基因總覽
ZNF221(zinc finger protein 221)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2-type zinc finger,呈現此蛋白質家族的結構特色。現有資料將它與轉錄調控可能相關聯,但未提供更具體的作用方式或調控對象。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000587682 ★ | 43,951,228–43,967,709 | 5 |
| ENST00000251269 | 43,951,204–43,967,709 | 6 |
| ENST00000886290 | 43,951,204–43,967,386 | 5 |
| ENST00001121653 | 43,951,204–43,972,739 | 6 |
| ENST00001143350 | 43,951,204–43,967,709 | 5 |
| ENST00000591168 | 43,951,223–43,965,893 | 5 |
| ENST00000592350 | 43,960,276–43,967,600 | 6 |
| ENST00000622072 | 43,962,723–43,967,600 | 4 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有資料指出,ZNF221 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與調節轉錄的過程有關,但未說明它促進或抑制轉錄,也沒有指出受調控的基因、轉錄因子或其他作用對象。因此,不能據此判定其調控方向或特定分子機制。
資料亦未提供此作用發生的生物學情境、所需條件或實驗細節,因而無法進一步界定 ZNF221 在何種過程中發揮作用,以及其參與對細胞功能的具體影響。這項功能資訊應保留為可能性,而非確定的功能結論。
Promoter 與基因調控
>ZNF221 ENST00000587682 GRCh38 chr19:43950228-43951328 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TATAAAACTAATAAAAGAAAACTTTGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGA GGCTGAAGTGGGTGGATCACGGGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTAGCTAACACGGTGAAAACCTGTCTC TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGA GGCAGGAGAATGGTATGAACCCAGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGC CTGGGTGAAAGAGCGAGACTCCACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTTCAAGAAAAAAGAATTATT TTACAAATGTATAAACAATATTTGAAAAATGAGGGAAAAGGCCAAAAAGCCATTAGTACAGTAGGCAAAA GGTTTGAACAATTTACCAATAATAATAATAATAATAATAATCATGGCCTTTGAAAATATGAAAAGATGTT CTATTTCATTTACAATACAGGAAATGTAAATTAAAATTACATCGGCATACTATCAGTTTTAGCCTCACAT CATCAGGTTATACTAAACATTTTCCTCTTTTCAGTTCTCTACTGATCCTCAAGCAGTAATTTCTTGTCAG TTCCTTGAAGATTTTATCTCCACCTTTGTTCACTCTCCAGTAATACTTCTGTAATAATTGGGGATATTTC AATCAGGAAATCATTGTTTATGTAATATTTTTGCTTGAAGACTCAAGAGAAAGGTAAGGACGACACTCAG TGCAGGAGTCCATATTACCACATAGGCGTTTCGGATGGGGGATTCCCTTCTCCGGGGACTTGGAAGAAGT GTGGTCAAGAAGCTATGTGTAGTTGCAACACTTCCCCCTGGAGGGTAAAACTGTGAACGTTTACTCCTTG GGCATTCTGGGAAGTGTCCCAACGGTCGGTGGGGTTGCGGGCACTTCCGGTCAGGCAGGCGGATCCGGGG AATTCTGGGAAATGTAGTCCAGACGCTCTGTGGAGTCGCGGGAGCTACGGCTGCGGGAGTTACCCTTTAT TCTGTGATATTTTGAGCTGTTCTGCGTCTCGCAGGCCCTTCTGAATTTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF221_1 ↗ | 19:43,951,228 | 正股 | 43,951,179–43,951,238 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9MG2B · promoter · 43950802–43951255 · regulatory
ENSR19_BBPHP · enhancer · 43951256–43951881 · regulatory
· motif · 43951044–43951057 · motif
· motif · 43951044–43951057 · motif
· motif · 43951179–43951188 · motif
· motif · 43951179–43951190 · motif
· motif · 43951179–43951190 · motif
· motif · 43951471–43951484 · motif
· motif · 43951471–43951484 · motif
· motif · 43955298–43955309 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:617 aa
ZNF221 長 617 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 區域(第 30–100 位),後續有 15 個 C2H2-type zinc finger 註解,分布於第 170–584 位;其中第 4 個被標示為退化型。蛋白質家族資料將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF221 定位於細胞核;未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- KRTAP10-6P60371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGEA8P43361 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGACGCTCTGTGGAGTCGCGGGAGCTACGGCTGCGGGAGT40TACCCTTTATTCTGTGATATTTTGAGCTGTTCTGCGTCTC80GCAGGCCCTTCTGAATTTCCTGGACCTACTCTCGGAACCC120TCAACGAGCTAGCGATAGATTTAGAGGAAAGGAAGCACCG160TCGGAAAGCAAAGGCATGATTTCACCTTCACTTGAACTGC200TTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAA240AATGACCACATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTG280GCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACC320CTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAA360CTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTCCAC400CAAGATACTTTCCACTTCTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGA440AGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGG480CAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGA520CCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAGCAAATATGGGAACAAA560TTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAA600CAGCTCTCAGTTCTTCAAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAG640ATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCAACAGAAAC680CTTACCGTTGTAATGAATGTAAACAGTCCTTCAGTGATGT720TTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAG760AAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTT800ACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCATATGGG840AGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTT880AATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATA920CTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。