演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF215ZKSCAN11

zinc finger protein 215

ZNF215(zinc finger protein 215)是 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens11p15.4UniProt Q9UL58
OFFICIAL SYMBOL
ZNF215
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q9UL58
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF215 是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列包含 SCAN box、KRAB 區域及多個 C2H2 型 zinc finger,呈現此蛋白質的結構組成。現有功能註解指出,它可能參與轉錄調控;此描述保留「可能」的限定,並未進一步確定其調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF215
Gene name
zinc finger protein 215
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13007
UniProt
Q9UL58
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZKSCAN11ZSCAN43

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p15.4
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegZNF215pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:6,926,343–7,001,004
Gene span
74,662 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000278319 ★6,926,426–6,958,0477
ENST000004145176,926,343–6,957,8486
ENST000008641786,926,343–6,957,8387
ENST000008641796,926,343–6,957,8387
ENST000009841836,926,343–6,956,5436
ENST000011077986,926,343–6,959,6925
ENST000008641776,926,373–6,957,8387
ENST000006105736,926,423–6,984,2388
ENST000009212866,926,425–6,958,0476
ENST000009212886,926,425–6,958,0446
ENST000009212896,926,425–6,957,8407
ENST000009212906,926,425–6,957,8456

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF215 的功能註解指出,它可能參與轉錄調控。這項描述將其與基因轉錄活動的調節相連,但來源未說明它促進或抑制轉錄,也未指出受調控的基因、細胞類型或生理條件。因此,不能據此把它描述成具有特定方向或特定靶點的轉錄調節因子。

現有資料亦未提供 ZNF215 如何影響轉錄的分子細節,例如是否直接辨識特定 DNA 序列、是否藉由其他分子間接作用,或其結構區域各自承擔何種調節功能。雖然蛋白質包含 SCAN box、KRAB 區域與 C2H2 型 zinc finger,這些結構資訊本身不足以確定它們在 ZNF215 中的實際作用,也不能補足尚未提供的機制證據。

因此,對 ZNF215 的功能理解應限於「可能參與轉錄調控」這一層級。現有註解沒有交代其調控發生的條件、涉及的生物學過程或下游結果,亦未指出相關功能的實驗情境。這項功能描述具有不確定性,不能延伸解讀為已證實的作用或特定生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6926426 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF215 ENST00000278319 GRCh38 chr11:6925426-6926526 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGAGGGTAATAACAGGGAAAACTAGTTGTGGAGTAGAAGGTAACTCTGTATATTACCTTCTCAATTTTT
CCAAAACTGTAAATCCAAAACTGCTCTAAAAAATAAGGTCTATTTAAAAAGAAATAAAAGAAACTATATG
GTGTGTCCTTGTTTTTTTGTGTCACTAGCTGTTCAAAGTTGCCATCTTGTTTTACCTTAGTCCACTCCTG
GCCTAGATATAAAGCTCTCTCTGGTTTAAGTTCTTTCACTCTGCTCCTACAGCACTGTCCACATGCCTCT
AGGCAAGCACTAATCATATTATCATGTACTTAATGCCACCAAGCATTCTCTCCTTTGTGACACACACATC
CCTTCCCTCTGTGTCTCCACACCCACCAGATTTCCTCCTACCTCTCAGGCTGATCCTCCTCTCTCTTTTT
TGCAGGTCCGCCTTCCTGACTCAACCAATGGTGTTGGTGTTCCCTGGGCCAATTCCAGCCCATTTCCTTC
TATTTTCTCTCTTCCTCTCTGTCCCTTTCTCTGCAGTCCTATTCCAATGGATAGCATCAATCACCATCTA
CCCAGATTGACCCAAATTTTACAGGTCTAGCCCCAGACATCTCTAAATTCCCAAATGCCTACATCCAAAT
GCCTAATTGACAATGCTTCTCAGATGCCACAAAGTACCTCAGTCTTAACAAGCCAAAACTGAACAACGAA
CTGCAAGCCCTCTCACTTCCATACAAAACTGAATGAATGAATCTGTGAACCAATAAACCAATAAAGACCA
TGTAAGAGACAATGTCTTGTCGAAATTGTCATTGTTTTTTGATTCCAGACAAATGGGGTGTGGGGAACAG
AAAGGCGATTTGGACTAGTTTCCCCGGACGGGATGAGGCAGCGCCGGAAGTATGACGCTCATTTCTTTAA
GCCACTAGAAGCTCACCGTGAGTCCATTCACAGGGCCAGAGTTCCAAGTGTGCGGCGTGGGCGGGGCCTG
CAGAAAGGGACGGGGCCTGCAGAAAGGGACGGGGCTGGCAAAGGCCTGGTCTACCTCACCGATCCGGGTC
GCGGGGGCTCCTAGGGGGTTCCTTCCACAGCTGGTGCGCGTGCGCAAGAGT
ZNF215 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF215_1 ↗11:6,926,426正股6,926,377–6,926,436

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_53LZD4 · CTCF_binding_site · 6924753–6924774 · regulatory

ENSR11_B3D53 · promoter · 6925933–6926532 · regulatory

ENSR11_94Q88 · enhancer · 6926533–6926867 · regulatory

ENSR11_53LZPG · CTCF_binding_site · 6926778–6926799 · regulatory

ENSR11_94Q8D · promoter · 6926868–6927368 · regulatory

ENSR11_53LZQ8 · CTCF_binding_site · 6926945–6926966 · regulatory

· motif · 6924755–6924771 · motif

· motif · 6926460–6926476 · motif

· motif · 6926510–6926521 · motif

· motif · 6926510–6926521 · motif

· motif · 6926780–6926796 · motif

· motif · 6926791–6926807 · motif

· motif · 6926947–6926963 · motif

· motif · 6927334–6927347 · motif

· motif · 6927690–6927705 · motif

· motif · 6927695–6927707 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:517 aa

1 aa517 aa結構域鋅指
依 Q9UL58 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

zinc finger protein 215 長 517 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其註解結構包括位於第 48–126 個胺基酸的 SCAN box、第 164–237 個胺基酸的 KRAB 區域,以及四個 C2H2 型 zinc finger,分別位於第 379–401、407–429、462–484 與 490–512 個胺基酸。

結構域SCAN box48–126 aa
結構域KRAB164–237 aa
鋅指C2H2-type 1379–401 aa
鋅指C2H2-type 2407–429 aa
鋅指C2H2-type 3462–484 aa
鋅指C2H2-type 4490–512 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UL58…

AlphaFold · Q9UL58

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

現有資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZKSCAN11ZNF215
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF215 可能參與轉錄調控;此註解未指出調控方向、靶點或作用條件,因此不能據此確定其具體調控機制。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF215 定位於細胞核;此定位註解未提供條件或異構型差異。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000278319 · 3,655 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAAAGGGACGGGGCTGGCAAAGGCCTGGTCTACCTCACC40
41GATCCGGGTCGCGGGGGCTCCTAGGGGGTTCCTTCCACAG80
81CTGGTGCGCGTGCGCAAGAGTGCGTCGAGGTTGTTCCGCG120
121GCAATTTATGAAACTCGGAGCCGGCAGTGAGTTGAGGGTT160
161CGGCGAGGTCAGGGATTCCTAGTTGCAGCGTGATTACCAA200
201CGCCAGCTCCCTTCACTGTCCAAGACAGCGATTCCGCGGC240
241TCCTCTGAGAACTGGCGCTTTGTTCATCATTTGCCACTTA280
281AGCTACTTGCAGTCACGTCACACCTTGGATCTCTATCATC320
321AAAACTATTCCACCTCGGAAATCTTACCTAAATGCAGCAT360
361GCCATCCTGAACGTCTCTCCCTGTCCTAGCTCTGTAACTG400
401TTTACATTGCTCAGGTACCTGAATATTGGCTTTGTGTCTA440
441AAGTTTCTGGAACTTTCCTCCTTACCGTGAAATAACTTGG480
481CTTAAATCACACTGCATATAGTACACAGGTGCTTAGCTCA520
521AGCCTGAGAATTACTGCAATCTAGTAAGGCGGATTTGAAC560
561TACTGTGGGAGTTCTATTTAGGAAGATGCAGCCTCTGAGC600
601AAGTTGATGGCTATCTCAAAACCTCGAAACCTGTCTCTAC640
641GTGAACAAAGAGAGGTTCTGAGAGCAGATATGTCTTGGCA680
681GCAGGAAACCAACCCCGTCGTGGAGACACATGACTCTGAG720
721GCATCTCGTCAAAAGTTCAGACATTTCCAGTATTTGAAAG760
761TGTCTGGGCCCCATGAAGCCCTGAGCCAACTCTGGGAGCT800
801CTGTCTTCAATGGCTGAGACCAGAGATTCATACAAAGAAG840
841CAGATTATAGAACTGTTGGTGCTGGAACAATTCCTGGCAA880
881TCCTGCCTGAAGAAGTCAGGACTTGGGTGAATTTACAACA920
921TCCAAACAACAGTAAAGATATGGTGACCCTCATAGAAGAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。