基因總覽
ZNF208 是一個蛋白質編碼基因,產物為 zinc finger protein 208,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。此蛋白質長 1280 個胺基酸,具有 N 端 KRAB 結構域,以及分布於蛋白質序列中的多個 C2H2 型 zinc finger 區域;其中部分區域被註記為退化型。這些結構特色構成此蛋白質的基本分子特徵。資料指出它可能參與轉錄調控,但未提供更具體的調控對象或作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397126 ★ | 21,966,095–22,010,943 | 4 |
| ENST00000599916 | 21,932,872–22,010,994 | 5 |
| ENST00001127875 | 21,932,872–22,010,994 | 4 |
| ENST00001127876 | 21,932,921–22,010,994 | 3 |
| ENST00001115299 | 21,939,689–22,010,994 | 5 |
| ENST00001115297 | 21,939,692–22,010,994 | 5 |
| ENST00001115298 | 21,939,693–22,010,994 | 5 |
| ENST00000601773 | 21,939,773–22,010,994 | 4 |
| ENST00001127877 | 21,959,390–22,010,994 | 5 |
| ENST00001127878 | 21,960,255–22,010,994 | 5 |
| ENST00001127879 | 21,965,705–22,010,994 | 5 |
| ENST00001141891 | 21,966,095–22,010,994 | 4 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF208 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表示其產物與調節轉錄過程可能相關,但來源未說明它會促進或抑制轉錄,也未指出特定的目標基因、調控情境或作用途徑,因此無法據此界定更精確的功能方向。
目前可支持的功能範圍僅限於上述可能性;資料沒有提供特定實驗系統、細胞或生物學過程,也沒有描述基因或蛋白質受到干預後的結果。因此,ZNF208 在不同情境下如何影響轉錄,以及這種可能的調控與其他生物學功能之間有何關聯,尚不能從現有資訊進一步判定。
Promoter 與基因調控
>ZNF208 ENST00000397126 GRCh38 chr19:22010843-22011943 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTG AGCTGAGATCATGCCATTGCACTCTAACCTGGTGGACAGAGCAAGACTCTGTCTCAAAAAACAACAACAA CCATAATAATAATAATAATAATAATTTAAGGTTGTTTCAAGTTAAAAAAATCTATTAAAATAAAATAGAA AAAGTTAAAAAAATGTGAGATTATAAAATATATATGAAAATGTAGAGTGTTGGAAAAGTGACAAATTTGA TGGATTTATTTATAAGGTTTTACTAAAATAAGTTTAATTTTTTTGTTTTGTTTTTTGAGATGGCGTTTCA CTCTTGTTGCGCAAGCTGGAGTGCAATGGCCCAACCTCGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCTGGATTCAA ATGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCACGCCCGACTAATTTT TGTATTTTTAGTAGAGAAGGGGTTTCACCCTATCGACCAGGCTGGTCTTGAACTTCTGACCTCCAGTGAT CCGCCCTCCTCGGCCTCCCAAACTGTTGAGATTAAAGGCGTAAGCCATCGCGCCCGGCCTTTAGTATTGA TAACACACTATGACTAAAGTAAAAATTAATTTACTCTGGAACAAAAGTTTTATGTATTATTAACATGGCA GTAAAATATATTCGTTCACATTTCGAATACATTTAAAAAGAGAGAGAGTAAAGAAGAGATAGAATATTCG CATGCTCTGGGGTGGGCCTGGCTCAGCTCAGGGAGGAAGCCCTGCCTGAAAGGTTGCAGCCTACGCTGGC TCTCTTTCTTCATTCAGCCCAGCATCTGATCACATCTTCTGTCACTCAGGGCCTGAAAGGGCGGGGCCTT AAACATTATCCAATCAGGGATGCTGGGCTGGGAACGTCCAATCAGGCAGGCAGCTGGAGGGGACAGGTCG GCTTCCGGGATGTGGTCGGTCCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGGTCAAGGTCTCGTCCTTACTGCTGT GTGTCCTCTGCTCCTAGAGTCCCAGCCTCTGTGGCCCTATGACCTGCAGGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF208_1 ↗ | 19:22,010,943 | 負股 | 22,010,933–22,010,992 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9BPTT · enhancer · 22010644–22010908 · regulatory
ENSR19_9BPTX · promoter · 22010909–22011190 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1280 aa
zinc finger protein 208 長 1280 個胺基酸,N 端含 KRAB 結構域。序列中註記有 39 個 C2H2 型 zinc finger 區域,其中第 1、2 與 29 個為退化型;其餘標示為 C2H2-type。這些為序列特徵註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZNF208 蛋白質定位於細胞核;未提供定位變化的條件、異構型差異或動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCTTTGTCTCTCGCTGCAGCCGGAGGTCAAGGTCTCGTCC40TTACTGCTGTGTGTCCTCTGCTCCTAGAGTCCCAGCCTCT80GTGGCCCTATGACCTGCAGGTATTGGGAGATCCACAACTA120AGTCGCCAGGACCCCCTGGAAGCCTAGAAATGGGATCATT160GACATTTAGGGATGTGGCCATAGAATTCTCTCTGGAGGAG200TGGCAATGCCTGGACACTGCACAGCAGAATTTATATAGAA240ATGTGATGTTAGAGAACTACAGAAACCTGGTCTTCCTGGG280TATTGCTGCCTTTAAGCCAGACCTGATCATTTTTCTGGAG320GAAGGAAAAGAGTCCTGGAATATGAAGAGACATGAGATGG360TGGAAGAATCCCCAGTTATATGTTCTCATTTTGCTCAAGA400TCTTTGGCCAGAGCAGGGCATAGAAGATTCTTTCCAAAAA440GTGATATTGAGAAGGTATGAAAAATGTGGACATGAGAATT480TACACTTAAAAATTGGTTATACCAATGTGGATGAGTGTAA520GGTGCACAAAGAAGGTTATAATAAACTTAACCAGAGTTTG560ACAACTACACAGAGCAAAGTATTTCAACGTGGCAAATATG600CAAATGTCTTTCATAAATGTTCAAATTCAAACAGACATAA640GATAAGGCATACTGGAAAGAAACATTTGCAATGTAAAGAA680TACGTCAGATCATTTTGCATGCTTTCACACCTATCTCAAC720ATAAAAGAATTTATACTAGAGAGAATTCCTACAAATGTGA760AGAAGGTGGCAAAGCTTTTAACTGGTCCTCAACCCTTACT800TATTATAAGAGTGCTCATACTGGAGAGAAACCCTACAGAT840GTAAAGAATGTGGCAAAGCCTTTAGTAAGTTCTCAATCCT880TACTAAACATAAGGTAATTCATACTGGAGAGAAATCCTAC920AAATGTGAAGAATGTGGCAAGGCTTTTAACCAATCTGCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。