演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF235HZF6

zinc finger protein 235

ZNF235 是一種含 KRAB 與多個 C2H2-type zinc finger 的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q14590
OFFICIAL SYMBOL
ZNF235
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q14590
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF235 是由 protein-coding gene 編碼的 zinc finger protein 235,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質長 738 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB domain,並在蛋白質後段排列多個 C2H2-type zinc finger;其中第一個被註記為退化型。這些結構註解呈現其家族與蛋白質組成特徵;現有資料將其主要角色概括為可能參與轉錄調控。

Official symbol
ZNF235
Gene name
zinc finger protein 235
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12866
UniProt
Q14590
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HZF6ANF270ZNF270ZFP93

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF235pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:44,228,729–44,305,046
Gene span
76,318 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000291182 ★44,286,348–44,305,0255
ENST0000058979944,233,915–44,305,0465
ENST0000099982744,233,915–44,305,0465
ENST0000101221344,233,915–44,304,9335
ENST0000058924844,274,752–44,305,0465
ENST0000114181944,286,348–44,305,0465
ENST0000094791444,286,352–44,304,9335
ENST0000065057644,286,364–44,305,0465
ENST0000059160944,288,805–44,304,9685
ENST0000101221444,301,493–44,305,0462

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,ZNF235 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能涉及對轉錄過程的調節,但資料未進一步說明它作用於哪些基因、如何辨識作用標的,或會使轉錄增加還是降低,因此不能據此判定其調控方向與具體機制。

ZNF235 的蛋白質註解包括 KRAB domain,以及多個 C2H2-type zinc finger;這些結構特徵與其可能參與轉錄調控的描述並列於資料中,但來源沒有提供實驗細節或明確的結構—功能因果證據。因此,不能僅由這些註解推定其 DNA 結合特異性、調控所需的分子夥伴,或其在特定細胞與生物過程中的作用。

目前可支持的功能結論限於「可能參與轉錄調控」。來源未交代此作用發生的條件、涉及的細胞系統或調控結果,也未提供其他生物學功能的說明;相關細節應維持未定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44305025 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF235 ENST00000291182 GRCh38 chr19:44304925-44306025 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACCCCTAGACACTGCCGTGGGGTTGGAGCCCTACAACCTGCCCGTGTGCATGCTCCCCTAGAGGTTTGA
GCGGCTGGGCACGAAGAAGCGAGCCACACCCCATCACATGCCCTGGGAGAGGGAGAAGTGAACTTTTCCC
GTTTCATCACAATTTACTTTCGGCACTAACATGATTGTTCAGCTGTCTTCATCAGCAGGCCTTTATTCCA
GGAGATTCCTGCCCAAGCAAACTGTTTAATTGTTCATTATGGGAACTTCCACAGAGACCCATCAAATTTT
CAATCTCTTCCAAAGAAAGTGTCAATAGATTGCAATTTAAGATTCTTTGCTTCAAAAATCCTTGCTATAT
CCACCAATCCTGGACTGTAGTATCATGATCATTATGCAATACTAATAAAATCCCTTGCATTGAAAGACCC
GCCTTAAACATCCAGTTCTCAATCAGTTCCAACCTTGCCTTGACACTTTGCTCTGTGAAGGTGCCAACGC
TCCGTCGAAGTGTTGTTCTCCATTACTGCAATCAACAATAAATTCTGTTTTTTGTCTTATCAACAGGTTG
AGTTGATGATATTTGGGGAGCCGGCATTTGACACAAGTTTGAGATCTGGTGTTCCTTAACGTTCAGCGTC
CATCGGAGCTCAGCCTAAGTCACTTTTACGCTTCCCATTTTAGCCTACCCTCTGCTTCTGCGAAAAATTT
TGGTTTCTAACTTATTTTAATAATACAAGCTGCACTTTTCATTTTTATATGTCATCACTTTAAAAATTTT
ACAATTATTTTCTCATGAGCTTTTAAAAATGAATAAAACAAAAACGAATCTCACAGTAGTAGCACCAGAG
AAGTGGCTCAAACCCAACCGGCTTGAGTCAAAACAAAGCCCAGCTGGTGGGAAGCGCTGCCCTTGGAGCA
TTCTGGGAACTGTAGTCCAGGAGTGAGAGAACTCTGAGACGCTTCCGCTTAGGAATTCTGGGAAGTGGAG
TCCACGAACCGTGGGCACTCGGAGGCACTTCCGCTCCAGGAAGGCGAGGTCGGATCTGAGATATCTCCCA
GGGAGGTGAGTCAGCTCCGGGTCTCCAAGACTTCTCCGAGCCCTCTTTGCC
ZNF235 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF235_1 ↗19:44,305,025負股44,305,015–44,305,074

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BBRDR · enhancer · 44303991–44305008 · regulatory

ENSR19_BBRDW · promoter · 44305009–44305528 · regulatory

· motif · 44304798–44304811 · motif

· motif · 44305009–44305020 · motif

· motif · 44305011–44305020 · motif

· motif · 44305065–44305076 · motif

· motif · 44305538–44305560 · motif

· motif · 44305538–44305560 · motif

· motif · 44305636–44305645 · motif

· motif · 44309537–44309548 · motif

· motif · 44309642–44309653 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:738 aa

1 aa738 aa結構域鋅指
依 Q14590 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF235 長 738 個胺基酸。蛋白質 N 端第 8–79 位註記有 KRAB domain;第 263–285 位為退化型 C2H2-type zinc finger,其後另有 15 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 319–733 位。蛋白質家族註解為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。

結構域KRAB8–79 aa
鋅指C2H2-type 1; degenerate263–285 aa
鋅指C2H2-type 2319–341 aa
鋅指C2H2-type 3347–369 aa
鋅指C2H2-type 4375–397 aa
鋅指C2H2-type 5403–425 aa
鋅指C2H2-type 6431–453 aa
鋅指C2H2-type 7459–481 aa
鋅指C2H2-type 8487–509 aa
鋅指C2H2-type 9515–537 aa
鋅指C2H2-type 10543–565 aa
鋅指C2H2-type 11571–593 aa
鋅指C2H2-type 12599–621 aa
鋅指C2H2-type 13627–649 aa
鋅指C2H2-type 14655–677 aa
鋅指C2H2-type 15683–705 aa
鋅指C2H2-type 16711–733 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q14590…

AlphaFold · Q14590

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF235 的定位註解為細胞核;資料未提供定位隨條件改變或異構型差異的描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HZF6ZNF235
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF235 可能參與轉錄調控;現有描述未指出具體調控標的、作用方式或轉錄變化方向,因此其調控機制與結果仍未明。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF235 的定位註解為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000291182 · 3,190 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAGGCACTTCCGCTCCAGGAAGGCGAGGTCGGATCTGAG40
41ATATCTCCCAGGGAGGTTCACTTCCCCGGAACTCTGCCTT80
81TTCCCAGAAGGAGGAGGGGAAAAATGACCAAGTTCCAGGA120
121GGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGCCTTCACTGAG160
161GAGGAGCTGGGGCTGCTGGACTCTGCCCAGAGGAAGCTGT200
201ACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTTAGGAACCTGGTTTC240
241AGTGGGACATCAGTCCTTCAAACCAGATATGATATCCCAG280
281TTGGAGAGGGAAGAAAAGCTTTGGATGAAGGAGCTTCAAA320
321CCCAAAGAGGTAAGCATTCAGGAGACAGGAATCAAAATGA360
361GATGGCAACTCTTCACAAAGCAGGATTAAGGTGCTTTTCA400
401CTGGGAGAGCTTTCATGCTGGCAAATCAAGAGACACATTG440
441CGAGCAAATTAGCCAGAAGTCAAGACTCCATGATAAATAT480
481TGAAGGAAAGAGCTCTCAGTTCCCCAAGCACCATGATTCC520
521CCCTGTCAAGTGGGAGCAGGAGAATCTATTCAAGCTTCTG560
561TGGATGACAACTGTCTAGTGAATCACATAGGGGATCATTC600
601CAGTATCATTGAAAATCAAGAATTTCCAACTGGGAAAGTT640
641CCGAATTCTTGGAGTAAAATATATCTGAATGAGACACAGA680
681ATTATCAGAGAAGTTGTAAGCAGACTCAGATGAAAAACAA720
721ACTATGTATATTTGCTCCATATGTTGACATTTTCAGTTGT760
761ATTTCACACCACCATGATGATAATATAGTGCACAAAAGAG800
801ATAAAGTTCATAGCAATAGTGATTGTGGTAAAGATACCCT840
841AAAGGTATCACCTCTTACCCAGCGTAGTATTCACACAGGA880
881CAGAAAACCTACCAGGGTAATGAATGTGAAGAAGCCTTCA920
921ATGATAGCTCCAGTCTTGAACTTCATAAACAGGTACACTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。