演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF217ZABC1

zinc finger protein 217

ZNF217 是 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族的蛋白質,可結合目標基因啟動子並參與轉錄抑制,也與促進細胞增殖及抑制細胞死亡相關。

Homo sapiens20q13.2UniProt O75362
OFFICIAL SYMBOL
ZNF217
CHROMOSOME
20
UNIPROT
O75362
PDB / ALPHAFOLD
3UK3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF217(zinc finger protein 217)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其蛋白質長 1,048 個胺基酸,具有多個 C2H2 型鋅指結構域,並包含數段預測為無序的區域。這些結構特徵構成 ZNF217 的基本分子特性;來源另指出它可參與目標基因的轉錄調控,以及與細胞增殖和細胞死亡相關的生物學作用。

Official symbol
ZNF217
Gene name
zinc finger protein 217
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13009
UniProt
O75362
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZABC1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q13.2
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegZNF217pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr20:53,567,071–53,609,907
Gene span
42,837 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000371471 ★53,567,071–53,593,8396
ENST0000030234253,567,071–53,583,0975
ENST0000113282053,567,071–53,594,0296
ENST0000043722253,568,820–53,576,0272
ENST0000043168753,582,542–53,608,8923

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF217 可結合目標基因的啟動子,並以轉錄抑制因子的方式作用。也就是說,它能在目標基因啟動子處參與調控,降低相關基因的轉錄活性;來源未列出具體目標基因,也未說明此作用所涉及的完整分子步驟,因此不宜延伸推定其調控範圍或機制細節。

在細胞層級,ZNF217 被指出可促進細胞增殖,並拮抗細胞死亡。這些描述反映其功能與細胞數量維持及存活相關過程相連,但來源沒有提供特定細胞類型、實驗條件或細胞死亡途徑,故無法據此進一步限定作用情境。

另一項具體作用是促進 AKT1 在 Ser-473 位點的磷酸化。這項結果將 ZNF217 與 AKT1 的特定位點修飾連結起來;來源未說明磷酸化增加是直接或間接造成,也未提供其上下游步驟,因此只能表述為 ZNF217 促進該位點磷酸化。綜合而言,來源支持 ZNF217 兼具啟動子相關的轉錄抑制作用,以及與細胞增殖、抗細胞死亡和 AKT1 Ser-473 磷酸化相關的功能;各作用之間的因果關係與先後順序則未被交代。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 53593839 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF217 ENST00000371471 GRCh38 chr20:53593739-53594839 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAATCTTTGGTGTTTTTCGCGCACAGCTGCCTTCTAACCCGCGAGCAACGGCGTTAAGGTTTTTGTTTG
TAATTCGGGGTGACCCAGGGGTTCGGGCCGCGGGCCCCTCCCCTCGCCCGCGCACACCTTGCAGAGGAGG
GGGCGGCGGGGACAGGGCCGGATCTGCGCCTGCGCACACCCTCGCGGCCCCCTCCCTCCGGCCTCCCCGG
GTACCTGTCACGGCTACCGCCGCGGCGCGCGCCCGCCACGTTAAGCCGGATGGCGGGAGGAGGGGTGCGG
GGCGGGGGGCGCGGGGAGGGTGGCACGGCGCGCGCGTGCGCGGGAGTCGCCGAGCGAGAACTGGGAGTGC
GCGCGCTCGCCGCTCGCTCCCGTCCCGGAGGCGGAGTCGGCGGCGGGGGGCGGAGCAGGGGCGCGCCTAT
GCTAGTCACGTGGGCGCTGGGGCGGGGCCGGGGCGGTGTGGGGCGTGGCCGGGCGGCCGGTGAAGGCAGG
GGGCGGGGCGGCCGGTGAAGGCAGGGGGCGGGGCGTCTCCGAGCGGCGGGGCCGAGGGAGGGCGCAACAG
CTGCTCCCTGAACACTTTCTGACCCAACAGTCCCCCAGCGCCGGACGCGCCGCGCCCCGGCGGCTCTAGG
GACCCCCCGCGCCTGCACTGTCCCCGCGCGGACGAGTAGGGGGCGCCCGCGCCTTTGCCCCCGTGCGCAC
CCCCGCCCCGCTCACCTTAGCCCCGCGCCCGAGGTGAGCCCGGCCCCTATATTCTCCGGGCGGGGGTGGG
GGTGGGGGACGCTCCTTTTTTGTTGGGGGGGGGTCTTGGAGGCGCGAAGGCACTAGGCTCCTCGGCGGAT
GGCTGCACCCCTCGCCCGCGGCTCCCCGTGTCTTTTGGGGGGCCGGGTGCGGGCGCGGAATCCGGGAGGT
GTCCGCACAAAAGGCTGAGAGAAACTCCGCGACGCCTCCCTCCCTCCCTCCGCCCTCCCCGCCCCCTCCC
CTCCGCGCCCGCTCCTCCTCATTCAAACCCGGCCGGCCCGAGTGGTGTCAGCTCAGTCCCGGCCGCCGCC
GCGCGAGGAAATGGCCGAGGAGCCGGAGCCGCAGGTAAAGGGGGCGCGCCC
ZNF217 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF217_2 ↗20:53,583,167負股53,583,157–53,583,216
ZNF217_1 ↗20:53,611,629負股53,611,619–53,611,678

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR20_9R9CJ · promoter · 53593829–53594329 · regulatory

ENSR20_7564FG · CTCF_binding_site · 53594282–53594362 · regulatory

ENSR20_D4MRL · enhancer · 53598204–53600251 · regulatory

· motif · 53589040–53589054 · motif

· motif · 53589400–53589414 · motif

· motif · 53589405–53589414 · motif

· motif · 53589516–53589527 · motif

· motif · 53589604–53589618 · motif

· motif · 53589703–53589714 · motif

· motif · 53589887–53589899 · motif

· motif · 53590425–53590439 · motif

· motif · 53590941–53590952 · motif

· motif · 53591067–53591082 · motif

· motif · 53591094–53591107 · motif

· motif · 53591198–53591211 · motif

· motif · 53591231–53591243 · motif

· motif · 53591347–53591358 · motif

· motif · 53591347–53591358 · motif

· motif · 53591347–53591361 · motif

· motif · 53591876–53591890 · motif

· motif · 53592920–53592934 · motif

· motif · 53593560–53593574 · motif

· motif · 53593636–53593643 · motif

· motif · 53594070–53594083 · motif

· motif · 53594131–53594144 · motif

· motif · 53594284–53594300 · motif

· motif · 53594318–53594334 · motif

· motif · 53594343–53594359 · motif

· motif · 53594406–53594415 · motif

· motif · 53594406–53594415 · motif

· motif · 53594518–53594529 · motif

· motif · 53594518–53594529 · motif

· motif · 53594522–53594533 · motif

· motif · 53594664–53594675 · motif

· motif · 53594664–53594675 · motif

· motif · 53595936–53595949 · motif

· motif · 53598034–53598048 · motif

· motif · 53598039–53598048 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1048 aa

1 aa1048 aa功能區域鋅指
依 O75362 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF217 蛋白質長 1,048 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。序列註解列出七個 C2H2 型鋅指,分布於胺基酸 65–238 及 375–521 的多個區段;另有數段區域被註記為無序,包括胺基酸 242–262、315–375、395–457、644–670 與 772–883。

鋅指C2H2-type 165–88 aa
鋅指C2H2-type 2128–150 aa
鋅指C2H2-type 3156–178 aa
鋅指C2H2-type 4216–238 aa
鋅指C2H2-type 5375–397 aa
鋅指C2H2-type 6471–493 aa
鋅指C2H2-type 7499–521 aa
功能區域Disordered242–262 aa
功能區域Disordered315–375 aa
功能區域Disordered395–457 aa
功能區域Disordered644–670 aa
功能區域Disordered772–883 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3UK3…

PDB · 3UK3

X-ray · 2.10 A · C/D=469-523

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF217 的細胞定位為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZABC1ZNF217
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZNF217 是一種含 HDAC2、KDM1A、CTBP1 與 ZNF217 的組蛋白去乙醯酶複合體成員。它也可能是 BHC 組蛋白去乙醯酶複合體的成員;此複合體包含 HDAC1、HDAC2、HMG20B/BRAF35、KDM1A、RCOR1/CoREST、PHF21A/BHC80、ZMYM2、ZNF217、ZMYM3、GSE1 與 GTF2I。此外,ZNF217 與 CTBP1 及 CTBP2 有交互作用;來源未進一步說明這些交互作用的性質。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF217 可結合目標基因的啟動子並發揮轉錄抑制作用;此外,它與促進細胞增殖、拮抗細胞死亡相關,並可促進 AKT1 在 Ser-473 位點的磷酸化。來源未進一步說明這些作用的細胞情境或分子步驟。含實驗來源
證據與來源

Binds to the promoters of target genes and functions as repressor. Promotes cell proliferation and antagonizes cell death. Promotes phosphorylation of AKT1 at 'Ser-473'

PMID 16203743 ↗ · PMID 16940172 ↗ · PMID 17259635 ↗ · PMID 18625718 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZNF217 是含 HDAC2、KDM1A 與 CTBP1 的組蛋白去乙醯酶複合體成員;它也可能屬於包含 HDAC1、HDAC2、HMG20B/BRAF35、KDM1A、RCOR1/CoREST、PHF21A/BHC80、ZMYM2、ZNF217、ZMYM3、GSE1 與 GTF2I 的 BHC 組蛋白去乙醯酶複合體。此外,ZNF217 與 CTBP1、CTBP2 交互作用。含實驗來源
證據與來源

Component of a histone deacetylase complex that contains HDAC2, KDM1A, CTBP1 and ZNF217. May be a component of a BHC histone deacetylase complex that contains HDAC1, HDAC2, HMG20B/BRAF35, KDM1A, RCOR1/CoREST, PHF21A/BHC80, ZMYM2, ZNF217, ZMYM3, GSE1 and GTF2I. Interacts with CTBP1 and CTBP2

PMID 12493763 ↗ · PMID 16940172 ↗ · PMID 18625718 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF217 位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000371471 · 5,790 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTCAAACCCGGCCGGCCCGAGTGGTGTCAGCTCAGTCCC40
41GGCCGCCGCCGCGCGAGGAAATGGCCGAGGAGCCGGAGCC80
81GCAGGGTTTGGAAATCCCTTGTCTCCAGGTTGCTGGGATT120
121GACTTCTTGCTCAATTGAAACACTCATTCAATGGAGACAA160
161AGAGAACTAATGCTTTGTGCTGATTCATATTTGAATCGAG200
201GCATTGGGAACCCTGTATGCCTTGTTTGTGGAAAGAACCA240
241GTGACACCATCACTGAGCTTCCTAAAAGTTCGAAGAAGTT280
281AGAGGACTATACACTTTCTTTTGAACTTTTATAATAAATA320
321TTTGCTCTGGTTTTTGGAACCCAGGGCTGTTAGAGGGGTG360
361AGTGACAAGTCTTACAAGTGGCCTTATTCCAACTCCAGAA400
401ATTGCCCAACGGAACTTTGAGATTATATGCAATCGAAAGT440
441GACAGGAAACATGCCAACTCAATCCCTCTTAATGTACATG480
481GATGGGCCAGAAGTGATTGGCAGCTCTCTTGGCAGTCCGA520
521TGGAGATGGAGGATGCCTTGTCAATGAAAGGGACCGCTGT560
561TGTTCCATTCCGAGCTACACAAGAAAAAAATGTCATCCAA600
601ATCGAGGGGTATATGCCCTTGGATTGCATGTTCTGCAGCC640
641AGACCTTCACACATTCAGAAGACCTTAATAAACATGTCTT680
681AATGCAACACCGGCCTACCCTCTGTGAACCAGCAGTTCTT720
721CGGGTTGAAGCAGAGTATCTCAGTCCGCTTGATAAAAGTC760
761AAGTGCGAACAGAACCTCCCAAGGAAAAGAATTGCAAGGA800
801AAATGAATTTAGCTGTGAGGTATGTGGGCAGACATTTAGA840
841GTCGCTTTTGATGTTGAGATCCACATGAGAACACACAAAG880
881ATTCTTTCACTTACGGGTGTAACATGTGCGGAAGAAGATT920
921CAAGGAGCCTTGGTTTCTTAAAAATCACATGCGGACACAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。