演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF24ZSCAN3

zinc finger protein 24

ZNF24(zinc finger protein 24)是蛋白質編碼基因,其產物為轉錄因子,與少突膠質細胞成熟及中樞神經系統發育中的前驅細胞維持有關。

Homo sapiens18q12.2UniProt P17028
OFFICIAL SYMBOL
ZNF24
CHROMOSOME
18
UNIPROT
P17028
PDB / ALPHAFOLD
3LHR
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF24 的正式名稱為 zinc finger protein 24,屬於蛋白質編碼基因。其產物是一種轉錄因子,來源資料指出它與少突膠質細胞的髓鞘形成,以及發育中的中樞神經系統維持前驅細胞階段有關。資料亦記載其具有體外轉錄抑制活性;這些資訊概述了此蛋白質的基本角色,具體作用情境與分子層級描述見功能段落。

Official symbol
ZNF24
Gene name
zinc finger protein 24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13032
UniProt
P17028
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZSCAN3Zfp191KOX17ZNF191

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q12.2
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegZNF24pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr18:35,332,227–35,345,502
Gene span
13,276 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000261332 ★35,332,227–35,344,4204
ENST0000058988135,332,227–35,344,4663
ENST0000039906135,332,227–35,344,4764
ENST0000087655235,332,227–35,345,5024
ENST0000087655335,332,227–35,344,4764
ENST0000087655435,332,227–35,344,4764
ENST0000087655535,332,227–35,344,4663
ENST0000087655635,332,227–35,343,9934
ENST0000087655735,332,227–35,343,9854
ENST0000087655835,332,227–35,343,9664
ENST0000093176535,332,227–35,344,4644
ENST0000093176635,332,227–35,344,4764

顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF24 是參與少突膠質細胞髓鞘形成所需的轉錄因子。它與已分化的少突膠質細胞形成髓鞘的過程有關,並且是少突膠質細胞由髓鞘形成前狀態轉變為髓鞘形成狀態所必需的因子。來源未提供此轉變所涉及的下游分子或具體調控步驟,因此其功能可依據資料概述為參與細胞狀態轉換及髓鞘形成,而不延伸推論未載明的機制。

在發育中的中樞神經系統,ZNF24 也參與維持細胞處於前驅細胞階段;來源描述此作用與促進細胞週期有關。這項資訊指出其在發育過程中的角色不同於少突膠質細胞轉為髓鞘形成狀態的功能,但未詳述所涉細胞類型、調控對象或作用時序。

分子作用方面,ZNF24 可特異性結合 5'-TCAT-3' DNA 序列;此結合資訊標示為相似性推定,應視為推論性描述。另有體外研究顯示,ZNF24 具有轉錄抑制活性。現有資料未進一步說明該序列結合與轉錄抑制活性之間的直接關係,也未指出特定靶基因,故不宜據此補述其調控網絡。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 35344420 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF24 ENST00000261332 GRCh38 chr18:35344320-35345420 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAAGACAAAACAAAACAAAAAATAAAACAAGTAAATAAATGAGATCACTTCCATTAATAACAGTGCCAT
GAAGGGTCATGCGCCATGAAAGGCAGGTGGTGAGGCTGAGGATCTTGGGCCACAATGAGCCGAGGAGCTG
AGGTGACTGGGGGCGCCAGGGTCTGGGGGTGCGGGCAGGCAACAGACCACAGGGGACTTACAGGCCATTA
TAAGGAGTTTTTATGTCATAAATTATTATGACATAAATTGGAGGGCTTTAAATAGGGGAGTGAAGTGGTC
TGATTTGTAATTTTAAATGATCGCGTCAGCAGTTGTTTTATGGTATAAAATGCCCAGCTTTAAGATGACC
ATGCATTCTACAAATTCACCGTGACATCACTGCCAAAACTCTTAACCTGTCTTATCTAGTTTTCCTGACA
GATAAATAGGTCGGAATAAAGCTCCATGACATAACTAGTGGGAGCCAAAGATTTGAATCACGTCTTGGTT
TCAAATCTTGCTACCCACAAATGAGTTGTGAGCTCTTGTCAGGTTATTTACTGTATTTGTGCCTCAACTA
TCTCAGCTGTGAAATGGGGATAATGAAAGTTCCTACATCATTTATTTGTGGAAAAAAAAATGACATGTAA
AGCACGACGAGAGCGCCTGGCACAATGTAGTAAGCTTTCACAAACACTCACTTTCATTCCTTCTTGCAGG
GGATTACTGAGAGGATCCACAAGATAATGCACGTGAAAGGGCTTGCGAAATTGTAAGGACTATCTTAATG
GTAGAGTCCTCTTTATGTTTTCTTTTAAACGGTCCAGAGGACGCTGGGCTGTTCGAGGAGAGGCGCGAGG
CCAAGCGCAGCCTCAATGCGGTCATTGTCGTGGGGCCGCCCCTCCCCCGCCCGGGGCGCTTCTCCATGGC
AACGTGGGCTTTACCTCTCCCCGCCTCCTCAGGCCCGCAGACCGGAAGCAGCCCGCGCCGGGGGCTTCTG
GGAAAAGGCTTGTGAACGGCGTTTCTGCGTCTGCCGTGGACAGCGAAGCTGCTGCGGTTCCTGAGCCGGA
GGTTTGCGCCGGTGTGCGGGGAACGTTATGAGAGGGAGGGGGGACACCGGG
ZNF24 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF24_1 ↗18:35,344,420負股35,344,410–35,344,469

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_9J2QR · promoter · 35343571–35344071 · regulatory

ENSR18_9J2QW · enhancer · 35344072–35344409 · regulatory

ENSR18_B92DJ · promoter · 35344410–35344946 · regulatory

· motif · 35343966–35343975 · motif

· motif · 35343966–35343977 · motif

· motif · 35343966–35343977 · motif

· motif · 35344216–35344233 · motif

· motif · 35344461–35344470 · motif

· motif · 35344464–35344479 · motif

· motif · 35344548–35344565 · motif

· motif · 35344806–35344817 · motif

· motif · 35345039–35345052 · motif

· motif · 35345105–35345116 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:368 aa

1 aa368 aa結構域功能區域鋅指
依 P17028 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF24 蛋白質長 368 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含一個 SCAN box,以及四個 C2H2-type zinc finger。另有一段涵蓋前兩個鋅指區域的序列註記為核定位所需且足以支持核定位。

結構域SCAN box52–134 aa
鋅指C2H2-type 1251–273 aa
鋅指C2H2-type 2279–301 aa
鋅指C2H2-type 3307–329 aa
鋅指C2H2-type 4335–357 aa
功能區域Necessary and sufficient for nuclear localization251–301 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3LHR…

PDB · 3LHR

X-ray · 1.90 A · A/B=46-136

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

序列註解指出,胺基酸 251–301 的區域被標示為核定位所需且足以支持核定位;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 40 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZSCAN3ZNF24AKT1APLP1APOEAPPDDX6DMWDDZIP3FAM161ALMO1LMO2MAP1LC3CMID2NEK6PGBD1PRPF31S100BSCAND1SPRED1SQSTM1SYKTCAF1UBE2IYJU2BZGPATZKSCAN4ZNF165ZNF174ZNF232ZNF396ZNF410ZNF444ZNF446ZNF483ZNF620ZSCAN12ZSCAN16ZSCAN21ZSCAN22ZSCAN23ZSCAN32
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 40 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF24 是少突膠質細胞髓鞘形成所需的轉錄因子,參與細胞由髓鞘形成前狀態轉為髓鞘形成狀態;在發育中的中樞神經系統,亦與促進細胞週期、維持前驅細胞階段有關。它可結合 5'-TCAT-3' DNA 序列,此結合為相似性推定,並在體外具有轉錄抑制活性。含實驗來源
證據與來源

Transcription factor required for myelination of differentiated oligodendrocytes. Required for the conversion of oligodendrocytes from the premyelinating to the myelinating state. In the developing central nervous system (CNS), involved in the maintenance in the progenitor stage by promoting the cell cycle. Specifically binds to the 5'-TCAT-3' DNA sequence (By similarity). Has transcription repressor activity in vitro

PMID 10585455 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF24 的細胞內定位為細胞核。含實驗來源
證據與來源

Nucleus

PMID 24224020 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000261332 · 6,256 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTTTCTGCGTCTGCCGTGGACAGCGAAGCTGCTGCGGTTC40
41CTGAGCCGGAGGTTTGCGCCGGAGTGCCTGTGAAGAAAAC80
81GGGGTATTGCCCTGAGGCTTATATTCTGCCTCAGTTGTCT120
121TTTCTTGAAATATTATAAATCAGAATGTCTGCACAGTCAG160
161TGGAAGAAGATTCAATACTTATCATCCCAACTCCAGATGA200
201AGAGGAAAAAATTCTGAGAGTGAAGTTGGAGGAGGATCCT240
241GATGGCGAAGAGGGATCAAGTATCCCCTGGAACCATCTCC280
281CAGACCCAGAGATTTTCCGACAGCGATTCAGGCAGTTTGG320
321ATACCAGGATTCACCTGGGCCCCGTGAGGCTGTGAGCCAG360
361CTCCGAGAACTTTGCCGTCTGTGGCTCAGGCCAGAGACGC400
401ACACAAAAGAACAAATCTTGGAGCTGGTAGTGCTGGAGCA440
441GTTTGTTGCCATCCTACCCAAAGAGCTACAGACTTGGGTT480
481CGAGATCATCATCCAGAGAATGGAGAGGAGGCAGTGACAG520
521TGCTGGAGGATTTGGAGAGTGAACTTGATGACCCTGGACA560
561ACCGGTTTCTCTCCGTCGACGAAAACGGGAAGTACTAGTA600
601GAAGACATGGTATCTCAAGAAGAAGCTCAGGGATTACCAA640
641GTTCTGAGCTTGATGCTGTGGAGAACCAGCTCAAGTGGGC680
681ATCCTGGGAGCTCCATTCCCTAAGGCACTGTGATGATGAT720
721GGTAGGACTGAAAATGGAGCACTAGCTCCAAAGCAGGAGC760
761TTCCTTCAGCATTAGAATCCCATGAAGTTCCTGGCACTCT800
801CAATATGGGTGTTCCTCAAATTTTTAAATATGGAGAAACC840
841TGTTTCCCCAAGGGCAGGTTTGAAAGAAAGAGAAATCCCT880
881CTCGAAAGAAACAACATATATGTGATGAATGTGGAAAACA920
921CTTCAGTCAGGGCTCAGCCCTTATTCTTCATCAAAGAATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。