演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF227

zinc finger protein 227

ZNF227(zinc finger protein 227)是含 KRAB 結構域與多個 C2H2 型鋅指的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q86WZ6
OFFICIAL SYMBOL
ZNF227
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q86WZ6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF227 的正式名稱為 zinc finger protein 227,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質長 799 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及分布於後段的 19 個 C2H2 型鋅指。現有功能註解指出,它可能參與轉錄調控;此描述提示其與基因表現調節相關,但未提供更具體的作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF227
Gene name
zinc finger protein 227
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13020
UniProt
Q86WZ6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF227pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:44,207,475–44,238,179
Gene span
30,705 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000313040 ★44,212,532–44,237,2686
ENST0000087687244,207,475–44,238,1796
ENST0000096699244,207,475–44,238,1795
ENST0000062108344,212,523–44,238,1796
ENST0000058622844,212,523–44,238,1796
ENST0000087687344,212,523–44,238,1795
ENST0000087687444,212,523–44,238,1796
ENST0000087687544,212,523–44,238,1795
ENST0000087687644,212,523–44,238,1796
ENST0000096699444,212,523–44,238,1796
ENST0000099998144,212,523–44,238,1796
ENST0000099998244,212,523–44,238,1796

顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF227 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述以可能性表述其角色,表示目前資料支持將它視為與轉錄調節相關的蛋白質,但未明確指出它會促進或抑制轉錄,也未交代受調控的基因或其他作用對象。

現有資料沒有提供 ZNF227 如何影響轉錄的分子機制、所涉及的細胞過程,或該作用在生物學上的具體後果。因此,對其功能的說明應限於「可能參與轉錄調控」,不宜進一步推定其作用方向、調控路徑或生理意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44212532 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF227 ENST00000313040 GRCh38 chr19:44211532-44212632 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCAAATTCAGAAACTCCTTGAGGAATGATTACAGAGGCCCTAGTTGCTTTGTGGAGTTGATCTACCATA
TGCCAAAGCTTGTGTTTTCTATGTCTAGCTATCCTCAGTAAGCAAGTTGTTCTGAATTATATGACTGTGC
TATTAAGAAAAGTGGAAATCCATAATATATTCTGCCTTCGTTGCATTTTTTGATTGCTCTTTCATTCTTT
TAGTATCTAAAGAGTAGTTTTTCTATTAGTCGATCCTGTTAAATGTAAAAACTTAAAGGGTTTCCTCTGC
CCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAGTGGTGGGTATAATTCTATTAGTACAGGATCACGTGATCTGTTTCTT
ATAATAGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA
GTGGCACGATCTTGGCTCACTGCACCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTTATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC
TGGGACTACAGGCGCGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGCTTCATCAT
ATTGGCCAAGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGT
CTTTTTTTATTTTAGGGCTCCAATTCTTCACATATTTGCTGTTACTTTTTGTTAATAAGAAAAACCTAAA
TTCCACTGACATCAGAGAACTGCTTCAGCCTGGCTAAACAGCAATAAGCCGTGAAGAGGATTCTGGATGT
TGTAGTCCGGGAGCTCCGAGAATTTTGTCACACTCTCCGTAACCCTCTCTCACTCGCTCGCTCCGTTTTT
TTTTTTGTTTTTTTTTTTTTCAAGCGCGAAGAGGGCGGCACCTGGATGGTTTTTCCTTCTGGAAGTTCTG
GGAAACGTATTCCAGAACTCTGTCCGGAAACAATTGGGCCGCAGGAGCGCGGGCCTTCTGGGAAGGGTAG
TTCAGGAGCTCTGGGCAGGCAGAGCCACTTCCGCCCCGGAAAGCGAGGCCGCCACCATCTTTTGGGTCCG
GGAGGTGAGTCAGCCCTGCACCCCCACGACCCCTCTTGAACCTTTTCAGCC
ZNF227 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF227_2 ↗19:44,207,547正股44,207,498–44,207,557
ZNF227_1 ↗19:44,212,538正股44,212,489–44,212,548

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BBQTR · enhancer · 44207130–44208136 · regulatory

ENSR19_BBQWG · promoter · 44212065–44212585 · regulatory

ENSR19_BBQWJ · enhancer · 44212586–44213358 · regulatory

· motif · 44207779–44207795 · motif

· motif · 44212325–44212337 · motif

· motif · 44212537–44212546 · motif

· motif · 44212537–44212548 · motif

· motif · 44213991–44214003 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:799 aa

1 aa799 aa結構域鋅指
依 Q86WZ6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF227 蛋白質長 799 個胺基酸,含有位於第 23–94 位的 KRAB 結構域,以及 19 個 C2H2-type zinc finger。鋅指區段分布於第 250–794 位;各結構域位置依序排列,部分相鄰區段有重疊。

結構域KRAB23–94 aa
鋅指C2H2-type 1250–272 aa
鋅指C2H2-type 2269–291 aa
鋅指C2H2-type 3324–346 aa
鋅指C2H2-type 4352–374 aa
鋅指C2H2-type 5380–402 aa
鋅指C2H2-type 6408–430 aa
鋅指C2H2-type 7436–458 aa
鋅指C2H2-type 8464–486 aa
鋅指C2H2-type 9492–514 aa
鋅指C2H2-type 10520–542 aa
鋅指C2H2-type 11548–570 aa
鋅指C2H2-type 12576–598 aa
鋅指C2H2-type 13604–626 aa
鋅指C2H2-type 14632–654 aa
鋅指C2H2-type 15660–682 aa
鋅指C2H2-type 16688–710 aa
鋅指C2H2-type 17716–738 aa
鋅指C2H2-type 18744–766 aa
鋅指C2H2-type 19772–794 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q86WZ6…

AlphaFold · Q86WZ6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF227 的定位註解為細胞核,資料未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或其他動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF227ZNF227CEP70
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF227 可能參與轉錄調控;此註解以可能性描述其功能,未指出調控方向、具體作用對象或分子機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF227 的定位註解為細胞核;此資訊指出其細胞內位置,但未提供定位變化條件或其他定位相關細節。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000313040 · 3,049 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCCACTTCCGCCCCGGAAAGCGAGGCCGCCACCATCT40
41TTTGGGTCCGGGAGGATTGAGTCATCGGGCTCCAATGCGT80
81GGGGATGTTTACCGCCGTTTATCCGGGATAGAGACTCCAT120
121CGTGCTGACAGCATCCTTTTATTCACCGCCTCCGAATTTG160
161CAAAGAGGAGGAAGGAGGGACTTCTTGGCTTCTCCCAGCA200
201TAGCCCCAGTTATGCCATCTCAGAACTATGACCTTCCCCA240
241GAAGAAGCAGGAGAAAATGACCAAGTTTCAGGAGGCTGTG280
281ACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCTCCAGGGAGGAAC320
321TGCGACTGCTCGATCTTACCCAGAGGAAGCTGTACCGAGA360
361TGTCATGGTGGAGAACTTCAAGAACCTGGTTGCAGTGGGG400
401CATCTTCCCTTCCAACCAGATATGGTATCCCAATTGGAAG440
441CAGAAGAAAAGCTTTGGATGATGGAAACAGAAACCCAAAG480
481AAGCAGCAAGCATCAAAATAAGATGGAAACACTCCAAAAA520
521TTTGCATTAAAATACCTTTCAAATCAAGAGCTGTCCTGCT560
561GGCAAATCTGGAAACAGGTTGCAAGTGAATTAACCAGGTG600
601TCTTCAGGGGAAGAGTTCCCAGTTATTACAAGGTGACTCT640
641ATTCAGGTTTCTGAAAATGAGAACAATATAATGAACCCTA680
681AAGGAGATAGCTCTATTTATATTGAAAATCAAGAGTTTCC720
721ATTTTGGAGAACCCAGCATTCTTGCGGGAATACATATCTG760
761AGTGAGTCACAGATTCAGAGTAGAGGTAAGCAAATTGATG800
801TGAAAAATAACCTGCAAATACATGAAGACTTCATGAAGAA840
841ATCACCATTTCATGAGCATATTAAAACTGACACAGAACCA880
881AAACCCTGCAAAGGTAATGAATATGGCAAAATCATTAGTG920
921ATGGCTCCAATCAGAAATTACCCTTAGGAGAGAAACCCCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。