演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF22KOX15

zinc finger protein 22

ZNF22 是蛋白質編碼基因,其產物可辨識特定 DNA 序列;資料指出它可能參與轉錄調控及牙齒形成,後兩項功能屬於相似性推定。

Homo sapiens10q11.21UniProt P17026
OFFICIAL SYMBOL
ZNF22
CHROMOSOME
10
UNIPROT
P17026
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF22 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 22。其產物可透過特定 DNA 序列與 DNA 結合;資料將它歸入 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。

Official symbol
ZNF22
Gene name
zinc finger protein 22
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13012
UniProt
P17026
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KOX15HKR-T1ZNF422Zfp422

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q11.21
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegZNF22pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:45,000,262–45,007,206
Gene span
6,945 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000298299 ★45,000,923–45,005,3262
ENST0000113674545,000,262–45,007,2062
ENST0000087078045,000,293–45,007,2062
ENST0000091300245,000,904–45,007,2062
ENST0000091300345,000,923–45,007,2062
ENST0000087078145,001,136–45,007,2062

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF22 蛋白質可辨識並結合 DNA 上的共識序列 5'-CAATG-3'。這項序列辨識能力提供其可能參與轉錄調控的功能基礎,但現有資料僅指出它「可能」參與此過程,未進一步說明受調控的基因或具體調控方式。

資料亦指出,ZNF22 可能在牙齒形成中發揮作用;此項功能註記是依相似性推定(By similarity),應視為推論,而非來源已明確證實的作用。現有資訊未提供牙齒形成中的作用階段、細胞或分子機制,因此無法進一步界定其功能細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45000923 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF22 ENST00000298299 GRCh38 chr10:44999923-45001023 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGGTGGCTTGGTGGTTATAGCAGTGGAAGTGTTGAAAGTGGCTTGATAATGAATATATTTTAACGATGA
AGCCGACAGAATTTGTGGATAAATCACAGGTGAATTTTGGATGAAAAAAAGAAGAGACAACAGTGACATC
AAGGTTTTTGGCTTGAGCAACTGGAAAGATGATGGGATCTTCACCCATCCCTGGGAAGAAGACTGTTGCA
AGAACAGGTTAGGTAGATATCAGGAATTCATTTGGGGGGTATGTTAGGTTTGGGATGTCCATTACACATG
CAAATGCAGCTCTTGAGTAATCAGTTCGATATACAAGTCTAAAGTTCAATAACATTTATGTCCCACAGTC
AGACTGGAGTTACCAATGCGGGAGTCTTCAGCATGCAGCAATAGCATTGGAAGCCAAAAGGCGGAGGAGC
TCCCCAGGGAGTGGGGGAACACGGAGGTCAGCTGGTCAGATGACTGAGCACGGCCAGGATGGCTGAGGAG
GAGCCTGGAAGGAATAAGAACAAAGAGAGATCATTACTAATGAGCAACAAAAGGGGTGTGTTGAAATCAG
ACTTTGGAGCCACAAAGAACCATTCCAATTCTGGGTCGTCCGCTTACACACGGTGAACGGAGCACATTTC
TTCTCTGAGCCTTGGTTCCTTTCCTGTAAATGGAGTATAACCACTCCCATCTTGCAGGAGCTTTTTGGTG
ATAATTAAGGTGACTTCGTGAAAAGTACCAGGGTCTCAAAAATCTCAAAATTTGTGGAAAGTATGCAGTT
TCTAGGTTGGAGAGGCTAGAGTTTGGTTTCAAAAGCCTCGACCACACACAGGGGCGGTTACAGCTCTTGA
GGTCCCGGGGGTCACAGGACGCCTTCCGAGTTGGGGGGAGGAGAAAACAAAACCACAGGAAGAAACGAAC
AACGCTTTCGGGTGGGCCCGGGACCATAGAGGGTCGCTCCGCCACTTTCCTAGAGCGACCGCGGCGGCGC
CAGAGCGCGGCGAGGCCCTCACTTCCGGCGGCGCGGGAGGCGCCCAGCGAGCCAGAGTGGTGGCTGGTCC
CGCGCGGTGAGTGGGATTGGGGCACTTGGGGCGCTCGGGGCCTGCGTCGGA
ZNF22 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF22_2 ↗10:45,000,504正股45,000,455–45,000,514
ZNF22_1 ↗10:45,000,923正股45,000,874–45,000,933

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_C6GJX · enhancer · 44995601–44997107 · regulatory

ENSR10_9MT8D · enhancer · 44998209–44998678 · regulatory

ENSR10_BBX5H · enhancer · 45000079–45000909 · regulatory

ENSR10_5DKR7L · promoter · 45000910–45000933 · regulatory

ENSR10_C6GKB · enhancer · 45000934–45002042 · regulatory

ENSR10_5DKRC2 · CTCF_binding_site · 45001651–45001672 · regulatory

· motif · 44996612–44996626 · motif

· motif · 44996689–44996700 · motif

· motif · 44996727–44996737 · motif

· motif · 45000237–45000250 · motif

· motif · 45000237–45000251 · motif

· motif · 45000237–45000252 · motif

· motif · 45000237–45000252 · motif

· motif · 45000464–45000474 · motif

· motif · 45000478–45000493 · motif

· motif · 45000592–45000602 · motif

· motif · 45000768–45000780 · motif

· motif · 45000770–45000777 · motif

· motif · 45000797–45000817 · motif

· motif · 45000812–45000820 · motif

· motif · 45000922–45000931 · motif

· motif · 45000922–45000933 · motif

· motif · 45001125–45001138 · motif

· motif · 45001164–45001181 · motif

· motif · 45001366–45001381 · motif

· motif · 45001653–45001669 · motif

· motif · 45003618–45003629 · motif

· motif · 45003702–45003713 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:224 aa

1 aa224 aa功能區域鋅指
依 P17026 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF22 蛋白質長 224 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列中註記有五個 C2H2 型鋅指區域,分別位於第 55–77、83–105、111–133、139–161 與 167–189 個胺基酸;第 1–34 位則標示為無序區域。

鋅指C2H2-type 155–77 aa
鋅指C2H2-type 283–105 aa
鋅指C2H2-type 3111–133 aa
鋅指C2H2-type 4139–161 aa
鋅指C2H2-type 5167–189 aa
功能區域Disordered1–34 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P17026…

AlphaFold · P17026

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF22 蛋白質的定位註記為細胞核。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KOX15ZNF22CFTR
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF22 可透過 5'-CAATG-3' 共識序列結合 DNA,並可能參與轉錄調控;資料也指出它可能在牙齒形成中發揮作用,但這些功能描述屬於依相似性推定,並非來源明確證實的作用。推論支持
證據與來源

Binds DNA through the consensus sequence 5'-CAATG-3'. May be involved in transcriptional regulation and may play a role in tooth formation (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF22 的細胞內定位註記為細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000298299 · 2,103 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTCCGGCGGCGCGGGAGGCGCCCAGCGAGCCAGAGTGG40
41TGGCTGGTCCCGCGCGAAAATTCTGAGCTGTACACCTCTA80
81GGAAATGAAACACTAGTTCAGAAGAAGCCTGTAAACTCTC120
121TTACAAATACATTTGGTTATTCACCATGAGGTTAGCAAAG160
161CCTAAAGCGGGTATTTCTCGGAGCTCAAGCCAAGGAAAGG200
201CCTATGAGAACAAGCGCAAAACAGGCCGGCAGCGGCAGAA240
241GTGGGGCATGACTATTCGATTTGACTCAAGCTTCAGTAGA280
281CTCAGAAGAAGCTTGGATGACAAACCCTATAAATGTACTG320
321AATGTGAAAAGAGTTTCAGTCAGAGTTCAACTCTTTTTCA360
361ACACCAGAAGATCCATACTGGAAAGAAATCCCATAAATGT400
401GCTGATTGTGGGAAAAGTTTCTTTCAGAGTTCTAATCTCA440
441TTCAGCATCGACGGATCCATACGGGGGAAAAGCCCTACAA480
481ATGTGATGAGTGTGGAGAAAGCTTCAAACAGAGCTCAAAT520
521CTCATTCAGCACCAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCT560
561ATCAGTGTGATGAGTGTGGCCGGTGTTTCAGCCAGAGCTC600
601CCACCTTATTCAACATCAGAGAACCCACACTGGGGAGAAA640
641CCCTACCAGTGCAGTGAATGTGGCAAATGTTTCAGTCAGA680
681GCTCTCATCTGAGGCAGCACATGAAGGTGCATAAAGAAGA720
721GAAGCCTCGTAAAACCCGGGGCAAAAATATCAGGGTGAAG760
761ACTCACTTACCCTCTTGGAAAGCTGGTACAGGAAGGAAGT800
801CTGTGGCTGGTCTCCGTTAAGTATAGGGCTTTTTGACAGC840
841TTTTTGAGACCTCTTAAGAAAAAATAAAAAGTAAAAAATG880
881AAAGGAATCTTTTTTAGAAATAGAGATGCTTTATAGTAGA920
921TCACTTAAATACTGGATCTTTTGCTAGTGTGAAAACATTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。