基因總覽
ZNF211 是蛋白質編碼基因,其正式名稱為 zinc finger protein 211。產物 Zinc finger protein 211 屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 KRAB 結構域及多個 C2H2-type zinc finger,呈現此類鋅指蛋白的結構特徵。來源指出,這個蛋白可能參與轉錄調控;目前提供的資料未進一步說明其調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000240731 ★ | 57,633,168–57,644,041 | 4 |
| ENST00000407202 | 57,630,395–57,642,226 | 3 |
| ENST00000541801 | 57,633,167–57,644,044 | 4 |
| ENST00000347302 | 57,633,167–57,644,044 | 3 |
| ENST00000299871 | 57,633,167–57,644,044 | 5 |
| ENST00000859800 | 57,633,167–57,644,044 | 5 |
| ENST00000859801 | 57,633,167–57,644,044 | 5 |
| ENST00000948851 | 57,633,167–57,644,044 | 4 |
| ENST00000948852 | 57,633,167–57,644,044 | 4 |
| ENST00000948853 | 57,633,167–57,644,044 | 4 |
| ENST00000948854 | 57,633,167–57,644,044 | 6 |
| ENST00001136863 | 57,633,167–57,644,044 | 4 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Zinc finger protein 211 可能參與轉錄調控。現有資料以「可能」描述此功能,並未提供特定基因、轉錄目標或調控方向,因此不能據此判定它會促進或抑制哪些基因的轉錄,也無法界定其作用所需的細胞或生物學條件。
已知的功能資訊僅指出其與轉錄調控可能相關,未詳述其分子作用方式、參與的生物學過程,或此作用對細胞功能的具體影響。雖然蛋白質具有 KRAB 結構域及多個 C2H2-type zinc finger,現有功能來源並未說明這些結構特徵如何促成轉錄調控,也未提供相關實驗情境或結果。因此,對 ZNF211 功能的描述應限於可能參與轉錄調控,不宜延伸為已確立的調控機制或生物學效應。
Promoter 與基因調控
>ZNF211 ENST00000240731 GRCh38 chr19:57632168-57633268 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTGTCCCTGACAAAACCTACAAAAAGTGACTTTAACACTTCAGGCTGCATGCATTTGAAGAGCAATAAGA TAACGTTTTTTCGCTTCCCACTACCAGTGGAGATCTGCTGGGGTGGGCTGCATGGAATCTGAAATGATGT CTAAATACTGAAGTGAACCTCTACACTAGAGACTGATATACAGCTGACCCTTAAACGACGCAGGGGTCAG GGATACCGACCCCTGCGGAATTGAAAATGCTTGTATTACTTTTGACTCCCCTAGGTCTTAACTACTAATA GCCAACTGTTGCCCGGAAGCCTTATGAAGTTGCCCGGAAGCCTTATGAATTACATAAACTCCCAGTCGAT TAACACATTTTGTATGATATATGCATGATATATGCATAATATATATGATATATGCATTTTGTATGATATA TGCATTATATATATTTTAGTATAAGAACTATACTTGTACTAAAACAGACCAGAGAAAGGGTATCAGGAAA ATTGTAAGAGGCTCGTTGACATTACACCCAATTAAAAAAAGGAAAATAAAAGAATACGGAAGGGAAAATA CATTTACTAATCATTAAGTGGAAGTGGATCATCATAAAGGTCTTCATCCTTGTGTTCTTCATGCTGGGCA AGAGAATGAGGTCTTGCTGTCTCTGGGGCAAGAGGTCGGGGAGCTGGAAGAGGCAGGAAAAGGAGCACAC TCGAAGTAACGTTTATTGGGGAAAAAAAACGCCTACGTGTAAATGGACCCGCACAGCTCAAACCTGTGTT GTTCAAGTGTCAACCTACTTAAGACCTCAAACACCGAAGCCCCTCAGTCGCCCTGGAAGGCAGCAGACGC AGCTTCCTAGCGCTCCCAGCTGTCTGCACACAAGGCGCCCTCCGTCGCAGCCTGGGGGAGACTACATTAC CCAGAAAGCCTTGCGTCGAGCGGCAGTACTTTGATCCAATGAAAATCCAAGACAGGGGCATTTCCGTGTG GGTCTACCCCCGCCCCCCCCAGGGCGGGACTTGTGGCGTCTTCGCAGCGGTCATTTTGGCTGCCCTCCCG GAGGTCCGTTCTGTCTGTCAGCCGCTTTGGTACGCTGCATCGGGATCGAAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF211_2 ↗ | 19:57,630,321 | 正股 | 57,630,272–57,630,331 |
| ZNF211_1 ↗ | 19:57,633,168 | 正股 | 57,633,119–57,633,178 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9STM7 · promoter · 57632762–57633226 · regulatory
· motif · 57632959–57632976 · motif
· motif · 57633136–57633147 · motif
· motif · 57633136–57633147 · motif
· motif · 57633154–57633164 · motif
· motif · 57633188–57633201 · motif
· motif · 57635324–57635333 · motif
· motif · 57635324–57635333 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:564 aa
Zinc finger protein 211 長 564 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質含有位於第 33–106 個胺基酸的 KRAB 結構域,以及 12 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 131–559 個胺基酸區間;第 85–108 個胺基酸另註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Zinc finger protein 211 的定位資料為細胞核;來源未提供定位改變的條件、時間動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AGGGCGGGACTTGTGGCGTCTTCGCAGCGGTCATTTTGGC40TGCCCTCCCGGAGGTCCGTTCTGTCTGTCAGCCGCTTTGG80TACGCTGCATCGGGATCGAAGTGACGGACCGTGAAGGCGC120GAGAGTCAGGTCTGAGGGTCGGGGGCAGAGCCGCCCGCGA160GGCCGGCCTGGGGATAGCGATGCTCGGGTTCCCCCCGGGT200CGCCCGCAGCTCCCGGTCCAGCTCCGCCCACAGACTCGGA240TGGCGACCGCACTGAGGGACCCGGCTTCGGTTCCCATAGC280TACAGAGGTGCTTTTCAAACTTACACAGGGAAGTGTGACC320TTTGAAGATGTGGCCGTGTACTTCTCCTGGGAGGAATGGG360ATCTCCTTGATGAGGCTCAGAAACACCTGTACTTCGATGT400GATGCTGGAGAACTTTGCACTTACGTCCTCCCTGGGTTGT440TGGTGTGGAGTGGAACATGAGGAAACACCTTCTGAACAGA480GAATTTCTGGAGAAAGAGTGCCACAGTTCAGGACTTCCAA520AGAAGGTTCATCTTCCCAGAATGCCGACTCCTGTGAAATA560TGTTGCCTGGTCTTGAGAGATATTTTGCACTTGGCTGAAC600ACCAAGGAACAAACTGCGGGCAGAAACTACACACATGTGG640AAAACAATTCTACATCAGTGCAAATCTTCAACAGCACCAG680AGGCAGCACATTACAGAGGCACCTTTCAGAAGTTATGTGG720ACACTGCCTCGTTTACACAGAGTTGCATAGTCCATGTGTC760GGAGAAACCCTTTACCTGCAGGGAGATCAGGAAAGACTTC800CTGGCCAACATGAGGTTTCTCCATCAAGACGCCACTCAAA840CAGGGGAGAAGCCAAATAACAGTAACAAGTGTGCGGTGGC880CTTTTACAGTGGAAAAAGTCATCACAACTGGGGAAAATGC920AGTAAAGCCTTTAGCCACATAGACACACTTGTTCAGGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。