演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF230FDZF2

zinc finger protein 230

ZNF230(zinc finger protein 230)是 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族的蛋白質,可能參與轉錄調控;其序列含 KRAB、KRNB 區域及多個 C2H2-type zinc finger。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q9UIE0
OFFICIAL SYMBOL
ZNF230
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9UIE0
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF230(zinc finger protein 230)是蛋白質編碼基因,產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 474 個胺基酸,具有 KRAB 與 KRNB 區域,並包含十個 C2H2-type zinc finger,其中第十個被註記為 atypical。這些序列特徵構成其主要結構辨識資訊;目前可用資料僅指出它可能參與轉錄調控,未提供更細緻的分子作用方式或下游效應說明。

Official symbol
ZNF230
Gene name
zinc finger protein 230
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13024
UniProt
Q9UIE0
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FDZF2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF230pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:44,002,934–44,013,924
Gene span
10,991 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000429154 ★44,002,957–44,013,9245
ENST0000089353244,002,934–44,013,9245
ENST0000058563244,002,940–44,009,3224
ENST0000091976044,002,940–44,013,9245
ENST0000113502144,002,940–44,013,9245
ENST0000091976144,002,955–44,013,9245
ENST0000058549144,006,700–44,009,1623

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF230 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述具有推測性,表示其可能與基因轉錄活動的調節有關,但現有資訊沒有說明調控的方向、目標基因或發生條件,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。

目前資料也未交代 ZNF230 如何參與轉錄調控,例如是否直接辨識特定 DNA 序列、是否透過其他分子介導作用,或其 KRAB、KRNB 與 C2H2-type zinc finger 區域各自的功能分工。因而,這些結構註解可用來描述蛋白質特徵,不能單獨視為已證實的調控機制。

因此,現階段能支持的功能性結論限於 ZNF230 可能涉及轉錄調節;其具體作用對象、分子步驟及生物學結果,來源未有進一步說明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44002957 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF230 ENST00000429154 GRCh38 chr19:44001957-44003057 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGAGACGAAGTCTCCCTGTATTTCCCTGTCTGGTCTCCAATTCCTGAGCTCAAGGGAACGTCCTGCCCTG
GCCTCCCAAAGGGTTGGCATTACAGGTTTGAGCCACTGCGCTTGGCCAGGAAGAAAACTCTTTATAAGAC
ATGCTCCTTCACCTATAGAATCCTCCCGTTTTACTGCATTTACAATCTCAATGTAAGATTGATACCAATG
CCTAGCTCTTCATCAGTCATTATTGCTCTGAGGTACTGAGCAATTCACTACATTCGCTGAAATTTGATGT
TTCTACATCTAAGGAGAAATATGAATACCATGAAAAGTTTATGGGAAGATAGCTATTCCATGACGACACC
GCTTCTCCACTAGTAGCTGTGATCTTAAATGGGGGTGGCTTTTCCTGCCAAACCAGTGGTCCCACAGCTT
CTGGAGTAGGGGCTGGTGTCTTCCTGCTCCTCATTGCCCCTGCCAAACCATTCCACCTGGCTCATCCTTT
AAACCGTTAGTTTTAACCTCCCATCGTCAGATTATCCTAATCCTTGAAGATTTTATCTCCTCGTTTGTTC
TCTTCCCAATAACACTCCTGTCATCGTGGGAGGCGTTTAGACTTCAGGAATTCCTGTCTATACACTATTT
TCGCTCAAAGACTCAGGAAGAGAGACGGACGACTCACAGGGTCACAGTCCACATTCCCCACCAGGCGCTC
AGAGATATGGAATACGTTCCCGGTGGGCACTGCGGTGTGTGTAGTCAAGGACCACCGCGGAGTCCAACGC
TTCCCGCTGAAGAGTGAGATTATAGACATTTTCCTTTGGCATTGGAGGAAGCGGAGTCCAGACACACTCT
GAGTCGCGGGCAAGTTGGCTCAGGCGGGTGGACGAGTGAATTCTGGGAACTGTAGTCCATCAACTTCATG
GAATGGCGGACCCTTTGGCTCAAGCAGTTGAACCGGGGAATTCTGGGAAGTGGAGTCCAGACGCTCTGTG
GAGACGCGAGCACTTCCGGTGTGTGAGCCTGCGGTTGCTACATAACCGCGTAGTTTGAGCCATTTCTGCG
TCTGGCGGGTCCTTCTGAACTTGTCACCTTCGCTTGGGGTCGCAACGACCC
ZNF230 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF230_1 ↗19:44,002,957正股44,002,908–44,002,967

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_839X2T · enhancer · 43997995–43998200 · regulatory

ENSR19_BBPR4 · enhancer · 44002201–44002774 · regulatory

ENSR19_839X5M · promoter · 44002775–44002988 · regulatory

ENSR19_C6CW5 · enhancer · 44002989–44004048 · regulatory

ENSR19_5DCG4R · CTCF_binding_site · 44003032–44003053 · regulatory

ENSR19_839X7J · enhancer · 44006092–44006267 · regulatory

· motif · 43997971–43997982 · motif

· motif · 44002294–44002307 · motif

· motif · 44002294–44002307 · motif

· motif · 44002624–44002637 · motif

· motif · 44002624–44002639 · motif

· motif · 44002677–44002694 · motif

· motif · 44002686–44002703 · motif

· motif · 44002867–44002877 · motif

· motif · 44002942–44002964 · motif

· motif · 44002942–44002964 · motif

· motif · 44002947–44002956 · motif

· motif · 44002947–44002958 · motif

· motif · 44002947–44002958 · motif

· motif · 44002965–44002973 · motif

· motif · 44003021–44003036 · motif

· motif · 44003034–44003050 · motif

· motif · 44003136–44003147 · motif

· motif · 44003232–44003247 · motif

· motif · 44003234–44003247 · motif

· motif · 44003240–44003247 · motif

· motif · 44003309–44003318 · motif

· motif · 44003335–44003350 · motif

· motif · 44003472–44003479 · motif

· motif · 44003561–44003576 · motif

· motif · 44003566–44003578 · motif

· motif · 44003569–44003576 · motif

· motif · 44003659–44003671 · motif

· motif · 44006149–44006158 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:474 aa

1 aa474 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9UIE0 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF230 蛋白質長 474 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 區域(第 8–76 位),其後有 KRNB 區域(第 80–167 位)。序列另含十個 C2H2-type zinc finger,分布於第 168–442 位;其中第十個區域標示為 atypical。

結構域KRAB8–76 aa
鋅指C2H2-type 1168–190 aa
鋅指C2H2-type 2196–218 aa
鋅指C2H2-type 3224–246 aa
鋅指C2H2-type 4252–274 aa
鋅指C2H2-type 5280–302 aa
鋅指C2H2-type 6308–330 aa
鋅指C2H2-type 7336–358 aa
鋅指C2H2-type 8364–386 aa
鋅指C2H2-type 9392–414 aa
鋅指C2H2-type 10; atypical420–442 aa
功能區域KRNB80–167 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UIE0…

AlphaFold · Q9UIE0

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF230 的定位資料指向細胞核;來源未提供條件差異、異構型差異或定位變化的描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FDZF2ZNF230CCDC125CCDC136CCNDBP1FSD2GOLGA6L9KRT40MDFIMTUS2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF230 可能參與轉錄調控;此描述保留可能性的限定,未進一步指定其調控方向、目標或作用條件。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF230 的定位註記為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000429154 · 4,104 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTGTGAGCCTGCGGTTGCTACATAACCGCGTAGTTTGAGC40
41CATTTCTGCGTCTGGCGGGTCCTTCTGAACTTGTCACCTT80
81CGCTTGGGGTCGCAACGACCCGATGATCGATGATCCAAGC120
121AAGGGAAAAGAAGCCTTGGCGGAGAGCGGAGGCACAATTC160
161CACCTTCCTTTGTGCTCCATTACTCAAGACACTGAAGACT200
201CCAAAAAGTAGTAGGAAAAATGACCACATTCAAGGAGGCA240
241GTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGG280
281AACTGGGGCTACTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCA320
321AGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTG360
361GGGCATCAACCATTCCACCCTTTCCACTTCCTAAGGGAAG400
401AAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGAGAAGG440
441AAATTCAGGCGGCAAGACTATTGCGGAAGCAGGACCACAT480
481GAAGACTGCCCTTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAA520
521GTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTC560
561TCACTTCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAG600
601GCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCAC640
641AGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCAT680
681CTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGAGAAGTCT720
721CATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCT760
761CAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTCACTTGAGAGAGAA800
801ACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAG840
841AGCTCATGTCTGCAAACTCGTGAGAGAGTCCACACTGGAG880
881AGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAG920
921ATGTAGAGCGATACTTCAAGTTCACTGCAAATTACACACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。