基因總覽
ZNF204P 的正式名稱為 zinc finger protein 204, pseudogene,分類為假基因。資料將此位點描述為有轉錄紀錄,並指出它可能與 ZNF79 有關;這項來源沒有確認其是否產生功能性蛋白質。若假設此位點所編碼的蛋白質存在,與 ZNF79 相比,該蛋白質會有明顯的 N 端截短,且缺少 KRAB domain 與 C2H2 type zinc finger domain。這些描述是對假設性產物的比較,不能據此將 ZNF204P 當作具有已確認蛋白質產物的基因。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000416749 ★ | 27,358,252–27,359,854 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
目前來源將 ZNF204P 描述為有轉錄紀錄的假基因,並未提供已確認的蛋白質功能或生物學作用。來源提出它可能是 ZNF79 的假基因,但這項關聯仍具不確定性,不能視為已證實的演化來源或功能關係。
來源另以假設方式描述該位點可能編碼的蛋白質:若此產物存在,與 ZNF79 相比會有明顯的 N 端截短,並缺少 KRAB domain 和 C2H2 type zinc finger domain。這些結構差異是對假設性產物的說明,並不證明 ZNF204P 會產生蛋白質,也未說明其是否具有任何特定分子作用或生物學功能。
Promoter 與基因調控
>ZNF204P ENST00000416749 GRCh38 chr6:27359754-27360854 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAAAGTGAAAAATAATGTAGATTTGTCATTAGAAAGACCTAATAATTATTTTTTCATTTCAAAAGAGTAA ATTTCTCCCTTTTCATCCTTTCCTTTGTCCTTAAACCTAGAGTTTATGGTCTTTTTATATCAAGTGTAAA GCAATAACAGCAGTTACCTGACAAAGAATAATTAGCTAAAAGTATTACTTTGTACAAGTACTAAAAAATC TAATATAAAAGCTTATTGAAAATAAAAAGCTCTTAGTATTTTTTAAGATAATAGTTTCAATGCTGAGTAA GTAGTTTTCTCATAGGATAATTTCTAAAAGACTATTTCTTTCTGATAACAGTTTTCATTTCTTAATCCCT GCTCATTGTTTCTCTTTTCTAATATTCGCCATTTAGTTTTTTCCCTAATCATTCTTCTCACCTGACAGAA TGTTTGCTTCATTCCCATTGATTGCGTTATGCTCTGTATCAGACACTTTCACTCCACTAGTATTTCCATC TCACTCCTCCCTAGATTACTATCTTATAGTCCCAGTATTTTATGTTCTCAGTATCTGCAATTTCATTATT CCATTCCTAATATACCAGCTTCTTTTCTCCCAACATTTGGCACATAGTAGAGTCATATTTTTATGTCTTT TAGATGGGAAGCTTGAACGTGGGGCCAAGACATCAAGAGTAGAGCAGCAGGACATTTCAAAAGAAGATTA ATCTCAAAGATTAGAGATGGAAGAACTTGCAAAGAGAAAGTCTGTACCGGAAGAAATCTGGAAATCTAGA GGCCAGTTTAAGAATCAGCAGCTAAACAAGGAGAATAATCTAGGGCAAGAGATAGCTACCTGCACAAAAA TTCCTACCAGAAAAAGAGACATAGAATCTAATGAATTTGTGAAAAATTTTACTGTAAGATCAATACTTGT TGCAGAACAGATAGATCCTATGGAAGAGAATTGTCATAAATATGGTACATGTTGAAAGATGCTCAAACAA AACTCAGATTTAATTATACAAAGAAAGTATGATGGAAAAAAAAAAACCTTGTAAATATAGTGAATGTGGG AGAACCTTCAGAGGCCACATCACTCTTGTTCAGCATCAAATAACTCATTGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 27362085–27362098 · motif
· motif · 27362085–27362098 · motif
基因座與轉錄註解
ZNF204P 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000416749 ★ | transcribed_unprocessed_pseudogene | 1,603 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZNF204P 是有轉錄紀錄的假基因,可能源自 ZNF79,但此來源關係仍不確定。若假設此位點編碼蛋白質,該產物相較於 ZNF79 會有明顯的 N 端截短,並缺少 KRAB domain 與 C2H2 type zinc finger domain;來源未確認其功能。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This locus represents a transcribed pseudogene, possibly of ZNF79 (GeneID 7633). The protein encoded by this locus would have significant N-terminal truncation, and would lack the KRAB domain and the C2H2 type zinc finger domain, compared to ZNF79. |
DNA 與 RNA 序列
AAGAAAGTATGATGGAAAAAAAAAAACCTTGTAAATATAG40TGAATGTGGGAGAACCTTCAGAGGCCACATCACTCTTGTT80CAGCATCAAATAACTCATTGTGGAGAGAGACCCTGTAAAT120GTACTGAGTGTAGAAAGGGATTTAATCAGAGTTCCCACTT160AAGAAATAATCAGAAAACTCTTTCAGGAGAAAAGCCCTAC200AAATGCAGTGAGTGTGGGAAGGCCTTCAGTTATTGCTTAG240TTCTTAATCAACACCAGAGAATTCACAGTGGAGAGAAACC280TTATGAGGGTACTGAATGTGGCAAGACATTCAGTCGTAGT320ACATACCTTACTCAGCATCAAAGAATTCACACTGGTGAGA360AGCCCTATACATGTCTTGAATGTGGAAAGGCTTTTAGTCA400GAACACACATCTTACTCTACATCAGAGAATCCATACTGGA440GAGAAACCTTATGAATGCAATGAATGTGGTAGGTCCTTTA480GTCAGAGTGCACATCTTACTCAACATCAAAGAATGTATAC520AGGAGAAAAACTCTATGAATGTAATGAATGTGAGAAAGCC560TTCCATGATCACTCAGCTCTTATTCAACATCATATTGTCC600ATACTGCAGAGAAACCCTATGAATATCATGACTGGGAAAA640CTTTCAGTTACTGTTCAGACCTCATTCAACATCAGAGAAT680GCACACTGGAGAGAAACCATACAAATGCAATGAATGTGGG720AATGCCTTTAGTGATTGTTCATCCCTTATTCAGCATCAAA760GAACTCACACCGGAGAAGAGCCTTATGAATGTAAGCAATG800TGGAAAAGCCTTTAGCAGAAGCACATACCTTACTCAACAT840CAGAGAAGTCACGCAGGAGAGAAACAGTATAAATGCAATG880AATGTGAGAAAACTTTCAGCCTGAGTTCATTCCTTACACA920GCATATGAGGGTTCAGACTGGAGAAAAACCCTACAAATAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。