演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF213CR53

zinc finger protein 213

ZNF213 是一種含 SCAN box、KRAB 區域及 C2H2 型鋅指的蛋白質,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens16p13.3UniProt O14771
OFFICIAL SYMBOL
ZNF213
CHROMOSOME
16
UNIPROT
O14771
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger protein 213(ZNF213)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 459 個胺基酸,包含 SCAN box、KRAB 區域與五個 C2H2 型鋅指;另有一段被註記為無序區域。現有功能描述僅指出它可能參與轉錄調控,並未提供更具體的調控對象或作用方式。

Official symbol
ZNF213
Gene name
zinc finger protein 213
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13005
UniProt
O14771
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CR53ZKSCAN21ZSCAN53

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF213pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:3,129,777–3,142,804
Gene span
13,028 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000396878 ★3,135,029–3,142,8046
ENST000005737713,129,777–3,137,4342
ENST000005749023,134,923–3,142,8047
ENST000011194463,135,024–3,142,8046
ENST000011328133,135,024–3,142,8046
ENST000005764163,135,133–3,142,8046
ENST000005726473,137,404–3,141,5324
ENST000005745753,137,650–3,141,3553

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF213 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,表示其調控角色尚不能據此視為已確立。

目前提供的資料未說明 ZNF213 如何影響轉錄,也未指出受調控的基因、參與的生物學過程或相關條件。因此,對其功能的解讀應限於可能與轉錄調控有關,不能進一步推定其具體機制或生物學效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3135029 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF213 ENST00000396878 GRCh38 chr16:3134029-3135129 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGGGAGAAAAGTTAACGCCGAGCACAGGTTGTTTACAGAGCTGGGGAAGGCCTCCTTGAGGGGGTGACA
TATGAGCAGAATGAGGGAGCAAGCCTTGTGGCTATCACGAGAAAGCTATCTTTATGGTTTTCCAATTAAT
TTTCTAAATTTTCTCTTCCAAGCATGCAACACCTACATAATTAAGACAAAACAAACCAAAAAAACTCTTT
CCATTTATGAAAGAGATCTGGAGCCTGAAATCATCTCCGGGTCGAGGCGTGGAGAGAGTGGGAGAGGATC
CGAGGGTATGGAAAGGACCCCGAGCCCCCCTGCTCTAGATCCCTCCGGGCCGTGGGACCCCTGACGCCCA
GCAGCAACTCGTGGACAAAGCAGCTGGTGAGAGAACGCGGGACTCCGGCCAGGTCAGTGTCCCGCTTGCC
GCGTCCTGCTAAGGCGACCCGAAGACAGAGGATCGCCGCAGGAGGCTCCGCGCCCCTTACCCGAGGGCAC
TTCCCAGCAAGCTCGACGCCTCTCCAGGGAATTGGGAGGAGCGGGACCCAAGAGGCTAGAAAAGAGTCTC
CCCGGCCCGAGCTCCACGGCCCGCGGCCTTTCGGCCCTCACCTACTAGTTGGCAAAGAAAGACCGTGGCA
GAAGGAAGAGGCCGCTCCAGCGCATCCCTTCGGGCGGAGCAGAAGCTCCACTTGTGGCTAGGCCATGTGC
CCTCTCCGTTCCTCGGGCCAGCCTTGGCTTCCCCTTTTTGTCGCTCAAGGGCCAGGGTCGCAAGGAAATG
TGAAAAAAAAGCGGAGACAAAAGAGAACGAGGTAAATCTAGATGCAGAGCCTCGCCTTTCCTCCCGGGTG
CAGGTGTATGACGCGTATGGAGTTTCTGTCTTCTAATAGGCAGCCTGAGAATTCTTCCTGTTCATTGGCC
ATCGGTCATGGAGAAGGCGGGCTCAGTGGACGAACGGCTTTCTGGGAGCTGGGGAATGCTTGCGTAGCGT
AGTTTCCCAGCGAGCCCCGCGAGGACTTCCGGCGCCGGGAGCTCGCGGCGGAAGTGGGATCTCCTGGGCC
GTAGTGGGCGTTGTGTGTTTCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCCGGGGC
ZNF213 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF213_1 ↗16:3,135,029正股3,134,980–3,135,039

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_CBDD · enhancer · 3129076–3130185 · regulatory

ENSR16_BLR5 · enhancer · 3131704–3132229 · regulatory

ENSR16_BLRG · enhancer · 3133914–3134770 · regulatory

ENSR16_938L4 · promoter · 3134771–3135143 · regulatory

ENSR16_BLRL · enhancer · 3135144–3135798 · regulatory

· motif · 3134754–3134767 · motif

· motif · 3135032–3135041 · motif

· motif · 3135053–3135064 · motif

· motif · 3135055–3135064 · motif

· motif · 3135095–3135108 · motif

· motif · 3135101–3135114 · motif

· motif · 3135107–3135120 · motif

· motif · 3135125–3135138 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:459 aa

1 aa459 aa結構域功能區域鋅指
依 O14771 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF213 為 459 個胺基酸的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其第 45–126 位胺基酸為 SCAN box,第 202–292 位為 KRAB 區域;第 317–451 位排列五個 C2H2 型鋅指。第 128–188 位另標註為無序區域。

結構域SCAN box45–126 aa
結構域KRAB202–292 aa
鋅指C2H2-type 1317–339 aa
鋅指C2H2-type 2345–367 aa
鋅指C2H2-type 3373–395 aa
鋅指C2H2-type 4401–423 aa
鋅指C2H2-type 5429–451 aa
功能區域Disordered128–188 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14771…

AlphaFold · O14771

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF213 的定位註記為細胞核;資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CR53ZNF213EEF2KMTFBXO17LMO4LNX1PPLSCAND1ZSCAN21
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF213 可能參與轉錄調控。此描述保留可能性的限定;資料未進一步指出調控的基因、作用機制、發生條件或相關生物學結果。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF213 的細胞定位註記為細胞核。此項資料僅提供核內定位資訊,未說明定位發生的條件、細胞系統、實驗處理、觀察方式或定位變化。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000396878 · 3,311 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGGACTTCCGGCGCCGGGAGCTCGCGGCGGAAGTGGGAT40
41CTCCTGGGCCGTAGTGGGCGTTGTGTGTTTCGGGGGCGGG80
81GGCGGGGGCGGGGGCCGGGGCGGGGACGGGGCCTCTGGCC120
121GCCTGGCTCCAACATCAAGCACCGGGCTCCGAGTGGCCGG160
161GATCAGCGCCCCGAGGCAGAGGCCGGAGGGCGCGCGCACT200
201GCTAGGAAGTGCTGGTCCCCCGCGCCGCTCTGCCAGCTTG240
241GTCCCCCGGCAGACGCCCCTGTACGATCGCCGCTCGCCCC280
281GCGGGCGAGGCTGCGGTGGACAGCGCGGGGCTCCGGCTGG320
321CTCGCCTTCCCGCCTGCCGTGTCCTGCTGAGCGACCCTGG360
361AGTACACATCCAGATGCCAGCCCAGCTACCACAGGGGATC400
401CCTCTGGGAGACTGAAAGTACAGGTTCTGGGGCCCAGGTT440
441GAAGCCGACCAACCCTGAGCCTCAGGCCAGGGGAATGGCA480
481GCCCCCTTGGAGGCCCAGGACCAGGCCCCTGGGGAGGGAG520
521AAGGGCTTCTGATTGTGAAAGTGGAAGATTCCTCCTGGGA560
561ACAGGAATCTGCCCAGCATGAGGATGGCAGGGATTCCGAA600
601GCCTGCCGCCAGCGCTTCCGGCAATTCTGCTACGGGGATG640
641TGCATGGGCCTCATGAGGCCTTCAGCCAGCTCTGGGAGCT680
681CTGCTGCCGCTGGCTGCGGCCCGAGCTGCGTACCAAGGAG720
721CAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACAG760
761TGCTGCCAGGGGAGATCCAGGGCTGGGTGCGTGAGCAGCA800
801CCCGGGAAGCGGTGAGGAGGCTGTCGCCTTGGTGGAGGAC840
841CTACAGAAGCAGCCAGTGAAAGCCTGGCGACAGGATGTGC880
881CCTCGGAGGAGGCGGAACCCGAGGCTGCAGGCCGGGGATC920
921CCAGGCCACGGGGCCTCCCCCGACGGTGGGGGCACGGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。