基因總覽
ZNF219 的正式名稱為 zinc finger protein 219，屬於蛋白質編碼基因；其產物歸於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。此蛋白質具有多個 C2H2-type zinc finger 結構，來源註解共列出九個，分布於蛋白質序列不同區段。這些特徵與其作為轉錄調節因子的基本性質相符。來源也指出，ZNF219 可與 SOX9 一同參與 COL2A1 表現調控；相關作用依序列相似性推定。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000360947 ★ | 21,090,077–21,098,655 | 5 |
| ENST00000451119 | 21,089,468–21,104,722 | 5 |
| ENST00000421093 | 21,089,468–21,099,014 | 5 |
| ENST00000878251 | 21,089,468–21,104,722 | 6 |
| ENST00000878252 | 21,089,468–21,104,722 | 6 |
| ENST00000878253 | 21,089,468–21,103,615 | 5 |
| ENST00000878254 | 21,089,468–21,101,015 | 5 |
| ENST00000878255 | 21,089,468–21,101,015 | 6 |
| ENST00000878256 | 21,089,468–21,099,014 | 5 |
| ENST00000878257 | 21,089,468–21,098,421 | 5 |
| ENST00000878258 | 21,089,468–21,094,543 | 5 |
| ENST00000918830 | 21,089,468–21,104,722 | 6 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF219 是轉錄調節因子，能辨識並結合 DNA 上的核心序列基序 5'-GGGGG-3'；來源指出其可結合兩份此基序。這項序列辨識能力與其調節基因轉錄的角色相關，但不同標的基因上的調控方向並不相同。
在 HMGN1 的調控中，ZNF219 會結合 HMGN1 啟動子，並可能抑制 HMGN1 的表現。此項抑制作用以「可能」描述，來源並未將其表述為確定結果。另一項研究指出，ZNF219 會在原代皮質神經元中調節 SNCA 的表現；來源未提供調節方向或更具體的分子步驟，因此不宜推定其作用方式。
依序列相似性推定，ZNF219 可與 SOX9 形成複合體，結合 COL2A1 啟動子並活化 COL2A1 表現。來源也指出，ZNF219 參與軟骨細胞分化；這些與 COL2A1 及軟骨細胞相關的功能同樣標示為依序列相似性推定，應保留其推論性質。
因此，來源支持的功能涵蓋不同細胞情境中的轉錄調節，包括對 HMGN1 表現可能具有抑制作用、在原代皮質神經元中調節 SNCA，以及依序列相似性推定的 SOX9 協同作用。這些資料呈現了 ZNF219 可能參與多種基因調控的面向，但未提供足以將各作用統整為單一調控方向或共同機制的資訊。
Promoter 與基因調控
>ZNF219 ENST00000360947 GRCh38 chr14:21098555-21099655 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTATTTCTTGTTGTTGACGATAAGAGGAGACTGCGCCAGAAGACTCTAGAAGTTAGTACGAGGAGGGAGG CAGGGTCCTGGGAGGCAAGTGATCTTTTGTAAGCCACTCCTGCCCCATCAGTGCTGTGCCAACATCGGCG GGTCATTGTATCTACTCTTTTCTTTCCCGGGGAGTGGGAGTCACGTTTTAAAGAGATCCAGAAAACTGCT GTGTGTCTACTCCTCCTCAATTCCCACGTGCATTGATTTTATTTGGTGGCGATGTGAGATGTTGGGCTTG CACTGAGGATCCCCGAGCCTGCAGGCCACTGGGGAAACAGACTTCCTGAAGCCTCATTTTTCTTACTTGT AAATGGGGGCTAATTTAATTATAGAGGGTTATTGGAAAGATTATATACTATTAGATAGGTGAACAGGCAT TCAGTAAATATTGACTAAATCTGAGTATACTACTTACCAGTTTGTAGTCTAGACTACAATCGCCTGGAAG GAAGGTACCACTTCTTTCTCATCCCTCACAGCGCTGAGCCCAGTGCCTGGCACTTAGTAAGCACTCAGTA AATATTTGTTGTATTGAAGAGCCATTAAAGTGACTTGAGGAATGGAAAATAGAATTCGAGAGGAAGGCGC AGGAATTGTTTATCAAGAACGGAAAGGACCGAAGAGTAACTTTAATAATGTTTCTTATACGGCCGACATT AACTATCTCTATAATCGCCCCTCCTCCTCCCCCAAAAGAGAGACAGAAATTGTAAGGGAGAGGCTTTGAG ATAAAACCCCAGGAAGAACTTCCCGAGTCTGTGCATGTTGGGGCAGAAAGAGCGGCAGAGCCAACTCCTT CCCTGGTATGTCCGGGTTTAGGGAGGGAGGGGCAGTGCTGCTTGGAGGCTGGGGGAAGGACGAGATGACC TTTCAAAATCTCTTCCAGTCTCCTGTTGGAATCCTCTGTGCGCCCCACCCCCGCTCCCTCCCTTCCTCCC TCCCTCCGACAGCGCCCCCCGTCTCCAAACCGCCCGCACCCCGCCCCTGGCGGCCGCCTCTCGCGGCTCC CGGGGTCCCCAGCTCCCTGTCCCCGGAGCCAGAGCCCGGCTCCCGCGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF219_1 ↗ | 14:21,098,649 | 負股 | 21,098,639–21,098,698 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_B672S · enhancer · 21093864–21094830 · regulatory
ENSR14_56XXX6 · CTCF_binding_site · 21093934–21093955 · regulatory
ENSR14_B6733 · enhancer · 21095522–21096118 · regulatory
ENSR14_C44J6 · enhancer · 21096944–21098644 · regulatory
ENSR14_56XZHN · CTCF_binding_site · 21097289–21097310 · regulatory
ENSR14_9BD4Z · promoter · 21098645–21098947 · regulatory
ENSR14_9BD54 · promoter · 21099004–21099504 · regulatory
ENSR14_8LQ9X · enhancer · 21102101–21102348 · regulatory
ENSR14_B6747 · promoter · 21103240–21104035 · regulatory
· motif · 21093936–21093952 · motif
· motif · 21094272–21094282 · motif
· motif · 21094288–21094298 · motif
· motif · 21094328–21094338 · motif
· motif · 21094331–21094341 · motif
· motif · 21094569–21094579 · motif
· motif · 21097291–21097307 · motif
· motif · 21098171–21098184 · motif
· motif · 21098177–21098190 · motif
· motif · 21098248–21098261 · motif
· motif · 21098254–21098267 · motif
· motif · 21098322–21098335 · motif
· motif · 21098337–21098350 · motif
· motif · 21098352–21098365 · motif
· motif · 21098433–21098446 · motif
· motif · 21098445–21098458 · motif
· motif · 21098451–21098464 · motif
· motif · 21098470–21098483 · motif
· motif · 21102710–21102721 · motif
· motif · 21103615–21103628 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：722 aa
ZNF219 蛋白質長 722 個胺基酸，屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。序列註解列出九個 C2H2-type zinc finger，分布於不同位置；另有多段區域註解為無序區，包括 N 端及蛋白質中段與末端的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF219 的細胞內定位為細胞核。 來源未提供定位隨條件改變、不同異構型之間差異或定位動態的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- AP1M1Q9BXS5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATOSBQ7L5A3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DR1Q01658 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRIPAP1Q4V328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO1P25800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM41Q8WV44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTC32Q5I0X7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBASH3AP57075-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZNF219 與 SOX9 有交互作用，涉及 ZNF219 的 C 端。另有依序列相似性推定的資料指出，ZNF219 可與 SOX9 共同形成複合體並參與 COL2A1 啟動子調控；此複合體與啟動子作用屬功能描述，不能據此額外推定其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF219 是轉錄調節因子，可辨識並結合兩份 5'-GGGGG-3' 核心 DNA 基序；它結合 HMGN1 啟動子並可能抑制其表現，也會在原代皮質神經元中調節 SNCA 表現。依序列相似性推定，ZNF219 與 SOX9 形成複合體，結合 COL2A1 啟動子並活化其表現，且參與軟骨細胞分化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional regulator. Recognizes and binds 2 copies of the core DNA sequence motif 5'-GGGGG-3'. Binds to the HMGN1 promoter and may repress HMGN1 expression. Regulates SNCA expression in primary cortical neurons. Binds to the COL2A1 promoter and activates COL2A1 expression, as part of a complex with SOX9 (By similarity). Plays a role in chondrocyte differentiation (By similarity) PMID 14621294 ↗ · PMID 19549071 ↗ |
| 交互作用 | ZNF219 與 SOX9 有交互作用；此交互作用涉及 ZNF219 的 C 端。來源未在這項敘述中提供其他結合夥伴、實驗條件或交互作用造成的功能結果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | ZNF219 的細胞內定位為細胞核。這筆定位資料未描述特定處理條件、異構型差異或定位變化，因此僅支持其位於細胞核的敘述。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTCTCCAAACCGCCCGCACCCCGCCCCTGGCGGCCGCCTC40TCGCGGCTCCCGGGGTCCCCAGCTCCCTGTCCCCGGAGCC80AGAGCCCGGCTCCCGCGCGGCTCCCAGCCCCGCCGCGCCG120CCCCCCGCATGCTAATGGCCGGGCCGCCTCCCGCCGCACA160CAATGCGGGCCAGGGCCGGGGGCGGGGGACCGGGGAGGGG200GCGGGGGCCGGGCCGGGGGCGGGGGGGCCGGGGCCCGGCG240CATCTCCCCCGGCCCCACGTAACGCTGACGCCCGCGCCGC280CGGCCCGCCGCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCCGC320TCCGCCGCCGCCCGCCCGGGGCTCCTCCACAGCACCTGTT360GCCTTCATTAGCAGCTTTTCCTCCTCTTCCCTGCACTTCC400CAGAACCAAAGAATGTGAAGGGGGTCCATGGAGGGCTCAC440GTCCCCGCGCCCCGAGCGGCCACTTAGCGCCGTCGCCGCC480GGCTTTCGACGGCGAGCTGGATCTGCAGCGATACTCCAAC520GGGCCAGCCGTGAGCGCAGGGTCGCTCGGGATGGGAGCGG560TGAGCTGGTCTGAGAGTCGTGCAGGCGAACGGCGCTTCCC600CTGCCCTGTATGCGGGAAGCGCTTCCGCTTCAACTCTATC640CTTGCTTTGCACCTGCGGGCGCACCCAGGAGCCCAGGCCT680TCCAGTGCCCTCACTGCGGCCACCGCGCGGCGCAGCGGGC720TCTGCTGCGCTCGCACCTGCGCACACACCAGCCCGAGCGC760CCACGTAGTCCTGCTGCACGCCTGTTGCTGGAGTTGGAAG800AGCGCGCGCTACTACGCGAGGCCCGACTGGGGAGAGCCCG840AAGCTCAGGGGGCATGCAGGCCACCCCTGCCACTGAGGGT880CTGGCGCGGCCCCAGGCTCCTTCATCGTCCGCCTTCCGTT920GCCCCTACTGCAAAGGCAAGTTTCGCACCTCGGCGGAGCG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。