演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF224BMZF-2

zinc finger protein 224

ZNF224(zinc finger protein 224)是含 KRAB 與多個 C2H2 型鋅指區域的蛋白質,可能參與轉錄抑制;其與 DEPDC1A 的複合體可能涉及膀胱癌細胞的凋亡調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q9NZL3
OFFICIAL SYMBOL
ZNF224
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9NZL3
PDB / ALPHAFOLD
2ELY
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF224 的正式名稱為 zinc finger protein 224,屬於蛋白質編碼基因,其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質含有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型鋅指區域,具有多區段的鋅指蛋白質架構。來源指出,ZNF224 可能具有轉錄抑制作用;此角色與其作為轉錄調控因子的可能性相符,但來源未提供更完整的基本生化性質或其他角色資訊。

Official symbol
ZNF224
Gene name
zinc finger protein 224
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13017
UniProt
Q9NZL3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BMZF-2KOX22ZNF255ZNF27

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF224pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:44,094,326–44,111,682
Gene span
17,357 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000693561 ★44,094,361–44,109,8266
ENST0000090292844,094,326–44,109,8326
ENST0000068494344,094,346–44,109,8195
ENST0000033697644,094,346–44,109,8866
ENST0000090292944,094,346–44,108,3267
ENST0000095045344,094,346–44,108,3246
ENST0000095045444,094,346–44,108,3217
ENST0000112078544,094,346–44,104,2546
ENST0000112078644,094,346–44,104,2516
ENST0000112832244,094,346–44,111,6824
ENST0000113974444,094,346–44,109,8266
ENST0000058987044,096,046–44,101,1504

顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF224 可能參與轉錄調控,並以轉錄抑制因子的身分發揮作用。現有資料將這項功能表述為可能性,未提供足以進一步界定其一般性轉錄抑制機制的細節。

在膀胱癌相關情境中,DEPDC1A-ZNF224 複合體可能透過抑制 A20 基因的轉錄,促使 NF-KB 蛋白移入細胞核。這一連串作用被描述為可能參與膀胱癌發生,並導致膀胱癌細胞的凋亡受到抑制。來源所述的是可能的作用鏈,不能據此將其視為已確立的普遍機制,也未提供更多可延伸至其他細胞或生物過程的證據。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44094361 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF224 ENST00000693561 GRCh38 chr19:44093361-44094461 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCACTGCACTCCAGCCTGGCACTTTTTTTGAGATTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAGCAGGATGCTA
AGTGAAAGGTGTCAGAAACAAAAGGTTCCATAATGTATAATTCCATTTATATGAAATGTCCACAATAGGT
AATTCAATAGGACAGAGATTAGTGTTAGACAGTGACTGCTTAGTGGGTATGGGGTTTTTGGGGTGATGAA
AATGTTTCCTAACTTTTTATTTGTACTACATATATCCTAAAATGGTGAATTTCACGTTTTGTGCATTACA
CCTCAATAGAGATGTTTTAAATAATAAAATACATTAAAATGTTTTGCATAGATAAAACAATAAAAAAAAA
CGTTTTTGTTGAGAAAATATTTGCGAGATAAAATGTTAATATCATGAATATAAGAACAGTGCTTGAAAAG
TGAGGGATAAAACCAAAAACTCAATAAGAAAGTGGGCAAAACATCTGGACAATTTACAAAAAATGTAATA
ATGACACCTGAAAATATGCAAGAATATGCCATCTTTACAAGAGTTATAAATTAAAACTACATGCCATTTC
TTACCACTGGCAAAACTTATTTGAAGAGTGTATCATCTCGCTTGTTCCCTTTCCAGTAACACTCCTGTCC
TCACTAGAGGGGTTTAGACTTCAGGAATTCCTTTCTATACGGTATTTTCTCTTAGGCACCCAGGGAGAGG
GAAGGACGACTCTCAGGGTAGAAGTCCACATTTCCCAACAGGCGCTCGGGGGTACGAGATTCGTTCCCCG
TGGGAAGAGTGGTCAAGGGCTTCCCAGTAGTCGTCAACACTTCCCTTTGAGTGTAATGCTGCAGGAGTAC
AGTCCAGACCCTCAGTGGAATCGCGGTCGGTTTAGCTCCGGCAGTTGGGTCCCAGGGAATTCTGGGAAGT
GTAGTCCAGACGCTCAGTGGAGTCGCGGTCAGTTTGGCTCCGGCTGGCGGGTCCCGGGGAATTCTGGGAA
GTGGAGTCCAAACATTCGGTGGAGTCGCGGACACTTCCGCTCGGGGACTGAGGTTGCTGCAGTTTTTCCG
CGATAGTTTGGGGCAGTTCCGCGCGTTGCAGGCCCTTCTGAATTTCCTGGA
ZNF224 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF224_1 ↗19:44,094,361正股44,094,312–44,094,371
ZNF224_2 ↗19:44,094,666正股44,094,617–44,094,676

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_BBQ9C · promoter · 44093871–44094402 · regulatory

ENSR19_C6D5Q · enhancer · 44094403–44095609 · regulatory

· motif · 44094075–44094090 · motif

· motif · 44094124–44094137 · motif

· motif · 44094124–44094137 · motif

· motif · 44094128–44094145 · motif

· motif · 44094372–44094381 · motif

· motif · 44094372–44094383 · motif

· motif · 44094388–44094405 · motif

· motif · 44094548–44094563 · motif

· motif · 44094882–44094893 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:707 aa

1 aa707 aa結構域鋅指
依 Q9NZL3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF224 蛋白質長 707 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 結構域(第 8–78 位),另有 18 個註記的 C2H2 型鋅指區域;其中第 14 個被標示為退化型。這些區域分布於第 176–702 位。

結構域KRAB8–78 aa
鋅指C2H2-type 1176–198 aa
鋅指C2H2-type 2204–226 aa
鋅指C2H2-type 3232–254 aa
鋅指C2H2-type 4260–282 aa
鋅指C2H2-type 5288–310 aa
鋅指C2H2-type 6316–338 aa
鋅指C2H2-type 7344–366 aa
鋅指C2H2-type 8372–394 aa
鋅指C2H2-type 9400–422 aa
鋅指C2H2-type 10428–450 aa
鋅指C2H2-type 11456–478 aa
鋅指C2H2-type 12484–506 aa
鋅指C2H2-type 13512–534 aa
鋅指C2H2-type 14; degenerate540–562 aa
鋅指C2H2-type 15568–590 aa
鋅指C2H2-type 16596–618 aa
鋅指C2H2-type 17652–674 aa
鋅指C2H2-type 18680–702 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2ELY…

PDB · 2ELY

NMR · - · A=227-259

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF224 位於細胞核,並與 DEPDC1A 在細胞核共定位。 資料未描述其他定位、定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BMZF-2ZNF224CARD9FANCLMAGEA8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料指出 ZNF224 與 WT1 及 DEPDC1A 有交互作用;另有資料將 ZNF224 與 DEPDC1A 描述為可能形成複合體。來源未提供與 WT1 的複合體資訊,也未說明上述交互作用的具體分子方式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF224 可能以轉錄抑制因子的身分參與轉錄調控。在膀胱癌相關情境中,DEPDC1A-ZNF224 複合體可能抑制 A20 基因轉錄,促使 NF-KB 蛋白移入細胞核,並因此抑制膀胱癌細胞凋亡;此作用關係仍以可能性表述。含實驗來源
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation as a transcriptional repressor. The DEPDC1A-ZNF224 complex may play a critical role in bladder carcinogenesis by repressing the transcription of the A20 gene, leading to transport of NF-KB protein into the nucleus, resulting in suppression of apoptosis of bladder cancer cells

PMID 20587513 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF224 與 WT1 有交互作用,也與 DEPDC1A 有交互作用;此資料未進一步描述作用方式或其功能後果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with WT1. Interacts with DEPDC1A

PMID 12239212 ↗ · PMID 20587513 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF224 位於細胞核,並與 DEPDC1A 在細胞核共定位;資料未說明其他定位或定位改變的條件。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Colocalizes with DEPDC1A at the nucleus

PMID 12239212 ↗ · PMID 20587513 ↗ · PMID 23665872 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000693561 · 3,993 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAGTCGCGGACACTTCCGCTCGGGGACTGAGGTTGCTGC40
41AGTTTTTCCGCGATAGTTTGGGGCAGTTCCGCGCGTTGCA80
81GGCCCTTCTGAATTTCCTGGACCTACGCATTGGATCCTCA120
121AAGAACTGGTGATCGAATTAGGGGAAAAGGGGCCTCGTCG160
161GAGAGTAGAGCTGAATACCACTAGAAACATACCTGTAACC200
201AGAGACAGCTGATTATAGCTTTCTGCAGCAAGGAAGCCCA240
241CGTACCAGGGGCTGTCTTGGCACAATTCTGCTTTCCCAGG280
281AACTGCATCACTCAGGACTCTGCAAGTTTCCAGAAGTAAG320
321AGGGAAAATGACCACGTTCAAGGAGGCAATGACCTTCAAG360
361GACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGGGGCTGC400
401TGGACCTTGCTCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCT440
441GGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGACATCAAGCA480
481TTCCACAGGGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGA520
521TTTGGATGATGAAGACAGCAATCCAAAGGGAAGGGAATTC560
561AGGAGACAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTTCAGAA600
601GCAGGAACACATCAAGAGTGGTCCTTCCAGCAAATCTGGG640
641AAAAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGTCTCAAGACTTGAT680
681GATAAATAGCTCTCAGTTCTCCAAAGAAGGTGATTTCCCC720
721TGCCAGACTGAGGCAGGACTATCTGTAATTCACACAAGAC760
761AGAAATCTTCCCAGGGCAATGGATATAAACCATCCTTCAG800
801TGATGTCTCCCACTTTGATTTTCATCAACAATTACACTCA840
841GGAGAGAAATCTCATACGTGTGATGAGTGTGGAAAGAACT880
881TTTGTTACATCTCAGCCCTTCGTATTCATCAGAGAGTCCA920
921CATGGGAGAGAAATGCTATAAGTGTGACGTGTGTGGTAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。