基因總覽
ZNF227 的正式名稱為 zinc finger protein 227,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質長 799 個胺基酸,具有位於 N 端的 KRAB 結構域,以及分布於後段的 19 個 C2H2 型鋅指。現有功能註解指出,它可能參與轉錄調控;此描述提示其與基因表現調節相關,但未提供更具體的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000313040 ★ | 44,212,532–44,237,268 | 6 |
| ENST00000876872 | 44,207,475–44,238,179 | 6 |
| ENST00000966992 | 44,207,475–44,238,179 | 5 |
| ENST00000621083 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000586228 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000876873 | 44,212,523–44,238,179 | 5 |
| ENST00000876874 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000876875 | 44,212,523–44,238,179 | 5 |
| ENST00000876876 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000966994 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000999981 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
| ENST00000999982 | 44,212,523–44,238,179 | 6 |
顯示 12/33 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF227 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述以可能性表述其角色,表示目前資料支持將它視為與轉錄調節相關的蛋白質,但未明確指出它會促進或抑制轉錄,也未交代受調控的基因或其他作用對象。
現有資料沒有提供 ZNF227 如何影響轉錄的分子機制、所涉及的細胞過程,或該作用在生物學上的具體後果。因此,對其功能的說明應限於「可能參與轉錄調控」,不宜進一步推定其作用方向、調控路徑或生理意義。
Promoter 與基因調控
>ZNF227 ENST00000313040 GRCh38 chr19:44211532-44212632 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCAAATTCAGAAACTCCTTGAGGAATGATTACAGAGGCCCTAGTTGCTTTGTGGAGTTGATCTACCATA TGCCAAAGCTTGTGTTTTCTATGTCTAGCTATCCTCAGTAAGCAAGTTGTTCTGAATTATATGACTGTGC TATTAAGAAAAGTGGAAATCCATAATATATTCTGCCTTCGTTGCATTTTTTGATTGCTCTTTCATTCTTT TAGTATCTAAAGAGTAGTTTTTCTATTAGTCGATCCTGTTAAATGTAAAAACTTAAAGGGTTTCCTCTGC CCTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAAGTGGTGGGTATAATTCTATTAGTACAGGATCACGTGATCTGTTTCTT ATAATAGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCA GTGGCACGATCTTGGCTCACTGCACCCTCCAGGGTTCAAGCGATTCTTATGCCTCAGCCTCCCAAGTAGC TGGGACTACAGGCGCGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTATATTTTTAGTAGAGACGGGGCTTCATCAT ATTGGCCAAGCTGGTCTGGAACTCCTGACCTCGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAGT CTTTTTTTATTTTAGGGCTCCAATTCTTCACATATTTGCTGTTACTTTTTGTTAATAAGAAAAACCTAAA TTCCACTGACATCAGAGAACTGCTTCAGCCTGGCTAAACAGCAATAAGCCGTGAAGAGGATTCTGGATGT TGTAGTCCGGGAGCTCCGAGAATTTTGTCACACTCTCCGTAACCCTCTCTCACTCGCTCGCTCCGTTTTT TTTTTTGTTTTTTTTTTTTTCAAGCGCGAAGAGGGCGGCACCTGGATGGTTTTTCCTTCTGGAAGTTCTG GGAAACGTATTCCAGAACTCTGTCCGGAAACAATTGGGCCGCAGGAGCGCGGGCCTTCTGGGAAGGGTAG TTCAGGAGCTCTGGGCAGGCAGAGCCACTTCCGCCCCGGAAAGCGAGGCCGCCACCATCTTTTGGGTCCG GGAGGTGAGTCAGCCCTGCACCCCCACGACCCCTCTTGAACCTTTTCAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF227_2 ↗ | 19:44,207,547 | 正股 | 44,207,498–44,207,557 |
| ZNF227_1 ↗ | 19:44,212,538 | 正股 | 44,212,489–44,212,548 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BBQTR · enhancer · 44207130–44208136 · regulatory
ENSR19_BBQWG · promoter · 44212065–44212585 · regulatory
ENSR19_BBQWJ · enhancer · 44212586–44213358 · regulatory
· motif · 44207779–44207795 · motif
· motif · 44212325–44212337 · motif
· motif · 44212537–44212546 · motif
· motif · 44212537–44212548 · motif
· motif · 44213991–44214003 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:799 aa
ZNF227 蛋白質長 799 個胺基酸,含有位於第 23–94 位的 KRAB 結構域,以及 19 個 C2H2-type zinc finger。鋅指區段分布於第 250–794 位;各結構域位置依序排列,部分相鄰區段有重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF227 的定位註解為細胞核,資料未提供定位變化的條件、不同異構型之間的差異,或其他動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- CEP70Q8NHQ1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAGCCACTTCCGCCCCGGAAAGCGAGGCCGCCACCATCT40TTTGGGTCCGGGAGGATTGAGTCATCGGGCTCCAATGCGT80GGGGATGTTTACCGCCGTTTATCCGGGATAGAGACTCCAT120CGTGCTGACAGCATCCTTTTATTCACCGCCTCCGAATTTG160CAAAGAGGAGGAAGGAGGGACTTCTTGGCTTCTCCCAGCA200TAGCCCCAGTTATGCCATCTCAGAACTATGACCTTCCCCA240GAAGAAGCAGGAGAAAATGACCAAGTTTCAGGAGGCTGTG280ACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCTCCAGGGAGGAAC320TGCGACTGCTCGATCTTACCCAGAGGAAGCTGTACCGAGA360TGTCATGGTGGAGAACTTCAAGAACCTGGTTGCAGTGGGG400CATCTTCCCTTCCAACCAGATATGGTATCCCAATTGGAAG440CAGAAGAAAAGCTTTGGATGATGGAAACAGAAACCCAAAG480AAGCAGCAAGCATCAAAATAAGATGGAAACACTCCAAAAA520TTTGCATTAAAATACCTTTCAAATCAAGAGCTGTCCTGCT560GGCAAATCTGGAAACAGGTTGCAAGTGAATTAACCAGGTG600TCTTCAGGGGAAGAGTTCCCAGTTATTACAAGGTGACTCT640ATTCAGGTTTCTGAAAATGAGAACAATATAATGAACCCTA680AAGGAGATAGCTCTATTTATATTGAAAATCAAGAGTTTCC720ATTTTGGAGAACCCAGCATTCTTGCGGGAATACATATCTG760AGTGAGTCACAGATTCAGAGTAGAGGTAAGCAAATTGATG800TGAAAAATAACCTGCAAATACATGAAGACTTCATGAAGAA840ATCACCATTTCATGAGCATATTAAAACTGACACAGAACCA880AAACCCTGCAAAGGTAATGAATATGGCAAAATCATTAGTG920ATGGCTCCAATCAGAAATTACCCTTAGGAGAGAAACCCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。