基因總覽
ZNF212 是一種由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其序列包含 KRAB 結構域與四個 C2H2-type zinc finger,另有數段被註記為無序區域。這些結構特色構成此蛋白質的基本分子特徵;現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的靶標或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335870 ★ | 149,239,651–149,255,606 | 5 |
| ENST00000877956 | 149,239,651–149,255,956 | 5 |
| ENST00000481584 | 149,250,443–149,253,768 | 5 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF212 可能參與轉錄調控。這項功能描述指出其與基因轉錄活動的調節有關,但來源未說明它會促進或抑制轉錄,也未指出特定調控基因、細胞過程或作用條件,因此不宜進一步推定其調控方向或分子機制。
目前提供的功能資料僅支持這項概括性角色,未描述 ZNF212 如何辨識 DNA、是否直接接觸特定序列,或是否透過其他分子完成調控。雖然其蛋白質結構包含 KRAB 與 C2H2-type zinc finger 特徵,現有來源並未將這些結構與特定轉錄調控步驟或功能結果建立明確關聯。
因此,對 ZNF212 的功能理解應限於「可能參與轉錄調控」:這代表它可能與控制轉錄活動的過程相關,但尚無足夠資訊界定其作用對象、所在的生物學情境,或對下游基因表現造成的具體影響。
Promoter 與基因調控
>ZNF212 ENST00000335870 GRCh38 chr7:149238651-149239751 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGCCGGGTGGGGTGGCTCACACCTGTAATCCCGGCGCTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGATCACCTGAGG TCGGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGGGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCAG GCGTGGTGGCACATGCCTGTAATCCCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATCGCTTGAGCCCGGGA GGTGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAACTCCATC TCAAAAAAAAAAAGTTTCGTTCTCAGAGGAAACACTTCACGCCTATCCTGTGAAGTGGAAGTTCATTGCT TGTCTCCAGAGAGACAATGGTATAAATTAGGCAGCTATGGTTGCCGTAGTGTTGCTGGTATTGGGGATTA AGTACATGGCGATTAAATGGTCATGTGGCCGTGCTTTCCAACAAAAATTCCAGACACATCGTCTTACATG TAGCATGAGGACTGGAAATATTTGAAATCAGGGTTGTCTTGGACTTTCCAAGGCACATGATTACCATAAT TAACAGGCTACAGAGGGCTGGCCTGGGCCTGACCCCACGCTCCACACTGTTGATATGGAAACTGTTCCCA GTTTCTAAAAAGCCAAATAACAGGTGAACTTTTGGAATAAAATCACTTGCCTTTTGGAACCATATTTCTT TTCCCCAACAACATTACATGTTCTTTCCTCAGCAAAAAGTCTGAGTTGTACACATTTTTGAATCCCTCAA AGCATTTAGCAGAGTGCTGGGCATACGGAAGACAGCAGGATCCCGTGGCTTTGCCTGAAACGCGGAACCT GGTCTTGACTTTTGAGTGACTGAGCCCTCCTGGTGCCCGCACTCTGGCCGGGAGTGCCAAGCAGCGTTCT CCCTCCCGCCGCACGGGGGCACAATGGGAAGCCTGCACAGTGAGGAAGAGCGGCTGGAGCCGGTCTTGTG CCGGGGAGGTCGCTGCTCCCAGAATGCACCTGGCATCAACACGGCGGCGGCGGCGGCGGCTTCCAACAGG CTCTGGGGCGCCGAGCGGACAGGAACGCAGCACGGGGGCTCCGAGGCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF212_1 ↗ | 7:149,239,651 | 正股 | 149,239,602–149,239,661 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_9478CC · enhancer · 149238027–149238480 · regulatory
ENSR7_9478CN · promoter · 149239161–149239661 · regulatory
ENSR7_53B4QQX · CTCF_binding_site · 149239565–149239586 · regulatory
ENSR7_B34LNF · enhancer · 149239662–149240379 · regulatory
· motif · 149238073–149238095 · motif
· motif · 149238073–149238095 · motif
· motif · 149239567–149239583 · motif
· motif · 149239655–149239664 · motif
· motif · 149239777–149239787 · motif
· motif · 149239867–149239882 · motif
· motif · 149239874–149239882 · motif
· motif · 149239913–149239930 · motif
· motif · 149243360–149243373 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:495 aa
ZNF212 蛋白質長 495 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。其第 141–219 位胺基酸區段為 KRAB 結構域;第 316–338、369–391、427–449 與 455–477 位各有一個 C2H2-type zinc finger。資料另將第 1–29、264–290、337–361 與 476–495 位區段註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF212 的細胞內定位資料指向細胞核。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM161BQ96MY7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM90A1Q86YD7 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- GAS8O95995 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GYS1P13807 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KANK2Q63ZY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MFAP1P55081 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MLH1P40692 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKAA2P54646 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SF3A3Q12874 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SUV39H2Q9H5I1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZNF3P17036 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZNF783Q6ZMS7 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGAATGCACCTGGCATCAACACGGCGGCGGCGGCGGCGGC40TTCCAACAGGCTCTGGGGCGCCGAGCGGACAGGAACGCAG80CACGGGGGCTCCGAGGCGGGGTCTGGGTGTTGAGGGGCGA120CTGGAGCCATGGCGGAGTCGGCGCCTGCTCGGCACAGGAG160AAAACGACGCTCCACACCTTTAACTTCTTCCACACTTCCT200TCACAAGCAACAGAGAAAAGCTCCTATTTTCAGACCACCG240AGATTTCACTCTGGACGGTGGTGGCCGCTATTCAGGCTGT280GGAGAAGAAGATGGAGTCCCAGGCTGCCCGGCTACAGAGC320CTGGAGGGGCGCACGGGGACAGCCGAGAAGAAGCTGGCTG360ACTGCGAGAAGATGGCCGTGGAGTTCGGGAACCAGCTGGA400GGGCAAGTGGGCCGTGCTGGGGACCCTGCTGCAGGAGTAT440GGGCTACTGCAGAGGCGGCTGGAGAACGTGGAGAACCTGC480TGCGCAACAGGAACTTCTGGATCCTGCGGCTGCCCCCGGG520CAGCAAGGGGGAGGCCCCCAAGGTGTCCAGGTCACTGGAG560AATGATGGCGTCTGTTTCACCGAGCAGGAATGGGAGAATC600TGGAGGATTGGCAGAAGGAGCTCTACAGAAACGTGATGGA640GAGTAACTATGAGACACTGGTCTCTCTGAAGGTCCTTGGC680CAGACAGAGGGAGAAGCGGAGTTGGGTACAGAGATGCTGG720GTGACTTGGAAGAGGAAGGTCCTGGTGGTGCCCACCCAGC760AGGTGGGGTCATGATCAAACAGGAGCTACAGTATACACAG800GAAGGCCCTGCGGATCTTCCTGGAGAGTTCTCATGCATTG840CTGAAGAGCAGGCTTTCCTGAGCCCAGAGCAGACCGAACT880CTGGGGTGGTCAGGGCAGTTCTGTCCTCTTGGAAACAGGT920CCTGGGGACTCTACTCTAGAGGAGCCTGTTGGTAGTAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。