演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZNF205Zfp13

zinc finger protein 205

ZNF205(zinc finger protein 205)是蛋白質編碼基因,其產物具有轉錄抑制作用,參與調控 MPV17L 表現。

Homo sapiens16p13.3UniProt O95201
OFFICIAL SYMBOL
ZNF205
CHROMOSOME
16
UNIPROT
O95201
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZNF205(zinc finger protein 205)是位於人類第 16 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物被歸為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並具有轉錄抑制作用;目前提供的功能資訊指出,它參與調控 MPV17L 的表現。

Official symbol
ZNF205
Gene name
zinc finger protein 205
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12996
UniProt
O95201
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Zfp13ZNF210

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegZNF205pq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:3,112,550–3,120,527
Gene span
7,978 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000219091 ★3,112,586–3,120,5177
ENST000008713143,112,550–3,120,5276
ENST000003821923,112,557–3,120,5277
ENST000006200943,112,557–3,120,5277
ENST000008713163,112,557–3,120,5277
ENST000009222653,112,557–3,120,5277
ENST000009830373,112,557–3,120,5277
ENST000010090233,112,557–3,120,5277
ENST000011385913,112,557–3,120,5277
ENST000008713153,112,562–3,120,5277
ENST000008713193,112,562–3,120,5277
ENST000008713203,112,562–3,120,5277

顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZNF205 的產物具有轉錄抑制作用,參與調控 MPV17L 的表現。來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出它對 MPV17L 表現的調控,會進一步涉及其他基因的調節。

這些受影響的基因與 H(2)O(2) 代謝及粒線體凋亡級聯反應有關。因此,ZNF205 對 MPV17L 表現的調控,與上述兩類生物學過程相關基因的調節相連;目前提供的資訊未進一步說明其調控方向、作用機制或具體靶基因。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3112586 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZNF205 ENST00000219091 GRCh38 chr16:3111586-3112686 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCTGGGTAACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAATAAGTAAATAAATAAACAAACAAACCCTTAAAAGCCCA
CACAACATAGCACGAGCTGGTACAGAGGCAGCTGGGCCCATCTTACTGTGTGAAGCTGTGCACCTCAGGG
GATTCTGGTGAGCCAAAGACAGTGGCATGGGGACGTTTCCTAGGGAAACTTCCTGGAATCTGATTCCAGG
ACTGGGCCCCTGGCCCTTTTCCTGACACCCAGCCCCCATGCCTGCCCAAGAGAAATGGTTCCTTCCCCCA
GAAAGTAAAGCACAGTCTCTGTCCTCTCTATTTGAGGCCTTACTTCTCAGGGTCTAAAGGGAAATGGTGC
CTGAGAGGCAGAATCTGCAGCTGCCAGGCGTGTTTGAGAACTTAGAACCCCATTTATAGCTGGATCACAC
CCTCTATCCCCAAGCTGAAATGGGCCTGGAAGAATCGGATTAACCAACTTCTTCCCAAGGTGTGGGGCAT
CCGGATTGGGGGGAGTTCCCAGCCTGTTTCCCAAGTTCACTCTTAGGGAGAGAGTTCTGTGCCAGTCTTG
GGGGGACCCAGAGGGCCCTTGACTAGGAGTCCCTAAATGAATTCAGGGTCCCTCAGGAGACAATAACCTT
CAGAAACCCCGAGTGCTAAAATAAATGGTCCTGCCCTCTCCACCCTGCAAAATGCCCTTCTTTCTACCTG
TGAGGACAACTGCAGTGCTCGCTTTGAAATTTCAAATAACACAATCTTTCCACAAAATGCATCTTCCATT
TTTCTGTTTTGGTGGCTCTGCCTTGCTGGCATCATGAACGCGTCCTGGGTAAAGCCATCCTCATGAGCTG
GCATTGCGGCTCTGGGAGTCACCTCCCGGCCAAGAGCAGGTGCAACCCAGGCTCGAGACTCCACACCCGG
AACCCTCAAAACCGGGAACGCTGTAGGGCTGCGGCTGCATGGGGAATGGGATCTGGGAGGGACTTCCTGT
CTTCCCTACTCCCAGTCTCCACCCAACTCCCCCGCCCGCCCCGTGCAGGCTGTGGAGACTCCCTTCCCGG
GGGAGGGGGCCCCCACTGCCGCAGGTGCCCCCTCTGCCTCCACCCCGGTGA
ZNF205 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF205_1 ↗16:3,112,586正股3,112,537–3,112,596

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_938BF · enhancer · 3108249–3108576 · regulatory

ENSR16_BLN9 · promoter · 3112070–3112596 · regulatory

ENSR16_CBC7 · enhancer · 3112597–3114096 · regulatory

ENSR16_5PQZZ · CTCF_binding_site · 3114275–3114296 · regulatory

ENSR16_5PR8D · CTCF_binding_site · 3115661–3115682 · regulatory

· motif · 3112747–3112762 · motif

· motif · 3112753–3112765 · motif

· motif · 3112755–3112762 · motif

· motif · 3112755–3112768 · motif

· motif · 3112755–3112770 · motif

· motif · 3114277–3114293 · motif

· motif · 3115663–3115679 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:554 aa

1 aa554 aa結構域功能區域鋅指
依 O95201 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZNF205 蛋白質長 554 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列註解包括位於第 124–193 個胺基酸的 KRAB domain,以及八個 C2H2-type zinc finger,分布於第 308–526 個胺基酸。此外,資料將第 1–74、173–195 與 240–303 個胺基酸區段註記為無序區。

結構域KRAB124–193 aa
鋅指C2H2-type 1308–330 aa
鋅指C2H2-type 2336–358 aa
鋅指C2H2-type 3364–386 aa
鋅指C2H2-type 4392–414 aa
鋅指C2H2-type 5420–442 aa
鋅指C2H2-type 6448–470 aa
鋅指C2H2-type 7476–498 aa
鋅指C2H2-type 8504–526 aa
功能區域Disordered1–74 aa
功能區域Disordered173–195 aa
功能區域Disordered240–303 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O95201…

AlphaFold · O95201

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZNF205 的定位註記為細胞核;此資料未提供定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 6 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Zfp13ZNF205GOLGA6L9PICK1TNS2TSGA10UBQLN2UBQLN4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZNF205 具有轉錄抑制作用,參與調控 MPV17L 的表現。透過調節 MPV17L 表現,它也與涉及 H(2)O(2) 代謝及粒線體凋亡級聯反應的基因調控相關;來源未交代調控方向或具體分子機制。含實驗來源
證據與來源

Transcriptional repressor involved in regulating MPV17L expression. By regulating MPV17L expression, contributes to the regulation of genes involved in H(2)O(2) metabolism and the mitochondrial apoptotic cascade

PMID 22306510 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZNF205 的細胞內定位註記為細胞核。此筆資料只提供核定位資訊,沒有描述定位變化的條件、異構型差異或其他定位特徵。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000219091 · 1,968 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACCCAACTCCCCCGCCCGCCCCGTGCAGGCTGTGGAGACT40
41CCCTTCCCGGGGGAGGGGGCCCCCACTGCCGCAGGTGCCC80
81CCTCTGCCTCCACCCCGCTCTGAAATAGAAAATGTCTGCA120
121GACGGCGGAGGCATCCAGGACACCCAGGACAAGGAGACAC160
161CCCCGGAGGTTCCAGATCGTGGACATCCTCATCAGGAAAT200
201GCCTTCTAAGCTGGGGGAGGCGGTACCTTCAGGGGACACT240
241CAGGAGTCACTGCACATTAAGATGGAGCCCGAAGAGCCAC280
281ACTCCGAGGGGGCATCGCAGGAGGATGGGGCTCAAGGTGC320
321CTGGGGCTGGGCACCCCTAAGTCACGGCTCTAAGGAGAAA360
361GCTCTCTTCCTGCCTGGCGGAGCCCTCCCCTCCCCCCGGA400
401TCCCCGTGCTTTCCCGAGAGGGGAGGACCAGAGACCGGCA440
441GATGGCTGCAGCGCTCCTCACTGCCTGGTCCCAGATGCCA480
481GTGACTTTCGAGGATGTGGCCTTGTACCTCTCCCGGGAGG520
521AGTGGGGACGGCTGGACCACACGCAGCAGAACTTCTACAG560
561GGATGTCCTGCAGAAGAAAAATGGGCTGTCACTGGGCTTT600
601CCCTTCAGCAGGCCTTTCTGGGCCCCTCAAGCGCACGGCA640
641AGGGTGAGGCCTCGGGCTCCAGCCGGCAGGCAGGAGATGA680
681GAAGGAGTGGAGAGGCGCGTGCACAGGAGCCGTCGAGGTG720
721GGGCAGAGGGTGCAGACCTCATCCGTGGCAGCCCTTGGGA760
761ATGTGAAGCCCTTCAGAACCAGGGCAGGGAGAGTCCAGTG800
801GGGCGTCCCGCAGTGCGCGCAGGAAGCAGCCTGCGGCCGG840
841AGCTCAGGGCCGGCCAAAGACTCCGGGCAGCCGGCTGAGC880
881CAGATCGCACCCCGGATGCAGCTCCGCCAGACCCCAGTCC920
921CACGGAGCCCCAGGAGTACCGCGTCCCGGAGAAGCCCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。