基因總覽
ZNF239 是蛋白質編碼基因，其產物為 zinc finger protein 239，屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質長 458 個胺基酸，序列中有九個 C2H2-type zinc finger，排列於蛋白質後段。來源指出此蛋白質可能參與轉錄調控；這項描述屬於可能的功能，而非確定結論。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374446 ★ | 43,556,344–43,574,616 | 4 |
| ENST00000306006 | 43,552,197–43,569,441 | 2 |
| ENST00000426961 | 43,552,197–43,574,623 | 3 |
| ENST00000535642 | 43,552,197–43,574,623 | 2 |
| ENST00000886909 | 43,552,197–43,574,621 | 2 |
| ENST00000886910 | 43,552,197–43,574,623 | 6 |
| ENST00000886911 | 43,552,197–43,574,623 | 4 |
| ENST00000886912 | 43,552,197–43,574,623 | 3 |
| ENST00000886913 | 43,552,197–43,574,621 | 3 |
| ENST00000886914 | 43,552,197–43,574,621 | 4 |
| ENST00000886915 | 43,552,197–43,574,621 | 4 |
| ENST00000886916 | 43,552,197–43,574,623 | 3 |
顯示 12/50 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF239 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性功能描述，未進一步說明它調控哪些基因、影響轉錄的方向，或在何種細胞與生理條件下發揮作用，因此其具體調控對象與作用情境尚不能由這些資料判定。
ZNF239 屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family，並具有多個 C2H2-type zinc finger。這些結構特徵與其可能參與轉錄調控的背景相符，但來源沒有提供 DNA 結合、轉錄活化或抑制、調控步驟，或相關分子互作的直接資訊。因而不能據此把某一種特定調控機制視為已證實，也不能推定其靶序列或結合夥伴。
目前可支持的生物學意義，限於 ZNF239 可能與轉錄調控有關。來源未描述基因表現改變、功能缺失或其他實驗結果，也沒有提供其在特定生物過程中的作用，因此無法進一步推論它對細胞或個體的影響。
Promoter 與基因調控
>ZNF239 ENST00000374446 GRCh38 chr10:43574516-43575616 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCAAGGAATGCAAATAGTCACTGGGAACTGGAAAAGGCAAAGAAATATTCTCATCTAGAACCTCCAGGA GGAACTAGCCCCACCAACACTGACTTTATAAAGCCCAGTAAAACTTGATTTCAGACTTGGCACCTCCAGA AGTTTAAGAGAATACATGTTTGTTATACTACTAAGTTTGTGTTAATTTGTTGTGACAGCAATTGGAAACT AATACACCAAGGAAGGGGGAGGATGTAGAAGAGAGGTCCAGGCAACATCTCTTTCCTCTCCAAAATAAAT CTGAAAGAAAGGAATTGGGAAAAGACCAAATGGGTAGCTCTGTGTCACTCGGTGAGAAGTGAAATAAACG TAAAATCCTGGTATCAACAACCCTTGTGTGCGTTTAGGAGAGTTCTGACTGCTGGGAGCCACTTGTCTAA TTCCCTCACCTCCTGTGTTTGTTCCAAGATCCCCTATTTAAAATTGCAAAGTACACCTCCAGTCCTACAC ACCCACAAACGCACCTCGCCACACCCCGCCCAGCTCTATGCTTTCAGTACCACCTCATGACACACACGAC GCCATATATTTACTATATTTATGGATTGCTTGTTTCCCCAACTAGAATAGGGCAGTGACTTTTGTGCAAG CATCTTGAACAGCTCCTGGTACACAGTTGGCTCTCAATTAATATCTGTTAAATGGATGAACTTCAGAGGT GAGATGGAAGATGCCGAATGGCAAATATTCACTTCAGAATGTTTTGAAAGGTAAAGATGAAATTATGGGT ATTTACATCCTTTTCCCCCAATAGTATTTTAACAAATGAAAATCACCTTAACAGGTATTCCTAAAATAAT TCTTATTTGTTTGTAATAAAAAACGAGGAGGAGGACTTGAATACACGCGTCGCTGACTCAAAGATGGTCC CCTCCGCCCAAGAATCCCGCTCCGCACAGCGCAGAGTTCAGGGGCCCGCGCCGGAAGTGGGCGTGGTTCG CCCGCGGCTTGCTGGGACTTGTATTTCGGGGCCCTAGGCGCGCGAGCGGTCAGCATCCGGAATCTGGCCC CTGCAGGCGTGGGGTTCCACGTGGGAGGTGAGACTGGCCGGGCTTCCCCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF239_1 ↗ | 10:43,574,585 | 負股 | 43,574,575–43,574,634 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_C6BQ3 · enhancer · 43573272–43574605 · regulatory
ENSR10_9M9ZG · promoter · 43574606–43575096 · regulatory
ENSR10_5D8PMH · CTCF_binding_site · 43574640–43574661 · regulatory
· motif · 43574378–43574387 · motif
· motif · 43574378–43574387 · motif
· motif · 43574378–43574387 · motif
· motif · 43574378–43574387 · motif
· motif · 43574486–43574498 · motif
· motif · 43574489–43574496 · motif
· motif · 43574490–43574503 · motif
· motif · 43574642–43574658 · motif
· motif · 43574648–43574657 · motif
· motif · 43574648–43574659 · motif
· motif · 43575041–43575051 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：458 aa
zinc finger protein 239 長 458 個胺基酸，屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質第 207–229、235–257、263–285、291–313、319–341、347–369、375–397、403–425 與 431–453 個胺基酸位置各有一個 C2H2-type zinc finger，共九個；這些區段的註解依據序列特徵預測。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位改變的條件、細胞內動態或異構型差異，也未描述與其他蛋白質的定位關係。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CARD10Q9BWT7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WTAPQ15007 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTATTTCGGGGCCCTAGGCGCGCGAGCGGTCAGCATCCGG40AATCTGGCCCCTGCAGGCGTGGGGTTCCACGTGGGAGGAA80TCCATCCCCTCTGGGAGTAAGAAATGACCAGGGTCCGGGA120ACCAGTTACATTCAAGGATGCCTCTGTGGCCTTCACCGAG160GAGGAGTGAGGTCACCTGGACTCTGCTCCCAGGAAGCTGT200GCGGAGCTGTGATGCTGGGCAACTACAGAAACTTGGTCTT240GGAGACTTGAATGAAAATTCTGTGGAGAATCTTCAGCAGA280AAACACTTCAGGATCTGTTACATGAGCTTTCCTCCTGGCT320AGTTTTGGAAGGCATGGCCAGTACAATTACTGGAAGTCAG360GATTGTATTGTGAATCATCGAGGGGAAGTGGATGGGGAGC400CTGAACTAGATATTTCCCCTTGTCAACAGTGGGGAGAAGC440ATCTTCTCCTATTTCCAGAAACAGGGACAGTGTGATGACT480CTTCAAAGTGGTTGTTTCGAAAACATTGAAAGTGAAACAT520ATTTGCCTTTGAAAGTCTCAAGCCAAATAGACACACAAGA560CTCTTCAGTGAAGTTCTGTAAGAATGAGCCTCAGGATCAT600CAGGAAAGCAGACGTCTCTTTGTAATGGAAGAAAGCACTG640AGAGAAAAGTGATAAAGGGGGAAAGTTGTTCAGAGAACCT680TCAAGTTAAACTGGTGTCTGATGGACAAGAACTGGCCTCG720CCATTGTTAAATGGTGAGGCAACTTGCCAGAATGGCCAGT760TAAAAGAATCTTTGGATCCCATTGACTGTAACTGCAAAGA800CATTCATGGATGGAAATCACAGGTGGTCAGTTGTAGTCAG840CAGAGAGCTCATACAGAGGAGAAACCCTGTGACCATAATA880ACTGTGGGAAAATACTTAACACCAGCCCAGATGGTCATCC920ATATGAGAAAATCCACACTGCAGAGAAACAATACGAATGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。