基因總覽
ZNF22 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 22。其產物可透過特定 DNA 序列與 DNA 結合;資料將它歸入 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000298299 ★ | 45,000,923–45,005,326 | 2 |
| ENST00001136745 | 45,000,262–45,007,206 | 2 |
| ENST00000870780 | 45,000,293–45,007,206 | 2 |
| ENST00000913002 | 45,000,904–45,007,206 | 2 |
| ENST00000913003 | 45,000,923–45,007,206 | 2 |
| ENST00000870781 | 45,001,136–45,007,206 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF22 蛋白質可辨識並結合 DNA 上的共識序列 5'-CAATG-3'。這項序列辨識能力提供其可能參與轉錄調控的功能基礎,但現有資料僅指出它「可能」參與此過程,未進一步說明受調控的基因或具體調控方式。
資料亦指出,ZNF22 可能在牙齒形成中發揮作用;此項功能註記是依相似性推定(By similarity),應視為推論,而非來源已明確證實的作用。現有資訊未提供牙齒形成中的作用階段、細胞或分子機制,因此無法進一步界定其功能細節。
Promoter 與基因調控
>ZNF22 ENST00000298299 GRCh38 chr10:44999923-45001023 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGGTGGCTTGGTGGTTATAGCAGTGGAAGTGTTGAAAGTGGCTTGATAATGAATATATTTTAACGATGA AGCCGACAGAATTTGTGGATAAATCACAGGTGAATTTTGGATGAAAAAAAGAAGAGACAACAGTGACATC AAGGTTTTTGGCTTGAGCAACTGGAAAGATGATGGGATCTTCACCCATCCCTGGGAAGAAGACTGTTGCA AGAACAGGTTAGGTAGATATCAGGAATTCATTTGGGGGGTATGTTAGGTTTGGGATGTCCATTACACATG CAAATGCAGCTCTTGAGTAATCAGTTCGATATACAAGTCTAAAGTTCAATAACATTTATGTCCCACAGTC AGACTGGAGTTACCAATGCGGGAGTCTTCAGCATGCAGCAATAGCATTGGAAGCCAAAAGGCGGAGGAGC TCCCCAGGGAGTGGGGGAACACGGAGGTCAGCTGGTCAGATGACTGAGCACGGCCAGGATGGCTGAGGAG GAGCCTGGAAGGAATAAGAACAAAGAGAGATCATTACTAATGAGCAACAAAAGGGGTGTGTTGAAATCAG ACTTTGGAGCCACAAAGAACCATTCCAATTCTGGGTCGTCCGCTTACACACGGTGAACGGAGCACATTTC TTCTCTGAGCCTTGGTTCCTTTCCTGTAAATGGAGTATAACCACTCCCATCTTGCAGGAGCTTTTTGGTG ATAATTAAGGTGACTTCGTGAAAAGTACCAGGGTCTCAAAAATCTCAAAATTTGTGGAAAGTATGCAGTT TCTAGGTTGGAGAGGCTAGAGTTTGGTTTCAAAAGCCTCGACCACACACAGGGGCGGTTACAGCTCTTGA GGTCCCGGGGGTCACAGGACGCCTTCCGAGTTGGGGGGAGGAGAAAACAAAACCACAGGAAGAAACGAAC AACGCTTTCGGGTGGGCCCGGGACCATAGAGGGTCGCTCCGCCACTTTCCTAGAGCGACCGCGGCGGCGC CAGAGCGCGGCGAGGCCCTCACTTCCGGCGGCGCGGGAGGCGCCCAGCGAGCCAGAGTGGTGGCTGGTCC CGCGCGGTGAGTGGGATTGGGGCACTTGGGGCGCTCGGGGCCTGCGTCGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF22_2 ↗ | 10:45,000,504 | 正股 | 45,000,455–45,000,514 |
| ZNF22_1 ↗ | 10:45,000,923 | 正股 | 45,000,874–45,000,933 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR10_C6GJX · enhancer · 44995601–44997107 · regulatory
ENSR10_9MT8D · enhancer · 44998209–44998678 · regulatory
ENSR10_BBX5H · enhancer · 45000079–45000909 · regulatory
ENSR10_5DKR7L · promoter · 45000910–45000933 · regulatory
ENSR10_C6GKB · enhancer · 45000934–45002042 · regulatory
ENSR10_5DKRC2 · CTCF_binding_site · 45001651–45001672 · regulatory
· motif · 44996612–44996626 · motif
· motif · 44996689–44996700 · motif
· motif · 44996727–44996737 · motif
· motif · 45000237–45000250 · motif
· motif · 45000237–45000251 · motif
· motif · 45000237–45000252 · motif
· motif · 45000237–45000252 · motif
· motif · 45000464–45000474 · motif
· motif · 45000478–45000493 · motif
· motif · 45000592–45000602 · motif
· motif · 45000768–45000780 · motif
· motif · 45000770–45000777 · motif
· motif · 45000797–45000817 · motif
· motif · 45000812–45000820 · motif
· motif · 45000922–45000931 · motif
· motif · 45000922–45000933 · motif
· motif · 45001125–45001138 · motif
· motif · 45001164–45001181 · motif
· motif · 45001366–45001381 · motif
· motif · 45001653–45001669 · motif
· motif · 45003618–45003629 · motif
· motif · 45003702–45003713 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:224 aa
ZNF22 蛋白質長 224 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列中註記有五個 C2H2 型鋅指區域,分別位於第 55–77、83–105、111–133、139–161 與 167–189 個胺基酸;第 1–34 位則標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF22 蛋白質的定位註記為細胞核。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF22 可透過 5'-CAATG-3' 共識序列結合 DNA,並可能參與轉錄調控;資料也指出它可能在牙齒形成中發揮作用,但這些功能描述屬於依相似性推定,並非來源明確證實的作用。 | 推論支持 | 證據與來源Binds DNA through the consensus sequence 5'-CAATG-3'. May be involved in transcriptional regulation and may play a role in tooth formation (By similarity) |
| 細胞定位 | ZNF22 的細胞內定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTTCCGGCGGCGCGGGAGGCGCCCAGCGAGCCAGAGTGG40TGGCTGGTCCCGCGCGAAAATTCTGAGCTGTACACCTCTA80GGAAATGAAACACTAGTTCAGAAGAAGCCTGTAAACTCTC120TTACAAATACATTTGGTTATTCACCATGAGGTTAGCAAAG160CCTAAAGCGGGTATTTCTCGGAGCTCAAGCCAAGGAAAGG200CCTATGAGAACAAGCGCAAAACAGGCCGGCAGCGGCAGAA240GTGGGGCATGACTATTCGATTTGACTCAAGCTTCAGTAGA280CTCAGAAGAAGCTTGGATGACAAACCCTATAAATGTACTG320AATGTGAAAAGAGTTTCAGTCAGAGTTCAACTCTTTTTCA360ACACCAGAAGATCCATACTGGAAAGAAATCCCATAAATGT400GCTGATTGTGGGAAAAGTTTCTTTCAGAGTTCTAATCTCA440TTCAGCATCGACGGATCCATACGGGGGAAAAGCCCTACAA480ATGTGATGAGTGTGGAGAAAGCTTCAAACAGAGCTCAAAT520CTCATTCAGCACCAGAGAATTCATACTGGAGAAAAACCCT560ATCAGTGTGATGAGTGTGGCCGGTGTTTCAGCCAGAGCTC600CCACCTTATTCAACATCAGAGAACCCACACTGGGGAGAAA640CCCTACCAGTGCAGTGAATGTGGCAAATGTTTCAGTCAGA680GCTCTCATCTGAGGCAGCACATGAAGGTGCATAAAGAAGA720GAAGCCTCGTAAAACCCGGGGCAAAAATATCAGGGTGAAG760ACTCACTTACCCTCTTGGAAAGCTGGTACAGGAAGGAAGT800CTGTGGCTGGTCTCCGTTAAGTATAGGGCTTTTTGACAGC840TTTTTGAGACCTCTTAAGAAAAAATAAAAAGTAAAAAATG880AAAGGAATCTTTTTTAGAAATAGAGATGCTTTATAGTAGA920TCACTTAAATACTGGATCTTTTGCTAGTGTGAAAACATTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。