基因總覽
ZNF214 是位於人類第 11 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 zinc finger protein 214。其蛋白質產物歸屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,具有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型 zinc finger。現有資料將其可能角色概括為參與轉錄調控,但未提供調控對象、作用方式或具體生物學情境,因此不宜據此延伸推定更細節的功能。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000278314 ★ | 6,997,085–7,020,346 | 3 |
| ENST00000536068 | 6,996,643–7,020,385 | 4 |
| ENST00000888786 | 6,996,643–7,020,385 | 4 |
| ENST00000888787 | 6,996,643–7,020,385 | 4 |
| ENST00000888788 | 6,996,643–7,020,385 | 5 |
| ENST00000888789 | 6,996,643–7,003,404 | 2 |
| ENST00000977463 | 6,996,643–7,020,385 | 3 |
| ENST00000977464 | 6,996,643–7,020,385 | 3 |
| ENST00001010367 | 6,996,643–7,020,385 | 4 |
| ENST00001144117 | 6,996,643–7,020,385 | 3 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF214 可能參與轉錄調控。現有資料僅提供這項概括性功能註記,未說明其調控的是哪些基因或轉錄程序,也沒有指出作用方向、分子機制或發生條件。因此,這項功能應保留為可能參與,而不能視為已確立的特定調控作用。
Promoter 與基因調控
>ZNF214 ENST00000278314 GRCh38 chr11:7020246-7021346 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACACCAAACTGTAAATATATAGTTCACAAGACTACTTCCTATGTGCAAGGGGCTGGTTTAAGCATTTTAA CTACACTAACTCATTTCAATCTAACAAGTCTGTTACATAGTTACTATTATTATTGGCTATCAATATTACG CCTATTAAGCTGATGCTTAAAGGTTAGGTAATCCAGCCAAGATCTCGTAAGTGGTGTTGTCAGATTTGAA TCCAAGGAGTCCCTTGCTTGTAATGACTATCCTACCAAAAGTTCCTTGCCTAATAAAATGTTTGAATATT ACTGATCCAGCCCAAGTTTGAAGGACAGGGCCCAAAGATGCGAAAGTATTTTCCTAATATAACACACTCA GCTAAATAATAGAACAGGCTCTTGCAACTCTCTGTGGTCCCAGGACACTGAGGAGGGGCTCCTTCTCATG GCTTCATTTCAGCTCCACTGTGCGTTTCCCTTCTCTGCCTGGAGTCTCCAGAGGAGCCTGGGATTTGGCA AGAAGGCGGGAGGGAGGAAAGCCTCACTGGACCAGGAACGAAGAGGGTGTCTGGCAACAATAGGACGGAA TTTGAAAACCTCTAACCTTGAGTTTAGAGCGATGCTAGCTAGTGCCAGGGCTAGTGAGGTGCCCATTCCG CCAAGGCGCGGGACAGCGAGGACAACCACGCCTTGCCAACCAAAGGCGACCTGACAGCGTTTCCTCGGGG TCGTCGCGGTGGTGAGGGTCACAGAATTCTCCGAAGCCAGTAGCTCCGTTTCCAGCCACGCCCCCTTTCC CAGGGCCCTAAAAGCTTCGGGAGTTCTCCTATTCCATTAATGCTGGTGCGTCCTCGCCTTATCCCCCGAG CGCCCGCAGCTCCCGCCCGCGCAGGAATGCCAGCGGCCAAAGGTCGGGAGGCGCGGGATACTTCTGGCCA ATCAGGAGTCACGTTTTCCCGCGCTCTCTCTTCCCGCCCCGCCCCTCCCGTATCCATGGAAACACTGCGA GTGTCTACTCCAAGACCTGGGACTTCCGTTTCGGTCCAGCCGGGCTGCGGCCATTGTTTGTGTGGACTGA GTGTTTTGGCCATCCCGGTCCACTCTCACAGGCTCCGTTAAGTGACATGAA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF214_1 ↗ | 11:7,020,346 | 負股 | 7,020,336–7,020,395 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_B3DLL · enhancer · 7019515–7020224 · regulatory
ENSR11_94R8C · promoter · 7020225–7020489 · regulatory
ENSR11_B3DLP · enhancer · 7020490–7021057 · regulatory
ENSR11_53MKZ8 · CTCF_binding_site · 7021554–7021575 · regulatory
· motif · 7020391–7020401 · motif
· motif · 7020460–7020474 · motif
· motif · 7020461–7020474 · motif
· motif · 7020582–7020592 · motif
· motif · 7021534–7021547 · motif
· motif · 7021534–7021547 · motif
· motif · 7021556–7021572 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:606 aa
zinc finger protein 214 長 606 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其 N 端含 KRAB 結構域;序列中另註解出 11 個 C2H2 型 zinc finger,其中第 1 與第 3 個標示為退化型,其餘為 C2H2 型。
蛋白質三維結構
細胞內定位
zinc finger protein 214 的定位資料指向細胞核;來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GACTTCCGTTTCGGTCCAGCCGGGCTGCGGCCATTGTTTG40TGTGGACTGAGTGTTTTGGCCATCCCGGTCCACTCTCACA80GGCTCCGTTAAGTGACATGAACTCTCAGGAGGACTGAGCC120AGAAGCGGACAGGGCAAGACGAGCTGTGCTTGAAGGAAGA160GGGGCAGAAAATCGAGGGTCAGGGACTGAGAAGCTACTCC200GGTTTAGAAACCCCAGAGACACCCGTGTAGATGGGTACAT240CACGGCTTCTCTCCCACGTTAAGACTTAATAAAGAAAGCC280TGATCTTTGACCAGATGGCAGTAACATTTGAAGATGTGAC320TATTATTTTTACATGGGAGGAGTGGAAATTCCTGGATTCT360TCTCAAAAAAGACTCTACAGGGAGGTCATGTGGGAGAACT400ACACAAATGTCATGTCAGTAGAAAACTGGAATGAGAGCTA440CAAATCCCAAGAAGAAAAATTCAGATACTTAGAATATGAA480AATTTTTCCTACTGGCAAGGCTGGTGGAATGCTGGCGCCC520AGATGTATGAGAATCAGAACTATGGGGAAACTGTTCAAGG560GACAGATTCCAAAGACCTCACACAGCAAGATCGTTCCCAG600TGTCAGGAATGGTTAATACTCTCCACACAAGTACCAGGGT640ATGGGAACTATGAACTGACTTTTGAAAGCAAAAGTCTCAG680GAACTTAAAATATAAAAATTTTATGCCTTGGCAGTCCTTA720GAAACAAAAACCACTCAAGACTATGGTAGAGAAATCTACA760TGAGTGGTTCACATGGTTTTCAAGGGGGCAGATACCGTCT800TGGCATATCCAGGAAAAACCTCTCCATGGAAAAAGAACAG840AAGCTCATAGTTCAGCATTCTTATATCCCAGTGGAGGAAG880CCCTTCCACAGTATGTTGGGGTGATATGTCAAGAAGACCT920ACTGAGAGATTCAATGGAAGAAAAGTACTGTGGATGTAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。