基因總覽
ZNF207 的正式名稱為 zinc finger protein 207,屬於蛋白質編碼基因。其產物也稱為 BuGZ,是與動粒和微管結合的蛋白質;蛋白質序列具有兩個 C2H2-type zinc finger 區域,並含有 GLEBS 區域。整體序列主要由低複雜度、無序區域構成。這些結構與特徵提供了認識 ZNF207 的基本背景;其在細胞分裂過程中的具體作用,則與微管、紡錘體及 BUB3 有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000394670 ★ | 32,350,157–32,381,885 | 12 |
| ENST00000321233 | 32,350,122–32,370,451 | 11 |
| ENST00000394673 | 32,350,122–32,370,343 | 11 |
| ENST00000577908 | 32,350,122–32,381,884 | 14 |
| ENST00000868080 | 32,350,122–32,370,448 | 12 |
| ENST00000868081 | 32,350,122–32,370,341 | 12 |
| ENST00000868082 | 32,350,122–32,370,341 | 11 |
| ENST00000868083 | 32,350,122–32,370,341 | 12 |
| ENST00000914402 | 32,350,122–32,370,449 | 11 |
| ENST00000914403 | 32,350,122–32,370,449 | 13 |
| ENST00000914404 | 32,350,122–32,370,448 | 12 |
| ENST00000914405 | 32,350,122–32,370,449 | 4 |
顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF207/BuGZ 是動粒與微管結合蛋白,參與紡錘體組裝。其主要由無序的低複雜度區域構成,能進行相分離或共凝聚,形成受溫度影響的液滴。這種共凝聚有助於微管束化,並使 tubulin 集中,進而促進微管聚合與紡錘體組裝。
透過集中紡錘體及紡錘體基質的構成物,ZNF207/BuGZ 也促進這些結構的組裝。來源指出,液滴形成與構成物的集中有助於紡錘體相關組裝過程,並未將其描述為單一、已完全釐清的分子機制。
ZNF207/BuGZ 也調節有絲分裂時的染色體排列,方式涉及維持 BUB3 的穩定性,以及促進 BUB3 載入動粒。不過,ZNF207/BuGZ 如何保護 BUB3 尚未明確:一項報告提出它可能阻止 BUB3 泛素化及其後續的蛋白酶體降解;另一項報告則指出,BUB3 的穩定化不依賴蛋白酶體。這些不同報告所述的保護機制仍未統一。
Promoter 與基因調控
>ZNF207 ENST00000394670 GRCh38 chr17:32349157-32350257 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCGCGCCCGGCTATCAGCTCCAGTCTTACCACGATTAGTTTTTCACGTGCCCAGCCTCAAAGACTTAAAC TCTTTGCTCCCTTACGGAGATACCCTTTCCTTCACCTTGCTTGCTCCCGTTGACTCCTCAAGAAACCTTT CTTATGTCGGGCGCAGCGGCTCAAGCCTGCAATCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACTTG AGCCCAGGAGTTCGAGACCAGCCTCGCTAACATGGTGAAACCCCATTCTACTAAAAATACAAAAATTAGC CGGGCTTGGTGGCGCGGGCCTGCAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCGCTTGAACCCG GGAGACGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGATCGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGAGACAGAGCGAGACTTGG TCTCAGAAAAATAAAACAAAACAAAGAAAAACAAAACTTTACTTGACAACCCAACGACCACTACCACTAC AGCCGCCCTAGGACTCCCGCTCTCTGAGGTCCTACAGCACTTCGCATTTCCCTCAACGCCGCACTGAGAA CTCTGCATTGTGTACTCGTCTGTCACCAATCTGCGAGTTACAAAGCAGAGACTAACTTATTTGGTTTAGC ATTTAATAGGCACATAATCAACATTTACTGTTCAATTGAAACAAAATTAAAATTGGGCGCTGTCTCTATC TTTATTTGTGATCGGCCCTAACTGCACTGGCAATCTTTTCCGTTTTTTTGTTTTCTGTTTTCCATTCGCA TGCCCCTTAGCGTACCTGGGGCTCCGGCTCCTTTACAAATGAAACCCAAAGTGCTCCGCAAGCACAGCCA GCGAAAGCGAAAAACTCTGAAACGGACAAGATGGCTGCCACCTCTTCGCGCCTCTTAGTCCCACCCACTC AGGGCGGAGGTCTGCGTCATGTGACCCTCCCCTTCTTGGCTCCGCCTCCTACCGCAGTGCTTGACGGGAG GCGGAGCGGGGAACGAGGCCGTCGGCCATTTTGTGTCTGCTTCCTGTGGGACGTGGTGGTAGCCGTTGGG TTGGGAAAGTGAGGGATTTTTGGCCTCGTTTCTCCTGCTTCTTTTCTCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF207_1 ↗ | 17:32,350,164 | 正股 | 32,350,115–32,350,174 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_8XNCC · enhancer · 32348683–32348827 · regulatory
ENSR17_B8FC8 · promoter · 32349642–32350190 · regulatory
ENSR17_59LG23 · CTCF_binding_site · 32350105–32350126 · regulatory
ENSR17_B8FCC · enhancer · 32350191–32351197 · regulatory
· motif · 32348661–32348676 · motif
· motif · 32348661–32348676 · motif
· motif · 32348662–32348676 · motif
· motif · 32348663–32348676 · motif
· motif · 32348681–32348696 · motif
· motif · 32348681–32348696 · motif
· motif · 32349416–32349427 · motif
· motif · 32350107–32350123 · motif
· motif · 32350157–32350167 · motif
· motif · 32350614–32350627 · motif
· motif · 32350614–32350627 · motif
· motif · 32350793–32350801 · motif
· motif · 32351642–32351651 · motif
· motif · 32352951–32352966 · motif
· motif · 32352957–32352969 · motif
· motif · 32352959–32352974 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:478 aa
ZNF207 蛋白質長 478 個胺基酸。序列第 11–34 與第 35–58 位各有一個 C2H2-type zinc finger;第 1–92 位註記為微管結合區。第 359–391 位為 GLEBS 區域。另有多段區域被註記為無序,包括第 99–157、238–276、300–362 及 384–478 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF207 在間期主要位於細胞核;核膜崩解前及前中期早期會集中於動粒。 當它與微管結合後,便從動粒消失。 來源亦列出其與細胞質細胞骨架及紡錘體相關的定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
未繪示構造:Chromosome, centromere, kinetochore。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BUB3O43684 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
ZNF207 透過自身的 GLEBS 區域與 BUB3 互作。來源支持兩者的互作關係;此處不將互作擴大解讀為其他複合體或結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF207/BuGZ 是能與動粒及微管結合的蛋白質,參與紡錘體組裝。它主要由無序低複雜度區域構成,可經相分離或共凝聚形成受溫度影響的液滴,促進微管束化、集中 tubulin,並協助微管聚合及紡錘體與紡錘體基質組裝。它也藉由維持 BUB3 穩定性並促進其載入動粒,調節有絲分裂染色體排列;BUB3 的保護機制仍不明,報告對是否依賴蛋白酶體有不同說法。 | 含實驗來源 | 證據與來源Kinetochore- and microtubule-binding protein that plays a key role in spindle assembly. ZNF207/BuGZ is mainly composed of disordered low-complexity regions and undergoes phase transition or coacervation to form temperature-dependent liquid droplets. Coacervation promotes microtubule bundling and concentrates tubulin, promoting microtubule polymerization and assembly of spindle and spindle matrix by concentrating its building blocks. Also acts as a regulator of mitotic chromosome alignment by mediating the stability and kinetochore loading of BUB3. Mechanisms by which BUB3 is protected are unclear: according to a first report, ZNF207/BuGZ may act by blocking ubiquitination and proteasomal degradation of BUB3. According to another report, the stabilization is independent of the proteasome PMID 24462186 ↗ · PMID 24462187 ↗ · PMID 26388440 ↗ |
| 交互作用 | ZNF207 透過其 GLEBS 區域與 BUB3 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZNF207 位於細胞核、染色體著絲點及動粒,也與細胞質細胞骨架及紡錘體相關。間期時主要在細胞核;核膜崩解前及前中期早期集中於動粒,與微管結合後則從動粒消失。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Chromosome, centromere, kinetochore; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Localizes primarily to the nucleus in interphase, concentrates at kinetochores prior to nuclear envelope breakdown and during early prometaphase, and disappears from kinetochores upon microtubule-binding PMID 24462186 ↗ · PMID 24462187 ↗ · PMID 26388440 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCGGCCATTTTGTGTCTGCTTCCTGTGGGACGTGGTGGT40AGCCGTTGGGTTGGGAAAGTGAGGGATTTTTGGCCTCGTT80TCTCCTGCTTCTTTTCTCCTCCCTTTTACTTTGCCGGTAG120AACACAGTTATGGGTCGCAAGAAGAAGAAGCAGCTGAAGC160CGTGGTGCTGGTATTGTAATAGAGATTTTGATGATGAGAA200GATCCTTATTCAGCACCAAAAAGCAAAGCATTTTAAATGC240CATATATGTCACAAGAAATTGTATACAGGACCTGGCTTAG280CTATTCATTGCATGCAGGTACATAAAGAAACAATAGATGC320CGTACCAAATGCAATACCTGGAAGAACAGACATAGAGTTG360GAAATATATGGTATGGAAGGTATTCCAGAAAAAGACATGG400ATGAAAGACGACGACTTCTTGAACAGAAAACACAAGAAAG440TCAAAAAAAGAAGCAACAAGATGATTCTGATGAATATGAT480GATGACGACTCTGCAGCCTCAACTTCATTTCAGCCACAGC520CTGTTCAACCTCAGCAAGGTTATATTCCTCCAATGGCACA560GCCAGGACTGCCACCAGTACCAGGAGCACCAGGAATGCCT600CCAGGCATACCTCCATTAATGCCAGGTGTTCCTCCTCTGA640TGCCAGGAATGCCACCAGTTATGCCAGGCATGCCACCTGG680ATTGCATCATCAGAGAAAATACACCCAGTCATTTTGCGGT720GAAAACATAATGATGCCAATGGGTGGAATGATGCCACCTG760GACCAGGAATACCACCTCTGATGCCTGGAATGCCACCAGG800TATGCCCCCACCTGTTCCACGTCCTGGAATTCCTCCAATG840ACTCAAGCACAGGCTGTTTCAGCGCCAGGTATTCTTAATA880GACCACCTGCACCAACAGCAACTGTACCTGCCCCACAGCC920TCCAGTTACTAAGCCTCTTTTCCCCAGTGCTGGACAGATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。