演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF223

zinc finger protein 223

ZNF223(zinc finger protein 223)是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族成員,可能參與轉錄調控;蛋白質含有 KRAB 區域及多個 C2H2 型鋅指。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q9UK11
OFFICIAL SYMBOL
ZNF223
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9UK11
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF223 是一種蛋白質編碼基因,其產物 zinc finger protein 223 歸屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質序列具有 KRAB 區域,並包含多個 C2H2 型鋅指,其中部分鋅指被註記為退化型。現有資料將其基本特徵歸納為鋅指家族蛋白,並指出它可能參與轉錄調控;可用資訊未進一步說明其特定調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF223
Gene name
zinc finger protein 223
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13016
UniProt
Q9UK11
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF223pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:44,051,367–44,069,308
Gene span
17,942 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000434772 ★44,052,036–44,067,9995
ENST0000058555244,052,006–44,060,9244
ENST0000091141044,052,006–44,067,9996
ENST0000091141144,052,006–44,067,9996
ENST0000112473944,052,006–44,069,3085
ENST0000112474044,052,006–44,067,4195
ENST0000114123944,052,006–44,067,9995
ENST0000091140844,052,015–44,067,9995
ENST0000091140944,052,035–44,067,9994
ENST0000059185044,060,364–44,066,6023

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF223 可能參與轉錄調控。現有功能資料僅提出這項可能性,未指出它調節哪些基因或轉錄程序,也沒有交代其作用方向、發生條件或調控結果。因此,目前可支持的功能描述限於其可能涉及轉錄調控,不能據此進一步推定具體的分子機制或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 44052036 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF223 ENST00000434772 GRCh38 chr19:44051036-44052136 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTTCCTGGCTTCTCATTGCCCCTCCCAACCCATTCTACCTGGCTCATTCTTTAAACCAGTGGTCCCCAA
CCGTTTTAGCACCATGGACCGGTTTTGTGGAAGACAATTTTTCCACGGACTGGGGAATGGTTTCGGGATG
AAACTGTTCCACCTCAGCCATTAGATTCTCATAAGGAGCGCCTGACCTAGATCCTTCGCACGCACAGTTC
ACAATAGGATCCGCGCTCCTATGAGAATGTAATGCTGGGCTGATCTCACAGGAGGTGGAGCTCAGGCCAT
AATGCTCCCTCACCTGCCGCTCACTTCCTGCTGTGCCGCCCGGTTCCTAACAGTCAGTGGACCGGTACAG
GTCTGTGGCCCTGGAGTTGGATATCCTTGCTTTAAACCCTGAGCCTCCTTTCAGCCATCTGACGGCTCAA
CAGTCACTCTATCTAGCTCCTTGAATATTGTATCTCCTCGCTTGTTCCCTGTCCAAGAACACTCCTGTCA
ATCATGGGAGACATTTAGACTTCATAAATTCTTTCTATTCAATATTTTCGCTCGAGGACTCTGGGAAGGA
CAACTGTCAGGGTAACAGTCTGCATTCCCCACCAGGAACCTGGGGCTATGAAATTCGTTCCCCGTGGGTG
TTGCGGGAAGTGTAATCGAGGAGCACCATGTAGTCGCAACACTTGAGCCTAAAGGGTGAGGTGATGGACA
TTTTCCTTTTGCATCTGAGGCTCTGCAGTCCAGACACCTTGCGGGATTCCTGATACTTCAGCTCAGGTAG
GCGTTTCCGGAGAATTCTGGGAAGAGTAGTCCATTTTACGGGAAGTGTAGTCCACTGGCTCGTGGAACAC
TGGGTATTTTGGCTCTGGCAGGTGAACCGTTGAATTCTGGGAACGATAGTCCAGACACTCTGCGGAGTCC
CGGGCCCTTTGGCTCAGGGGGGCGGGTCCGGGGAATTCTGGGGAGTGGAGTCCAGACACTCTGGCGCAGA
GAGGACACTTCCGGTCTCCTAGTCTGAGGTTCCTGCTTTAATGACCGGGGTAGTTTGAGCCATTTCTGCG
TCTTGCAGGACATTTTGAACGAACCCCCTTTGCTTGAGGCTCGCAACCACC
ZNF223 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF223_1 ↗19:44,052,036正股44,051,987–44,052,046

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9MH4G · promoter · 44051546–44052051 · regulatory

ENSR19_9MH4L · enhancer · 44052052–44052469 · regulatory

ENSR19_5DCR7F · CTCF_binding_site · 44056093–44056114 · regulatory

· motif · 44051337–44051346 · motif

· motif · 44051337–44051348 · motif

· motif · 44051839–44051850 · motif

· motif · 44051963–44051973 · motif

· motif · 44052021–44052030 · motif

· motif · 44052021–44052032 · motif

· motif · 44052021–44052032 · motif

· motif · 44052151–44052164 · motif

· motif · 44052151–44052164 · motif

· motif · 44052317–44052332 · motif

· motif · 44052319–44052332 · motif

· motif · 44056095–44056111 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:482 aa

1 aa482 aa結構域鋅指
依 Q9UK11 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 223 長 482 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列第 8–78 位為 KRAB 區域;第 176–450 位分布十個 C2H2 型鋅指,其中第六與第十個被註記為退化型。

結構域KRAB8–78 aa
鋅指C2H2-type 1176–198 aa
鋅指C2H2-type 2204–226 aa
鋅指C2H2-type 3232–254 aa
鋅指C2H2-type 4260–282 aa
鋅指C2H2-type 5288–310 aa
鋅指C2H2-type 6; degenerate316–338 aa
鋅指C2H2-type 7344–366 aa
鋅指C2H2-type 8372–394 aa
鋅指C2H2-type 9400–422 aa
鋅指C2H2-type 10; degenerate428–450 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UK11…

AlphaFold · Q9UK11

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

zinc finger protein 223 定位於細胞核。 現有資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF223ZNF223CABP5CARD10CCNDBP1KRTAP10-7MDFIZC4H2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF223 可能參與轉錄調控;現有敘述只指出這項可能性,未具體說明調控對象、作用方式或結果。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF223 蛋白質定位於細胞核;此筆資料未提供其他定位條件或變化資訊。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000434772 · 2,399 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCTGAGGTTCCTGCTTTAATGACCGGGGTAGTTTGAGC40
41CATTTCTGCGTCTTGCAGGACATTTTGAACGAACCCCCTT80
81TGCTTGAGGCTCGCAACCACCCGATGATCGATGATCGTCT120
121CAGGGGAAAAGAAGCCTTGGCGAAGAGCAGAGGTTTAGAG160
161GCACAATTCTGCTTTCCCTGGAACTGTGTCATTCAGGACT200
201CTGCAAATTCCCTAAAGTAGGAGGAAAAATGACCATGTCC240
241AAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCAGTGGTCTTCA280
281CTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTGCCCAGAGGAA320
321GCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTG360
361CTGTCAGTGGGGCATCAACCATTCCACCGAGATACTTTCC400
401ACTTTCTAAGGGAGGAAAAGTTTTGGATGATGGATATAGC440
441AACCCAAAGGGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAACCT480
481GAGATGAAGACTTTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGGGT520
521GGTCCTGCCAGCAGATCTGGGAAGAAATTGCAAGTGATTT560
561AACCAGGCCTCAAGACTCTACCATAAAGAGCTCTCAGTTC600
601TTTGAACAGGGTGATGCCCACTCCCAGGTTGAGGAAGGAC640
641TATCTATAATGCACACAGGACAGAAACCTTCCAATTGTGG680
681GAAGTGTAAACAATCCTTCAGTGATATGTCCATCTTTGAT720
721CTTCCTCAGCAAATACGCTCAGCAGAGAAGTCTCATTCCT760
761GTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCGCT800
801TCATATTCATCAGAGAGTCCACCTGGGAGAGAAACTCTTT840
841AAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTTAC880
881ATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACC920
921TTTCAAATGTGAACAATGTGGGAGAGGCTTCAGATGTAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。