基因總覽
zinc finger protein 213(ZNF213)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。蛋白質全長 459 個胺基酸,包含 SCAN box、KRAB 區域與五個 C2H2 型鋅指;另有一段被註記為無序區域。現有功能描述僅指出它可能參與轉錄調控,並未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000396878 ★ | 3,135,029–3,142,804 | 6 |
| ENST00000573771 | 3,129,777–3,137,434 | 2 |
| ENST00000574902 | 3,134,923–3,142,804 | 7 |
| ENST00001119446 | 3,135,024–3,142,804 | 6 |
| ENST00001132813 | 3,135,024–3,142,804 | 6 |
| ENST00000576416 | 3,135,133–3,142,804 | 6 |
| ENST00000572647 | 3,137,404–3,141,532 | 4 |
| ENST00000574575 | 3,137,650–3,141,355 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF213 的功能註記指出,它可能參與轉錄調控。這項描述帶有不確定性,表示其調控角色尚不能據此視為已確立。
目前提供的資料未說明 ZNF213 如何影響轉錄,也未指出受調控的基因、參與的生物學過程或相關條件。因此,對其功能的解讀應限於可能與轉錄調控有關,不能進一步推定其具體機制或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF213 ENST00000396878 GRCh38 chr16:3134029-3135129 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAGGGAGAAAAGTTAACGCCGAGCACAGGTTGTTTACAGAGCTGGGGAAGGCCTCCTTGAGGGGGTGACA TATGAGCAGAATGAGGGAGCAAGCCTTGTGGCTATCACGAGAAAGCTATCTTTATGGTTTTCCAATTAAT TTTCTAAATTTTCTCTTCCAAGCATGCAACACCTACATAATTAAGACAAAACAAACCAAAAAAACTCTTT CCATTTATGAAAGAGATCTGGAGCCTGAAATCATCTCCGGGTCGAGGCGTGGAGAGAGTGGGAGAGGATC CGAGGGTATGGAAAGGACCCCGAGCCCCCCTGCTCTAGATCCCTCCGGGCCGTGGGACCCCTGACGCCCA GCAGCAACTCGTGGACAAAGCAGCTGGTGAGAGAACGCGGGACTCCGGCCAGGTCAGTGTCCCGCTTGCC GCGTCCTGCTAAGGCGACCCGAAGACAGAGGATCGCCGCAGGAGGCTCCGCGCCCCTTACCCGAGGGCAC TTCCCAGCAAGCTCGACGCCTCTCCAGGGAATTGGGAGGAGCGGGACCCAAGAGGCTAGAAAAGAGTCTC CCCGGCCCGAGCTCCACGGCCCGCGGCCTTTCGGCCCTCACCTACTAGTTGGCAAAGAAAGACCGTGGCA GAAGGAAGAGGCCGCTCCAGCGCATCCCTTCGGGCGGAGCAGAAGCTCCACTTGTGGCTAGGCCATGTGC CCTCTCCGTTCCTCGGGCCAGCCTTGGCTTCCCCTTTTTGTCGCTCAAGGGCCAGGGTCGCAAGGAAATG TGAAAAAAAAGCGGAGACAAAAGAGAACGAGGTAAATCTAGATGCAGAGCCTCGCCTTTCCTCCCGGGTG CAGGTGTATGACGCGTATGGAGTTTCTGTCTTCTAATAGGCAGCCTGAGAATTCTTCCTGTTCATTGGCC ATCGGTCATGGAGAAGGCGGGCTCAGTGGACGAACGGCTTTCTGGGAGCTGGGGAATGCTTGCGTAGCGT AGTTTCCCAGCGAGCCCCGCGAGGACTTCCGGCGCCGGGAGCTCGCGGCGGAAGTGGGATCTCCTGGGCC GTAGTGGGCGTTGTGTGTTTCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGCCGGGGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF213_1 ↗ | 16:3,135,029 | 正股 | 3,134,980–3,135,039 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_CBDD · enhancer · 3129076–3130185 · regulatory
ENSR16_BLR5 · enhancer · 3131704–3132229 · regulatory
ENSR16_BLRG · enhancer · 3133914–3134770 · regulatory
ENSR16_938L4 · promoter · 3134771–3135143 · regulatory
ENSR16_BLRL · enhancer · 3135144–3135798 · regulatory
· motif · 3134754–3134767 · motif
· motif · 3135032–3135041 · motif
· motif · 3135053–3135064 · motif
· motif · 3135055–3135064 · motif
· motif · 3135095–3135108 · motif
· motif · 3135101–3135114 · motif
· motif · 3135107–3135120 · motif
· motif · 3135125–3135138 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:459 aa
ZNF213 為 459 個胺基酸的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其第 45–126 位胺基酸為 SCAN box,第 202–292 位為 KRAB 區域;第 317–451 位排列五個 C2H2 型鋅指。第 128–188 位另標註為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF213 的定位註記為細胞核;資料未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- EEF2KMTQ96G04 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FBXO17Q96EF6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO4P61968 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPLO60437 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SCAND1P57086 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ZSCAN21Q9Y5A6 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGGACTTCCGGCGCCGGGAGCTCGCGGCGGAAGTGGGAT40CTCCTGGGCCGTAGTGGGCGTTGTGTGTTTCGGGGGCGGG80GGCGGGGGCGGGGGCCGGGGCGGGGACGGGGCCTCTGGCC120GCCTGGCTCCAACATCAAGCACCGGGCTCCGAGTGGCCGG160GATCAGCGCCCCGAGGCAGAGGCCGGAGGGCGCGCGCACT200GCTAGGAAGTGCTGGTCCCCCGCGCCGCTCTGCCAGCTTG240GTCCCCCGGCAGACGCCCCTGTACGATCGCCGCTCGCCCC280GCGGGCGAGGCTGCGGTGGACAGCGCGGGGCTCCGGCTGG320CTCGCCTTCCCGCCTGCCGTGTCCTGCTGAGCGACCCTGG360AGTACACATCCAGATGCCAGCCCAGCTACCACAGGGGATC400CCTCTGGGAGACTGAAAGTACAGGTTCTGGGGCCCAGGTT440GAAGCCGACCAACCCTGAGCCTCAGGCCAGGGGAATGGCA480GCCCCCTTGGAGGCCCAGGACCAGGCCCCTGGGGAGGGAG520AAGGGCTTCTGATTGTGAAAGTGGAAGATTCCTCCTGGGA560ACAGGAATCTGCCCAGCATGAGGATGGCAGGGATTCCGAA600GCCTGCCGCCAGCGCTTCCGGCAATTCTGCTACGGGGATG640TGCATGGGCCTCATGAGGCCTTCAGCCAGCTCTGGGAGCT680CTGCTGCCGCTGGCTGCGGCCCGAGCTGCGTACCAAGGAG720CAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTGACAG760TGCTGCCAGGGGAGATCCAGGGCTGGGTGCGTGAGCAGCA800CCCGGGAAGCGGTGAGGAGGCTGTCGCCTTGGTGGAGGAC840CTACAGAAGCAGCCAGTGAAAGCCTGGCGACAGGATGTGC880CCTCGGAGGAGGCGGAACCCGAGGCTGCAGGCCGGGGATC920CCAGGCCACGGGGCCTCCCCCGACGGTGGGGGCACGGAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。