAGAATGTCTGCACAGTCAG160TGGAAGAAGATTCAATACTTATCATCCCAACTCCAGATGA200AGAGGAAAAAATTCTGAGAGTGAAGTTGGAGGAGGATCCT240GATGGCGAAGAGGGATCAAGTATCCCCTGGAACCATCTCC280CAGACCCAGAGATTTTCCGACAGCGATTCAGGCAGTTTGG320ATACCAGGATTCACCTGGGCCCCGTGAGGCTGTGAGCCAG360CTCCGAGAACTTTGCCGTCTGTGGCTCAGGCCAGAGACGC400ACACAAAAGAACAAATCTTGGAGCTGGTAGTGCTGGAGCA440GTTTGTTGCCATCCTACCCAAAGAGCTACAGACTTGGGTT480CGAGATCATCATCCAGAGAATGGAGAGGAGGCAGTGACAG520TGCTGGAGGATTTGGAGAGTGAACTTGATGACCCTGGACA560ACCGGTTTCTCTCCGTCGACGAAAACGGGAAGTACTAGTA600GAAGACATGGTATCTCAAGAAGAAGCTCAGGGATTACCAA640GTTCTGAGCTTGATGCTGTGGAGAACCAGCTCAAGTGGGC680ATCCTGGGAGCTCCATTCCCTAAGGCACTGTGATGATGAT720GGTAGGACTGAAAATGGAGCACTAGCTCCAAAGCAGGAGC760TTCCTTCAGCATTAGAATCCCATGAAGTTCCTGGCACTCT800CAATATGGGTGTTCCTCAAATTTTTAAATATGGAGAAACC840TGTTTCCCCAAGGGCAGGTTTGAAAGAAAGAGAAATCCCT880CTCGAAAGAAACAACATATATGTGATGAATGTGGAAAACA920CTTCAGTCAGGGCTCAGCCCTTATTCTTCATCAAAGAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。