基因總覽
zinc finger protein 236 是由 ZNF236 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列包含多個 C2H2 型鋅指,並散布有數段預測為無序的區域。現有功能註記僅指出此蛋白可能參與轉錄調控,未進一步說明其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000320610 ★ | 76,822,557–76,972,901 | 31 |
| ENST00001025965 | 76,822,367–76,877,518 | 6 |
| ENST00001117057 | 76,822,367–76,881,465 | 9 |
| ENST00001132243 | 76,822,367–76,972,901 | 31 |
| ENST00000253159 | 76,824,160–76,972,901 | 31 |
| ENST00000645888 | 76,927,927–76,937,343 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前可用的功能註記指出,zinc finger protein 236 可能參與轉錄調控。這項描述具有不確定性,僅表示其可能與調控轉錄的過程有關,並未說明它對特定基因的轉錄是促進或抑制,也沒有提供其作用對象、調控條件或分子機制等細節。
因此,依據現有資料,尚無法進一步界定此蛋白在轉錄調控中的具體角色,亦不能據此推論它參與哪些生物過程或產生何種細胞效應。其家族與鋅指結構資訊可描述蛋白質特徵,但不足以單獨確定轉錄調控的方式。
Promoter 與基因調控
>ZNF236 ENST00000320610 GRCh38 chr18:76821557-76822657 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGTGGGTCCCGATCGTGTCACTGCACTCCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGCGAGACCCAGTCTGTATAAA AAGATATTTAAAAACTCCAGGAAATTCAAACTATAGTGACAAAAAGCAGATGGGTGGGAGGGGGAGGAGG GAAGGAGGGAGAGAGGAAAGGGTTACAGAGAGACGGGAGGAACATCTTCACTGTTGATTGTGATGATGGT TTCACAGTGTATACATGTGTCAAGATGTATCAAACTGCACACTTTAATTTGCGCCACTGCACTCCAGCCC AGGTGACAGAGTAAGGTCGCTTTCCCCGGGCTCGGCCGGCCTCTCCACCCGGCGCTCGGGTGCTGCGCTG CCTGTTCCTGTTGCCACTTCGTGTAAGTTAGCGCAGGCAACAACACACAAGACCAGCACACGTGAAATGG TCCATTTTAATGCACTGCCCCCAGGGAAAGGAACATTACCGGCTTCTGGCCATGTCGTCTTCCCAGTCCC AGATGGCGGTTCCGGGTTTGGGCTCCGAGGCCCTTCGCAGCACTAGGGCGGCGCGAGTAGGGCCGCCCTC CGAGCCATGCTGCGGTCCGAGGTGACGCGCGCACGCGAGTTCGCGGACACGCACGAGACGCCCGGGCCAC GGAGGCGCGGGGCTGGCCCAGGGTCCCCGCCAGGCCGAGCTCTAGGGCTGCCGGCCCGGCCCGGTGACCC CCGCGCTCCCCTCCGTCCGCTAAGGCCCCGCGGCGCCGCGCATGCGCCCCGCCGCCGCCCCCGCCCCCAC CGCGCCCGCGCCCGCGCCCAACGCCCCCACCGCGGCCCGCGGGCCATGGAACCTGCCAAGGCCGGCGCGG TTCGAGCGCTCCGGTGCGCGCGTTCAGGCGCCTTTCCCCCGTGAGCCCGGCGGCGCTCGGACCGGGCCGC CCGCCGCCGGGCAGCTCCGCCCGCCTCTAGCGCCGGCTGGGCGCGCCCCCGCCCCGGTGCCCGCGCGTGC GCGCCCCCGCCGCCGCGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGGGTGTGGGTGCGAGCCGGGCCGCCGAC GATGCCGCGGGGCCGCCCCCCGAAGCCCAGGGAGAGCAAGGCGCGCGGCGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF236_3 ↗ | 18:76,822,163 | 正股 | 76,822,114–76,822,173 |
| ZNF236_2 ↗ | 18:76,822,557 | 正股 | 76,822,508–76,822,567 |
| ZNF236_4 ↗ | 18:76,822,667 | 正股 | 76,822,618–76,822,677 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR18_C9LS4 · enhancer · 76820255–76822116 · regulatory
ENSR18_935H9N · promoter · 76822117–76822567 · regulatory
ENSR18_5N3TNL · CTCF_binding_site · 76823116–76823137 · regulatory
ENSR18_935HB5 · promoter · 76823670–76824170 · regulatory
ENSR18_848ZLS · enhancer · 76824814–76824952 · regulatory
· motif · 76817651–76817666 · motif
· motif · 76817656–76817668 · motif
· motif · 76817659–76817666 · motif
· motif · 76817659–76817674 · motif
· motif · 76818087–76818100 · motif
· motif · 76819913–76819925 · motif
· motif · 76819915–76819930 · motif
· motif · 76821952–76821968 · motif
· motif · 76821952–76821968 · motif
· motif · 76822047–76822057 · motif
· motif · 76822053–76822064 · motif
· motif · 76822126–76822141 · motif
· motif · 76822242–76822257 · motif
· motif · 76822247–76822259 · motif
· motif · 76822250–76822257 · motif
· motif · 76822304–76822317 · motif
· motif · 76822310–76822323 · motif
· motif · 76822316–76822329 · motif
· motif · 76822346–76822359 · motif
· motif · 76822508–76822521 · motif
· motif · 76822536–76822549 · motif
· motif · 76822542–76822555 · motif
· motif · 76822572–76822585 · motif
· motif · 76822729–76822738 · motif
· motif · 76822762–76822775 · motif
· motif · 76822768–76822781 · motif
· motif · 76822792–76822805 · motif
· motif · 76822795–76822808 · motif
· motif · 76822961–76822974 · motif
· motif · 76823118–76823131 · motif
· motif · 76823118–76823134 · motif
· motif · 76823790–76823807 · motif
· motif · 76823849–76823866 · motif
· motif · 76827359–76827370 · motif
· motif · 76827490–76827501 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1845 aa
zinc finger protein 236 長 1,845 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列註解列出 30 個 C2H2 型鋅指,分布於多個區段;另有三段區域被註解為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 236 的定位註記為細胞核;資料未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- PRKAB2O43741 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGGGTGTGGGTGCGAGCCG40GGCCGCCGACGATGCCGCGGGGCCGCCCCCCGAAGCCCAG80GGAGAGCAAGGCGCGCGGCGACTCCGATGGAGTTTTAACA120TTGAATGCGGAGAACACTAATTATGCCTATCAAGTTCCAA160ACTTCCATAAATGTGAAATCTGTCTACTATCTTTTCCAAA200AGAATCCCAGTTTCAACGCCACATGAGGGATCACGAGCGA240AATGACAAGCCACATCGATGTGACCAGTGCCCCCAAACAT280TTAATGTTGAATTCAACCTGACACTTCATAAATGCACCCA320CAGCGGGGAAGATCCTACCTGCCCTGTGTGTAACAAGAAA360TTCTCCAGAGTGGCTAGTCTCAAAGCGCATATTATGCTAC400ATGAAAAGGAAGAGAATCTCATCTGTTCTGAGTGTGGGGA440TGAGTTTACTCTGCAGAGTCAGCTGGCCGTGCACATGGAG480GAGCACCGCCAGGAGCTGGCTGGAACCCGGCAGCATGCCT520GCAAGGCCTGCAAGAAAGAGTTCGAGACCTCCTCGGAGCT560GAAGGAACACATGAAGACTCATTACAAAATTAGGGTATCA600AGTACAAGGTCTTATAACCGGAATATCGACAGAAGTGGAT640TCACGTATTCGTGTCCGCACTGTGGAAAGACGTTTCAAAA680GCCAAGCCAGTTAACGCGACACATTAGGATACACACAGGT720GAAAGGCCGTTCAAATGTAGTGAATGTGGAAAGGCTTTTA760ACCAGAAGGGGGCACTGCAGACCCACATGATCAAGCACAC800AGGTGAAAAACCCCATGCCTGTGCCTTCTGTCCTGCCGCC840TTCTCTCAGAAAGGGAATCTTCAGTCGCACGTGCAGCGAG880TCCACTCAGAGGTCAAGAATGGTCCTACCTATAACTGTAC920AGAATGTAGTTGTGTATTTAAAAGTTTAGGCAGCTTAAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。