演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF236

zinc finger protein 236

ZNF236 編碼 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族成員;此蛋白可能參與轉錄調控,並具有多個 C2H2 型鋅指。

Homo sapiens18q23UniProt Q9UL36
OFFICIAL SYMBOL
ZNF236
CHROMOSOME
18
UNIPROT
Q9UL36
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger protein 236 是由 ZNF236 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列包含多個 C2H2 型鋅指,並散布有數段預測為無序的區域。現有功能註記僅指出此蛋白可能參與轉錄調控,未進一步說明其調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF236
Gene name
zinc finger protein 236
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13028
UniProt
Q9UL36
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q23
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegZNF236pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:76,822,367–76,972,901
Gene span
150,535 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000320610 ★76,822,557–76,972,90131
ENST0000102596576,822,367–76,877,5186
ENST0000111705776,822,367–76,881,4659
ENST0000113224376,822,367–76,972,90131
ENST0000025315976,824,160–76,972,90131
ENST0000064588876,927,927–76,937,3433

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前可用的功能註記指出,zinc finger protein 236 可能參與轉錄調控。這項描述具有不確定性,僅表示其可能與調控轉錄的過程有關,並未說明它對特定基因的轉錄是促進或抑制,也沒有提供其作用對象、調控條件或分子機制等細節。

因此,依據現有資料,尚無法進一步界定此蛋白在轉錄調控中的具體角色,亦不能據此推論它參與哪些生物過程或產生何種細胞效應。其家族與鋅指結構資訊可描述蛋白質特徵,但不足以單獨確定轉錄調控的方式。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 76822557 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF236 ENST00000320610 GRCh38 chr18:76821557-76822657 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGTGGGTCCCGATCGTGTCACTGCACTCCCGCCTGGGTGACAGAGCAAGCGAGACCCAGTCTGTATAAA
AAGATATTTAAAAACTCCAGGAAATTCAAACTATAGTGACAAAAAGCAGATGGGTGGGAGGGGGAGGAGG
GAAGGAGGGAGAGAGGAAAGGGTTACAGAGAGACGGGAGGAACATCTTCACTGTTGATTGTGATGATGGT
TTCACAGTGTATACATGTGTCAAGATGTATCAAACTGCACACTTTAATTTGCGCCACTGCACTCCAGCCC
AGGTGACAGAGTAAGGTCGCTTTCCCCGGGCTCGGCCGGCCTCTCCACCCGGCGCTCGGGTGCTGCGCTG
CCTGTTCCTGTTGCCACTTCGTGTAAGTTAGCGCAGGCAACAACACACAAGACCAGCACACGTGAAATGG
TCCATTTTAATGCACTGCCCCCAGGGAAAGGAACATTACCGGCTTCTGGCCATGTCGTCTTCCCAGTCCC
AGATGGCGGTTCCGGGTTTGGGCTCCGAGGCCCTTCGCAGCACTAGGGCGGCGCGAGTAGGGCCGCCCTC
CGAGCCATGCTGCGGTCCGAGGTGACGCGCGCACGCGAGTTCGCGGACACGCACGAGACGCCCGGGCCAC
GGAGGCGCGGGGCTGGCCCAGGGTCCCCGCCAGGCCGAGCTCTAGGGCTGCCGGCCCGGCCCGGTGACCC
CCGCGCTCCCCTCCGTCCGCTAAGGCCCCGCGGCGCCGCGCATGCGCCCCGCCGCCGCCCCCGCCCCCAC
CGCGCCCGCGCCCGCGCCCAACGCCCCCACCGCGGCCCGCGGGCCATGGAACCTGCCAAGGCCGGCGCGG
TTCGAGCGCTCCGGTGCGCGCGTTCAGGCGCCTTTCCCCCGTGAGCCCGGCGGCGCTCGGACCGGGCCGC
CCGCCGCCGGGCAGCTCCGCCCGCCTCTAGCGCCGGCTGGGCGCGCCCCCGCCCCGGTGCCCGCGCGTGC
GCGCCCCCGCCGCCGCGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGGGTGTGGGTGCGAGCCGGGCCGCCGAC
GATGCCGCGGGGCCGCCCCCCGAAGCCCAGGGAGAGCAAGGCGCGCGGCGA
ZNF236 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF236_3 ↗18:76,822,163正股76,822,114–76,822,173
ZNF236_2 ↗18:76,822,557正股76,822,508–76,822,567
ZNF236_4 ↗18:76,822,667正股76,822,618–76,822,677

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_C9LS4 · enhancer · 76820255–76822116 · regulatory

ENSR18_935H9N · promoter · 76822117–76822567 · regulatory

ENSR18_5N3TNL · CTCF_binding_site · 76823116–76823137 · regulatory

ENSR18_935HB5 · promoter · 76823670–76824170 · regulatory

ENSR18_848ZLS · enhancer · 76824814–76824952 · regulatory

· motif · 76817651–76817666 · motif

· motif · 76817656–76817668 · motif

· motif · 76817659–76817666 · motif

· motif · 76817659–76817674 · motif

· motif · 76818087–76818100 · motif

· motif · 76819913–76819925 · motif

· motif · 76819915–76819930 · motif

· motif · 76821952–76821968 · motif

· motif · 76821952–76821968 · motif

· motif · 76822047–76822057 · motif

· motif · 76822053–76822064 · motif

· motif · 76822126–76822141 · motif

· motif · 76822242–76822257 · motif

· motif · 76822247–76822259 · motif

· motif · 76822250–76822257 · motif

· motif · 76822304–76822317 · motif

· motif · 76822310–76822323 · motif

· motif · 76822316–76822329 · motif

· motif · 76822346–76822359 · motif

· motif · 76822508–76822521 · motif

· motif · 76822536–76822549 · motif

· motif · 76822542–76822555 · motif

· motif · 76822572–76822585 · motif

· motif · 76822729–76822738 · motif

· motif · 76822762–76822775 · motif

· motif · 76822768–76822781 · motif

· motif · 76822792–76822805 · motif

· motif · 76822795–76822808 · motif

· motif · 76822961–76822974 · motif

· motif · 76823118–76823131 · motif

· motif · 76823118–76823134 · motif

· motif · 76823790–76823807 · motif

· motif · 76823849–76823866 · motif

· motif · 76827359–76827370 · motif

· motif · 76827490–76827501 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1845 aa

1 aa1845 aa功能區域鋅指
依 Q9UL36 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 236 長 1,845 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列註解列出 30 個 C2H2 型鋅指,分布於多個區段;另有三段區域被註解為無序區。

鋅指C2H2-type 137–59 aa
鋅指C2H2-type 266–88 aa
鋅指C2H2-type 393–115 aa
鋅指C2H2-type 4121–143 aa
鋅指C2H2-type 5153–175 aa
鋅指C2H2-type 6197–219 aa
鋅指C2H2-type 7225–247 aa
鋅指C2H2-type 8253–276 aa
鋅指C2H2-type 9285–308 aa
鋅指C2H2-type 10482–504 aa
鋅指C2H2-type 11510–532 aa
鋅指C2H2-type 12538–560 aa
鋅指C2H2-type 13566–588 aa
鋅指C2H2-type 14657–679 aa
鋅指C2H2-type 15685–707 aa
鋅指C2H2-type 16713–735 aa
鋅指C2H2-type 17741–763 aa
鋅指C2H2-type 18967–989 aa
鋅指C2H2-type 19995–1017 aa
鋅指C2H2-type 201023–1045 aa
鋅指C2H2-type 211051–1073 aa
鋅指C2H2-type 221167–1189 aa
鋅指C2H2-type 231195–1217 aa
鋅指C2H2-type 241223–1245 aa
鋅指C2H2-type 251251–1273 aa
鋅指C2H2-type 261657–1680 aa
鋅指C2H2-type 271686–1708 aa
鋅指C2H2-type 281722–1744 aa
鋅指C2H2-type 291750–1772 aa
鋅指C2H2-type 301778–1801 aa
功能區域Disordered404–466 aa
功能區域Disordered864–890 aa
功能區域Disordered1267–1297 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UL36…

AlphaFold · Q9UL36

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 236 的定位註記為細胞核;資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF236ZNF236PRKAB2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能zinc finger protein 236 可能參與轉錄調控。此註記以「可能」描述其功能關聯,未指出調控方向、作用對象、發生條件或具體分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位zinc finger protein 236 的定位註記為細胞核;此項資訊未補充特定細胞狀態、條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000320610 · 10,157 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGTGTGAGTGTGAGTGTGAGTGGGTGTGGGTGCGAGCCG40
41GGCCGCCGACGATGCCGCGGGGCCGCCCCCCGAAGCCCAG80
81GGAGAGCAAGGCGCGCGGCGACTCCGATGGAGTTTTAACA120
121TTGAATGCGGAGAACACTAATTATGCCTATCAAGTTCCAA160
161ACTTCCATAAATGTGAAATCTGTCTACTATCTTTTCCAAA200
201AGAATCCCAGTTTCAACGCCACATGAGGGATCACGAGCGA240
241AATGACAAGCCACATCGATGTGACCAGTGCCCCCAAACAT280
281TTAATGTTGAATTCAACCTGACACTTCATAAATGCACCCA320
321CAGCGGGGAAGATCCTACCTGCCCTGTGTGTAACAAGAAA360
361TTCTCCAGAGTGGCTAGTCTCAAAGCGCATATTATGCTAC400
401ATGAAAAGGAAGAGAATCTCATCTGTTCTGAGTGTGGGGA440
441TGAGTTTACTCTGCAGAGTCAGCTGGCCGTGCACATGGAG480
481GAGCACCGCCAGGAGCTGGCTGGAACCCGGCAGCATGCCT520
521GCAAGGCCTGCAAGAAAGAGTTCGAGACCTCCTCGGAGCT560
561GAAGGAACACATGAAGACTCATTACAAAATTAGGGTATCA600
601AGTACAAGGTCTTATAACCGGAATATCGACAGAAGTGGAT640
641TCACGTATTCGTGTCCGCACTGTGGAAAGACGTTTCAAAA680
681GCCAAGCCAGTTAACGCGACACATTAGGATACACACAGGT720
721GAAAGGCCGTTCAAATGTAGTGAATGTGGAAAGGCTTTTA760
761ACCAGAAGGGGGCACTGCAGACCCACATGATCAAGCACAC800
801AGGTGAAAAACCCCATGCCTGTGCCTTCTGTCCTGCCGCC840
841TTCTCTCAGAAAGGGAATCTTCAGTCGCACGTGCAGCGAG880
881TCCACTCAGAGGTCAAGAATGGTCCTACCTATAACTGTAC920
921AGAATGTAGTTGTGTATTTAAAAGTTTAGGCAGCTTAAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。