基因總覽
ZNF232(zinc finger protein 232)是位於人類第 17 號染色體 17p13.2 的蛋白質編碼基因。其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,長 444 個胺基酸,具有 SCAN box 與多個 C2H2-type zinc finger 結構。現有資料將它與轉錄調控可能具有的關聯列為待確認的功能描述;細胞定位資料則指出蛋白質位於細胞核。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000250076 ★ | 5,105,736–5,111,878 | 4 |
| ENST00000696535 | 5,105,269–5,111,891 | 4 |
| ENST00000696536 | 5,105,269–5,111,852 | 4 |
| ENST00000895122 | 5,105,269–5,111,891 | 4 |
| ENST00000916914 | 5,105,269–5,111,891 | 4 |
| ENST00000983044 | 5,105,269–5,111,891 | 3 |
| ENST00001089748 | 5,105,269–5,111,891 | 3 |
| ENST00001091533 | 5,105,269–5,111,891 | 2 |
| ENST00001143087 | 5,105,269–5,111,891 | 4 |
| ENST00000575898 | 5,105,541–5,111,891 | 4 |
| ENST00000895121 | 5,105,541–5,111,891 | 4 |
| ENST00000895124 | 5,105,541–5,111,891 | 4 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF232 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其產物可能與調節轉錄有關,但來源未進一步說明它促進或抑制哪些基因的轉錄,也沒有交代其作用對象、分子機制或調控結果。因此,現有證據僅支持將轉錄調控列為可能參與的功能,不能據此判定具體調控方向或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF232 ENST00000250076 GRCh38 chr17:5111778-5112878 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAAACGATTCTCCTGCCTCCTGAGTAGTGGGGACTACAGGCGCCCGCCACCACGCCCAGCTAACCTTTTT GTATTTTTAATAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCACCATGTCTCAAAAAAAAAATAAAAAATAATCG GCCGGGCGCCTGTAAACCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGAC CATCCTGGCTAATATGGTGAAACGCCGTGTCTCCTACCAAAAAAAAAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCGG GCGCCTCTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGC AGTGAGCCAAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAATAAATAAA TAAAATAAAAAATAACAACAACAAAAAAACACCAACCCCTATTTCCCCCATCGCAATAAAATTAACCTTA GAATTCTTTTTTCTCCTCCCCTCCCCCTACGCCCCAGGAATTGTACAGGCTAGTGGTTGGGGAATATTTT TTCGTGGAAGGGACCGTCTTCCTTAGCTGTGGCCCTCTCATCAGGTCTGGGAAGAGGTAATTGGAAAATA GAACTCATGGAGAAGTGTTACCACAGGCCATGGACAAGGCCAGAATTTCCCTGACATCTGTCCGCCAGCA CCGCCCTTCAGGTACAATTCCACAAGAGACCCCCCAAACTTGATGAAGTCACCCGCTTACAAGGGCTCAC TCTCCACCTGCGCAAGGACTGCAATTCCCAGGGGCCTCCAGGGCACCCGGCCGCTCCAGTCCAGTCGTGC AGGCGGCGCGCTCTTTCTCGCTCCGCTCAAGTCCAGGAACCGGTTCCCGGGCTCCCAGCCTCTCGGCAGC GCCCACGCGCCTGGGCCAAAGTCCGCGAACGGAAGCCGGCGGCGAGGAGGATTCTGGGAGTTGGAGGCCG AGGCTGCGACCTGCGCAGGCGCAAACCTGCCCCTGGGGTGAGGGCTGTAAGTGGCGCGATTCGCGGCAGC GCCCCGATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGGTGAGTGTTGGCGGCGGCTTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF232_1 ↗ | 17:5,111,876 | 負股 | 5,111,866–5,111,925 |
| ZNF232_2 ↗ | 17:5,123,116 | 負股 | 5,123,106–5,123,165 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_B32DH · enhancer · 5110875–5111830 · regulatory
ENSR17_537GDW · CTCF_binding_site · 5111181–5111202 · regulatory
ENSR17_863K9 · promoter · 5111831–5111962 · regulatory
ENSR17_B32DM · enhancer · 5111963–5112825 · regulatory
ENSR17_B32F7 · enhancer · 5116085–5116725 · regulatory
· motif · 5111001–5111014 · motif
· motif · 5111183–5111199 · motif
· motif · 5111395–5111417 · motif
· motif · 5111395–5111417 · motif
· motif · 5111617–5111626 · motif
· motif · 5111617–5111626 · motif
· motif · 5111876–5111887 · motif
· motif · 5111876–5111887 · motif
· motif · 5111942–5111957 · motif
· motif · 5111943–5111957 · motif
· motif · 5111958–5111971 · motif
· motif · 5112072–5112085 · motif
· motif · 5112072–5112085 · motif
· motif · 5112125–5112138 · motif
· motif · 5112125–5112138 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:444 aa
ZNF232 蛋白質長 444 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列包含位於第 79–161 個胺基酸的 SCAN box,以及第 303–325、331–353、359–381、387–409 與 415–437 個胺基酸的五個 C2H2-type zinc finger。第 161–188 個胺基酸區段另標註為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF232 的定位資料將其列於細胞核;來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
- ATXN10Q9UBB4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ELAVL4P26378-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EMDP50402 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FOSP01100 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FXR2P51116 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GFAPP14136 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIA1P42261 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF1Q00613 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTRA2O43464 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTUS2Q5JR59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- NDUFV2P19404 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOS3P29474 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PKN1Q16512 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PMP22A0A6Q8PF08 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPCDCQ96CD2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PRPHP41219 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAB11AP62491 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRCP12931 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UQCRC1P31930 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VBP1P61758 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF24P17028 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZNF446Q9NWS9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCAAACCTGCCCCTGGGGTGAGGGCTGTAAGTGGCGCGAT40TCGCGGCAGCGCCCCGATGGAACCTCCTGGTCCTGTGAGG80GGGCCCTTGCAAGATTCCAGCTGGTATGAGCCTTCTGCAG120AGCTAGTGCAGACTAGGATGGCTGTATCACTAACAGCAGC160TGAAACTCTGGCCCTTCAGGGTACACAGGGACAAGAGAAG200ATGATGATGATGGGACCAAAGGAAGAGGAACAGTCTTGTG240AGTATGAGACCAGGCTACCTGGGAACCACTCTACCAGTCA280AGAGATCTTCCGCCAACGCTTCAGGCATCTCCGCTACCAG320GAGACTCCTGGTCCCCGGGAGGCCTTGAGCCAACTACGAG360TACTCTGCTGTGAGTGGCTGAGGCCAGAGAAACACACGAA400GGAGCAGATCCTGGAGTTCCTGGTGCTGGAACAATTCTTG440ACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAATCCTGGGTGCGGGGAC480ATCACCCTAAGAGTGGAGAGGAGGCTGTGACTGTGCTGGA520GGATTTAGAGAAAGGACTTGAACCAGAGCCGCAGGTCCCA560GGCCCTGCACATGGACCTGCACAGGAAGAGCCATGGGAGA600AGAAGGAATCTCTGGGAGCAGCCCAGGAAGCACTGAGCAT640CCAGCTCCAGCCTAAGGAGACCCAGCCTTTCCCAAAGAGT680GAACAGGTATATTTACATTTTCTGTCAGTTGTTACAGAAG720ATGGCCCAGAGCCCAAGGACAAAGGATCATTGCCACAACC760ACCCATTACTGAAGTGGAATCACAGGTGTTCTCAGAAAAA800CTTGCTACTGACACCTCTACATTTGAAGCTACCTCTGAGG840GTACCTTAGAACTGCAGCAGAGAAATCCCAAAGCGGAGAG880ACTGAGGTGGTCCCCTGCCCAGGAGGAAAGTTTCAGGCAG920ATGGTTGTCATCCATAAGGAAATTCCCACAGGGAAGAAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。