演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF221

zinc finger protein 221

ZNF221 是一種含 KRAB 與多個 C2H2-type zinc finger 的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens19q13.31UniProt Q9UK13
OFFICIAL SYMBOL
ZNF221
CHROMOSOME
19
UNIPROT
Q9UK13
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF221(zinc finger protein 221)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 N 端 KRAB 區域,以及多個 C2H2-type zinc finger,呈現此蛋白質家族的結構特色。現有資料將它與轉錄調控可能相關聯,但未提供更具體的作用方式或調控對象。

Official symbol
ZNF221
Gene name
zinc finger protein 221
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13014
UniProt
Q9UK13
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.31
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25ZNF221pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:43,951,204–43,972,739
Gene span
21,536 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000587682 ★43,951,228–43,967,7095
ENST0000025126943,951,204–43,967,7096
ENST0000088629043,951,204–43,967,3865
ENST0000112165343,951,204–43,972,7396
ENST0000114335043,951,204–43,967,7095
ENST0000059116843,951,223–43,965,8935
ENST0000059235043,960,276–43,967,6006
ENST0000062207243,962,723–43,967,6004

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,ZNF221 可能參與轉錄調控。這項描述表示其可能與調節轉錄的過程有關,但未說明它促進或抑制轉錄,也沒有指出受調控的基因、轉錄因子或其他作用對象。因此,不能據此判定其調控方向或特定分子機制。

資料亦未提供此作用發生的生物學情境、所需條件或實驗細節,因而無法進一步界定 ZNF221 在何種過程中發揮作用,以及其參與對細胞功能的具體影響。這項功能資訊應保留為可能性,而非確定的功能結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43951228 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF221 ENST00000587682 GRCh38 chr19:43950228-43951328 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATAAAACTAATAAAAGAAAACTTTGGGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCTAGCACTTTGGGA
GGCTGAAGTGGGTGGATCACGGGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTAGCTAACACGGTGAAAACCTGTCTC
TACTAAAAATACAAAAAATTAGCCTGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGAAGGCTGA
GGCAGGAGAATGGTATGAACCCAGGAGGCAGAGTTTGCAGTGAGCCGAGATCATGCCACTGCACTCCAGC
CTGGGTGAAAGAGCGAGACTCCACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAATTTTCAAGAAAAAAGAATTATT
TTACAAATGTATAAACAATATTTGAAAAATGAGGGAAAAGGCCAAAAAGCCATTAGTACAGTAGGCAAAA
GGTTTGAACAATTTACCAATAATAATAATAATAATAATAATCATGGCCTTTGAAAATATGAAAAGATGTT
CTATTTCATTTACAATACAGGAAATGTAAATTAAAATTACATCGGCATACTATCAGTTTTAGCCTCACAT
CATCAGGTTATACTAAACATTTTCCTCTTTTCAGTTCTCTACTGATCCTCAAGCAGTAATTTCTTGTCAG
TTCCTTGAAGATTTTATCTCCACCTTTGTTCACTCTCCAGTAATACTTCTGTAATAATTGGGGATATTTC
AATCAGGAAATCATTGTTTATGTAATATTTTTGCTTGAAGACTCAAGAGAAAGGTAAGGACGACACTCAG
TGCAGGAGTCCATATTACCACATAGGCGTTTCGGATGGGGGATTCCCTTCTCCGGGGACTTGGAAGAAGT
GTGGTCAAGAAGCTATGTGTAGTTGCAACACTTCCCCCTGGAGGGTAAAACTGTGAACGTTTACTCCTTG
GGCATTCTGGGAAGTGTCCCAACGGTCGGTGGGGTTGCGGGCACTTCCGGTCAGGCAGGCGGATCCGGGG
AATTCTGGGAAATGTAGTCCAGACGCTCTGTGGAGTCGCGGGAGCTACGGCTGCGGGAGTTACCCTTTAT
TCTGTGATATTTTGAGCTGTTCTGCGTCTCGCAGGCCCTTCTGAATTTCCT
ZNF221 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF221_1 ↗19:43,951,228正股43,951,179–43,951,238

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9MG2B · promoter · 43950802–43951255 · regulatory

ENSR19_BBPHP · enhancer · 43951256–43951881 · regulatory

· motif · 43951044–43951057 · motif

· motif · 43951044–43951057 · motif

· motif · 43951179–43951188 · motif

· motif · 43951179–43951190 · motif

· motif · 43951179–43951190 · motif

· motif · 43951471–43951484 · motif

· motif · 43951471–43951484 · motif

· motif · 43955298–43955309 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:617 aa

1 aa617 aa結構域鋅指
依 Q9UK13 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF221 長 617 個胺基酸。其 N 端含 KRAB 區域(第 30–100 位),後續有 15 個 C2H2-type zinc finger 註解,分布於第 170–584 位;其中第 4 個被標示為退化型。蛋白質家族資料將其歸入 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。

結構域KRAB30–100 aa
鋅指C2H2-type 1170–192 aa
鋅指C2H2-type 2198–220 aa
鋅指C2H2-type 3226–248 aa
鋅指C2H2-type 4; degenerate254–276 aa
鋅指C2H2-type 5282–304 aa
鋅指C2H2-type 6310–332 aa
鋅指C2H2-type 7338–360 aa
鋅指C2H2-type 8366–388 aa
鋅指C2H2-type 9394–416 aa
鋅指C2H2-type 10422–444 aa
鋅指C2H2-type 11450–472 aa
鋅指C2H2-type 12478–500 aa
鋅指C2H2-type 13506–528 aa
鋅指C2H2-type 14534–556 aa
鋅指C2H2-type 15562–584 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UK13…

AlphaFold · Q9UK13

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZNF221 定位於細胞核;未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF221ZNF221KRTAP10-6MAGEA8MDFI
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF221 可能參與轉錄調控;資料未指出調控方向、作用對象或具體機制,因此此功能仍屬可能性描述。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF221 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000587682 · 2,382 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGACGCTCTGTGGAGTCGCGGGAGCTACGGCTGCGGGAGT40
41TACCCTTTATTCTGTGATATTTTGAGCTGTTCTGCGTCTC80
81GCAGGCCCTTCTGAATTTCCTGGACCTACTCTCGGAACCC120
121TCAACGAGCTAGCGATAGATTTAGAGGAAAGGAAGCACCG160
161TCGGAAAGCAAAGGCATGATTTCACCTTCACTTGAACTGC200
201TTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAA240
241AATGACCACATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTG280
281GCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACC320
321CTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAA360
361CTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTCCAC400
401CAAGATACTTTCCACTTCTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGA440
441AGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGG480
481CAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGA520
521CCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAGCAAATATGGGAACAAA560
561TTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAA600
601CAGCTCTCAGTTCTTCAAAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAG640
641ATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCAACAGAAAC680
681CTTACCGTTGTAATGAATGTAAACAGTCCTTCAGTGATGT720
721TTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAG760
761AAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTT800
801ACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCATATGGG840
841AGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTT880
881AATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCATA920
921CTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGGGCAATGTGGGAAAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。