演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF232ZSCAN11

zinc finger protein 232

ZNF232(zinc finger protein 232)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控,並定位於細胞核。

Homo sapiens17p13.2UniProt Q9UNY5
OFFICIAL SYMBOL
ZNF232
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9UNY5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF232(zinc finger protein 232)是位於人類第 17 號染色體 17p13.2 的蛋白質編碼基因。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 444 個胺基酸,具有 SCAN box 與多個 C2H2-type zinc finger 結構。現有資料將它與轉錄調控可能具有的關聯列為待確認的功能描述;細胞定位資料則指出蛋白質位於細胞核。

Official symbol
ZNF232
Gene name
zinc finger protein 232
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13026
UniProt
Q9UNY5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZSCAN11

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717p13.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegZNF232pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:5,105,269–5,123,162
Gene span
17,894 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000250076 ★5,105,736–5,111,8784
ENST000006965355,105,269–5,111,8914
ENST000006965365,105,269–5,111,8524
ENST000008951225,105,269–5,111,8914
ENST000009169145,105,269–5,111,8914
ENST000009830445,105,269–5,111,8913
ENST000010897485,105,269–5,111,8913
ENST000010915335,105,269–5,111,8912
ENST000011430875,105,269–5,111,8914
ENST000005758985,105,541–5,111,8914
ENST000008951215,105,541–5,111,8914
ENST000008951245,105,541–5,111,8914

顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF232 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其產物可能與調節轉錄有關,但來源未進一步說明它促進或抑制哪些基因的轉錄,也沒有交代其作用對象、分子機制或調控結果。因此,現有證據僅支持將轉錄調控列為可能參與的功能,不能據此判定具體調控方向或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 5111878 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF232 ENST00000250076 GRCh38 chr17:5111778-5112878 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAAACGATTCTCCTGCCTCCTGAGTAGTGGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCTAACCTTTTT
GTATTTTTAATAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCACCATGTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAATCG
GCCGGGCGCCTGTAAACCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC
CATCCTGGCTAATATGGTGAAACGCCGTGTCTCCTACCAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGG
GCGCCTCTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGC
AGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAATAAATAAA
TAAAATAAAAAATAACAACAACAAAAAAACACCAACCCCTATTTCCCCCATCGCAATAAAATTAACCTTA
GAATTCTTTTTTCTCCTCCCCTCCCCCTACGCCCCAGGAATTGTACAGGCTAGTGGTTGGGGAATATTTT
TTCGTGGAAGGGACCGTCTTCCTTAGCTGTGGCCCTCTCATCAGGTCTGGGAAGAGGTAATTGGAAAATA
GAACTCATGGAGAAGTGTTACCACAGGCCATGGACAAGGCCAGAATTTCCCTGACATCTGTCCGCCAGCA
CCGCCCTTCAGGTACAATTCCACAAGAGACCCCCCAAACTTGATGAAGTCACCCGCTTACAAGGGCTCAC
TCTCCACCTGCGCAAGGACTGCAATTCCCAGGGGCCTCCAGGGCACCCGGCCGCTCCAGTCCAGTCGTGC
AGGCGGCGCGCTCTTTCTCGCTCCGCTCAAGTCCAGGAACCGGTTCCCGGGCTCCCAGCCTCTCGGCAGC
GCCCACGCGCCTGGGCCAAAGTCCGCGAACGGAAGCCGGCGGCGAGGAGGATTCTGGGAGTTGGAGGCCG
AGGCTGCGACCTGCGCAGGCGCAAACCTGCCCCTGGGGTGAGGGCTGTAAGTGGCGCGATTCGCGGCAGC
GCCCCGATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGGTGAGTGTTGGCGGCGGCTTCC
ZNF232 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF232_1 ↗17:5,111,876負股5,111,866–5,111,925
ZNF232_2 ↗17:5,123,116負股5,123,106–5,123,165

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_B32DH · enhancer · 5110875–5111830 · regulatory

ENSR17_537GDW · CTCF_binding_site · 5111181–5111202 · regulatory

ENSR17_863K9 · promoter · 5111831–5111962 · regulatory

ENSR17_B32DM · enhancer · 5111963–5112825 · regulatory

ENSR17_B32F7 · enhancer · 5116085–5116725 · regulatory

· motif · 5111001–5111014 · motif

· motif · 5111183–5111199 · motif

· motif · 5111395–5111417 · motif

· motif · 5111395–5111417 · motif

· motif · 5111617–5111626 · motif

· motif · 5111617–5111626 · motif

· motif · 5111876–5111887 · motif

· motif · 5111876–5111887 · motif

· motif · 5111942–5111957 · motif

· motif · 5111943–5111957 · motif

· motif · 5111958–5111971 · motif

· motif · 5112072–5112085 · motif

· motif · 5112072–5112085 · motif

· motif · 5112125–5112138 · motif

· motif · 5112125–5112138 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:444 aa

1 aa444 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9UNY5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF232 蛋白質長 444 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列包含位於第 79–161 個胺基酸的 SCAN box,以及第 303–325、331–353、359–381、387–409 與 415–437 個胺基酸的五個 C2H2-type zinc finger。第 161–188 個胺基酸區段另標註為無序區。

結構域SCAN box79–161 aa
鋅指C2H2-type 1303–325 aa
鋅指C2H2-type 2331–353 aa
鋅指C2H2-type 3359–381 aa
鋅指C2H2-type 4387–409 aa
鋅指C2H2-type 5415–437 aa
功能區域Disordered161–188 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UNY5…

AlphaFold · Q9UNY5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF232 的定位資料將其列於細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 24 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZSCAN11ZNF232ATXN10ELAVL4EMDFOSFXR2GFAPGRB2GRIA1HSF1HTRA2JPH3MTUS2NDUFV2NOS3PKN1PMP22PPCDCPRPHRAB11ASRCUQCRC1VBP1ZNF24ZNF446
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF232 可能參與轉錄調控;現有描述未說明其調控方向、作用標的或具體機制,因此此功能仍應視為可能性。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF232 的定位資料指出其位於細胞核;該資料未提供其他定位條件或動態資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000250076 · 1,479 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAAACCTGCCCCTGGGGTGAGGGCTGTAAGTGGCGCGAT40
41TCGCGGCAGCGCCCCGATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGG80
81GGGCCCTTGCAAGATTCCAGCTGGTATGAGCCTTCTGCAG120
121AGCTAGTGCAGACTAGGATGGCTGTATCACTAACAGCAGC160
161TGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAG200
201ATGATGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTG240
241AGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCA280
281AGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAG320
321GAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGAG360
361TACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAA400
401GGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACAATTCTTG440
441ACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGAC480
481ATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTGTGACTGTGCTGGA520
521GGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCA560
561GGCCCTGCACATGGACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGA600
601AGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCAT640
641CCAGCTCCAGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGT680
681GAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAG720
721ATGGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACC760
761ACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAA800
801CTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGG840
841GTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGAGAG880
881ACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAG920
921ATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAGGGAAGAAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。