基因總覽
ZNF215 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2 型 zinc finger,呈現此蛋白質的結構組成。現有功能註解指出,它可能參與轉錄調控;此描述保留「可能」的限定,並未進一步確定其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000278319 ★ | 6,926,426–6,958,047 | 7 |
| ENST00000414517 | 6,926,343–6,957,848 | 6 |
| ENST00000864178 | 6,926,343–6,957,838 | 7 |
| ENST00000864179 | 6,926,343–6,957,838 | 7 |
| ENST00000984183 | 6,926,343–6,956,543 | 6 |
| ENST00001107798 | 6,926,343–6,959,692 | 5 |
| ENST00000864177 | 6,926,373–6,957,838 | 7 |
| ENST00000610573 | 6,926,423–6,984,238 | 8 |
| ENST00000921286 | 6,926,425–6,958,047 | 6 |
| ENST00000921288 | 6,926,425–6,958,044 | 6 |
| ENST00000921289 | 6,926,425–6,957,840 | 7 |
| ENST00000921290 | 6,926,425–6,957,845 | 6 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF215 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述將其與基因轉錄活動的調節相連,但來源未說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞類型或生理條件。因此,不能據此把它描述成具有特定方向或特定靶點的轉錄調節因子。
現有資料亦未提供 ZNF215 如何影響轉錄的分子細節,例如是否直接辨識特定 DNA 序列、是否藉由其他分子間接作用,或其結構區域各自承擔何種調節功能。雖然蛋白質包含 SCAN box、KRAB 區域與 C2H2 型 zinc finger,這些結構資訊本身不足以確定它們在 ZNF215 中的實際作用,也不能補足尚未提供的機制證據。
因此,對 ZNF215 的功能理解應限於「可能參與轉錄調控」這一層級。現有註解沒有交代其調控發生的條件、涉及的生物學過程或下游結果,亦未指出相關功能的實驗情境。這項功能描述具有不確定性,不能延伸解讀為已證實的作用或特定生物學效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF215 ENST00000278319 GRCh38 chr11:6925426-6926526 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAGAGGGTAATAACAGGGAAAACTAGTTGTGGAGTAGAAGGTAACTCTGTATATTACCTTCTCAATTTTT CCAAAACTGTAAATCCAAAACTGCTCTAAAAAATAAGGTCTATTTAAAAAGAAATAAAAGAAACTATATG GTGTGTCCTTGTTTTTTTGTGTCACTAGCTGTTCAAAGTTGCCATCTTGTTTTACCTTAGTCCACTCCTG GCCTAGATATAAAGCTCTCTCTGGTTTAAGTTCTTTCACTCTGCTCCTACAGCACTGTCCACATGCCTCT AGGCAAGCACTAATCATATTATCATGTACTTAATGCCACCAAGCATTCTCTCCTTTGTGACACACACATC CCTTCCCTCTGTGTCTCCACACCCACCAGATTTCCTCCTACCTCTCAGGCTGATCCTCCTCTCTCTTTTT TGCAGGTCCGCCTTCCTGACTCAACCAATGGTGTTGGTGTTCCCTGGGCCAATTCCAGCCCATTTCCTTC TATTTTCTCTCTTCCTCTCTGTCCCTTTCTCTGCAGTCCTATTCCAATGGATAGCATCAATCACCATCTA CCCAGATTGACCCAAATTTTACAGGTCTAGCCCCAGACATCTCTAAATTCCCAAATGCCTACATCCAAAT GCCTAATTGACAATGCTTCTCAGATGCCACAAAGTACCTCAGTCTTAACAAGCCAAAACTGAACAACGAA CTGCAAGCCCTCTCACTTCCATACAAAACTGAATGAATGAATCTGTGAACCAATAAACCAATAAAGACCA TGTAAGAGACAATGTCTTGTCGAAATTGTCATTGTTTTTTGATTCCAGACAAATGGGGTGTGGGGAACAG AAAGGCGATTTGGACTAGTTTCCCCGGACGGGATGAGGCAGCGCCGGAAGTATGACGCTCATTTCTTTAA GCCACTAGAAGCTCACCGTGAGTCCATTCACAGGGCCAGAGTTCCAAGTGTGCGGCGTGGGCGGGGCCTG CAGAAAGGGACGGGGCCTGCAGAAAGGGACGGGGCTGGCAAAGGCCTGGTCTACCTCACCGATCCGGGTC GCGGGGGCTCCTAGGGGGTTCCTTCCACAGCTGGTGCGCGTGCGCAAGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF215_1 ↗ | 11:6,926,426 | 正股 | 6,926,377–6,926,436 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_53LZD4 · CTCF_binding_site · 6924753–6924774 · regulatory
ENSR11_B3D53 · promoter · 6925933–6926532 · regulatory
ENSR11_94Q88 · enhancer · 6926533–6926867 · regulatory
ENSR11_53LZPG · CTCF_binding_site · 6926778–6926799 · regulatory
ENSR11_94Q8D · promoter · 6926868–6927368 · regulatory
ENSR11_53LZQ8 · CTCF_binding_site · 6926945–6926966 · regulatory
· motif · 6924755–6924771 · motif
· motif · 6926460–6926476 · motif
· motif · 6926510–6926521 · motif
· motif · 6926510–6926521 · motif
· motif · 6926780–6926796 · motif
· motif · 6926791–6926807 · motif
· motif · 6926947–6926963 · motif
· motif · 6927334–6927347 · motif
· motif · 6927690–6927705 · motif
· motif · 6927695–6927707 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:517 aa
zinc finger protein 215 長 517 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其註解結構包括位於第 48–126 個胺基酸的 SCAN box、第 164–237 個胺基酸的 KRAB 區域,以及四個 C2H2 型 zinc finger,分別位於第 379–401、407–429、462–484 與 490–512 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAAAGGGACGGGGCTGGCAAAGGCCTGGTCTACCTCACC40GATCCGGGTCGCGGGGGCTCCTAGGGGGTTCCTTCCACAG80CTGGTGCGCGTGCGCAAGAGTGCGTCGAGGTTGTTCCGCG120GCAATTTATGAAACTCGGAGCCGGCAGTGAGTTGAGGGTT160CGGCGAGGTCAGGGATTCCTAGTTGCAGCGTGATTACCAA200CGCCAGCTCCCTTCACTGTCCAAGACAGCGATTCCGCGGC240TCCTCTGAGAACTGGCGCTTTGTTCATCATTTGCCACTTA280AGCTACTTGCAGTCACGTCACACCTTGGATCTCTATCATC320AAAACTATTCCACCTCGGAAATCTTACCTAAATGCAGCAT360GCCATCCTGAACGTCTCTCCCTGTCCTAGCTCTGTAACTG400TTTACATTGCTCAGGTACCTGAATATTGGCTTTGTGTCTA440AAGTTTCTGGAACTTTCCTCCTTACCGTGAAATAACTTGG480CTTAAATCACACTGCATATAGTACACAGGTGCTTAGCTCA520AGCCTGAGAATTACTGCAATCTAGTAAGGCGGATTTGAAC560TACTGTGGGAGTTCTATTTAGGAAGATGCAGCCTCTGAGC600AAGTTGATGGCTATCTCAAAACCTCGAAACCTGTCTCTAC640GTGAACAAAGAGAGGTTCTGAGAGCAGATATGTCTTGGCA680GCAGGAAACCAACCCCGTCGTGGAGACACATGACTCTGAG720GCATCTCGTCAAAAGTTCAGACATTTCCAGTATTTGAAAG760TGTCTGGGCCCCATGAAGCCCTGAGCCAACTCTGGGAGCT800CTGTCTTCAATGGCTGAGACCAGAGATTCATACAAAGAAG840CAGATTATAGAACTGTTGGTGCTGGAACAATTCCTGGCAA880TCCTGCCTGAAGAAGTCAGGACTTGGGTGAATTTACAACA920TCCAAACAACAGTAAAGATATGGTGACCCTCATAGAAGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。