基因總覽
ZNF226(zinc finger protein 226)是人類的蛋白質編碼基因,其產物屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質全長 803 個胺基酸,具有位於序列前段的 KRAB 結構域,以及集中在後半段的多個 C2H2-type zinc finger;其中兩個鋅指被註記為退化型。蛋白質末端另有一段被註記為無序區。這些序列特徵構成其家族與蛋白質結構的基本描述;目前可用資料僅概括指出它可能參與轉錄調控,未提供更具體的調控靶標或作用細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337433 ★ | 44,165,100–44,177,685 | 6 |
| ENST00000589160 | 44,165,069–44,173,191 | 6 |
| ENST00000588883 | 44,165,069–44,178,381 | 5 |
| ENST00000413984 | 44,165,069–44,175,158 | 6 |
| ENST00000300823 | 44,165,069–44,175,429 | 6 |
| ENST00000588795 | 44,165,069–44,173,234 | 5 |
| ENST00000852800 | 44,165,069–44,177,689 | 6 |
| ENST00000852801 | 44,165,069–44,177,689 | 7 |
| ENST00000852802 | 44,165,069–44,177,689 | 5 |
| ENST00000929407 | 44,165,069–44,177,689 | 6 |
| ENST00000966188 | 44,165,069–44,177,689 | 7 |
| ENST00000966189 | 44,165,069–44,177,689 | 6 |
顯示 12/51 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有註解指出,ZNF226 可能參與轉錄調控。這項描述表明其可能與基因轉錄活動的調節有關,但來源沒有說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞情境或具體分子作用方式。因此,不能據此判定其調控方向或明確的生物學效應。
目前資料亦未提供 ZNF226 如何辨識 DNA、是否透過其他分子協助調控,或其參與哪些特定生物學過程。其轉錄調控角色應維持「可能參與」的推論層級,不宜延伸為已確認的作用機制或特定功能結果。
Promoter 與基因調控
>ZNF226 ENST00000337433 GRCh38 chr19:44164100-44165200 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACTACATCTCCCCAGCCTTGGAGACAACTAATTTACTTTCTGTCTCTATGGACTTGCCTATTCTGCACAT TTGATATAAATGGAATCATACCATATATGGTATCTTGTGTCTGGCTTCTTTCATTGGACATAATGTCTTC AGAGTTCATCTATGTTATAACATGAATCAATATTTTGTTCATTCACATTACTAAATAATATTGCATTATA TGGCTAGACCACATTTTGTTTATCCACTCATCAGCTGATGGACATTGGGTCTTCTCCACTTTTTGACTAT TATGACTAATGCTGCTATGAACTTTTTTAGAACAAGTTTTTGTGTGGATATCTTTCAGTTCTCCTGGGTA TTTACTTAGGAGTGAAATTGCTGGCACATAAGCCCCAGATCGGGTGCCAGCAGATTCAGTGTCTGGTGAG GTCCCGCTTTCTAAGTCATACATGGTCCTTCTGGCTGTGTCCTCACATAACTAAAGAGGCAAAGGAGCTC CCTCAGGCCACTTATAAGAGAGCATTAATCCTATTCATGAGGGCATTGCCCTCTTGATCTGATCACGTCC CATAGGTTCCACCTCCTAATATCTTCTTGGGAGTTAGGATTTAAACATACGAATTTGGTGGGGGCCATAA ACACTCAGACCATAATAATACCTAAAGAGAAGTGAGGGATTCTGGGAAATGAAAACCAGGAGCTCAAGGT AGTTGGACACTTCCACATCAGAAGGCTTGGACATTCCGGAAGTGTAGTCCAGGAGGGCGGTACTGTTCTG TTTTTCCCCCAACTCCAGCATTCTGTGATATGTAGTCCGGAGTTCCGTGTAGTCGCGCATAGCTCAGCTG CAGTAAGGCTGTAAATGTTTCCCCTGCGGAATCCTGGGAACTGTAGGTCCAATCGTTCTAGGTAGTTGTA GGCACTTCCGGCTCGAGGAAGGCAGTGCTGTGGAATTCTGGGAAGCGTAGTCCAGGTCCTCCTGATACTC GCAGGCACTTCCGCCCAGGAAGACGACGTAGCAGCCATCTTTTCCCTGGCTTTGGTGATTCAGGTCAGCT TCTCAGGAACCTTTCAAACTTCCCCGAAATGCACTTGTGGTCAGCAGCTAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF226_1 ↗ | 19:44,165,104 | 正股 | 44,165,055–44,165,114 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_BBQMK · enhancer · 44164413–44165027 · regulatory
ENSR19_83B3LH · promoter · 44165028–44165174 · regulatory
ENSR19_BBQMN · enhancer · 44165175–44166057 · regulatory
· motif · 44164187–44164202 · motif
· motif · 44164187–44164202 · motif
· motif · 44164830–44164843 · motif
· motif · 44164832–44164843 · motif
· motif · 44164832–44164843 · motif
· motif · 44164834–44164843 · motif
· motif · 44164871–44164882 · motif
· motif · 44165012–44165021 · motif
· motif · 44165012–44165023 · motif
· motif · 44165012–44165023 · motif
· motif · 44165085–44165094 · motif
· motif · 44165085–44165096 · motif
· motif · 44165184–44165199 · motif
· motif · 44165191–44165206 · motif
· motif · 44165211–44165222 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:803 aa
ZNF226 為 803 個胺基酸的蛋白質,屬 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列第 8–78 位有 KRAB 結構域;第 252–274 位及第 280–302 位的 C2H2-type zinc finger 被註記為退化型,後續則有 17 個 C2H2-type zinc finger。第 781–803 位為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF226 的定位註記為細胞核。 可用資料未提供定位隨條件變化的資訊,也未列出不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGACGACGTAGCAGCCATCTTTTCCCTGGCTTTGGTGATT40CAGCCCTGACTTCTCAAAAAGCACTGCACAGAGGAGGAGG80CAGCAGAACCCCATTTCAGCTTCTTAGGACTCTGCACTTC120CCCAGAAGGAAGAATTAAAAATGAATATGTTCAAGGAAGC160AGTGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGCCTTCACGGAGGAG200GAATTGGGGCTGCTGGGCCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACC240GAGATGTGATGGTGGAGAACTTTAGGAACCTGCTGTCAGT280GGGGCATCCACCCTTCAAACAAGATGTATCACCTATAGAA320AGAAATGAGCAGCTTTGGATAATGACGACAGCAACCCGAA360GACAGGGAAATTTAGGAGAGAAAAATCAAAGTAAGTTAAT400TACTGTTCAAGACAGAGAATCAGAAGAAGAGCTTTCTTGT440TGGCAAATCTGGCAACAAATTGCAAATGACTTAACCAGGT480GTCAAGACTCCATGATCAATAATTCTCAGTGTCACAAACA520AGGTGATTTCCCTTACCAGGTAGGGACAGAACTGTCTATT560CAAATTTCTGAAGATGAGAACTATATAGTAAATAAAGCAG600ATGGTCCCAATAATACTGGGAATCCAGAGTTTCCTATCTT640GAGAACCCAGGATTCTTGGAGGAAAACATTCCTGACTGAG680TCACAGAGATTGAACAGAGATCAGCAAATTTCCATAAAAA720ATAAATTATGTCAATGTAAGAAGGGTGTTGATCCCATCGG760TTGGATTTCACATCATGATGGTCATAGAGTACACAAAAGT800GAAAAATCTTATAGACCCAATGATTATGAAAAAGACAACA840TGAAGATTTTGACATTTGATCACAATAGCATGATTCACAC880AGGACAGAAATCGTACCAGTGTAATGAGTGTAAAAAACCC920TTCAGTGATCTCTCCAGCTTTGATCTTCATCAGCAGTTAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。