基因總覽
ZNF205(zinc finger protein 205)是位於人類第 16 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物被歸為 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族,並具有轉錄抑制作用;目前提供的功能資訊指出,它參與調控 MPV17L 的表現。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000219091 ★ | 3,112,586–3,120,517 | 7 |
| ENST00000871314 | 3,112,550–3,120,527 | 6 |
| ENST00000382192 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00000620094 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00000871316 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00000922265 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00000983037 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00001009023 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00001138591 | 3,112,557–3,120,527 | 7 |
| ENST00000871315 | 3,112,562–3,120,527 | 7 |
| ENST00000871319 | 3,112,562–3,120,527 | 7 |
| ENST00000871320 | 3,112,562–3,120,527 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZNF205 的產物具有轉錄抑制作用,參與調控 MPV17L 的表現。來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出它對 MPV17L 表現的調控,會進一步涉及其他基因的調節。
這些受影響的基因與 H(2)O(2) 代謝及粒線體凋亡級聯反應有關。因此,ZNF205 對 MPV17L 表現的調控,與上述兩類生物學過程相關基因的調節相連;目前提供的資訊未進一步說明其調控方向、作用機制或具體靶基因。
Promoter 與基因調控
>ZNF205 ENST00000219091 GRCh38 chr16:3111586-3112686 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCTGGGTAACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAATAAGTAAATAAATAAACAAACAAACCCTTAAAAGCCCA CACAACATAGCACGAGCTGGTACAGAGGCAGCTGGGCCCATCTTACTGTGTGAAGCTGTGCACCTCAGGG GATTCTGGTGAGCCAAAGACAGTGGCATGGGGACGTTTCCTAGGGAAACTTCCTGGAATCTGATTCCAGG ACTGGGCCCCTGGCCCTTTTCCTGACACCCAGCCCCCATGCCTGCCCAAGAGAAATGGTTCCTTCCCCCA GAAAGTAAAGCACAGTCTCTGTCCTCTCTATTTGAGGCCTTACTTCTCAGGGTCTAAAGGGAAATGGTGC CTGAGAGGCAGAATCTGCAGCTGCCAGGCGTGTTTGAGAACTTAGAACCCCATTTATAGCTGGATCACAC CCTCTATCCCCAAGCTGAAATGGGCCTGGAAGAATCGGATTAACCAACTTCTTCCCAAGGTGTGGGGCAT CCGGATTGGGGGGAGTTCCCAGCCTGTTTCCCAAGTTCACTCTTAGGGAGAGAGTTCTGTGCCAGTCTTG GGGGGACCCAGAGGGCCCTTGACTAGGAGTCCCTAAATGAATTCAGGGTCCCTCAGGAGACAATAACCTT CAGAAACCCCGAGTGCTAAAATAAATGGTCCTGCCCTCTCCACCCTGCAAAATGCCCTTCTTTCTACCTG TGAGGACAACTGCAGTGCTCGCTTTGAAATTTCAAATAACACAATCTTTCCACAAAATGCATCTTCCATT TTTCTGTTTTGGTGGCTCTGCCTTGCTGGCATCATGAACGCGTCCTGGGTAAAGCCATCCTCATGAGCTG GCATTGCGGCTCTGGGAGTCACCTCCCGGCCAAGAGCAGGTGCAACCCAGGCTCGAGACTCCACACCCGG AACCCTCAAAACCGGGAACGCTGTAGGGCTGCGGCTGCATGGGGAATGGGATCTGGGAGGGACTTCCTGT CTTCCCTACTCCCAGTCTCCACCCAACTCCCCCGCCCGCCCCGTGCAGGCTGTGGAGACTCCCTTCCCGG GGGAGGGGGCCCCCACTGCCGCAGGTGCCCCCTCTGCCTCCACCCCGGTGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF205_1 ↗ | 16:3,112,586 | 正股 | 3,112,537–3,112,596 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_938BF · enhancer · 3108249–3108576 · regulatory
ENSR16_BLN9 · promoter · 3112070–3112596 · regulatory
ENSR16_CBC7 · enhancer · 3112597–3114096 · regulatory
ENSR16_5PQZZ · CTCF_binding_site · 3114275–3114296 · regulatory
ENSR16_5PR8D · CTCF_binding_site · 3115661–3115682 · regulatory
· motif · 3112747–3112762 · motif
· motif · 3112753–3112765 · motif
· motif · 3112755–3112762 · motif
· motif · 3112755–3112768 · motif
· motif · 3112755–3112770 · motif
· motif · 3114277–3114293 · motif
· motif · 3115663–3115679 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:554 aa
ZNF205 蛋白質長 554 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。序列註解包括位於第 124–193 個胺基酸的 KRAB domain,以及八個 C2H2-type zinc finger,分布於第 308–526 個胺基酸。此外,資料將第 1–74、173–195 與 240–303 個胺基酸區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZNF205 的定位註記為細胞核;此資料未提供定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- GOLGA6L9A6NEM1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PICK1Q9NRD5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNS2Q63HR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSGA10Q9BZW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN4Q9NRR5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF205 具有轉錄抑制作用,參與調控 MPV17L 的表現。透過調節 MPV17L 表現,它也與涉及 H(2)O(2) 代謝及粒線體凋亡級聯反應的基因調控相關;來源未交代調控方向或具體分子機制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcriptional repressor involved in regulating MPV17L expression. By regulating MPV17L expression, contributes to the regulation of genes involved in H(2)O(2) metabolism and the mitochondrial apoptotic cascade PMID 22306510 ↗ |
| 細胞定位 | ZNF205 的細胞內定位註記為細胞核。此筆資料只提供核定位資訊,沒有描述定位變化的條件、異構型差異或其他定位特徵。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACCCAACTCCCCCGCCCGCCCCGTGCAGGCTGTGGAGACT40CCCTTCCCGGGGGAGGGGGCCCCCACTGCCGCAGGTGCCC80CCTCTGCCTCCACCCCGCTCTGAAATAGAAAATGTCTGCA120GACGGCGGAGGCATCCAGGACACCCAGGACAAGGAGACAC160CCCCGGAGGTTCCAGATCGTGGACATCCTCATCAGGAAAT200GCCTTCTAAGCTGGGGGAGGCGGTACCTTCAGGGGACACT240CAGGAGTCACTGCACATTAAGATGGAGCCCGAAGAGCCAC280ACTCCGAGGGGGCATCGCAGGAGGATGGGGCTCAAGGTGC320CTGGGGCTGGGCACCCCTAAGTCACGGCTCTAAGGAGAAA360GCTCTCTTCCTGCCTGGCGGAGCCCTCCCCTCCCCCCGGA400TCCCCGTGCTTTCCCGAGAGGGGAGGACCAGAGACCGGCA440GATGGCTGCAGCGCTCCTCACTGCCTGGTCCCAGATGCCA480GTGACTTTCGAGGATGTGGCCTTGTACCTCTCCCGGGAGG520AGTGGGGACGGCTGGACCACACGCAGCAGAACTTCTACAG560GGATGTCCTGCAGAAGAAAAATGGGCTGTCACTGGGCTTT600CCCTTCAGCAGGCCTTTCTGGGCCCCTCAAGCGCACGGCA640AGGGTGAGGCCTCGGGCTCCAGCCGGCAGGCAGGAGATGA680GAAGGAGTGGAGAGGCGCGTGCACAGGAGCCGTCGAGGTG720GGGCAGAGGGTGCAGACCTCATCCGTGGCAGCCCTTGGGA760ATGTGAAGCCCTTCAGAACCAGGGCAGGGAGAGTCCAGTG800GGGCGTCCCGCAGTGCGCGCAGGAAGCAGCCTGCGGCCGG840AGCTCAGGGCCGGCCAAAGACTCCGGGCAGCCGGCTGAGC880CAGATCGCACCCCGGATGCAGCTCCGCCAGACCCCAGTCC920CACGGAGCCCCAGGAGTACCGCGTCCCGGAGAAGCCCAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。